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文檔簡介
1、GeneCards:基因信息最全面的網站如果要看基因的序列,我們可以去NCBI,UCSC和ENsemb;如果要看這個基因的蛋白功能,那可以去uniprot那么有沒有一個網站可以把基因的這些信息匯總到一起的呢?答案當然是有,就是:我們先看一下這個網站的介紹吧:GeneCards:TheHumanGeneDatabaseGeneCardsisasearchable,integralvedatabasethatDrovidsGoirprehensive,LiscrtrieiialymkrmtonoraIannotatedardprcdicHhumangenesiHaulDnnaHcalMinteQf
2、Mes娠n卜g汕trie曲偽from"氐websojrces,IncludinggenomlGr:ranscriptomic,pioteomichg?neticrGeneCards是一個可搜索的綜合數據庫,它自動整合約125個網絡來源的基因的數據(包括基因組,轉錄組學,蛋白質組學等),怎么樣是不是感覺很厲害,那么接下來我們來看一下這個神奇的網站吧。在搜索基因進入主界面以后,我們可以在頁面的頂端看到這樣子的信息,這個是網站基本信息的小標題,仔細看一下是不是很詳細!ExpressionFunctoiExploreaGenaAP0A1Jumptoseclicnlorthisgene:Ali
3、asesDiscrdersDomansDrixs我們以P21基因為例看一下這個網站的一些常用的基本信息(由于信息太多,沒提到的可以自己的挖掘一下)1.對于一個基因會有很多名字,我們查的可能是基因的曾用名,所以GeneCards中就有一項是Aliases,如下圖P21是CDKN1A的曾用名。2我們查一個基因時,常常會在NCBI或UNIPROT上查看這個基因的描述,以便我們快速的了解這個基因。在GeneCards中,把其他網站中對這個基因的描述都放到了一起,不用我們去其他網站看這些信息了,如圖。3.看完對此基因的描述后,我們可以在Function中觀察基因的功能。GeneCards中不僅總結了此基
4、因基本的功能,還包括對于基因GO分析的功能和其基因的臨床疾病表型,如圖:P21的功能介紹和Go分析。HCfflcosi!CnlimedpillwnaI?G4-JHrl1r:fU-r.i:-n-ri-lb4此外,我們還可以在Pathway中觀察其可能涉及的通路及PPI。如圖:P21涉及的信號通路及PPI;其中標記:R的為Reactome的通路信息(很生動的一個通路網站,有時間再介紹吧),G為Kegg的信息。VupkitaHmfi.iikrniMii'UlidmiF«1ERSect11;Qd-upciPalhMT1(Qt-midlidodpl*DT|hiTitlGHndramin
5、S1!巧伽詞川一L一一一一一_02&3UJ._3!s«Rrud%S14f3<wZ44XEUDHE®3IUJSetdoptlr-Epuc*4w-養iMnxa8S2S0u誇Ty鈕咅5JH3pna-cttsEOOTillsXEfrr8»bsAins«XE£tl?funmt2e3_?a4<goC0EM*£8fJfet4«u63££>irfnfEcu1£n£ft££JX_afufiso10socws*9*>»£&&g
6、t;*$«_一一一L-kVFi&$e_bslM堂停dmu££。皚設EMsL2d鹵-。皚設SE購腺屬XI曰-毎廿uo匸eoo-lwgAi3-ly-c1:蘭總-£rJ-2£7iymual1Is*ffsl_ufl,in-E-CEd.-一氣iduA二-UES-rL-Als_c2凸bub-£0,肖t-芹Buur詈就譽a7<-wAnp.c呂扁Al工口且也cuw噸-JsrldspCQI里工冷J冒恬二.1,壬站X凸P.-BP-E-13二F卑En-B.-SS-?:-加耳凸533E聲0,rsSQ9:理.工目3I-J>a£
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