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文檔簡(jiǎn)介

上一章的重點(diǎn)內(nèi)容1.掌握DNA半保留復(fù)制及半不連續(xù)復(fù)制的概念;2.掌握領(lǐng)頭鏈、隨從鏈、崗崎片段的概念;3.掌握DNA復(fù)制的反應(yīng)體系;4.掌握逆轉(zhuǎn)錄的概念和逆轉(zhuǎn)錄酶;5.掌握引發(fā)突變的因素;6.掌握DNA損傷的種類(lèi)及機(jī)理;7.掌握DNA修復(fù)的種類(lèi)及機(jī)理。

遺傳信息傳遞的中心法則

(centraldogma)FrancisCrick(1916-2004)核酸RNADNA不脫氧的核苷酸磷酸二酯鍵①脫水生成磷酸二酯鍵③模板決定DNA鏈的脫氧

核苷酸的順序(A.T.G.C)②模板決定DNA鏈的長(zhǎng)短第8章核苷酸代謝合成RNA生物合成母代DNA鏈不脫氧的核苷酸第十章RNA的生物合成RNABiosynthesis,Transcription1.RNA轉(zhuǎn)錄(DNA→RNA)2.RNA復(fù)制(RNA→RNA)轉(zhuǎn)錄(transcription)生物體以DNA單鏈為模板,以NTP為原料,在DNA指導(dǎo)的RNA聚合酶催化下合成RNA鏈的過(guò)程。

DNA

RNA轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄與復(fù)制相同點(diǎn)模板都為DNA都需依賴(lài)DNA的聚合酶都形成磷酸二酯鍵方向都為5’→3’都遵循堿基互補(bǔ)配對(duì)原則轉(zhuǎn)錄與復(fù)制的差異轉(zhuǎn)錄復(fù)制模板模板鏈轉(zhuǎn)錄兩條鏈均全復(fù)制原料NTP(N=AGCU)dNTP(N=AGCT)引物不需要需要堿基配對(duì)A=U;T=A;C≡GA=T;C≡G聚合酶RNA聚合酶DNA聚合酶產(chǎn)物mRNAtRNArRNA等DNARNA的生物合成體系第一節(jié)RNA轉(zhuǎn)錄體系包括:原料:

NTP模板:

DNA酶:

RNA聚合酶RNApolymerase,RNA-pol某些蛋白質(zhì)因子及無(wú)機(jī)離子AOCH2POPP~~ATPOCH2POPP~~UUTPGOCH2POPP~~GTPCOCH2POPP~~CTP一、DNA模板DNA分子上轉(zhuǎn)錄出RNA的區(qū)段,稱(chēng)為結(jié)構(gòu)基因。DNA雙鏈中按堿基配對(duì)規(guī)律能指引轉(zhuǎn)錄生成RNA的一股單鏈,稱(chēng)為模板鏈,與mRNA互補(bǔ)。相對(duì)的另一股單鏈?zhǔn)蔷幋a鏈,與mRNA一致(僅U→T)。不對(duì)稱(chēng)轉(zhuǎn)錄

(asymmetrictranscription)

轉(zhuǎn)錄對(duì)DNA鏈的選擇性稱(chēng)為不對(duì)稱(chēng)轉(zhuǎn)錄。有兩方面的含義:在DNA分子雙鏈上某一區(qū)段,一股鏈用作模板指引轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;模板鏈并非永遠(yuǎn)在同一條單鏈上。二、RNA聚合酶(一)原核生物的RNA聚合酶目前研究比較透徹的是E.coli的RNA聚合酶。全酶(holoenzyme)核心酶(coreenzyme)

轉(zhuǎn)錄起始階段轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)階段

(二)真核生物的RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物對(duì)鵝膏蕈堿反應(yīng)不敏感敏感不同物種敏感性不同ⅢⅡⅠ45SrRNAHnRNAtRNA5S-rRNAsnRNARNA聚合酶定位核仁核質(zhì)核質(zhì)(mRNA的前體)(5S,5.8S,28S)三、啟動(dòng)子(一)原核生物的啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn):常見(jiàn)的序列為CAT,A為轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)。-35區(qū):為RNA聚合酶識(shí)別位點(diǎn)。-10區(qū):為RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn),使封閉復(fù)合物轉(zhuǎn)變成開(kāi)放復(fù)合物,便于轉(zhuǎn)錄的起始。啟動(dòng)子:DNA分子上被RNA聚合酶特異性識(shí)別并結(jié)合形成起始轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的區(qū)域。三、啟動(dòng)子(二)真核生物的啟動(dòng)子啟動(dòng)子:RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)周?chē)囊唤M轉(zhuǎn)錄控制組件。TATA盒:控制轉(zhuǎn)錄起始的準(zhǔn)確性。CAAT盒:決定啟動(dòng)子起始轉(zhuǎn)錄的效率及頻率。GC盒:為啟動(dòng)子中的常見(jiàn)成分。RNA的生物合成過(guò)程TheProcessofTranscription

第二節(jié)一、轉(zhuǎn)錄的起始轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問(wèn)題:RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域(啟動(dòng)子)

。DNA雙鏈解開(kāi),使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板,合成第一個(gè)磷酸二酯鍵。(一)原核生物轉(zhuǎn)錄的起始過(guò)程RNA聚合酶的移動(dòng)TTGACAAACTGTTATAATATATTARNA-Poly-40-35-30-25-20-15-10-5+1+5+10+15+20+25啟動(dòng)子保守序列開(kāi)始轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)原核生物的轉(zhuǎn)錄起始過(guò)程σ亞基識(shí)別-35區(qū)RNApol全酶移向-10區(qū)及轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn),打開(kāi)雙鏈β亞基催化合成第一個(gè)磷酸二酯鍵

5’-pppGpN-OH-3’

形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物RNApol(αββ′σ)—DNA—pppGpN-OH(結(jié)合松弛)(結(jié)合緊密)轉(zhuǎn)錄起始不需引物!原核轉(zhuǎn)錄起始(二)真核生物轉(zhuǎn)錄的起始過(guò)程真核生物的轉(zhuǎn)錄起始上游區(qū)段比原核生物多樣化。真核生物RNA-pol不與DNA分子直接結(jié)合,而需依靠眾多的轉(zhuǎn)錄因子,形成轉(zhuǎn)錄起始前復(fù)合物(PIC)真核生物轉(zhuǎn)錄起始(動(dòng)畫(huà))二、轉(zhuǎn)錄的延長(zhǎng)(順藤摸瓜,照葫蘆畫(huà)瓢)

1.

轉(zhuǎn)錄起始,即第一個(gè)磷酸二酯鍵形成后,

亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;2.

在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。(一)原核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng)(NMP)n

+NTP

(NMP)n+1

+PPi1、轉(zhuǎn)錄泡RNA-Pol(核心酶)-DNA-RNA形成的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物轉(zhuǎn)錄解鏈范圍10-20bpNMP逐個(gè)加入遇到模板為A時(shí)加入的是U不是TRNA-Pol向下游移動(dòng)時(shí)RNA分子5′pppG···的結(jié)構(gòu)仍然保留35¢DNARNA聚合酶核糖體RNA2、原核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的羽毛狀現(xiàn)象(二)真核生物轉(zhuǎn)錄延長(zhǎng):與原核生物大致相似。有核膜相隔,沒(méi)有轉(zhuǎn)錄與翻譯同步的現(xiàn)象。

依賴(lài)ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止非依賴(lài)ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止(一)原核生物的轉(zhuǎn)錄終止指RNA聚合酶在DNA模板上停頓下來(lái)不再前進(jìn),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來(lái)。分類(lèi)三、轉(zhuǎn)錄的終止ρ因子是由相同亞基組成的六聚體蛋白質(zhì),亞基分子量46kD。ρ因子能結(jié)合RNA,又以對(duì)polyC的結(jié)合力最強(qiáng)。ρ因子還有ATP酶活性和解螺旋酶的活性。1.依賴(lài)ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止ρ因子:

ρ因子終止轉(zhuǎn)錄的作用:與RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物結(jié)合,結(jié)合后ρ因子和RNA聚合酶都可發(fā)生構(gòu)象變化,從而使RNA聚合酶停頓,解螺旋酶的活性使DNA/RNA雜化雙鏈拆離,利于產(chǎn)物從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物中釋放。莖環(huán)結(jié)構(gòu)使轉(zhuǎn)錄終止的機(jī)理:

使RNA聚合酶變構(gòu),轉(zhuǎn)錄停頓;使轉(zhuǎn)錄復(fù)合物趨于解離,RNA產(chǎn)物釋放。2.

非依賴(lài)ρ

因子的轉(zhuǎn)錄終止DNA模板上靠近終止處,有些特殊的堿基序列,轉(zhuǎn)錄出RNA后,RNA產(chǎn)物形成特殊的結(jié)構(gòu)來(lái)終止轉(zhuǎn)錄。5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`

RNA5

TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT...3

DNAUUUU...…UUUU...…5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU...3`近終止區(qū)的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物形成發(fā)夾(hairpin)結(jié)構(gòu)是非依賴(lài)ρ因子終止的普遍現(xiàn)象。非依賴(lài)ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止5------AAUAAA-5

------AAUAAA--核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAAGTGTGTG轉(zhuǎn)錄終止的修飾點(diǎn)5

5

3

3

3加尾AAAAAAA······3mRNAmRNA轉(zhuǎn)錄終止——

和轉(zhuǎn)錄后修飾密切相關(guān)。(二)真核生物轉(zhuǎn)錄終止真核生物RNA轉(zhuǎn)錄后的加工Post-transcriptionalModification第三節(jié)一、前體mRNA的加工

在真核細(xì)胞核內(nèi)可分離到一類(lèi)含量很高,分子量很大但不穩(wěn)定的RNA,稱(chēng)核不均一RNA(hnRNA),比mRNA的平均長(zhǎng)度大4-5倍,它是mRNA的前體,含有內(nèi)含子。雞卵清蛋白成熟mRNA與DNA(hnRNA)雜交圖(一)核不均

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