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文檔簡介
1、實驗十七 單細胞凝膠電泳技術丁書茂單細胞凝膠電泳技術丁書茂1ppt課件實驗十七 單細胞凝膠電泳技術丁書茂1ppt課件單細胞凝膠電泳技術(single cell gel electrophoresis, SCGE) ,也稱彗星試驗(comet assay) ,是Ostling O和Johanson KJ首次提出,后經Singh等進一步完善的一種在單個細胞水平上檢測DNA損傷、交聯和修復的方法。因其簡單、靈敏、低耗、快速等優點而廣泛應用于生物檢測、遺傳毒理、流行病學調查等諸多方面。2ppt課件單細胞凝膠電泳技術(single cell gel elec一、實驗原理DNA鏈多為磷酸復合物,在生理條件
2、下DNA的多聚核酸鏈多呈陰離子狀態,當外源性因素(如紫外照射)造成DNA鏈斷裂時,負超螺旋結構變得松散,那么在電場作用下DNA就會以一定速率向正極移動。在細胞裂解液作用下,細胞膜、核膜等結構受到破壞,胞內蛋白質、RNA及其它成分均擴散到溶液中,而核DNA由于分子量大而只能留在原位。3ppt課件一、實驗原理DNA鏈多為磷酸復合物,在生理條件下DNA的多聚經堿處理和在堿性電解質的作用后,DNA解旋,損傷的DNA斷鏈及其片段會被釋放出來,而在電泳條件下, DNA片段可進入凝膠孔隙發生遷移。由于這些DNA分子量很小,所以在電泳過程中會離開核DNA向正極移動,形成彗星狀的圖像。在一定條件下,DNA遷移距
3、離和DNA含量分布與DNA損傷程度呈線性相關。隨著DNA損傷程度加劇,斷片數目增加,表現為尾部DNA含量增加,彗尾延長,熒光強度加強。4ppt課件經堿處理和在堿性電解質的作用后,DNA解旋,損傷的DNA斷鏈二、實驗流程采用堿性SCGE,其基本操作過程包括:5ppt課件二、實驗流程采用堿性SCGE,其基本操作過程包括:5ppt課1.細胞制取取處于對數生長期的Hela細胞,吹打為單細胞懸液,用PBS調節細胞密度為105-106 個/ml。6ppt課件1.細胞制取取處于對數生長期的Hela細胞,吹打為單細胞懸液2.細胞染毒染毒組:取1ml細胞懸液加入10-3 M H2O2 溶液50l ,混勻,37
4、水浴30min;陰性對照組:取1ml細胞懸液加入50l PBS緩沖液,同等條件下水浴30min。7ppt課件2.細胞染毒染毒組:取1ml細胞懸液加入10-3 M H2O3.制片第一層膠:在完全磨毛的載玻片上鋪180L質量分數為 1%的正常熔點瓊脂糖(NMA),室溫固化10min;可將玻片用吹風機稍微加熱,以延緩瓊脂糖凝固。 8ppt課件3.制片第一層膠:在完全磨毛的載玻片上鋪180L質量分數為第二層膠:取50L 質量分數為0.8%的低熔點瓊脂糖(LMA)和30L的細胞懸液,混勻后滴加于第一層膠上,加該蓋片使其均勻鋪開,4凝固10min; 9ppt課件第二層膠:取50L 質量分數為0.8%的低熔
5、點瓊脂糖(LM第三層膠:移開蓋片,滴加100L質量分數為0.5%的LMA于第二層膠上,加蓋片, 4凝固10min。 10ppt課件第三層膠:移開蓋片,滴加100L質量分數為0.5%的LMA4. 裂解將制好的凝膠放入冷的裂解液中,4下裂解2小時;裂解液使用時新配(鋪完第二層膠后即可配制) 90ml lysis solution 10ml DMSO 1ml Triton-X10011ppt課件4. 裂解將制好的凝膠放入冷的裂解液中,4下裂解2小時;15. 解旋從裂解液中將載玻片取出,在蒸餾水中洗去過多鹽,晾干。將新配制的電泳緩沖液倒入電泳槽中,約覆過載玻片0.25cm,蓋上蓋子,在高pH電泳緩沖液
6、中放置20 min以便DNA解螺旋。12ppt課件5. 解旋從裂解液中將載玻片取出,在蒸餾水中洗去過多鹽,晾干6. 電泳室溫下調節緩沖液液面高低,于20V,200mA下電泳20min。 13ppt課件6. 電泳室溫下調節緩沖液液面高低,于20V,200mA下電7. 中和將凝膠浸入0.4M Tris緩沖液(pH7.5)中,浸洗 30min。14ppt課件7. 中和將凝膠浸入0.4M Tris緩沖液(pH7.5)中8. 染色觀察用20g/L的吖啶橙染色35min,用雙蒸水洗掉表面的染料,24小時內在熒光顯微鏡下觀察。 15ppt課件8. 染色觀察用20g/L的吖啶橙染色35min,用雙蒸 三 結果觀察16ppt課件 三 結果觀察16ppt課件17ppt課件17ppt課件18ppt課件18ppt課件四 注意事項實驗操作均在紅光或暗處條件下進行,以避免造成DNA的額外損傷。關鍵步驟是鋪膠,尤其是第一層膠,一定要平整,均勻。若有氣泡,用下一層膠填平。配制裂解液時,DMSO為致癌劑,注意安全。用去尖的槍頭取Triton-X10019ppt課
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