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文檔簡介
高通量測序在出生缺陷預防中的應用我的基因我知道我的健康我做主主講人:李先卓山東省臍血庫臨床應用中心客戶經理目錄一、高通量基因測序技術的應用現狀二、三級預防基因項目介紹一、高通量基因測序技術的應用現狀人類基因組計劃:
六國參與,耗時超10年,花費30億美金
促進了諸多學科的發展
帶動了8萬億的產業機會1999年9月9日,華大基因為了完成人類基因組計劃(中國部分)而成立全球第一的基因組學(研究)中心5679出生缺陷三級預防孕前植入前產前新生兒篩查篩查/診斷篩查/診斷篩查/診斷二級預防一級預防三級預防未雨綢繆忍痛割愛亡羊補牢+10高通量測序在一級預防中的應用——康孕
染色體檢測-100K檢測內容23對染色體非整倍體和100KB以上缺失、重復臨床適應癥1、中晚孕期自然流產(孕周>12周),死胎,或B超異常、多發畸形胎兒2、先天畸形、智力低下/發育遲緩、先天性心臟病以及有語言障礙、不明原因多發系統異常等臨床表征的新生兒/兒童患者和疑似患者臨床意義1、幫助查找中晚孕期流產,死胎,或B超異常、多發畸形胎兒的遺傳原因2、輔助患者和疑似患者的臨床診斷樣本類型流產組織高通量測序在二級預防中的應用——無創產前DNA檢測產前基因檢測的必要性與可行性產前檢測的必要性遺傳變異的種類定義:遺傳物質的改變稱為遺傳變異,常會導致疾病的產生。具體包括:染色體數目改變、染色體結構改變、基因突變。染色體數目改變:染色體條數增加或減少引起的遺傳物質的改變,又稱為非整倍體變異。染色體結構改變:染色體上部分片段缺失、重復、易位或倒位引起的遺傳物質的改變。基因突變:基因內部堿基的增加、缺失或堿基種類的變化引起的遺傳物質的改變。什么是唐氏綜合征?唐氏綜合征:是最常見的先天愚型疾病,也是我國危害最嚴重的染色體異常疾病之一,最根本的原因,是人體正常的23對染色體中,在第21對染色體上多了一條。發病率1/600——1/800染色體數目改變引起的疾病:染色體非整倍體包括21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛德華氏綜合征)、13-三體綜合征(帕陶氏綜合征),以及一些性染色體三體型及X單體型。47,XY,+212047,XY,+18染色體數目改變引起的疾病:染色體數目改變引起的疾病:唐氏綜合征發病原因只是由遺傳因素決定嗎?
由遺傳因素和環境相互作用,孕婦年齡(35歲以上)和環境為主導因素,占比70%——80%。環境因素:
食品安全
空氣污染
水污染
細菌及病毒感染
電器輻射
藥物影響……
發病率1/600——1/800唐氏綜合征發病的遺傳學原理錯誤分裂錯誤分裂正常分裂正常分裂正常分裂第一次減數分裂第二次減數分裂三體三體單體單體精子(單倍體)精子(單倍體)正常正常三體單體目前對于唐氏綜合征的檢測方法唐篩羊穿無創30%的誤差準確、無風險1984年2007年30%的誤差便捷準確有流產風險抽取母體血液,檢測母體血清中激素,甲胎蛋白等的濃度,結合孕婦的預產期、年齡和采血時的孕周,計算出唐氏兒的危險系數。優勢:簡單、安全、方便不足:存在30%的誤差唐氏篩查12羊水穿刺抽取孕婦羊水,檢測羊水中胎兒細胞內的染色體(DNA)數目。優勢:準確率高達99.9%。不足:有創傷風險(流產、術后感染)唐篩的安全源自于采集母血羊穿的準確源自于檢測胎兒的染色體(DNA)無創之所以安全、準確是因為采集母血、檢測胎兒的DNA3無創檢測
無創產前基因檢測28
1997年香港中文大學醫學院盧煜明(DennisLo)教授發現母體外周血漿中存在游離胎兒染色體,隨孕周增加穩定存在,可以作為非創傷性產前診斷的理想材料。結合新一代染色體基因測序技術誕生無創基因檢測新一代染色體基因檢測方法——無創產前檢測。安心:無創安全、無風險無創基因檢測只需抽取5ml母體靜脈血即可檢測所以:無創傷性。無感染、無流產風險。極大地緩解了孕婦及家屬的心理負擔貼心:早期便捷、無憂慮
早期12周15周20周28周18周唐氏篩查穿刺羊水穿刺:18——28周無創產前:12——24周相比唐氏篩查提前3-6周即可檢測便捷一次篩查一步到位唐氏篩查:15——20周無創檢查相比提前3——6周即可檢測12周15周20周18周24周唐氏篩查羊水穿刺無創檢測舒心:準確私密、有保障
準確準確率高達99.7%私密保證對受檢者所有信息保密有保障保險知情同意書充分保障產婦利益:高危孕婦免費做穿刺檢測結果假陰性,產前2萬產后40萬巨額保險,從未出現賠付情況。高通量測序在三級預防中的應用——新生兒遺傳代謝病篩查48項——遺傳性耳聾基因檢測——“安馨可”新生兒基因檢測新生兒遺傳代謝病篩查(48項)
我國每年1600萬左右出生人口中約有40-50萬的兒童患有遺傳代謝病。遺傳代謝病主要影響神經系統和運動系統發育,很多患兒因未及時診斷和治療,造成因腦肝腎等損害而導致智力或身體發育障礙,甚至死亡,給家庭帶來莫大的遺憾,給社會造成沉重的負擔。
對遺傳代謝病的患者而言,越早發現越早治療越好。新生兒疾病篩查是減少出生缺陷的第三級預防措施,是嬰兒邁入健康人生的第一道“安檢”。國家《母嬰保健法》及其實施辦法已明確規定醫療保健機構應逐步開展新生兒疾病篩查,并將其列入母嬰保健技術服務項目。新生兒遺傳代謝病篩查(48項)目前,全國采用傳統的生化方法只能對新生兒2-5種疾病進行篩查,而采用串聯質譜檢測可以做到一滴血幾分鐘內一次性檢測48種遺傳代謝病,是目前世界上最先進、最經濟、最高效的篩查方法。發達國家普遍采用這一技術進行新生兒代謝病篩查,但我國覆蓋度不足5%。近幾年的數據表明:采用串聯質譜所檢測的疾病發病率為1/5000~1/3000,而有些發病率較高的遺傳代謝病(如甲基丙二酸血癥、丙酸血癥等疾病)只能采用質譜檢測。全面推廣質譜檢測對新生兒遺傳代謝進行更多病種、更高覆蓋率的檢測是關乎我國人口素質、人力資源的健康存量和經濟社會可持續發展的重大公共衛生問題。。檢測內容適用人群檢測意義擴大常規(2-5種)遺傳代謝病檢測范圍,挽救新生兒,降低出生缺陷早篩查、早診斷、早治療,避免或減輕兒童致殘分析人群和患者親屬的致病基因攜帶情況,預估子代潛在患病風險,提供健康保障利用基因檢測平臺,輔助臨床患者診斷,明確致病基因位點,輔助健康再育和植入前診斷新生兒遺傳代謝病檢測技術平臺串聯質譜技術將新生兒足跟血經過萃取、衍生化處理,通過添加同位素內標(IS)對樣本中的氨基酸、酰基肉堿進行定量分析,一滴血幾分鐘內一次性分析五十多種代謝物檢測48種遺傳代謝病。高通量測序技術通過高通量基因檢測技術平臺對外周血樣本DNA中目的基因進行捕獲測序和生物信息學分析找出可疑致病突變,從基因水平為臨床輔助診斷和治療提供專業指導。耳聾是世界范圍內的多發病2023/8/2041億人年全球WHO(NewEnglJMed,2007)我國耳聾現狀2023/8/20在我國,聽力殘疾(耳聾)占各類殘疾之首,成為嚴重危害我國人口健康及生活質量的疾病。全國第二次殘疾人抽樣調查,2006我國耳聾現狀我國目前耳聾致殘人口2780萬人每年新生聾兒3.5萬名國家非常重視耳聾的預防和康復,在全國范圍內開展了新生兒普通聽力篩查工作將每年的3月3日定為全國“愛耳日”。耳聾現狀如何改善?問:能治療嗎?答:無藥可治,聽力損失不可逆。同時一旦出現耳聾,將會面臨:
1、由聾致啞-殘疾加重
2、人工耳蝸昂貴-生活負擔加重
3、再生育風險遺傳性耳聾基因檢測耳聾致殘人群中遺傳因素耳聾占比60%以上,成為最主要致聾原因。新生兒普通聽力篩查對于遺傳因素耳聾存在漏檢。耳聾的原因是什么?耳聾非綜合征型(70%)遺傳因素(約60%)常染色體隱性(77%)環境因素(約20%)綜合征型(30%)Alport綜合征Pendred綜合征Waardenburg綜合征BOR綜合征Usher綜合征……等四百余種常染色體顯性(22%
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