文獻管理Referencemanager計算機應用

王祿山May,2007文獻管理以《論語·學而》第一首段開篇：

子曰：

學而時習之，不亦說乎？

有朋自遠方來，不亦樂乎？

人不知不慍，不亦君子乎？論語今讀文獻管理（一）孔子在此彰顯出求知、求學、求道的身心狀態的歷程描繪出人與真理接觸互動的生活圖像（二）求知、求學、求道之三難

1、學而厭（學而不習、不時）2、學而孤（獨學無友）3、學而驕（驕而怨怒）學習之道在於超越上述三難的處境達到君子的身心境界。論語今讀文獻管理學習什么？知識信息數據課本科學雜志實驗結果求知、求學與求道大學懷疑精神自學方法文獻管理

20002004RelatedRecords?TimeCitedCiting19951973跨越時間的限制

回顧創意的起源與前瞻研究的進展1999198519961980求學更應了解研究“歷史”遠古朋友學習智慧文獻管理課本科學雜志科研成果創新性結果具有首創性1、背景介紹（提出問題）2、材料、方法、結果（分析問題）3、討論及結論（解決問題）科技論文參考文獻求學更應了解“歷史”—參考文獻文獻管理參考文獻的功能與作用

1）參考文獻是科技論文的重要組成部分，它不僅能為作者的論點提供有力的論據，而且可以精練文字節約篇幅，增加論文的信息量，具有很高的信息價值。2）論文作者在其課題的選題論證、實驗研究、以及總結和書寫論文的過程中，都要參閱和利用大量的科學文獻，由于作者在撰寫論文時，不可能將所有引用前人成果都詳盡地復述，只能將其主要引用文獻注明出處列于文后。科研工作：從查閱文獻開始。文獻管理3）參考文獻注明了被引理論、觀點、方法、數據的來源，反映了論文的真實科學依據，沒有參考文獻的科學論文，應視為作者忽略了科學工作的繼承性，也反映了作者科學學風和態度的欠缺。4）引用一定數量的參考文獻，既表明學科的繼承性和作者對他人勞動成果的尊重，也為編輯部、審稿專家和讀者提供了鑒別論文價值水平的重要信息。5）參考文獻為讀者和審閱專家提供了與論文有關的文獻題錄，便于檢索，以達到共享信息資源和推動科技進步的作用。6）著錄參考文獻有助于科技信息人員進行信息研究和文獻計量學研究。科研工作：從查閱文獻開始。文獻管理如何查閱參考文獻？原始文獻文獻管理文獻管理中國期刊全文數據庫ElsevierScience文獻管理ElsevierScience是世界上公認的高品位學術出版公司，也是全球最大的出版商，已有100多年的歷史。除了出版圖書外，還是當今世界最大的學術期刊出版商，內容涉及生命科學，物理，醫學，工程技術及社會科學，其中許多為核心期刊。近年來，Elsevier公司合并了一些出版社，如AcademicPress、CellPress的學術期刊全文數據也已加入到ScienceDirect，目前國際網站的服務器上安裝有1500多種期刊。

文獻管理綜述（Review)文獻專家分析（專業），對從事科技工作的初學者重要。是文獻的深入加工，而不是簡單的羅列。綜述是對相關進展作出（專家）評判。如何查閱參考文獻？CurrentOpinionsJournalsAnnualReviewJournals文獻管理影響因子高綜合性雜志科普性寫作文獻綜述好在線他引全文獻管理文獻管理二次文獻數據庫及檢索BiologicalAbstractMedline/Pubmed文獻管理二次文獻綜述文獻信息加工，一般為科技論文的摘要如何查閱參考文獻？文獻管理二次文獻數據庫及檢索生物學文獻中國期刊網文獻管理概述收錄范圍:

1MEDLINE2PreMEDLINE3Publishersuppliedcitations文獻管理MEDLINE收錄了全世界70個國家和地區的4600余種生物醫學期刊，起始時間1953年，目前文摘條目1200

萬篇，年報道量近40萬條，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，周更新。內容涉及：醫學、藥學、牙醫學、護理學、衛生保健、獸醫學等專業。記錄標注[PubMed-indexedforMEDLINE]文獻管理PublisherSuppliedCitation出版商直接向PubMed遞送的電子記錄。記錄標注[PubMed-assuppliedbypublisher]備注：提供的數據如果超出MEDLINE數據庫的收錄范圍，如在綜合性科學雜志（Science，Nature）上發表的地理學文章等，將不被采用。PreMEDLINE是臨時性醫學文獻數據庫，每天接收新數據，經MeSH詞表標引后，每周向medline移加一次。記錄標注[PubMed-inprocess]文獻管理AB-Abstract LA-LanguageAD-Affiliation MH-MeSHTermsAU-Authors

PMID-PubMedUniqueIdentifierCY-Country PT-PublicationTypeDP-PublicationDate

SO-SourceEDAT-EntrezDate TA-JournalTitleAbbreviation

GS-GeneSymbo TI-TitleIS-ISSN UID-UniqueIdentifiersVI-Volume PG備注：檢索詞[字段標識符]字段標識符文獻管理自動詞語匹配鏈接點多，部分在網上免費獲得全文也可以直接定購原文PubMed的特點文獻管理AutomaticTermMapping詞匯自動轉換1、MeSHTranslationtableVitaminc轉換為“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]備注：想要查驗檢索詞的轉換情況，并進行調整和保存檢索策略，可點擊“details”按鈕檢索規則文獻管理AutomaticTermMapping2、JournalsTranslationtableNewEnglandjournalofmedicine轉換為“NEnglJMed”[Journal]備注：三種不同的表達方式

刊名全稱、MEDLINE刊名縮寫格式、ISSN檢索規則文獻管理AutomaticTermMapping3、PhraseList在前兩個表中均未找到，而在短語列表中找到這個詞4、AuthorIndex姓（全稱）在前,名在后（首字母縮寫）smithjc當一個短語在前三個表中都找不到匹配詞，并且有1或2個字母在詞后時，PubMed就在該索引中查找。檢索規則文獻管理備注：如果在上述4個表或索引中仍找不到相匹配的詞時，PubMed就將短語劈開，再重復以上順序單獨分別查找，直到找到相匹配的詞。如果仍找不到匹配詞，則用AND將短語中的單個詞連接起來在全部字段中查找。例：pressurepoint轉換為((“pressure”[MeSHTerms]ORpressure[TextWord])ANDpoint[AllFields])檢索規則文獻管理短語檢索：如果在短語上加雙引號，將不執行轉換功能例如：“singlecell”“oxygenfreeradicals”檢索規則截詞檢索：例：輸入bacter*，檢出bacteria、bacterium等備注：將不執行轉換功能；截詞檢索只限于單詞，對詞組無效。文獻管理布爾邏輯運算：AND、OR、NOT必須大寫。

E-coliANDhamburger；vitamincORzinc；

traceelementNOTzinc邏輯符的運算次序是從左至右，括號內的檢索式可作為一個單元，優先運行。布爾邏輯檢索允許在檢索詞后面附加字段標識例如：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]檢索規則文獻管理基本檢索-BasicSearch高級檢索-AdvancedSearch限定檢索-LimitsSearch期刊檢索–JournalSearch主題詞檢索-MeSHBrowser檢索途徑與方法文獻管理基本檢索文獻管理檢索步驟：輸入檢索詞，點[Go]按鈕或按回車檢索詞的輸入形式：

輸入單詞或短語或表達式，也可用*及“”如，aspirin；stomachulcerIddmANDapoptosisasthmaKamadaA或asthma,KamadaA

者著姓名：wengxz、“wengxz”[au]

刊名標題：刊名全稱、縮寫、ISSN

Journalofleukocytebiology、Jleukocbiol、0741-5400文獻管理備注：刊名后附加字段標識符

刊名與主題詞相同的期刊

genetherapy[ta]、science[ta]、cell[ta]

單個詞刊名的期刊,Scanning[ta]帶括號刊名的期刊，錄入時應將括號省略

JHandSurg[Am]輸入格式為JHandSurgAm文獻管理高級檢索文獻管理檢索“阿爾茨海默病的基因治療”檢索步驟：在Searchfor框中輸入alzheimerdisease，點擊特征欄的[Preview/Index]按鈕在“AllFields”選擇一個檢索字段，其右側輸入框中輸入檢索詞genetherapy，點擊[AND]，點擊屏幕上部[Preview]開始檢索并顯示記錄條數，這樣可以反復操作；若點擊[Go]則顯示結果。文獻管理如果選擇一個檢索字段，在提問框中輸入檢索詞，點擊[Index]，則系統顯示相應字段的索引詞列表。選中一個索引詞，點擊邏輯符（AND、OR、NOT），被選中的索引詞會自動粘貼在提問框中，然后點擊“Preview”或“Go”按鈕備注：在高級檢索界面，可以用邏輯組配符將檢索歷史中的序號加以組配。例，#1ANDenglish文獻管理限定檢索文獻管理檢索“近2年有關細胞凋亡的綜述文獻”檢索步驟：在特征欄點擊“Limits”鍵輸入檢索詞apoptosis在Limitedto欄下,進行如下各種限定：

選擇字段、只檢帶文摘的記錄、文獻類型（選擇review）、語種、子集、年齡組、人類或動物實驗、性別、錄入系統日期（2years）、文獻出版日期點擊“Go”文獻管理期刊

(Journal)

檢索JAMA文獻管理文獻管理文獻管理期刊編目信息瀏覽頁機讀格式NLM館藏情況文獻管理主題詞(MeSH)

檢索AminatedTutorial文獻管理檢索“阿司匹林引起胃潰瘍的文獻”檢索步驟：點擊“MeshBrowser”，進入MeSH瀏覽器的首頁在提問框中輸入aspirin，點擊[Go]按鈕，顯示該主題詞的定義。點擊該詞可做如下3種選擇：

選擇副主題詞adverseeffects；

RestrictSearchtoMajorTopicheadingsonly；

DoNotExplodethisterm瀏覽樹形結構文獻管理……文獻管理文獻管理檢索結果文獻管理1、結果的顯示Display旁的下拉菜單，選擇記錄格式：

summary默認、brief、Abstract、Citation、ASN.1、MEDLINE、XML等格式顯示所有記錄;記錄前方框：顯示標記記錄顯示每屏記錄條數

Show：默認20（5-500）

page:1of13Next文獻管理2、排序(Sort)

著者（Author）FirstAuthor,LastAuthor

刊名（Journal）出版日期（PubDate）3、打印或存盤(sentto)純文本格式Sentto-Text

/file/Clipboard/email打印：使用瀏覽器的打印功能，存盤：點Sendto下拉按鈕選file

首先選擇所要存盤的數據（show），其次點擊display顯示所要存盤的格式，然后點Sendto-file即可文獻管理RelatedArticles-鏈接相關文獻鏈接NCBI數據庫

Necleotide、Protein、Genome、Structure、Popset、Taxonomy、OMIM、Books、Probeset、3DDomainsLinksBooks-鏈接相關圖書

Linkout–

鏈接外部資源，與生物醫學文獻出版商Web站點期刊全文的鏈接鏈接(link)功能文獻管理ReferenceManager文獻管理

Day-to-dayorganisedreading/archivingThesiswriting;300-400referencesWritingpapersre-submissiontodifferentjournalsWhydoyouneedcitationmanagementsoftware?文獻管理SoftwarepackagesavailableAdeptScientific;()Endnote,ReferenceManager,ProcitePapyrus,Biblioscape3.3RefWorks;www.文獻管理Whatcancitationmanagersoftwaredo?KeeptrackofallkeypapersinafieldRescueandimportreferencesviaInternetconnectiondirectlyintoyourdatabase(s)文獻管理“Citewhileyouwrite”;automaticembeddingofcitationsinWorddocumentGeneratebibliographiesinanyjournalstyle(forendofyearreports,thesis,papers)Whatcancitationmanagersoftwaredo?文獻管理InternetReferenceSearcher

CollectreferencesfromonlineandWebdatabases

SearchPubMedandInternetlibrariesworldwidefromReferenceManagerDatabaseManager

Organizeyourpersonalreferencecollectioneasily.

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WhatReferenceManagerdoes;文獻管理Createbibliographiesinonestep

CreatebibliographieswithReferenceManager–

EasyReferenceSharing

SharereferencesonanetworkeditionAutomatickeywordassignment

ReferenceManagerscansthetitleandnotesofnewreferencesforanytermsthatarealreadyinyourkeywordlist.WhatReferenceManagerdoes;文獻管理Neverleaveyourwordprocessortoidentifycitations

Workentirelywithinyourwordprocessor.ThisletsyouconcentrateonyourwritingwhileReferenceManagerlocatesthecorrectcitations–evenacrossmultipledatabases–CreatemultiplelinkstotheWorldWideWeb

LaunchyourWebbrowserfromReferenceManagertolinktofull-textarticlesontheWeb!WhatReferenceManagerdoes;文獻管理ByauthorBytitleBykeyword……Retrievingreferencesfromyourdatabase文獻管理文獻管理ReferenceDisplayColumnheadingsReferencelistDatabasetabStatusbar文獻管理RetrievingreferencesfromtheInternetDirectInternetconnectionestablishedtoPubMed(NCBI)Retrievalbasedonauthorname/keywordusinglogicaloperators(AND,OR,NOT)Directimportintoyourdatabase文獻管理文獻管理文獻管理文獻管理文獻管理GenerateabibliographyListofreferencespulledoutofyourdatabaseFormattedinanyjournalstyleExporteddirectlytoarichtextWorduploading文獻管理文獻管理ReferenceListAltmann,M.,Muller,P.P.,Wittmer,B.,Ruchti,F.,Lanker,S.,andTrachsel,H.(1993).ASaccharomyces

cerevisiaehomologofmammaliantranslationinitiationfactor-4bcontributestoRNAhelicaseactivity.EMBOJ.12,3997-4003.Borman,A.M.,Kirchweger,R.,Ziegler,E.,Rhoads,R.E.,Skern,T.,andKean,K.M.(1997).EIF4Ganditsproteolyticcleavageproducts:effectoninitiationofproteins