1、靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證靶向上調靶向上調ID4基因表達藥物的生物信基因表達藥物的生物信息學預測、分析和驗證息學預測、分析和驗證盧學春盧學春 楊波楊波 朱宏麗等朱宏麗等 靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證生物信息學在全球迅猛發展生物信息學在全球迅猛發展 基因基因基因組學基因組學 蛋白質蛋白質蛋白質組學蛋白質組學 表觀遺傳學表觀遺傳學表觀基因組學表觀基因組學 疾病狀態的疾病狀態的靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證如何利用數據庫為我們服務？如何利用數據庫為我們服務？生物信息學！生物信息學！靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和

2、驗證表觀遺傳學的貢獻表觀遺傳學的貢獻 抗癌基因的丟失與腫瘤的發生密切相關抗癌基因的丟失與腫瘤的發生密切相關 ID4基因的表達缺失而非突變與白血病和淋巴瘤的基因的表達缺失而非突變與白血病和淋巴瘤的發生密切相關發生密切相關靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證ID4丟失對白血病治療前景的啟示丟失對白血病治療前景的啟示重新表達！轉染轉染-基因治療基因治療藥物誘導藥物誘導靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證哪些藥物能夠誘導哪些藥物能夠誘導ID4基因的表達？基因的表達？生物信息學可以預測！生物信息學可以預測！實驗室證實實驗

3、室證實靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證ID4ID4基因的啟動子分析基因的啟動子分析靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證ID4基因啟動子活性分析基因啟動子活性分析靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證 ID4基因基因5側翼區順式作用元件的預測結果側翼區順式作用元件的預測結果 調控區調控區順式元件順式元件位置位置正向調控正向調控c-Myb-903, -621, -441, -374, -149,-136, -606 NR-903, -621, -441, -374, -149,-136, -606 NRSp1-901N, -872NR, -867,

4、 -559, -369, -283, -187, -118, -91, -58, +14, +17, +45, +47, -901N, -872NR, -867, -559, -369, -283, -187, -118, -91, -58, +14, +17, +45, +47, +48, +78, +81, +91, +94, +1004, +1006, +1007, +1011 +124, +130, +132, +133, +134, +48, +78, +81, +91, +94, +1004, +1006, +1007, +1011 +124, +130, +132, +133,

5、+134, +173, +191, +193, +194, +231, +233, +235, +236, +259, +260+173, +191, +193, +194, +231, +233, +235, +236, +259, +260abaA-794NR, -498, -424, -419, -350, -157, -4-794NR, -498, -424, -419, -350, -157, -4C/EBPalpha-705, -369, -572, -253, -108-705, -369, -572, -253, -108GR-355NR, -148, -106-355NR,

6、-148, -106Zeste-291, -249, -80, -32, +34, +53, +61-291, -249, -80, -32, +34, +53, +61CRE/half-301-301，-267-267ERE-244-244，-214-214，-181-181，-155-155，-129-129，-68-68，-28-28負向調控負向調控GCF+44, +133, +160, +177+44, +133, +160, +177WT1 -KTS+46, +102, +105, +131, +124+46, +102, +105, +131, +124HiNF-C+105, +1

7、31, +46+105, +131, +46EGR2+107, +127, +133, +194+107, +127, +133, +194CACC-binding factor-873, -871 NR, -283-873, -871 NR, -283靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證ID4基因表達譜的生物信息學預測基因表達譜的生物信息學預測靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證雌激素對雌激素對ID4基因表達的影響基因表達的影響 a. C57BL/6小鼠卵巢切除后的胸腺用小鼠卵巢切除后的胸腺用17-雌二醇（雌二醇（E2）或）或E2的類似物三羥的類似物三羥基異黃

8、酮處理基異黃酮處理. b. 卵巢切除卵巢切除14天后，小鼠皮下注射黃體酮，在不同時間點天后，小鼠皮下注射黃體酮，在不同時間點切除子宮檢測切除子宮檢測靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證對對ID4基因表達具有抑制作用的因素基因表達具有抑制作用的因素a.肺組織取自100氧損傷的野生型Nrf2敲除小鼠. b.用100uM ZVAD處理REtsAF-Bcl-2細胞，并在39.5條件下培養使caspases失活. REtsAF-Bcl-2細胞帶有溫度敏感的LT抗原突變體，能夠在33而非39.5條件下抑制p53基因的活性. c.脊髓組織， 200ng的二羥維生素D3對多發脊髓硬化B10PL

9、小鼠基因表達的影響. d. 比較對Sindbis病毒具有抗性和敏感性293細胞的基因表達靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證對對ID4基因表達具有促進作用的因素基因表達具有促進作用的因素 a.3日齡小鼠用日齡小鼠用ATRA處理處理.在第在第4天給一半小鼠以地塞米松（天給一半小鼠以地塞米松（DEX）. b. 額葉皮質的基因表達，取自過表達人類乙酰膽堿酯酶（額葉皮質的基因表達，取自過表達人類乙酰膽堿酯酶（AchE）的雌性小）的雌性小鼠和雌性鼠和雌性FVB/N小鼠小鼠. C. 巨噬細胞和臍靜脈內皮細胞用巨噬細胞和臍靜脈內皮細胞用100nM白三烯處白三烯處理理1小時后的基因表達小時后的

10、基因表達. d. 來自骨髓的巨噬細胞來自骨髓的巨噬細胞PIAS1用用500U/ml的的IFN-或或10ng/ml IFN-處理處理2h或或4h. 靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證有關有關ID4基因表達調控的文獻基因表達調控的文獻No.paperAuthorExperiment materialsID4 expression1Nat-GenetYu L, 2005miceMethylation(-)2Oncogene Umetani N, 2005breast cancer tissuesMethylation(-)3OncogeneChan AS，2003breast ca

11、ncer cell linesMethylation(-)4Anal-BiochemSemov A，2002WI-38 fibroblastE-box binding factor and c-Myc-binding protein(-)5EndocrinologyChaudhary J，2001Sertoli cell lineFSH and cAMP(+)*6Exp-Cell-ResAndres BPJ, 1999mouse forebrain astrocytescAMP(-)*7J-Biol-ChemPagliuca A, 1998DNA sequenceE-box (+)GA (-)*不同研究結果間存在矛盾不同研究結果間存在矛盾. (-)抑制表達; (+)促進表達 靶向上調ID4基因表達藥物的生物信息學預測分析和驗證 二丁酰環磷腺苷鈣對二丁酰環磷腺苷鈣對MOLT4白血病細胞系表達白血病細胞系表達ID4基因的影響基因的影響 DL2000為為DNA分子量標準；分子量標準；M4為不做任何處理的為不做任何處理的MOLT4細胞系，細胞系，M4-DC濃度為濃度為0.1mmol/L的二丁酰環磷腺苷鈣處理的二丁酰環磷腺苷鈣處理48h。ID4基因的基因的PCR產物長度為產物長度為364bp。內參。內參hHPRT的產物長度為的產物長度為231bp。