1、BrainNet Viewer工作流程： 可分成四部分：讀入文件、設置繪圖格式、網絡顯示和結果導出。BrainNet Viewer定義4中可讀入的文件：1)腦曲面文件（Brain surface files）：ASCII文件，后綴名為“nv”，包含了腦曲面的上的頂點和三角面片信息。2)節(jié)點文件（node files）：ASCII文件，后綴名為“node”，為n6的矩陣，包含了節(jié)點的坐標、顏色、大小和標簽信息3)邊文件（edge files）：ASCII文件，后綴名為“edge”，為nn的矩陣，即節(jié)點間的相關矩陣4)三維圖像文件（volume files）：NIFTI或Analyze格式，后綴名

2、為配對的“hdr”和“img”該文件僅用于體素到曲面的映射繪制.主要功能：（1）腦網絡的多視角顯示（2） 顯示多種由腦曲面，節(jié)點和邊構成的不同組合（3） 多種方式調節(jié)節(jié)點的顏色和大小（4） 多種方式調整邊的顏色和大小（5） 自定閥值來提取相關矩陣中的邊信息（6） 實現體素圖像到曲面的映射（7） 支持輸出常用的包括TIFF、BMP、JPEG、PNS和EPS五種格式圖片（8） 支持輸出圖片尺寸和分辨率的調整（9） 可進行放大和縮小，旋轉等交互式操作功能和使用：(1)Installation 打開matlab，把BrainNet Viewer添加當前路徑（注意全是英文路徑，否則出現讀取錯誤），在ma

3、tlab 工作區(qū)內輸入BrainNet即打開如下圖片： Fig 1.BrainNet Viewer界面（2）picture：產生的組合圖片。（提供參考） Fig.2 各種組合（3）Load Files點擊File-Load File出現以下圖片： Fig.3 加載界面1.點擊Browse（Surface file）選擇.DataSurfTemplateBrainMesh_ICBM152.nv(BrainNet Viewer提供2中不同類型的大腦模板CH2ICBM152,根據自己所需，選擇不同模板)2. 點擊Browse（node）選擇.DataExampleFilesAAL90Node_AAL

4、90.node(可以選擇不同節(jié)點模板，一共提供ALL90、Brodmann82、Custom、Dos160、Fair34、HOA112、LPBA40，在這其中進行選擇)3. 點擊Browse（edge）選擇.DataExampleFileAAL90Edge_AAL90_Binary.edge4. 點擊Browse（volume）選擇雙樣本t檢驗結果。點擊OK：（4） Visualize option1Layoutpanel（如下圖） Fig4.BrainNet選擇 Fig5.不同選擇產生不同結果2. Global panel Fig6全腦控制面板和各種全腦樣本3. Surface panel

5、Fig 7表面面板和雙腦模型4. Node panel Fig8 節(jié)點控制面板5. Edge panel Fig.9邊控制面板和邊、節(jié)點表面的組合6. Volume panel Fig.10 三維控制面板和三維腦表面現象表示7. Image panel Fig.11 圖像控制面板操作實例：（1）Brain Surface Fig.12大腦表面直接在Browse（Surface）中輸入.DateSurTemplateBrainMesh_ICBM152.nv,其他默認設置，點OK。（2） Nodes在Browse（node）中輸入.DateExampleFilesAAL90Node_ALL90.n

6、ode在Node選項中Label選Above Threshold設置大小為1.94,；在color中選取Colormap，點OK。圖像如下： Fig.13節(jié)點（3） Surface&Nodes1. Browse（Surface）加入.DateSurTemplateBrainMesh_ICBM152.nv。2. .Browse(Node)中加入.DataExampleFilesAAL90Node_AAL90.node。3. 在Node選項中Color選取中選取Modular選項，其他不變點OK，圖像產生如下： Fig14.節(jié)點和表面（4） Nodes&Edges1. Browse

7、(Node）中加入.DataExampleFilesAAL90Node_AAL90.node。2. Browse（edge）中加入.DataExampleFilesAAL90Edge_AAL90_Binary.edge。 在Node選項中選取Color的Modular；在Edge中選取Node module。圖像如下： Fig15.節(jié)點和邊（5） Surface mapping1點擊Browse（Surface）加入.DateSurTemplateBrainMesh_ICBM152.nv,2. 1選擇Browse（Voluse）加入mark_user_ReslicedResliced_FG.nill(此為雙樣本t檢驗產生的結果（55-56區(qū)）) Fig.16感興趣區(qū)3. 在Global中的Object Material選擇Shiny；在Surface中選取0.70，其他不變。 2.2選擇Browse（Voluse）加入t-twospm_0001.img(此為注意和非注意實驗下產生雙樣本檢驗的結果： Fig.17注意區(qū)2.3選擇Browse（Voluse）加入m