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文檔簡介
生物學做Westernblot儀器第1頁/共50頁化學顯色法操作簡便,無需暗房和顯影設備,顯色直觀,但靈敏度較低,國外已不常見。化學發光法(ECL)比化學顯色法靈敏度高,可達pg水平。但由于是酶促反應,不同曝光時間得到的信號與樣品量不成線性關系,不能做準確定量。熒光法采用熒光檢測原理,操作簡單,熒光信號強弱直接反映目的蛋白量,可進行精確定量;還可以根據熒光染料的不同,用不同的熒光二抗可以在同一張膜上同時檢測兩種蛋白質。第2頁/共50頁不同檢測方法特點ECL常見問題第3頁/共50頁暗房操作麻煩,曝光時間難以控制,無法準確定量背景高,高濃度蛋白易出現“吹泡”現象檢測兩種蛋白時,需要Stripping和Re-probe,操作復雜膠片上無法直接觀察到Marker解決方案:Odyssey第4頁/共50頁熒光紅外雙色Odyssey
VS
ECL流程酶紅外染料第5頁/共50頁熒光直接檢測INFRAREDLASERDIODEINFRAREDAPDDETECTOR信號持久第6頁/共50頁不需要底物不需要底片/暗室熒光-準確定量TIMETIMECHEMILUMINESCENCE動態信號-信號隨時間變化信號不與目標蛋白濃度成比例關系ODYSSEY靜態信號-信號不隨時間變化信號和目標蛋白濃度成比例關系High
concentration
/signalMedium
concentration
/signalLow
concentration
/signalSaturationBackground0,00,0INTENSITY第7頁/共50頁紅外熒光VS化學發光第8頁/共50頁量線ECLODYSSEYOdyssey系統定量的線性相關性倍比稀釋的IRDye
800-標記的抗體.R2
從1.5
ngto
0.8pg是0.99996,極佳的線性相關性。極佳的線性相關性增加了定量的準確性1.5
ng0.8
pg第9頁/共50頁Dilutions
of
transferrin
detected
with
rabbit
anti-Tf
primary
andAlexa
Fluor
680
goat
anti-rabbit
secondary.第10頁/共50頁BioTechniques
29:636-642)紅外熒光
VS 化學發光紅外熒光VS化學發光成
效第11頁/共50頁紅外+熒光
DEMO第12頁/共50頁實驗目的實驗步驟結論10:4:2:1稀釋第13頁/共50頁紅外技術優點—低背景VisibleFluorophoresPAHs
PorphyrinsBiomolecules
NIR
Dyes1000
nm800600400200All
othersequencers400-650
nmLI-COR700
-
800
nm第14頁/共50頁紅外熒光vs可見熒光膜第15頁/共50頁背景更低,信噪比高,保證更好檢測靈敏度定量線性范圍更寬,可達4個數量級,定量更準確穿透力更強(活體成像的應用)第16頁/共50頁紅外熒光優點Odyssey—雙色同時檢測800
nm700
nmOverlay兩套獨立激發檢測系統第17頁/共50頁靶蛋白+靶蛋白
核酸+結合蛋白
Marker+總蛋白
參比蛋白+靶蛋白總蛋白+修飾化蛋白Odyssey雙色應用第18頁/共50頁雙通道同時檢測第19頁/共50頁雙色-ERK蛋白的磷酸化Anti-EGFR
and
anti-phospho-EGFR
antibody
specificity
inA431
cellsThe
mobility
shift
caused
byphosphorylation
is
visible
(A)
asindicated
by
the
red
bands
above
theyellow
bands.
(yellow
indicatesoverlapping
red
and
green
signals).Single
color
images
(B
and
C)
can
be
overlaid
(A)
to
showboth
total
protein
and
phosphorylated
protein.第20頁/共50頁雙色-EMSADNA-Protein
ComplexUnbound
DNA
IRDye
800ound
DNA
IRDye
700第21頁/共50頁Odyssey雙色檢測的優越性第22頁/共50頁雙色輸出,兩個目標基因同時檢測,減少了工作量,而且雜交條件均等,便于兩個數據的對比雜交結果對比輸出,結論更加直觀,一目了然可進行準確的量化分析In-Cell
Western
AssayThe
Odyssey
In-Cell
Western
(ICW)
Assayis
a
high-throughput
approach
tosimultaneously
detect
and
quantify
twoseparate
proteins
directly
within
cells.第23頁/共50頁In-Cell
Western
Assay第24頁/共50頁細
Cul e
c
96-wellll
ateIncubate
with
IRDye?
secondary
antibodies(e.g.:
IRDye?
680
and
IRDye?
800CW)Incubate
with
2
primary
antibodiesIncubate
with
1
primary
antibodyIncubate
with
IRDye?
secondary
antibody
anda
DNA
stain
(e.g.:
To-Pro-3)In-Cell
Western工作流程第25頁/共50頁Membrane
Westerns
vs
ICW第26頁/共50頁EGF對ERK磷酸化水平的調控%第27頁/共50頁EGF抑制劑對ERK磷酸化水平的影響第28頁/共50頁In-Cell
Western軟件模塊第29頁/共50頁在用客戶提供的結果第30頁/共50頁Odyssey
ICW的優點第31頁/共50頁高速與普通膜雜交相比,通量提高30倍ICW軟件提供便捷的計算和分析準確紅外檢測提供最準確的量化結果。避免在細胞裂解等步驟中蛋白的損失。操作簡單操作步驟簡單ICW試劑第32頁/共50頁其他經ICW驗證的抗體以及kit第33頁/共50頁應用文獻一第34頁/共50頁RasRafMekERKJAKSTAT1STAT3Grb2SOSRAS/RAF/Mek/ERK信號通路KSR1第35頁/共50頁第36頁/共50頁左圖:The
effect
of
KSR1
phosphorylationon
MEK1/2
and
RSK1
activation.上圖:Mutation
of
KSR1
phosphorylationsites
enhances
the
duration
of
ERKac第ct3i7v頁a/t共i5o0n頁.應用
獻二第38頁/共50頁第39頁/共50頁第40頁/共50頁蛋白
芯片掃描CST
PathScan
RTKSignaling
antibody
arraykit(7949)kit包括:所有的輔助產品和試劑R&D
4種適合Licor檢測試劑盒第41頁/共50頁小動物活體成像-雙色第42頁/共50頁小動物活體成像-附件第43頁/共50頁軟件功能儀器軟件AdministrationDiagnostics應用軟件圖象控制背景扣除條帶發現和定位定量ICW%結果計算(includingnormalization)小動物活體分析第44頁/共50頁第45頁/共50頁Odyssey系統發表文獻統計第46頁/共50頁Paper
List第47頁/共50頁Nagashima,,
K.,
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and
pharmacological
inhibition
of
PDK1
in
cancer
cells
characterization
of
aselective
allosteric
kinase
inhibitorJ.
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C.J.,
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activities
of
wild-type
plus
mutant
EZH2
drive
tumor-associatedhypertrimethylation
of
lysine
27
on
histone
H3
(H3K27)
in
human
B-cell
lymphomasPNAS
107:20980
(2010)Cittelly,
D.
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HER2D16
suppresses
miR-15a/16
and
deregulates
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to
promoteendocrine
resistance
of
breast
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31:2049
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Kras
signaling
rescues
Shp2
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lens
and
lacrimalglad
development.Development
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D
et
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mechanisms
regulating
corticotropin-releasing
hormone
receptor-2betaendocytosis
and
interaction
with
extracellularly
regulated
kinase
1/2
and
p38mitogen-activated
protein
kinase
signaling
cascades.
Mol
Endocrinol.
22(3):
689-706
(2008)總結第48頁/共50頁準確定量—提供更完善的數據,提升文章檔次成像效果好—背景低,條帶清晰,沒有吹泡現象雙色檢測—靶蛋白+總蛋白+Maker
同時檢測成本低—無需底物,無需膠片,無需暗室,二抗稀釋倍數高擴展應用—ICW
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