I.中性演化論 1一 自然界中的遺傳變自然選擇的基礎：遺傳變異

2 突變：單3 Dobzhansky的果蠅實驗（1938-1940年） 4 Watson&CrickDNA雙螺旋結構（double5 G6組(一般 中的

最終形成7

舉例：編碼蛋白質

搬運 RNA上的三聯 相應的氨基 豌豆天冬氨酸氨基轉移酶（AAT）的多態AATAAT AAT2與AAT3： MotooKimura（11.13.1924–假設一個哺乳動物有個獨立分離的loci，2alleles/locus；雜合子有選擇優勢，純合子的選擇系數（s）為 若要維持原來種群的大小，每 結論：不可能！ 變率和遺傳漂變(geneticdrift)而定。1968年Kimura Evolutionaryrateatthemolecularlevel.Nature(1968)217:624-中性理論中sutrs= 基本的公式：p2+2pq+q2= 0,selected 0,selectNearly|s|

1/（2Ne），或|s|定義：一個種群中能將其連續傳遞到下一代的平均數。實際上相當于理想狀態下(種群大小穩定，世代之間沒有，所有個人以相同的 Ne=4NmNf/Nm:雄 Nf:雌 （Elaphurusdavidianus原產亞洲東部，1898年僅剩18 (江蘇省大豐市：N=819/Ne=50)種群恢復很快，2003年從國際“紅皮書”中“除名”從“瀕 群（7只）kN:population中的 每代Population中新的突變=u：單個突變在Population每代被固定在Population中的中性突變的概率=因此，當skv)(1/2N）v，與Population三 中性或近中性突變，隨機選擇（遺傳漂變承認負選擇（negativeselection) King&Science(1969)164:788- 兼并性Neutral偏愛性——水 NaturalselectionTomokoOhta（太田朋子,1933-NearlyNeutralTheoryofEvolution 提出了一個slightlydeleteriousmodel，Slightlydeleteriousmutantsubstitutionsinevolution.Nature(1973)246:96-五.分子演化的主要研究

DNA、RNA、蛋白質分長短（核苷酸和氨基酸的數目序列（核苷酸和氨基酸的排列順序),MERPWKCCDNI

一致性（identity）相似性（Similarity） 或蛋白質的序列一致性或相似性很鐘南山 并系同源paralogous：由

直系同 a2,a2,a3,a4,a2’,a2’,a4’,

a2

a2’,a4’,a2’,a4’,a2,a3,a4,物種 物種中性演化理 分子演化的一些術語：相似性，同源性（直系、并系MotooKimura，1983，TheNeutralTheoryofMolecularEvolution,CambridgeUniversityPressWen-HsiungLi,1997,MolecularEvolution,SinauerAssociatesInc.,，OhtaT,2010,