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文檔簡介
1、一、實驗?zāi)康暮鸵髮W(xué)習(xí)SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)的基本原理和操作方法。2蔗糖酶分離純化產(chǎn)物的SDSPAGE檢測分析。學(xué)習(xí)測定蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量(Mr)的方法。二、實驗內(nèi)容和原理電泳是帶電顆粒在電場作用下,作定向運動即向著與其電荷相反的電極移動的現(xiàn)象。電泳法分離、檢測蛋白質(zhì)混合樣品,主要是根據(jù)各蛋白質(zhì)組分的分子大小和形狀以及所帶凈電荷多少等因素所產(chǎn)生的電泳遷移率的差別。區(qū)帶電泳:是樣品物質(zhì)在一惰性支持物上進行電泳,因電泳后,樣品不同組分形成帶狀區(qū)間,故稱區(qū)帶電泳。4聚丙烯酰胺凝膠(polyacrylamidegel,簡稱PAG)是由丙烯酰胺(Acr)和交聯(lián)試劑N,N-甲叉雙丙烯酰胺(B
2、is)在有引發(fā)劑(如過硫酸銨或核黃素)和增速劑(如N,N,N,N-四甲基乙二胺,TEMED)的情況下聚合而成的。CH|nCH2-cococoNHNEINH2NH!COTOC o 1-5 h z-CH2CH-CH2COCOCOIIIHHNH2NHj彈NHICO5.聚丙烯酰胺凝膠.電泳(PAG*)是在恒定的、非解離的緩沖系統(tǒng)中來分離蛋白質(zhì),這主要是由蛋白質(zhì)樣品所帶的電荷和分子質(zhì)量的差異性進行分離;在電泳過程中仍保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象、亞基之間的相互作用及其生物活性。結(jié)構(gòu)連續(xù)系統(tǒng):凝膠緩沖液的pH值及凝膠濃度不變。該電泳系統(tǒng)具有電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng);不連續(xù)系統(tǒng):凝膠緩沖離子成分、pH值、凝膠濃度、電位
3、梯度不連續(xù),由濃縮膠和分離膠組成。由于濃縮膠的堆積(濃縮)作用,可使樣品(即使是稀釋樣品)在濃縮膠和分離膠的界面上先濃縮成一窄帶,然后在一定濃度(或一定濃度梯度)的凝膠上進行分離。該電泳系統(tǒng)具有濃縮效應(yīng)、電荷效應(yīng)、分子篩效應(yīng)。7.SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)以PAG為支持物的電泳,由于各種蛋白質(zhì)所帶靜電荷、分子量大小和形狀不同而有不同的遷移率。為消除靜電荷對遷移率的影響,在整個電泳體系中加入一定量的陰離子去污劑“十二烷基硫酸鈉(簡稱SDS)”和“強還原劑(巰基乙醇)”后,蛋白質(zhì)樣品就會與SDS結(jié)合形成帶負電荷復(fù)合物,而SDS作為一種變性劑和助溶劑,它能破壞蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間的非共價鍵,
4、并結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上,使分子去折疊,破壞蛋白質(zhì)分子內(nèi)的二級和三級結(jié)構(gòu),使蛋白質(zhì)變性而改變原有的空間構(gòu)象。另外,SDS蛋白質(zhì)復(fù)合物在強還原劑(巰基乙醇)存在下,可打開蛋白質(zhì)分子內(nèi)或肽鏈間的二硫鍵,并能避免重新氧化,這樣分離出的譜帶即為蛋迤亞基。蛋白質(zhì)亞基的電泳的遷移率主要取決于亞基的相對分子質(zhì)量大小,而電荷的因素可以忽略。8蛋白質(zhì)亞基相對分子質(zhì)量的測方法在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中,加入一定量的SDS時,蛋白質(zhì)一SDS復(fù)合物在水溶液中的形狀,近似于雪茄煙形的長橢圓棒。不同蛋白質(zhì)的SDS復(fù)合物的短軸長度都一樣,約為1.8nm,而長軸則隨蛋白質(zhì)的分子量成正比變化。這樣的蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物在凝膠中的遷移率
5、,不再受蛋白質(zhì)原有電荷和形狀的影響,而只主要取決于它的橢圓棒的長度即蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量的大小,而其他因素對電泳遷移率的影響幾乎可以忽略不計。由于蛋白質(zhì)的相對分子質(zhì)量不同,所形成復(fù)合物的相對分子質(zhì)量不同,在電泳中反映出不同的遷移率。當?shù)鞍踪|(zhì)或亞基的相對分子質(zhì)量在15,000200,000之間時,電泳遷移率與相對分子質(zhì)量的對數(shù)呈直線關(guān)系,符合下列方程式:lgMr=KbRf式中Mr代表相對分子質(zhì)量,K代表常數(shù),b代表斜率,Rf代表遷移率。若將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量的對數(shù)作圖,可獲得一條標準曲線。未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得蛋白質(zhì)相對分子質(zhì)量
6、。三、實驗材料和試劑1實驗材料:蔗糖酶樣品(樣品I、II、III、W)2實驗試劑:30.8%凝膠貯液:丙烯酰胺(Acr)30g,甲叉雙丙烯酰胺(Bis)0.8g,加水溶解,并加水定容到100ml,過濾。貯于棕色瓶,可在4C保存一個月。丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺單體及溶液是中樞神經(jīng)毒物,要小心操作。分離膠緩沖液:3mol/LTris-HClpH8.9濃縮膠緩沖液:0.5mol/LTris-HClpH6.710%SDSTEMED(N,N,Z,NZ-四甲基乙二胺)(增速劑)10%過硫酸銨(引發(fā)劑)電泳緩沖液(pH8.3):Tris6g,甘氨酸28.8g,SDS2g,用蒸餾水溶解并定至1000ml,使用
7、時稀釋1倍。蛋白質(zhì)樣品溶解液(2X蛋白質(zhì)樣品溶解液):內(nèi)含1%SDS,1%巰基乙醇,40%蔗糖或20%甘油,0.02%溴酚藍,0.01mol/LTris-HClpH8.0緩沖液。染色液:0.25g考馬斯亮藍R-250或G-250,加90.8ml50%甲醇,加9.2ml乙酸,溶解混勻后使用。脫色液:75ml乙酸,50ml甲醇,加蒸餾水875ml,混勻使用。蛋白質(zhì)分子量標準溶液:P-半乳糖苷酶(MW116,000)牛血清白蛋白(MW66,200)卵清蛋白(MW45,000)乳酸脫氫酶(MW35,000)限制性內(nèi)切酶Bsp981(MW25,000)P-乳球蛋白(MW18,400)雞蛋清溶菌酶(MW1
8、4,400)四、實驗器材與儀器1電泳儀、垂直電泳槽及配件(長短玻璃板各1塊、封膠條2條、梳子1個)微量移液器:1000M1、200p1、10pl3燒杯、長滴管微量注射器50p1恒溫水浴100C高速臺式離心機離心管(1.5ml、0.5ml)及離心管架8.015cm培養(yǎng)皿(染色、脫色用)9.搖床(染色、脫色用)五、操作方法和實驗步驟1.準備電泳裝置:電泳槽、電泳儀。2.配膠及凝膠的制備(1)配制凝膠:不連續(xù)體系SDS聚丙烯酰胺凝膠配制3%分離嘲濡商量(訕5%糧縮膠所需試劑量(ml)3O.S%JS膠貯液20.353nmLLTris-HCIpHS.9分離膠鉤中菠0.950.5nioLLTriHCIpH
9、6.7淞宿膠緩菠0.3210%SDS0.0750.Q25TEMED0.0030.003蒸憐K4.51.S10%Ap0.G4G0.020:總、為去除抑制膠聚合的氧,加入、AP前可進行抽氣處理;2、過,硫酸銨和TEMED的量應(yīng)根據(jù)室溫聚合情況而定;3、混勻后立即灌注凝膠和用手封頂。凝膠板的制備分離膠的制備:按上表配制7.5ml分離膠,混合均勻后將凝膠液加至長、短玻璃板間的縫隙內(nèi),再用少許蒸餾水(或水飽和的異丙醇或正丁醇)沿長玻璃板板壁緩慢注入,約5mm高,以封住膠面,以促使聚合并使膠面平直,約30min后,凝膠與水封層間出現(xiàn)折射率不同的界線,則表示凝膠完全聚合,傾去水封層的蒸餾水,再用濾紙條吸去多
10、余的水分。濃縮膠的制備:按上表配制2.5ml濃縮膠,混勻后將濃縮液加到已聚合的分離膠上方,直至離短玻璃板上得約0.1cm處,輕輕將樣品槽模板(梳子)插入濃縮膠內(nèi),約lOmin后凝膠聚合。小心拔去樣品槽的槽板(梳子),將電泳緩沖液倒入上、下貯槽中,電泳緩沖液應(yīng)沒過短板約0.5cm以上,即可準備加樣。樣品處理與加樣(1)樣品制備取蔗糖酶樣品(樣品I、II、III、W)各50ul,分別放入1.5ml離心管中,12000r/min離心15min,收集上清為樣品溶液。(2)樣品處理將樣品溶液分別按等體積加入“2XSDS蛋白質(zhì)上樣緩沖液”,100C保溫3分鐘。(3)加樣用微量注射器向樣品槽內(nèi)注入310“1樣品混合液。如樣品濃度較低,可適當增加上樣量。樣品markerIIIinIV-1W-2IV-3W-4上樣*(pl)533310101010電泳在電泳槽中加入電泳緩沖液,上槽(加樣孔端)接負極、下槽接正極,接電泳儀電源電流控制在23mA/樣品孔,一般樣品進濃縮膠前,電流控制在1020mA,待樣品進分離膠后,將電流調(diào)到2030m
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