英語多生物芯片技術第一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日教學要求掌握：1基因芯片的設計原理和基本方法

2各種芯片的使用及意義了解：1各種芯片的分類特點

2基因芯片的操作及結果分析第二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日FoodtestingLivestockdiagnosticsorgradingAgriculturalbiotechHumandiagnosticsEnvironmentaltestingBasicResearchIdentitytestingPersonalizedmedicineDrivingtheGeneticRevolution第三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基本概念基因gene基因組genome

生物單體中一套完整的遺傳物質,即全部基因結構基因非編碼基因,一般不顯示功能功能基因編碼基因,產生功能蛋白第四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日人類基因組

30億堿級對組成；共編碼約3.5萬基因。cDNA

是基因轉錄過程mRNA的互補DNA，代表了基因的生物學信息。ESTexpressedsequencetag

表達序列標簽,是長度為300—500bp的cDNA片段。用于克隆全長基因;制備基因表達譜。SNPsinglenucleotidepolymorphicallele

單核苷酸多態性等位基因。

第五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日芯片的基本概念生物芯片

主要指通過平面微細加工技術，在固體芯片表面構建的微流體分析單元和系統，以實現對細胞、蛋白質、核酸以及其它生物組分的準確、快速、大信息量的檢測。基因芯片

技術是通過微陣列技術,將高密度DNA片段陣列通過高速機器人，以一定的順序或排列方式使其附著在如玻璃片等固相表面，以熒光標記的DNA探針，借助堿基互補雜交原理，進行大量的基因表達及監測等方面研究的最新革命性技術。微陣列技術

微陣列技術巨大優勢在于它可以并行地宏量獲取生物信息，借助此技術發展的生物芯片，則提供了以核酸雜交為基礎的基因水平的表達監控，多態性研究和基因分型。從而使我們對基因表達調控有更深入的了解。

第六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日微陣列芯片（Microarray）微型實驗室芯片(Lab-on-a-chip)液體芯片(Liquichip)生物芯片分類基因芯片蛋白芯片組織芯片第七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日什么是組織芯片？定義：將數十個、數百個乃至上千個小的組織片整齊地排列在載體上（通常是載玻片）而成的微縮組織切片,它是一種高通量、多樣本的分析工具。第八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日何謂蛋白芯片？蛋白芯片：將多種蛋白質以微陣列的形式固定在固相或液相支持物上，在孵育反應中與樣品中靶分子的結合，并用報告分子檢測結合信號。抗體芯片：將不同抗體按照類似基因芯片的方法點陣在特定的片基上，通過抗原抗體結合來對檢測樣品中的蛋白作定性和定量分析。

作用：可以在一次實驗中比較生物樣品中成百上千的蛋白質的相對豐度第九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日RNA蛋白質轉錄翻譯細胞表型生物表型復制逆轉錄

(病毒中)Oligo芯片,CpG-島芯片，CGHcDNA芯片Oligo芯片蛋白芯片組織芯片芯片技術的應用

？ ？ ？ ？1.SNPs2.拷貝數3.DNA修飾1.開/閉2.拷貝數3.剪接分析1.酶分析2.拷貝數3.蛋白修飾1.細胞形態2.細胞功能3.細胞生長PCR-測序SouthernblotFISHNorthernblotRT-PCRRNase保護WesternblotELISA質譜分析組織培養組織學免疫組織學生物學中心法則—

分子生物學的基本原理DNA第十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因芯片發展歷史Southern&NorthernBlotDotBlotMacroarrayMicroarray第十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因芯片分類按功能劃分基因組芯片

檢測某一基因是否存在，若存在，拷貝數是多少。探針是DNA.

表達譜芯片

確定基因表達的途徑與表達產物。探針是RNA或cDNA。測序芯片

通過探針與微陣列的配對分析獲得探針的序列結果。按探針類型劃分cDNA芯片：幾百到上千個堿基Oligo芯片:25mer(affymetrix)；70mer(Operon)；80mer（Clontech）

第十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日用GeneChip作為主要研究手段

發表在國際雜志的研究論文第十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因芯片研究的總體方案圖象掃描/結果分析雜交/洗滌芯片標記好的樣品點樣（針點或噴點）探針標準化Oligo探針合成Oligo探針序列確定基因組序列分析組織樣品目的細胞總RNA提取cDNAmRNA基因文庫構建目的基因擴增PCR產物純化第十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日TheProcessCellsPoly-ARNAAAAAcDNALLLLIVT10%Biotin-labeledUracilAntisensecRNALFragment(heat,Mg2+)LabeledfragmentsHybridizeWash/stainScanL第十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日GenechipsforgenesexpressionanalysisStandardeukaryoticgeneexpressionassay.ThebasicconceptbehindtheuseofGeneChiparraysforgeneexpressionissimple:labeledcDNAorcRNAtargetsderivedfromthemRNAofanexperimentalsamplearehybridizedtonucleicacidprobesattachedtothesolidsupport.BymonitoringtheamountoflabelassociatedwitheachDNAlocation,itispossibletoinfertheabundanceofeachmRNAspeciesrepresented.Althoughhybridizationhasbeenusedfordecadestodetectandquantifynucleicacids,thecombinationoftheminiaturizationofthetechnologyandthelargeandgrowingamountsofsequenceinformation,haveenormouslyexpandedthescaleatwhichgeneexpressioncanbestudied.Formoredetailedinformation,reviewtheGeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual.

第十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日TheResultAlightsourcescansthearray,causingthedyestofluoresceTheglowispickedupbyasensorandisusedtodeterminetherelativeabundanceoftheRNAThisinformationmustbeprocessedtodeterminethelevelofactivityforeachexpressedgene第十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（一）探針設計與合成探針標準化Oligo探針合成Oligo探針序列確定基因組序列分析基因文庫構建目的基因擴增PCR產物純化cDNA探針Oligo探針第十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日探針設計的要求高度特異性較高靈敏度第十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日cDNA探針的缺點由于不同的基因長短不同，Tm值各異，成千上萬的基因在同一張芯片上雜交，使得雜交條件很難同一。同一個體中總是存在一些基因家族的同源序列，加上有的物種存在基因重疊序列的相互干擾，使得傳統的cDNA芯片的分辨能力受到限制，結果的準確性也受到影響。有些組織中在DNA雙鏈中的無意義鏈中存在重疊的基因；而且不同RNA的剪切方式等基因表達方式很難用cDNA芯片來區分。PCR產物是結合穩定的DNA雙鏈，加入探針后在雜交中必然存在競爭性抑制，影響探針和模板的結合能力和穩定性，進一步影響cDNA芯片的分辨能力和結果的可信度，這對于低豐度的基因影響尤為明顯。PCR產物濃度不均一也可能導致錯誤的結論。

第二十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日cDNA探針無法區別同源基因基因1基因2基因3基因1cDNA探針基因2cDNA探針基因3cDNA探針第二十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日cDNA探針空間結構影響雜交效率SignalIntensity021QuantitativeNoReproducibleNo第二十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日寡核苷酸探針比cDNA探針的優點探針序列經過系統優化，減少非特異雜交，能有效區分有同源序列的基因；減少二級結構及其對雜交結果的影響

雜交溫度均一，提高雜交效率

；合成產物濃度均一，避免因樣品濃度差異而造成點樣量差異；可以設計檢測不同剪切方式的基因；

無需擴增，防止擴增失敗影響實驗。第二十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日單個長片段Oligo探針全長基因序列Oligo探針5′3′單點或重復第二十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日GeneChip表達譜探針設計原理全長基因序列多段探針完全匹配不完全匹配5′3′第二十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日多段寡核苷酸探針基因1基因2基因3基因2多段OLIGO探針基因3多段OLIGO探針基因1多段OLIGO探針第二十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日探針長度與特異性和靈敏度第二十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日PerfectMatchPMMMMismatchPM-MM探針設計Oligo探針第二十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日ExcellentDiscriminationofMismatchBaseSequenceATCGGTAGCCATGCATGAGTTACTAATCGGTAGCCATCCATGAGTTACTA13MisMatchBase第二十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日PM-MM設計作用

---有效的扣除掉芯片上面的背景其他的基因芯片只是用片基上空白處的雜交信號作為背景扣除，空白背景?水背景?核苷酸背景與這條MM探針結合的信號里面有一部分就是背景信號，在實際計算每一點的實際的信號值時，這些信號將被去除，最終獲得準確的數據并有利于在低豐度基因表達的準確定量。第三十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日PM-MMProbePairsOfferHighSensitivityDiscriminateagainstbackgroundsignalsIncreasingsensitivityatlowtargetconcentrations第三十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日探針特點總結cDNA探針特異性最差；檢出限最低，但并非真實靈敏度單個長的Oligo探針保證較好的特異性和靈敏度，是不得已的折中路線；多個Oligo探針：

25bp探針保證最高特異性多段探針保證最高的靈敏度

PM-MM探針設計有效扣除假陽性第三十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（二）樣品制備與標記標記好的樣品組織樣品目的細胞總RNA提取cDNAmRNA標記物標記方法熒光素放射性同位素金屬粒子反轉錄標記PCR標記隨機引物標記第三十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日樣品制備與標記的質控TEST芯片監控RNA提取及反轉錄的完整性監控RNA提取及反轉錄的靈敏度監控系統操作的靈敏度第三十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日標記方法的區別雙色標記：Cy3,Cy5標記效率不同，相同的雜交探針不同的熒光信號，不能進行直接比較，必須進行反標記校正。單色標記：標記效率相同，信號值可直接進行比較。第三十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（三）生物芯片制作技術第三十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日生物芯片制作方法分類探針固定方式片基特點原位合成（in-situsynthesis）剛性片基，如玻璃片、半導體硅片等高密度，探針合成均一；可制作全基因組芯片，并允許進行復雜的探針設計合成后點樣(off-chipsynthesis)剛性片基，如玻璃片、半導體硅片等薄膜片基，如NC膜、Nylon膜等低密度，CV值高；芯片基因數目少，不允許進行復雜的探針設計，直接導致假陽性率高第三十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日原位合成(InSituSynthesis)壓電打印原位合成分子印章原位合成原位光刻合成第三十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日FabricationFabricationviaPrintingDNAsequencestucktoglasssubstrateDNAsolutionpre-synthesizedinthelabFabricationInSitu

Sequence“built”Photolithographictechniquesuselighttoreleasecappingchemicals365nmlightallows20-mresolution第三十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日原位光刻合成

美國著名的Affymetrix公司率先開發的寡聚核苷酸原位光刻專利技術，是生產高密度寡核苷酸基因芯片的核心關鍵技術。

優點：合成效率高，點陣密度高缺點：設備昂貴，技術復雜第四十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日

原位光刻合成原理Lightdirectedoligonucleotidesynthesis.Asolidsupportisderivatizedwithacovalentlinkermoleculeterminatedwithaphotolabileprotectinggroup.Lightisdirectedthroughamasktodeprotectandactivateselectedsites,andprotectednucleotidescoupletotheactivatedsites.Theprocessisrepeated,activatingdifferentsetsofsitesandcouplingdifferentbasesallowingarbitraryDNAprobestobeconstructedateachsite.第四十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日 AffymetrixusesauniquecombinationofphotolithographyandcombinatorialchemistrytomanufactureGeneChip?Arrays.

第四十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日GeneChipsProbeArrays***************QuantitativeYesReproducibleYes

第四十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（四）、雜交/洗滌技術雜交技術的關鍵在于使雜交洗滌條件的標準化、均一化方法蓋玻片雜交盒全自動雜交洗滌工作站第四十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（五）基因芯片檢測技術非共聚焦激光掃描儀激光共聚焦掃描儀第四十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因組芯片

在臨床研究領域的應用第四十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日

EukaryoticCellDNARNAGenotypingandGeneExpressionMonitoringGenotyping:IsitAorB?GeneExpression:Whichgenes?Howmuch?第四十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（一）人類全基因組分析第四十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第四十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日HuSNPApplicationsLinkageStudies(確定疾病相關基因在染色體的位置)humanfamiliallinkagestudiestomapdisease-associatedgenestospecificchromosomallocationsLOH(LossofHeterozygosity,雜合子缺失研究以確定癌細胞中染色體缺失的位置和程度)comparethequantitativerepresentationofallelesforsamplesobtainedfromnormaltissuetothoseobtainedfromtumortissuetodeterminethelocationandextentofchromosomallossintumorcells揭示個體間差異的遺傳基礎第五十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日美國、加拿大、英國和歐洲其他國家超過50個研究中心組成科學研究小組170多位專家，利用Affymetrix研發SNP新技術，掃描1500個有自閉癥孩子家庭基因與自閉癥之間可能存在的聯系overfifteenpublicationsinlessthantheyearsinceitslaunch，MappingArraysforapplicationsincludinglinkageanalysis,populationgenetics,andchromosomalcopynumberchangesduringcancerprogression第五十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日SNPGenotypingUsingMolecularInversionProbesTheSNPgenotypingprocessusingmolecularinversionprobesisoutlineddiagrammaticallyinbelow.10,000multiplexMIPassaydetectedonTagMicroarray

第五十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日Allelicimbalanceanalysisbyhigh-densitysinglenucleotidepolymorphicallele(SNP)arraywithwholegenomeamplifiedDNAosteosarcomatissuesvspatient-matchedbloodNucleicAcidsResearch,Vol.32No.9

OxfordUniversityPress2004;應用實例1第五十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日CopynumberofindividualSNPsinchromosome6detectedfromcaseOST1976q12--13have5-to20-foldamplificationbyreferencedataconsistentwithCGHresult第五十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日Significancegraphofdetectingcopynumberchanges.Anexampleforchromosome6ofOST197lossof6q14-q27gainat6q12—13confirmedbyCGH第五十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日SNPlociat6q12-13arewithinaregionofLOHbutalsohavesignificantincreaseincopynumber.TheincreaseincopynumberinaLOHregionmaysuggestthelossofanallelefollowedbyamplificationoftheremainingallele.---TheabilitytomakesuchaninferenceisoneoftheadvantagesofSNParrayoverothermicroarray-basedmethodssuchastheuseofcDNAandBACforallelicimbalanceanalysis.SNPArrayAdvantage第五十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第五十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日TraditionalMethodinLOHDetectionRestrictionFragmentLengthPolymorphism(RFLP)Microsatellitemarkers第五十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第五十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（二）表達譜芯片在臨床研究中的應用第六十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日表達譜基因芯片

表達譜基因芯片通俗地講是指用于基因功能研究的一種基因芯片。研究基因在不同組織或細胞、不同發育階段中基因表達的改變，進而闡明基因的功能。第六十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日應用表達譜芯片的意義表達譜基因芯片可以快速、有效地幫你尋找到與您研究領域相關的靶基因。在人類10萬種基因中，目前已研究過的基因僅2000-3000種，絕大部分基因尚處于待研究階段，通過基因芯片您可以獲得最多待研究基因。通過對大量未知基因的研究，您可以獲得更多的基因功能專利，而專利就是財富。第六十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日表達基因芯片檢測示意圖第六十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日GeneLogicGeneExpress?databasesuite?BioExpress?研究人和動物正常組織和病變組織基因表達規律,揭示疾病發生分子機制,包括了解生理病理過程涉及的分子的相互關系?ToxExpress?研究各種毒素引發的基因表達規律,篩選合適的毒理標志分子,評估藥物毒理作用,比經典的臨床前安全測試方法(臨床化學和組織病理學等)更有效?PharmExpress?研究典型藥物藥理作用的分子機制第六十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日表達譜基因芯片檢測原理用不同的熒光染料通過逆轉錄反應將不同組織或細胞的mRNA分別標記成不同的探針，將探針混合后與芯片上的基因進行雜交、洗滌，用特有的熒光波長掃描芯片，得到這些基因在不同組織或細胞中的表達譜圖片，再通過計算機分析出這些基因在不同組織中表達差異的重要信息。第六十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日ClinicalTrialsProcessFlow-Expression第六十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因芯片技術在藥物篩選中的應用第六十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日TargetIdentificationPharmaceuticalChallengeSolvecomplex,multifactorialdiseasessuchascardiovascular,neurodegenerative,andcancerFindnoveltargetsforhigh-valuetherapeuticproductsGeneChipSolutionGlobaltranscriptomeanalysisispossiblythebestwaytounravelcomplexdiseaseGenome-wide,high-densityassociationstudieswillallowthedeterminationofgeneticbasisofdiseasesusceptibilityTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第六十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日CompoundScreeningPharmaceuticalChallengeDeterminethenumeratoranddenominatorofthetherapeuticindexatanearlierpointinthediscoveryprocessPrioritizecompoundssoonerinthescreeningprocessGeneChipSolutionBuildrobustdatabasestocharacterizeindexesofgenesthatcanbecorrelatedwithefficacyandtoxicityPerforminformation-richscreeningusingautomated,

high-throughputgeneexpressionanalysissystemTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第六十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日PreclinicalandClinicalTrialsPharmaceuticalChallengeFaster,moreeffectivetrialsthataremorepredictiveofhumantrials(preclinical)andclinicaloutcomes(clinical)GeneticandgenomicinformationthatmeetsregulatoryrequirementsGeneChipSolutionHighestqualityproductsthatdeliverreproducibleresultsCustomdesigncapabilitiesallowselectionandcost-effectivescreeningofspecificgenesofinterestCommitmenttounderstandingandmeetingregulatoryrequirementsTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第七十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日

寡核苷酸微陣列對正常結腸、結腸腺瘤、結腸腺癌的基因表達譜分析實例2第七十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第七十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日用基因表達和聚類分析的方法能否鑒別良性和惡性腫瘤進一步研究正常組織病變成腺癌的過程中基因表達

研究目的第七十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日實驗設計

腫瘤組織腺瘤或腺癌患者正常組織切片腺瘤或腺癌組織切片正常組織第七十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日疾病發展過程

正常

結腸腺瘤

結腸腺癌表達譜比較正常22腺瘤4腺癌18第七十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日芯片統計分析統計分析統計學軟件Statistica（Stat-Soft.Tulsa.OK）聚類分析Cluster20.2進行聚類Treeview1.45瀏覽分析結果圖第七十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第七十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日第七十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日一些基因的表達經半定量RT-PCR進一步證實epithelialtissuewasgrosslydissectedfreeofunderlyingstromalandmuscularelements

第七十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日在腺瘤與腺癌中均過量表達的產物Mr100,000coactivator(by11-fold)BIGH3(8.9-fold)ckshs2(2.7-fold)MGSA(2.1-fold)matrilysin(3.0-fold).

在腺瘤與腺癌中均下調表達的產物:Thecolonicepithelialcellproduct,guanylin(111-fold),down-regulatedinadenocarcinoma(40-fold)hevin(7.2-fold).結腸腺瘤與結腸腺癌相比第八十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日正常組織結腸腺癌結腸腺瘤聚類分析第八十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日腺癌與正常組織或腺瘤相比正常組織與腺癌或腺瘤相比腺瘤與正常組織或腺癌相比正常組織結腸腺癌結腸腺瘤第八十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日聚類分析結果

這組基因在腺瘤組織中高水平表達，比腺癌或正常組織中的表達都更活躍。包括幾個轉錄因子（其中一些可能為癌基因,XBP-1、SSRP1、ETS-2、SOX9）、核糖體蛋白（S29和S9）、一個凋亡誘導因子（NBK）和一個剪切因子（SRp30c）推測這些基因很可能在腺瘤向腺癌轉化的早期起一定的作用。基因簇1－第八十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日這個基因簇在腺癌中特定高水平表達包括許多在結腸瘤(colorectalneoplasia)中高表達的已知基因產物，如Ckshs2、MGSA、matrilysin和一些與代謝率和繁殖相關的基因。基因簇2－第八十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日這組基因在正常組織中高水平表達，這些基因(guanylin,colonmucosaantigen)，在結腸瘤組織(colorectalneoplasms)中的表達是抑制的。這些基因還包括平滑肌和結締組織相關基因。基因簇3－第八十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日用寡核苷酸微陣列技術可鑒定出在腺瘤向腺癌轉化過程中起一定作用的基因進一步確認已知表達發生變化的基因，在腫瘤轉移過程中表達發生改變證明用基因表達譜可區分正常組織表型上十分相似的結腸腺瘤和腺癌結論第八十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日Clusterdiagramofgeneexpressionprofilesof29pediatricALLsamplesBonemarrowaspiratesfrompediatricpatientswithacutelymphoblasticleukemia

Theresearchersdevelopednewalgorithmstoanalyzethegeneexpressiondataandclassifypatientsdependingontheirriskforfailingtherapy.Thenumberofgenesrequiredforclassifyingpatientsvariedamongthesubtypes.Asinglegenewassufficienttoachieve100percentaccuracyfortwoALLsubtypes.第八十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日MovingtotheClinicClassifyingAML,ALLandMLL

LungCancerClassificationColonCancerClassificationsPrognosisforPediatricALLArmstrong,S.A.,etal.NatureGenetics30:41-47,2002Affymetrix,Inc.–nonpublisheddataBhattacharjeeetal.PNAS

98(24),

13790-5,

2001Ross,M.E.etal.Blood

102,

2951-9,

2003

第八十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（三）組織芯片

在臨床研究領域的應用表達譜分析結果的快速高通量后續驗證第八十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日

蛋白AAAAARNA抗體DNA基因組水平表達水平蛋白質水平組織芯片－靈活的研究工具第九十頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日組織芯片的優點可提高實驗效率，減少實驗誤差高效、快速、低消耗、自身內對照和可比性強應用范圍廣形態學觀察，免疫組織化學染色、原位雜交(FISH)、原位PCR(MSP-ISH)和各種原位組織、細胞學的觀察和研究第九十一頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日組織芯片的研究意義1.實現高通量的組織樣本研究第九十二頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日HumanMolecularGenetics,2001,Vol.10,No.7組織芯片的研究意義檢測特定基因或蛋白在不同組織中的表達變化第九十三頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日基因芯片腎癌細胞系5184種cDNA89種差異表達的基因編碼Vimentin基因組織芯片和基因芯片技術結合在腫瘤生物學的研究應用實例組織芯片技術和免疫組化532例腎癌組織中Vimentin的表達51％透明細胞癌61％乳頭狀癌出現陽性表達僅在4％的腎臟嫌色細胞癌和12％的嗜酸細胞癌中出現陽性表達Vimentin與患者預后密切相關，而與腫瘤的分期、分級無關MochH.etal..AmJPathology,1999,154:981-986.第九十四頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日BubendorfLetal.,1999,CancerResMar15;59(6):1388組織芯片和FISH技術結合在腫瘤生物學的研究應用實例第九十五頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日（四）蛋白質芯片

在臨床研究領域的應用功能驗證及臨床應用第九十六頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日臨床應用的芯片分類按照反應類型：

抗原-抗體芯片受體-配基芯片酶-底物芯片按照芯片的用途

蛋白質組芯片臨床檢測芯片藥物篩選芯片代謝工程芯片第九十七頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日蛋白質芯片（ProteinChip）蛋白分析技術高通量微型化自動化多樣化第九十八頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日蛋白功能芯片蛋白檢測芯片蛋白質芯片的類型第九十九頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日蛋白質芯片的類型

蛋白質微陣列三維凝膠塊芯片微孔板蛋白質芯片第一百頁，共一百一十一頁，2022年，8月28日蛋白芯