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文檔簡介

1、條件性敲除小鼠定義:條件性基因敲除小鼠(也叫Flox小鼠)是指在目的基因中含有成對的loxp位點(diǎn)的小鼠,與Cre工具小鼠交配后可在特定的組織或細(xì)胞中敲除目的基因。l CKO如何實(shí)現(xiàn)?重組酶系統(tǒng)(如:Cre-loxP)介導(dǎo)的位點(diǎn)特異性重組技術(shù)。Cre是重組酶(38kDa),可識別 34bp 長的 DNA 序列l(wèi)oxP。loxP 兩側(cè)各 13bp 構(gòu)成回文結(jié)構(gòu),中間 8bp為非回文結(jié)構(gòu),因此loxp具有方向性。(當(dāng) DNA 分子上存在兩個同向 loxP 序列時,Cre可將兩個loxP 序列之間的DNA 片段切出并環(huán)化,同時將 loxP 兩側(cè)的序列進(jìn)行連接;當(dāng) DNA 分子上存在兩個方向相反的 lo

2、xP 序列時,Cre 可導(dǎo)致 loxP 之間的序列發(fā)生反轉(zhuǎn)。)l CKO敲除的是什么?條件性基因敲除的靶基因中必須帶有可以被 Cre 重組酶識別的 loxP 序列,這種基因稱為 floxed gene。帶有 floxed 靶基因的小鼠稱為 flox 小鼠。在這種小鼠中,通常采用 DNA 同源重組方法,在擬敲除基因片段的兩側(cè)分別放置一個同向的 loxP 位點(diǎn)。loxP 位點(diǎn)的存在應(yīng)不影響該基因的功能,故選擇對照為flox/flox小鼠l CKO敲除何時何地發(fā)生?除了 flox 小鼠以外,重組酶系統(tǒng)介導(dǎo)的條件性基因敲除還需要另一類重要的基因工程小鼠的參與Cre 工具鼠。Cre 工具鼠中,將 Cre

3、 重組酶的編碼序列置于特定的基因啟動子下,Cre 的表達(dá)特性決定了靶基因何時何地發(fā)生敲除。Cre 在哪一種組織細(xì)胞中表達(dá),靶基因的敲除就發(fā)生在哪種組織細(xì)胞;Cre 的表達(dá)水平將影響靶基因在此種組織細(xì)胞中進(jìn)行修飾的效率;使用誘導(dǎo)型Cre 重組酶可以通過給予誘導(dǎo)劑,決定在特定的發(fā)育時期或疾病發(fā)生階段,定時地進(jìn)行基因敲除。(范衡宇老師課件)實(shí)驗(yàn)時,將 flox 小鼠和 Cre 工具鼠進(jìn)行交配,最后獲得 flox 純合且 Cre 雜合的小鼠。在這類小鼠中,凡是表達(dá) Cre 的細(xì)胞,兩個 loxP 之間的序列被切除,從而實(shí)現(xiàn)組織特異性基因敲除。(參考資料:南方模式生物官網(wǎng))l 交配策略 將獲得的flox

4、雜合子小鼠(geneflox/+)分成兩部分:1. flox/+小鼠與Cre小鼠交配,同時獲得flox陽性且Cre陽性小鼠(該小鼠簡寫為:geneflox/+;Cre+),flox陽性且Cre陰性小鼠(geneflox/+);2. flox小鼠自交,獲得flox純合(該小鼠簡寫為:geneflox/flox)和flox雜合小鼠(geneflox/+)。 為獲得flox純合且Cre陽性的小鼠,可有兩種繁育方法選擇:1. 將獲得的flox和Cre雙陽性雜合子小鼠(geneflox/+:Cre+)與flox雜合子小鼠(geneflox/+)交配,最終獲得flox純合且Cre陽性的實(shí)驗(yàn)組小鼠(該小鼠簡

5、寫為:geneflox/flox;Cre+,該小鼠所占后代比例為:1/8)和flox純合且Cre陰性的對照組小鼠(geneflox/flox,該小鼠所占后代比例為:1/8);2. 將獲得的flox和Cre雙陽性雜合子小鼠(geneflox/+:Cre+)與flox純合子小鼠(geneflox/flox)交配,最終獲得flox純合且Cre陽性的實(shí)驗(yàn)組小鼠(geneflox/flox;Cre+,該小鼠所占后代比例為:1/4)和flox純合且Cre陰性的對照組小鼠(geneflox/flox,該小鼠所占后代比例為:1/4)。 后續(xù)實(shí)驗(yàn)(實(shí)驗(yàn)組:geneflox/flox;Cre+,對照組:實(shí)驗(yàn)組:g

6、eneflox/flox)為快速獲得上述所需小鼠,可將geneflox/flox;Cre+小鼠與geneflox/flox小鼠雜交l 小鼠基因型鑒定 小鼠編號原則 Flox小鼠基因型鑒定(用于鑒定flox純合、雜合和野生型)PCR鑒定引物位置示意圖(可選擇P1,P2引物對,或P3,P4,P1,P4引物對) 目的基因組織特異性敲除效果驗(yàn)證(1) DNA水平cre活性驗(yàn)證通常是取一小塊表達(dá)Cre的組織,抽提基因組DNA,通過PCR的方法對flox區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,通過flox區(qū)域的有無,定性判斷Cre是否發(fā)揮作用。(2) RNA水平cre敲除效率驗(yàn)證通常是取一小塊表達(dá)Cre的組織,抽提RNA,反轉(zhuǎn)錄成

7、cDNA后,通過Realtime-PCR的方法,利用Cre作用后的mRNA ,所設(shè)計(jì)的引物無法擴(kuò)增出PCR產(chǎn)物的原理,定量判斷Cre作用效率。(3) 蛋白水平cre敲除效率驗(yàn)證目的組織western blot或免疫組化檢測。原理:表達(dá)cre的組織無法檢測到目的蛋白。 動物組織DNA抽提1) 250ul 裂解液+2.5ul proteinase K(10mg/ml) 直接消化組織,放于55恒溫?zé)嵩∵^夜2) 加入同體積(250ul)苯酚:氯仿:異戊醇混合物(使用前搖晃瓶身混勻),上下劇烈震蕩15s,12000rpm,15min常溫離心3) 轉(zhuǎn)移上清于新的EP管(期間可能會吸起白色絮狀物,無妨)4)

8、 加入等體積的異丙醇,上下劇烈震蕩15s,12000rpm,15min常溫離心5) 倒掉上清(也可用真空泵吸,小心底部沉淀),用75%乙醇(400ul),7500rpm, 5min(可多清洗2遍)6) 將管壁內(nèi)部及管蓋上的殘留乙醇吸干,沉淀相對較干,根據(jù)不同體積加入ddH2O注:因沒加RNA酶,可能會殘余RNA,A260/280會居于1.9以上,但PCR無妨lysis buffer配制(裂解液):先加水500ml,再加各種成分,最后定容到1L成分配置(1L)1M Tris 8.0-100x10mL5M Tris 8.0-50x20mL0.5M EDTA-20x50mL10% SDS50mLl

9、小鼠飼養(yǎng)及繁殖期間遇到的問題Q:小鼠合籠后,很久都不懷孕?A:考慮換雌鼠或雄鼠,重新交配Q:小鼠合籠后,雄鼠和雌鼠比例及年齡選擇?A:雄:雌一般1:2或1:3,不要太多雌鼠。雄鼠至少8w,9-10w更為合適;而雌鼠一般選擇6w及以上。Q:什么時候分籠?A:大小鼠的哺乳期是20-22d,3周齡可離乳獨(dú)立生活,因此出生3周后即可將幼鼠與母鼠分開,獨(dú)立生活。視小鼠生長情況,可多哺乳幾天。有時為避免籠盒中同時存在兩胎幼鼠,導(dǎo)致新生的幼鼠被上一胎幼鼠踩踏致死的情況,在19d左右即可將其分籠。分籠時需要標(biāo)記新生小鼠,選擇減腳趾,或打耳釘(耳釘一定要訂的足夠好,否則后續(xù)會被小鼠抓掉)雌鼠4周齡陰腔開張,雄鼠

10、5周齡睪丸降落至陰囊,開始形成精子。因此,4周齡前一定要進(jìn)行分籠,以免發(fā)生交配Q:母鼠吃仔怎么辦?A:1. 雌鼠與雄鼠合籠交配后,雄鼠可以一直與孕鼠一起生活,這樣有利于孕鼠整個妊娠過程的穩(wěn)定以及仔鼠的出生與哺乳。2. 懷孕的雌鼠(一般兩只)一起生活,或?qū)言屑拔磻言械拇剖笤谝黄稹H欢^對不要在雌鼠分娩前幾天再在籠舍中加入新的雌鼠,這樣會打擾到孕鼠以及新生仔鼠;要等仔鼠斷奶(21天)后才能再將雄鼠放入繁殖籠內(nèi)。3. 第一胎分娩或太過于年輕的新手母鼠育成仔鼠的成功率比有經(jīng)驗(yàn)或較為年長的雌鼠要低。仔鼠出生第一天盡量不要打擾母鼠與幼仔,到第二天母鼠就比較能容忍被打擾的狀況了。4. 若一直持續(xù)吃鼠,選

11、擇換孕鼠。Q:如何準(zhǔn)確知道小鼠懷孕天數(shù)?A:傍晚5-6點(diǎn)將雌鼠雄鼠合籠,第二天早晨8點(diǎn)檢查雌鼠是否有陰道栓(下圖所示)。有陰道栓的當(dāng)天中午算為胚胎第0.5天。檢栓后,未見到栓的雌雄鼠分開,至下午再進(jìn)行合籠。不過,觀察到陰道栓只能說明發(fā)生了交配行為,并不能完全作為懷孕的標(biāo)志,見到栓以后仍可能發(fā)生未懷孕的情況。小鼠表型觀測參考點(diǎn):體型差異、毛發(fā)、體重、活動能力,最關(guān)鍵還是要結(jié)合敲除或敲入基因的具體功能常見的肝癌模型1. 誘發(fā)性肝癌模型:DEN, DEN+CCl4,HFD+CD+CCl42. 移植性肝癌模型:異位移植即皮下成瘤,原位移植(肝臟,經(jīng)脾臟)3. 基因敲除鼠(如HBV-TG, PTEN,

12、APC, miR-122肝特異性敲除, Myc肝特異性過表達(dá))4. 高壓尾靜脈HTVI誘發(fā)性肝癌模型Treatment( Intraperitoneal injection)Mouse strainAgePost-Intrasplenic inoculation(#tumor/# total mice)20mg/kg DENC57BL-male12day8month-8.5month 20mg/kg DENC57BL-female12day9month-10month l DENl DEN+CCl420mg/kg DEN, injected at day 12 of C57BL mice.1u

13、l/g of 20% of CCL4 (diluted by Olive), start from week 4 of mice, once a week, for 14-18 weeks (Male-16week, female-17week)移植性肝癌模型l 皮下成瘤subcutaneous tumor formation注意點(diǎn)(1) 腫瘤細(xì)胞系選擇(2) 小鼠品系選擇:Nude, NOD/SCID, NSG(3) 接種部位:腋下、腹股溝、側(cè)腹部及頸背部(血管豐富且易操作部位)操作步驟(1) 腫瘤細(xì)胞的傳代擴(kuò)增確保腫瘤細(xì)胞的活力和良好的生長狀態(tài)(病毒感染可選擇再傳代擴(kuò)增;若siRNA或質(zhì)粒

14、轉(zhuǎn)染處理細(xì)胞不建議傳代擴(kuò)增,質(zhì)粒轉(zhuǎn)染24小時,保證最大效率。siRNA取決于平時做實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn)。)(2)計(jì)算細(xì)胞接種量結(jié)合文獻(xiàn)來確定細(xì)胞接種量,在找不到相關(guān)資料的情況下,最高就用到1000萬/0.1ml,不可再高(因?yàn)榧?xì)胞懸液已達(dá)飽和狀態(tài))。并且提前計(jì)算確定細(xì)胞數(shù)量,一般注射40只小鼠,至少需要準(zhǔn)備50只小鼠的細(xì)胞量。(3)準(zhǔn)備裸鼠一般選擇5-6W裸鼠,小于4W動物可能不耐受而過早死亡,大于6W免疫力會增強(qiáng),不易成瘤;雌雄均可(4)操作步驟 預(yù)準(zhǔn)備:matrigel 4過夜融化,若1人操作可選擇使用呼吸麻醉儀,去鼠房前可考慮打一盒冰和帶上移液器和槍頭,用注射器不好重懸細(xì)胞 接種時選擇好部位進(jìn)針,

15、建議接種前酒精棉球擦拭消毒進(jìn)針位置(實(shí)驗(yàn)室選擇以后腿股); 向前方穿行,注射前針頭稍微動一動,能動說明在皮下,否則可能在皮內(nèi)或者肌肉內(nèi); 針頭在皮下走一段再注射,速度不可太快,一般體積為100-200L(PBS或者無血清培養(yǎng)基稀釋細(xì)胞,若不易成瘤可添加matrigel促進(jìn)成瘤),可看見明顯的鼓包; 接種點(diǎn)離進(jìn)針點(diǎn)盡量較遠(yuǎn),減少漏液和污染的可能; 注射完畢后,緩慢旋轉(zhuǎn)退出針頭(Z字型扭),盡量避免漏液; 細(xì)胞需一直置于冰上,使細(xì)胞處于比較低的代謝狀態(tài),一般2h之內(nèi)不會有問題。(5)后續(xù)實(shí)驗(yàn)安排 分組:一般來說皮下荷瘤主要用于抗腫瘤藥物的檢測,因此我們一般分為對照組,陽性藥物組,低劑量、中劑量及高

16、劑量藥物組等; 數(shù)量:荷瘤時每組不少于10只,考慮到小鼠成瘤率和死亡原因,最終實(shí)驗(yàn)應(yīng)至少可以獲取6個有效數(shù)據(jù); 給藥時間:一般接種7-10天后便可看到腫瘤長起,便可分組實(shí)驗(yàn)(鼠源細(xì)胞系會更快); 人道終點(diǎn):動物倫理學(xué)規(guī)定,小鼠腫瘤重量不可超過小鼠體重10%,平均腫瘤直徑不超過20mm,并且如果出現(xiàn)潰爛,造成感染或壞死時,應(yīng)該中止實(shí)驗(yàn)且對動物施行安樂死。(參考資料:參考劑量和處理時間Cell lineMouse strainAgeHCC formation Huh7 cell (106/flank,100ul PBS+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)

17、5w18day(first), 25day (almost)Huh7 cell (106/flank,100ul DMEM+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)5w14day(first), 20day (almost)HLE cell (5*106/flank,100ul PBS+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)5wHuh7 cell (8*105/flank,100ul PBS+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)5w14day(first)RBE cell (

18、8*105/flank,100ul PBS+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)5w14day(first)HUCCT1 cell (8*105/flank,100ul PBS+ 100ul matrigel )BALB/c nude mice(Male)5w14day(first)Huh7 cell EpCAM+(Top8%) (5*104/flank,100ul DMEM+ 100ul matrigel )Nod SCID(Male)5w20day(first), 25day (almost)Huh7 cell CD133+(Top8%) (5*1

19、04/flank,100ul DMEM+ 100ul matrigel )Nod SCID(Male)5w15day(first), 20day (almost)l 經(jīng)脾臟注射肝癌細(xì)胞Intrasplenic inoculation操作步驟:預(yù)準(zhǔn)備:麻醉劑2%戊巴比妥鈉配置(100ml 0.9%的生理鹽水中含有2g戊巴比妥鈉,用0.22um 過濾器除菌)。加熱墊、止血鉗、prolene線1.腹腔注射麻醉劑(劑量、/kg,如小鼠體重20g,注射100ul)2.將麻醉狀態(tài)的小鼠側(cè)躺(我們的左側(cè)),有毛的老鼠需剃毛。在前肢與后肢中線靠后肢1/3處,用75%酒精棉擦拭,觀察到暗色的脾臟。3.左手用彎頭

20、鑷提起皮膚,右手操作眼科剪(彎頭朝內(nèi))剪開小鼠的皮膚,再用鑷子提起皮膚下的肌肉組織,剪開,此時觀察到鮮紅色的脾臟,用鑷子輕輕將脾臟提出,靠近下緣2mm位置,針面朝上,慢慢推入的已備好劑量的細(xì)胞,可見脾臟被膜腫脹,顏色變稍白。4.脾臟下緣和上緣各有一條血管,中間無組織粘連,此時左手用鑷子夾住這個沒有血管和組織的脾臟,輕輕提起,能明顯觀察到血管,然后用電凝筆,靠近脾臟將連接的血管和有些許胰腺功能的組織切割下來,觀察切割下來的組織血管是否出血(最好用電凝筆再止血)當(dāng)電凝筆不能止血時,立刻用止血鉗夾住出血位置,在貼近止血鉗下方用縫合線結(jié)扎止血(剪線時留,小于2mm線頭)。用鑷子輕輕將脾臟稍微往外拉出,

21、觀察到上緣的血管,同下緣脾臟血管操作。5.用鑷子提起肌肉組織,此時胰腺較容易重回腹腔。左手用鑷子夾住肌肉和皮膚,右手拿縫合針(用離持針器前2mm位置夾住縫合針)穿過一側(cè)皮膚和肌肉,在將另一側(cè)的肌肉和皮肉夾起,縫合針穿透時,打開持針器,左手的鑷子順著針的弧度將針拔出(右手的持針器可輔助穩(wěn)定老鼠)。靠左4-0#絲線繞靠右的持針器一圈,持針器夾住另一端線頭,打結(jié)。同操作打第二個結(jié),剪線。用浸有生理鹽水的棉花,擦拭傷口周圍血漬。6.將小鼠趴臥,再用拇指和食指捏住小鼠頸部皮膚,并輕提,右手持注射器將針頭插到皮下,注射1ml生理鹽水(防止脫水)。如果注射后出現(xiàn)皮膚起包,則注射到了皮內(nèi)。(一般情況下,兩個手

22、指可以感覺到針頭的位置,可以確定針頭是否在皮下)。7.將脾臟注射后的小鼠放置在加溫墊的鼠盒上,以維持其體溫。8.注射后第二天觀察小鼠的行為活動,生命體征。(參考資料:妮婭師姐整理)Cell lineBALB/c nude micePost-Intrasplenic inoculation(#tumor/# total mice)Huh7-ctrl, miR192KO cell (106)Male-4w8w (6/12 outside of liver, 2/12 intra-hepatic)l 肝臟原位注射肝癌細(xì)胞Intrahepatic transplantation 操作步驟(1)用50%

23、基質(zhì)膠重懸細(xì)胞,小鼠(選用Nude mice)106個/20-30ul PBS體系(2)麻醉小鼠:戊巴比妥鈉,麻醉后綁定(可用醫(yī)用膠布)(3)剃毛后沿腹中線切開皮膚,長度3cm左右,露出劍狀軟骨,將切口撐開(4)先用棉簽使用生理鹽水浸潤,然后將肝左葉(最大的一葉)用棉簽挑起(5)緩慢注射20ul細(xì)胞懸液,注射后停留5s,旋轉(zhuǎn)退出針頭,避免細(xì)胞回流。注射成功后在肝臟部位一般能看見白色突起(6)注射完畢后消毒腹腔,然后縫合傷口(參考資料:Nat Protoc. 2015 Aug;10(8):1264-74.)參考劑量:Cell lineC57BLPost-Intrasplenic inoculat

24、ion(#tumor/# total mice)Huh7-ctrl, miR192KO cell (106cell/30ul PBS)Male-4w1month 無肉眼可見結(jié)節(jié)高壓尾靜脈HTVIl Sleeping beauty system注意點(diǎn)(1) Plasmid of SB: plasmid of gene X=1:10 1:25(2) Time for injection: 5-9 seconds(3) Buffer: salin (10% mice body weight)(4) 選用小鼠最好一批出生,要設(shè)置的對照和實(shí)驗(yàn)組同一天注射操作步驟預(yù)準(zhǔn)備:所用溶劑可為生理鹽水或Ringer

25、s buffer(1L溶液中含0.42g KCl, 9.00g NaCl, 0.24g CaCl2,0.2g NaHCO3)1. 將小鼠固定,用呼吸麻醉儀持續(xù)讓小鼠吸入異氟烷2. 用熱水浸濕紙巾捂熱小鼠尾巴,使靜脈擴(kuò)張,緊靠白色尾骨兩側(cè)有清晰可見的2根紅色靜脈3. 用左手的食指、中指、無名指及大拇指將小鼠尾巴固定。手法:握住1ml注射器前面0.1mL處,右手小指搭在拽著鼠尾的左手拇指處,按此手形進(jìn)針4. 注射時左手扯尾,使尾巴緊貼桌面,一般選擇距尾尖1/4或1/3處進(jìn)針,此處皮膚較薄,血管清晰,進(jìn)針容易。將欲注射的鼠尾用左手緊緊壓在桌面上,右手進(jìn)針時針頭與桌面平行,針尖稍稍朝下,一旦進(jìn)入,將針

26、頭稍稍上挑進(jìn)入,針頭沿血管進(jìn)入,肉眼可觀察到針頭前進(jìn)。如果針頭在血管中前進(jìn),可明顯地感覺到針行通暢,毫無阻力。若針頭不在血管中,手感針行有阻力。進(jìn)針時不要太深,針頭入皮膚后馬上把針頭略往上,平行進(jìn)針,針扎入時有落空感,推液時無阻力則說明成功了。如果推液阻力較大,甚至注射處出現(xiàn)滲液,則說明不在靜脈內(nèi),需要重新調(diào)整注射。5. 注射結(jié)束后,用醫(yī)用棉花止血。可能會出現(xiàn)小鼠心跳驟停,采用擠按心臟部位復(fù)蘇,密切觀察。注射成功特點(diǎn):注射到靜脈的推液幾乎沒有阻力,可快速將液體推完。如果注射到靜脈以外,強(qiáng)行推液,阻力較大,注射處周圍會出現(xiàn)露水樣滲液,而且出針后,出血較少。并且由于藥液瘀阻在尾部,導(dǎo)致血流不暢,尾

27、部缺血,易導(dǎo)致尾部炎癥和壞死。參考劑量Gene XC57BL mouseAgesplasmidPost-injection(#tumor/# total mice)c-mycMale-4w20ug c-Myc/pT3EF1a + 2ug SB in 1.5mL8w (1/6), 12w (1/8)cmyc+MCLIMale-7w2ugMyc/pT3EF1a+2ugMCLI/pT3EF1a+0.3ug SB8w (no nodule)NRasV12+myr-AKTMale-4w5ug Ras/pT3EF1a +5ug Akt/pT3EF1a +0.67ug SB in 1.5mL5w (5/5)

28、NRasV12+myr-AKTMale-6w1.5ug Ras/pT3EF1a +1.5ug Akt/pT3EF1a +0.2ug SB in 2mL8w (small nodule)Gene XFVB/N mouseAgesplasmidPost-injection(#tumor/# total mice)c-mycMale-4w20ug c-Myc/pT3EF1a + 2ug SB in 1.5mL8w (1/6), 12w (1/8)NRasV12+myr-AKTMale-4w5ug Ras/pT3EF1a +5ug Akt/pT3EF1a +0.67ug SB in 1.5mL5w (

29、5/5)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)部交流問題和解答1. 當(dāng) DNA 分子上存在兩個方向相反的 loxP 序列時,Cre 可導(dǎo)致 loxP 之間的序列發(fā)生反轉(zhuǎn),那么序列反轉(zhuǎn)的后果是什么呢?如果是讓這段序列失去功能的話,也相當(dāng)于敲除嗎?解答:序列反轉(zhuǎn)指的是目標(biāo)序列的倒位,的確失去功能,但應(yīng)該不算敲除,因?yàn)槟且欢尾恢罆l(fā)生什么作用。2. 兩個loxp之間基因的大小如果會影響敲除效率,那么基因大小的可能極限是?解答:現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)兩個因素會影響Cre-lox重組的效率。第一個因素是lox序列中不對稱區(qū)段的堿基序列。第二個影響因素是一對lox序列之間floxed序列的長度,Cre-lox重組的效率隨著其長度的增大而降低,或許

30、是因?yàn)榉磻?yīng)動力學(xué)的影響。根據(jù)這篇文獻(xiàn),(PLoS One. 2009; 4(1): e4200)建議最長為13kb。且Cre重組酶在不同物種或者同一物種的不同類型細(xì)胞或組織中介導(dǎo)lox位點(diǎn)發(fā)生重組的效率差異較大, 目前對導(dǎo)致這種現(xiàn)象產(chǎn)生的內(nèi)在機(jī)理不清楚, 有文獻(xiàn)推測這可能是由于Cre重組酶對處于不同類型細(xì)胞和不同發(fā)育時期的染色質(zhì)中l(wèi)ox位點(diǎn)的識別能力不同所致。(參考資料:維基百科)3. Cre鼠不能鑒定純合雜合的原因?解答:判斷小鼠是否為cre,用PCR判斷只能說有這個酶,有可能是cre+/+,cre+/-,然后用同為cre陽性的2個鼠去雜交,如果后代一直穩(wěn)定為cre,則上述2只大概率為cre

31、+/+。4. Cre酶可以發(fā)揮效應(yīng)去切割loxp的是嗎?然后切割完loxp兩側(cè)的序列還是連接上的嗎?解答:Cre 酶作用后,切除部分為兩個同向Loxp位點(diǎn)中間的部分和其中一個Loxp位點(diǎn),在DNA酶的作用下發(fā)生環(huán)化,剩下部分相連。5. 當(dāng)兩個loxp位點(diǎn)方向相同的時候Cre可將兩個loxP 序列之間的DNA 片段切出并環(huán)化,那環(huán)化的這個片段會對小鼠有影響嗎?解答:留下那段環(huán)化的loxp序列,因?yàn)轶w內(nèi)有DNA酶,不受保護(hù),會被降解掉,對體內(nèi)不會有太大影響。6. 如果需要檢cre的敲除效果,一般取的是什么組織呢?能和基因型鑒定一樣用鼠尾嗎?解答:檢測Cre的敲檢效率需使用條件性敲除的臟器組織(如我

32、們實(shí)驗(yàn)室使用的是肝臟)。一般在最初建立品系時會檢測一次,從蛋白和RNA的水平(如果是miRNA只能是RNA水平),確定確實(shí)已經(jīng)敲除。在完成實(shí)驗(yàn)小鼠死亡后,再次取肝臟組織鑒定敲除效率。如果是全身性敲除的話,鼠尾鑒定是可以從基因組上看出來的,那一段是缺失的。7. 親本可用Cre,loxp純陽性替代嗎?解答:cre是雜合或純和都會顯示cre陽性,而loxp最早公司提供給你的就是loxp+/-,等后續(xù)拿到純和,需要大批量實(shí)驗(yàn)組的時候,可以采取均純陽性。但推薦有雜合的繼續(xù)進(jìn)行繁殖。8. 鼠尾基因型鑒定一般進(jìn)行幾次?解答:鼠尾基因型鑒定一般在小鼠分籠時和小鼠死亡后各做一次。9. 實(shí)驗(yàn)室所用NASH的模型解

33、答:DEN+HFCD,12天DEN 20mg/kg, HFCD三周開始喂食,27周有小結(jié)節(jié)形成。10. 如果是質(zhì)粒或siRNA處理細(xì)胞去做皮下成瘤,一般細(xì)胞處理多久呢?會取一部分再做個鑒定嗎,比如有沒有過表達(dá)或者敲減?解答:留一部分細(xì)胞做檢驗(yàn),質(zhì)粒轉(zhuǎn)染24小時,保證最大效率。siRNA取決于平時做實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn),若24h有效果即可收細(xì)胞皮下注射。病毒加足夠量確保過表達(dá)或敲減,可以再細(xì)胞傳代的。11. 選擇皮下成瘤的細(xì)胞系?解答:常見有HepG2SMMC-7721Huh7Hep3BHCCLM3。不推薦HepG2,需要劑量太大且細(xì)胞堆疊生長。12. 皮下注射、肝臟原位注射、脾臟注射產(chǎn)生的腫瘤有什么區(qū)別?該怎樣判斷應(yīng)該選擇哪一種注射方式進(jìn)行實(shí)驗(yàn)?解答:皮下成瘤的優(yōu)點(diǎn):成瘤率高,周期短,腫瘤的大小和位置較易控制,個體差異小,另外,對宿主的影響類似,易于客觀判斷療效。缺點(diǎn):缺乏腫瘤微環(huán)境的影響,該模型不能很準(zhǔn)確模擬腫瘤細(xì)胞在體內(nèi)生長。原位移植(經(jīng)脾臟或肝臟原位注射)的優(yōu)點(diǎn):原位生長能更好的模擬腫瘤細(xì)胞在體內(nèi)生長的微環(huán)境,藥物療效預(yù)測更加精準(zhǔn)。缺點(diǎn):外科移植手術(shù)程序

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