中國知識創新工程試點對科技體制機制改革的探索及影響（1998～2006年）

導讀：1997年12月中國科學院向中央提交了《迎接知識經濟時代，建設國家創新體系》的研究報告。1998年2月4日，江澤民做出重要批示：“我認為可以支持他們搞些試點，先走一步。真正搞出我們自己的創新體系。”1998年6月國務院正式批準中國科學院開展知識創新工程試點。實施知識創新工程試點以來，中國科學院在明確戰略定位和辦院方針、建立戰略研究體系與機制，重構院宏觀管理組織體系、改革人事管理制度與機制、改革資源配置和預算制度、改革科技評價和獎勵制度、調整科技布局與組織機構、創新國內外開放合作模式等方面采取了一系列重大改革舉措，探索建立了現代科研院所制度，改革創新發展成效顯著，為科研事業單位改革提供了豐富的有借鑒意義的經驗。一引言1997年12月，中國科學院向中央提出了《迎接知識經濟時代，建設國家創新體系》的戰略研究報告，系統分析了世界知識經濟發展態勢及其給中國帶來的挑戰，提出了建設面向21世紀的中國國家創新體系的思路與新時期中國科學院的戰略選擇，建議國家組織實施“知識創新工程”。1998年2月4日，江澤民做出重要批示：“知識經濟、創新意識對于我們二十一世紀的發展至關重要。科學院提出了一些設想，又有一支隊伍，我認為可以支持他們搞些試點，先走一步。真正搞出我們自己的創新體系。”[1]1998年6月9日，國家科技教育領導小組第一次會議審議并原則通過了中國科學院《關于“知識創新工程”試點的匯報提綱》，決定由中國科學院作為國家創新體系建設的試點，率先啟動知識創新工程試點工作。中國科學院知識創新工程試點的總體目標是：到2010年前后，把中國科學院建設成為瞄準國家戰略目標和國際科技前沿、具有強大和持續創新能力的國家自然科學和高技術的知識創新中心；成為具有國際先進水平的科學研究基地、培養造就高級科技人才的基地和促進中國高技術產業發展的基地；成為有國際影響的國家科技知識庫、科學思想庫和科技人才庫。試點工作分三個階段實施：1998～2000年為啟動階段，努力把試點單位建設成為代表中國科學水平的、面向21世紀的國家知識創新基地；2001～2005年為全面推進階段，全面展開80個左右研究所的試點工作，形成國家科研機構新體制和現代科研院所制度；2006～2010年為優化完善階段，實現知識創新工程試點的總體目標，大幅度提高創新能力。2000年12月21日，國家科教領導小組聽取了中國科學院啟動階段試點工作的匯報，審議了《中國科學院關于全面推進知識創新工程試點工作的報告》，批準中國科學院知識創新工程試點工作自2001年轉入全面推進階段。2006年發布的《中國科學院中長期發展規劃綱要（2006—2020年）》進一步指出：至2010年，大部分研究所成為具有一流的成果、一流的效益、一流的管理、一流的人才的國家科研團體，全院整體實力進入世界同類研究機構前5名。至2020年，全院研究機構均達到“四個一流”的標準，實現建設“三個基地”的目標，整體實力進入世界同類研究機構前3名。為了加速推進知識創新工程試點，中國科學院直面問題，勇于創新，在人事管理制度、資源配置和預算管理、科技評價與獎勵制度等方面實施了一系列重要改革舉措，并且在改革實踐中不斷調整完善，對知識創新工程試點順利實施起到了重要的推動作用。二實施知識創新工程試點的主要舉措1998～2010年，中國科學院實施知識創新工程試點13年，通過組織開展戰略研究，明確中國科學院戰略定位，直面發展面臨的能力不足與科技體制改革難點問題，調整辦院方針，建立戰略研究體系，重構以規劃為核心的中國科學院宏觀管理組織體系，深入推進人事管理制度與機制、資源配置和預算制度、科技評價和激勵制度等改革，調整科技布局與組織機構，充分發揮了中國科學院在中國科技發展和體制機制改革方面的骨干引領作用和示范帶動作用。（一）明確戰略定位和辦院方針1.明晰中國科學院戰略定位實施知識創新工程試點工作面臨的首要問題是明確中國科學院在國家創新體系中的戰略定位。中國科學院在啟動知識創新工程試點之初，就按照“全球眼光，中國國情，著眼當前，面向未來”的指導思想，從深刻認識經濟全球化、知識經濟和世界科技發展新態勢帶來的機遇與挑戰出發，注重把握當代科技、經濟和社會發展的客觀規律，研究世界主要國家發展階段與創新體系的歷史演進，全面正確地理解國家創新體系建設目標和國立科研機構戰略定位，深入分析中國科學院實施知識創新工程試點的基礎和面臨的問題，明確自身作為國家戰略科技力量的戰略定位，主要從事基礎性、戰略性和前瞻性科技創新，并在此過程中不斷向社會輸送人才、傳播知識和轉移技術，成為國家知識創新體系的核心。1999年，江澤民視察知識創新工程并為中國科學院建院50周年題詞，要求中國科學院“攀登科學技術高峰，為我國經濟發展、國防建設和社會進步做出基礎性、戰略性、前瞻性的創新貢獻”，進一步明確了中國科學院的戰略定位。2.調整中國科學院辦院方針中國科學院的辦院方針是準確把握知識創新工程試點工作方向的需要。在知識創新工程試點實踐中，中國科學院不斷明晰發展愿景、使命和目標。2002年，中國科學院從自身戰略定位出發，按照“既要保持一定的歷史連續性，更要把握時代特點，與時俱進，面向未來”的思路，將原來的辦院方針“把主要力量動員和組織到為國民經濟和社會發展服務的主戰場，同時保持一支精干力量從事基礎研究和高技術創新”調整為“面向國家戰略需求，面向世界科學前沿，加強原始科學創新，加強關鍵技術創新與系統集成，攀登世界科技高峰，為我國經濟建設、國家安全和社會可持續發展不斷做出基礎性、戰略性、前瞻性的重大創新貢獻”。調整后的辦院方針體現了國家對中國科學院的戰略定位，不僅要服務于國家經濟社會可持續發展和國家安全，也要攀登世界科學高峰。一是始終將面向國家戰略需求放在首位；二是加強原始科學創新和加強關鍵技術創新與系統集成并舉；三是發揮中國科學院在資源、環境、生態等研究方面的優勢，為中國社會可持續發展重大科學決策提供支撐；四是推動科技創新成果轉化，為中國產業結構調整和經濟快速增長做貢獻。（二）建立戰略研究體系與機制1.戰略研究明確科技目標中國科學院在實施知識創新工程試點之初，成立了由200余位中青年科學家、戰略科學家和管理專家參加的9個戰略研究組，先后召開了有上千人次參加的各類研討會，系統研究分析了世界科技發展態勢和中國經濟社會發展與國家安全的重大戰略需求，并經學部和海外專家的咨詢與評議，形成了《優先發展領域方向和重大項目戰略研究》報告，引導各研究所將科技力量向重點領域方向凝聚。在知識創新工程試點全面推進階段，推出了科技創新戰略行動計劃，組織實施了科技創新跨越發展戰略，按照“領域前沿、重要方向和重大項目”三個層次部署實施了一批創新項目。領域前沿項目以基礎研究和高技術前沿探索為主，原則上由各研究所自主部署；重要方向項目主要開展基礎性、戰略性和前瞻性研究，與科技布局調整、創新基地和人才創新隊伍建設相結合；重大項目以解決中國經濟發展、國家安全和社會可持續發展的重大戰略性科技問題為主要目標，采取頂層設計、統一規劃、自上而下的組織方式。2.構建全院戰略研究體系2004年組織研究中國科學院戰略研究體系，2005年組建中國科學院戰略研究中心，加強院屬政策與管理、自然科學史、文獻情報研究機構隊伍建設，凝聚和培養戰略研究人才，建設國家科學思想庫研究支撐體系，建設中國科學院決策與管理支撐體系，優化和加強戰略研究相關的學科布局，開展國家中長期科技發展相關戰略研究和中國科學院中長期發展戰略問題研究以及相關基礎理論探索與前沿研究，為國家宏觀管理部門決策和中國科學院科學決策與管理以及科學思想傳播提供重要支撐。2006年發布的《中國科學院中長期發展規劃綱要（2006—2020年）》明確提出：“建設由規劃職能部門、戰略研究平臺和專業研究機構、科技創新基地戰略研究組、研究所戰略研究組等構成的戰略研究體系，形成持續開展戰略研究的機制，準確把握國家戰略需求，敏銳關注世界科技前沿，成為院重大決策的基礎，成為規劃體系的支撐。”2010年中國科學院發布關于加強戰略研究體系建設的指導意見，明確提出：“加快構建覆蓋院機關、科技創新基地和院屬各單位的全院戰略研究體系，充分依靠科學家、管理專家，建立多層次、系統性、有重點持續開展戰略研究的機制，為我院發展方向、戰略重點、項目遴選等決策提供基礎、依據和建議。”3.健全戰略研究工作機制明確規劃職能部門、戰略研究平臺（系統性、綜合性和前瞻性戰略研究）、專業研究機構、重要領域科技路線圖研究組、科技創新基地戰略研究組（項目遴選與科技布局）、研究所戰略研究組在中國科學院戰略研究體系中的戰略定位，注重發揮規劃戰略布局的主導作用和中國科學院科技政策與管理研究會聯系全院戰略研究隊伍的網絡作用，定期召開中國科學院年度戰略研討會、領域（基礎研究、高技術、資源環境）戰略研討會、學科戰略論壇，研討國家科技發展戰略問題、領域發展戰略問題和學科發展戰略問題及相關理論方法，分析科學技術領域重大進展和發展態勢并提交戰略研究報告。建立年度戰略研究報告和信息交流制度，加強國際競爭格局和主要國家重要政策動態監測，加強國家重大科技任務追蹤分析并定期報告相關信息和情況。建立戰略研究評價與信譽制度，將戰略研究體系各組成部分戰略研究情況納入中國科學院評價體系。發布了《科學發展報告》《高技術發展報告》《中國可持續發展戰略研究報告》等年度報告，定期發布《重要國家和國際組織關注的重大問題》《國際科技競爭力分析報告》《國家創新體系各單元競爭分析報告》《中國科學院研究所態勢分析報告》等研究報告以及戰略情報研究報告等。戰略研究為國家科技創新相關規劃和中國科學院發展規劃的研究編制提供了重要支撐，也為中國科學院政策規劃執行與動態調整提供了重要支撐。（三）重構宏觀管理組織體系中國科學院組建規劃戰略局，重點加強全院規劃體系建設。中國科學院將確立科技目標作為研究所進入知識創新工程試點序列的首要標準，在總體設計基礎上，按照“成熟一個、啟動一個”的原則，規范程序，嚴格論證，逐所審核，明確任務，以研究所進入試點序列為抓手，推動研究所進一步明確科技創新目標，對自身學科布局和重點發展領域進行調整，取得了明顯的效果，凸顯了戰略研究和規劃對中國科學院宏觀管理的重要作用。2006年中國科學院發布的《中國科學院中長期發展規劃綱要（2006—2020年）》明確提出：“建立規劃體系、執行體系、資源配置體系與評價體系相互制約、相互促進的新的科技創新宏觀管理體制。”2006年《中國科學院中長期發展規劃綱要實施意見》[2]明確提出，要建立以規劃綱要為主體的規劃體系。一是建立由院級規劃和所級規劃構成的兩級三類規劃體系，明確院級規劃（規劃綱要、配套規劃及專門規劃）和所級規劃（規劃綱要、配套規劃及專門規劃）定位及編制重點。二是建立規劃編制立項、審批管理、專家咨詢論證制度。三是建立規劃制定、發布、執行、評估、修訂的規劃全過程管理工作機制，院級規劃發布由院黨組批準，所級規劃報院審批。四是建立規劃銜接協調機制，院級規劃必須與國家規劃銜接，所級規劃必須與院級規劃和國家規劃銜接，使規劃制定過程成為集思廣益、凝聚目標、明確重點、達成共識的過程，使規劃成為謀劃未來、謀劃全局發展的重要方法論和指導工作的行動指南。建立規劃體系，旨在加強規劃對全院改革發展的統籌協調功能，建立規范的規劃制定、發布、決策與動態管理制度。建立執行體系，旨在強化科技創新基地對重大科技創新活動的組織管理功能，強化專業局為科技創新基地提供管理支撐的功能，建立適時調整機構設置與職能的機制，不斷優化科技項目組織與支持方式。建立資源配置體系，旨在加強人財物等資源管理部門間的協調聯動，按創新發展需求、創新績效和創新活動規律統籌配置資源，加強資源使用監督與績效考核，建立導向明確、分類管理、鼓勵競爭、注重績效的資源配置體系。建立評估體系，旨在堅持質重于量、分類評價、科學嚴謹、公開公正的評估原則，開展對重大科技創新活動及效益、機構、人員與政策執行等評估，包括綜合質量評估、政策導向評估、科技布局評估、創新能力監測及發展態勢分析。（四）改革人事管理制度在實施知識創新工程試點之初，中國科學院在全國率先推行了崗位聘任制度，建立了“崗位聘任、項目聘用和流動人員相結合”的新型用人制度，建立了體現績效優先原則的三元結構分配制度，形成了人員能進能出、職務能上能下、待遇能高能低的用人新機制，為優秀人才脫穎而出創造了良好的制度環境，為科研事業單位人事制度改革提供了經驗。1.實行崗位聘任制度1999年，中國科學院率先實行了全員聘用合同制，打破計劃經濟時期形成的“鐵飯碗”和“終身制”，實行事業單位人員合同管理，實現了科研事業單位用人制度的重大轉變。各研究所按1998年在編人數的1/3設置創新崗位、核算創新經費，其中對外招聘崗位不低于20%。2001年，實施了以“按需設崗、按崗聘任、擇優上崗、動態更新”為主要內容的崗位聘用制，停止職稱評定工作，提高聘任標準、嚴格聘任程序，實現了評聘并軌，實現了競爭擇優上崗，顯著增強了科技人員的競爭意識，有效激發了科技人員的創新活力，一批青年學術帶頭人嶄露頭角，隊伍整體素質和創新能力顯著提高，人才結構日趨合理。例如，在4個數學類研究所合并基礎上組建的數學與系統科學研究院，原有160名研究員中只有60人被聘為首批創新崗位研究員。2.實行項目聘用制度在嚴格創新崗位聘任制度的同時，中國科學院配套實行了項目聘用制度，允許研究所和項目負責人根據科技創新需要自主招聘項目聘用人員，實行有期限的合同聘用，不占事業編制，突破了事業編制的局限性。在人才使用上“不求所有，但求所用”，滿足了對科研人才的動態需求。對博士后試行項目聘用管理，增強了博士后的崗位意識，不僅吸引集聚了大批高素質科研骨干，也為社會培養了一批高層次科技人才。實行高級訪問學者制度，不僅吸引了一批優秀人才到中國科學院工作，而且加強了中國科學院對外學術交流與合作。對研究生實行研究助理制度，促進了流動科研隊伍建設和科研教育結合。截至2010年底，項目聘用人員約有9700人，占中國科學院職工總數的14%。3.推行人事代理制度為了推進崗位聘任制度改革，中國科學院實行部分人事管理職能的委托代理，對新進人員全部實行人事代理，逐步實現人事關系管理與人員使用分離，體現了人才社會化。在中國社會保障機制尚不健全的環境下，中國科學院鼓勵“人才+成果”進入市場發展高技術企業，積極向社會輸送人才。采取“離崗安置”等多種方式，積極穩妥推進轉崗分流工作。4.推行新型分配制度中國科學院在深入研究基礎上全面推行體現績效優先的“基本工資、崗位津貼、績效獎勵”的“三元結構”分配制度，由原來的簡單從對外爭取項目經費中提取獎勵，逐步轉向按照科技創新貢獻確定績效獎勵，根據財政部有關規定按照知識創新工程試點經費的15%～20%設立創新崗位津貼。同時，試行了研究所法定代表人年薪制、特殊拔尖人才協議工資制、項目聘用人員的合同工資制，積極探索知識和技術要素參與分配的多種分配形式，形成了以“三元結構”分配制度為主體、多種分配形式并存的收入分配體系，打破了人員收入分配的“大鍋飯”，有效地激勵了科技人員創新積極性，提高了對優秀人才的凝聚力。中國科學院作為人事部科研事業單位分配制度改革試點，為探索科研事業單位收入分配模式提供了寶貴的實踐經驗。（五）改革資源配置和預算制度中國科學院堅持以資源配置制度改革帶動管理創新，調整資源配置方針，改革資源配置機制，按照國家預算制度改革要求建立了新型預算制度，實現了從單一分配國家財政撥款向廣泛吸納社會創新資源的轉變，從按計劃平均分配資源向競爭擇優重點支持轉變，從院統一安排各類科技資源向充分發揮院所兩級資源集成優勢轉變。1.調整資源配置方針中國科學院調整了資源配置方針，從資源短缺時期過分強調平衡平均，調整為“整體規劃、保證重點、擇優支持、鼓勵競爭、優化配置、動態調整”的新方針，充分發揮資源配置的杠桿作用，提高資源配置效率，保證知識創新工程試點工作的順利實施。在試點實踐的基礎上，中國科學院進一步調整資源配置方針為“績效優先、鼓勵創新、競爭向上、協同發展、創新增值”，力圖實現科技創新增值循環。2.改革資源配置制度按照新的資源配置方針，中國科學院確定了院所兩級資源配置的宏觀比例，加大了對發展迅速的科技領域和新興交叉學科以及科技創新隊伍建設的投入，建立了與研究所績效掛鉤的創新試點經費動態調整和擇優支持新機制。一是堅持“發展快先支持，發展好多支持”，在研究所進入創新試點序列的過程中，選擇改革發展處于前列的研究所先行試點，通過“時間差”體現資源重點支持。在研究所全面進入試點后，根據研究所創新績效和評價結果，對做出重大創新貢獻、評價結果名列前茅的研究所進行獎勵性經費支持，對評價結果相對靠后的研究所適度核減創新經費。二是堅持對外競爭經費比例。根據研究所科技創新工作性質，確定了各研究所對外競爭經費與院撥經常性經費的比例，其中基礎研究和社會公益性創新保持在3∶7左右，高技術研究與發展保持在7∶3至6∶4，對不能達到對外競爭經費比例的研究所，相應核減院經常性經費，并在研究所評價中減分，有效地調動了研究所對外合作競爭和聚集社會創新資源的積極性。三是堅持重大創新項目、重要方向項目和基礎設施建設項目經費院所兩級匹配支持，其中重大創新項目保持在1∶2左右，重要方向項目保持在1∶1左右，基本建設項目保持在7∶3左右，有效地調動了研究所的積極性，保證了項目的有效實施，并使項目實施與研究所的發展有機結合。3.探索預算制度改革中國科學院借鑒國際經驗并結合自身特點，改革按人平均分配資源的做法，積極探索符合國家預算制度改革要求、適應科技創新活動特點的預算管理制度，逐步實現研究所全部收入與支出納入年度預算管理，根據定員定額、分類分檔、總量調整的原則，建立以研究所發展績效和態勢為主要依據的經濟資源配置制度體系，運用預算手段推動事業的發展。在知識創新工程試點啟動階段，實施“基本事業費+創新經常性經費”的配置模式，重在推動研究所改革。在知識創新工程試點二期，實施“總量不變、取消基數、結構調整”的配置模式，重在推動研究所整體學科建設與發展。在知識創新工程三期，實施“基本運行費+基本科研費”為核心的資源配置模式，重在提升研究所運行保障和前瞻布局能力。（六）改革科技評價和獎勵制度中國科學院持續推進科技評價和激勵制度改革，在十余年研究所績效評價實踐基礎上，不斷完善知識創新工程試點研究所評價體系和評價方法，堅持“質重于量、分類導向、公開公正、科學嚴肅”的原則，不斷探索完善研究所評價體系，建立了評價結果與研究所資源配置及法人代表年薪掛鉤機制。1.調整研究所評價指標體系和評價方法1999～2001年，中國科學院試點研究所評價重點是“創新任務完成情況評價”和“基礎性、戰略性與前瞻性貢獻”評價，并于2000年將“創新文化建設”納入試點研究所評價體系。2002年，試行了以“重大創新貢獻評價”“分類導向評價”“基礎指標測評”為主要類型的研究所績效評價體系。分類導向評價進一步強化了評價對于科研活動的導向作用，“基礎指標測評”則演變為“研究所產出評價”與“研究所可持續發展能力評價”。從2004年起，試行“綜合質量評估”“政策導向評價”“基礎指標測評”相結合的研究所績效評價體系。研究所綜合質量評估旨在提升研究所科研創新質量，改變了過去以定量評價為主的方法，試行以同行專家定性評價為主、以基礎指標測評為參考的評價方法，聘請國內外著名專家到研究所實地考察與函評相結合，逐步建立與國際接軌的研究所評價規范。2.積極探索評價結果與資源配置掛鉤的新方式評價是科研管理的重要手段，評價結果是資源配置的重要依據。中國科學院通過不斷改進評價體系，不斷探索評價結果與資源配置掛鉤方式，初步形成了與研究所創新經費和研究所法人代表年薪掛鉤的制度。2000年，中國科學院開始將績效評價結果與研究所創新經費掛鉤，4類研究所分類評價結果的排序居首的4個研究所得到300萬元創新經費獎勵，4類研究所評價結果排序最后的研究所則核減20%的創新經費。2002年，按照基礎研究發展、高技術研究發展、社會可持續發展、科技和高技術產業化等進行分類評價的結果排序靠前的4個研究所和做出重大創新貢獻的13個研究所各增加了200萬～300萬元的創新經費，對4類研究所分類進行基礎指標測評的結果排序靠后的12個研究所則分別扣減了10%～20%的創新經費。1999年，中國科學院開始進行研究所法人代表年薪制試點，2003年試點范圍擴大到59個研究所。研究所績效評價結果作為確定試點研究所所長年薪的一項重要指標，權重占70%。2006年發布的《中國科學院中長期發展規劃綱要（2006—2020年）》，明確對研究所定期進行綜合質量評估，主要內容包括職能定位、目標實現、投入產出、科技活動及管理水平、發展態勢等。實行研究所分檔管理制度，以綜合質量評估結果為主要依據，將研究所分為優秀、良好、合格三檔。分檔結果作為確定研究所基本科研費、創新崗位數、所長年薪及進行組織結構調整的一個重要因素。分檔工作以5年為周期，其間可根據重大科技貢獻與創新能力監測結果，對研究所檔次進行適當調整。3.積極推進科技獎勵制度改革2002年，中國科學院對科技獎勵制度進行了重大改革，取消科技成果獎，新設兩年一屆的“中國科學院杰出科技成就獎”。一是改革了獎勵評審方法。建立了開放式的推薦、評審模式，在院屬單位推薦之外增加了院內外5名同行專家推薦的規定，規定院外評審專家的比例不能低于10%，并將國外同行專家對初評結果的書面評價意見作為評獎的重要依據。這種征詢國外同行專家評價意見的做法，已被國家科技獎勵辦公室在2004年度國家自然科學獎和技術發明獎初評之后采納。二是確立了高標準、嚴要求、寧缺毋濫和以人為本的評獎原則。獎勵對象從過去獎勵科研成果轉變為獎勵科技人員，獎勵成果注重原創和學科交叉與系統集成，獎勵優秀集體有利于培育科研團隊合作精神，有效地激發科學家的創造潛能，在基礎研究和應用基礎研究中做出世界一流的原創性成就，在滿足國家戰略需求的科技工作中做出擁有自主知識產權的高技術創新與集成系統和高技術產業化成就，在公益性科技活動中做出具有顯著社會效益的重大貢獻。（七）調整科技布局與組織機構中國科學院積極調整組織結構，通過推進知識創新基地建設、科研機構重組、非法人研究單位布局和應用開發類研究機構轉制等措施，完善全院科技布局和組織機構調整。院屬法人研究機構由1997年的123個調整為2010年的99個。1.調整重點領域方向中國科學院加速將重點領域方向從以學科為主聚焦到關系中國當前與長遠持續發展的戰略必爭領域和重要基礎交叉前沿。在知識創新工程一期，通過研究基地建設帶動科技布局調整。首批建設了數學與系統科學研究院和上海生命科學研究基地、北京物質科學研究基地、北京地球科學研究基地等研究基地。在戰略性基礎研究、可持續發展相關科技創新研究、戰略高技術創新研究（民用）、國家安全戰略高技術創新研究、自然科學前沿和大科學創新研究等方面，重點部署了一批領域和方向。在知識創新工程二期，更加關注國家戰略需求和科技發展前沿的緊密結合，確定了重點發展的九大領域。在知識創新工程三期，著力加強具有明確目標導向的交叉和重大科學前沿，加快信息科技創新基地，光電和空間科技創新基地，先進能源科技創新基地，納米、先進制造與新材料創新基地，人口健康與醫藥創新基地，先進工業生物技術創新基地，先進可持續農業科技創新基地，生態與環境科技創新基地，資源與海洋科技創新基地，依托大科學裝置的綜合研究基地等10個基地建設，通過科技創新基地建設帶動領域和方向調整。2.建設知識創新基地中國科學院按照具有明確的戰略目標和鼓勵交叉綜合以及空間相對集中的原則，在基礎科學研究、生命科學與生物技術、資源環境科學研究以及高技術研究與發展領域，重點建設了18個優勢較強、規模較大的綜合研究基地。基礎科學研究領域包括北京物質科學基地、國家天文臺、數學與系統科學研究院、合肥物質科學研究院、大科學研究基地等；生命科學與生物技術領域包括上海生命科學研究院、北京農業生物技術與生態環境研究基地、西南生物資源與生物多樣性保護研究基地等；資源環境科技領域包括北京地球科學研究基地、西北資源環境與可持續發展研究基地、長江流域生態環境與可持續發展研究基地、東北高效農業與生態系統管理研究基地、海洋科學研究基地等；高技術研究發展領域包括上海高技術研究發展基地、北京信息科學技術研究發展基地、東北新材料與先進制造技術研究發展基地、光電研究院、戰略能源研究基地等。3.重組院屬科研機構知識創新工程試點啟動后，中國科學院通過研究所定位調整、研究所整合等方式進行了重組。1998～2010年對46個研究所進行重組，整合組建了16個研究所（院），包括數學與系統科學研究院、理化技術研究所、地理科學與資源研究所、國家天文臺、地質與地球物理研究所、遺傳與發育生物學研究所、金屬研究所、長春光學精密機械與物理研究所、東北地理與農業生態研究所、上海生命科學研究院、合肥物質科學研究院、廣州地球化學研究所、寒區旱區環境與工程研究所、新疆理化技術研究所、新疆生態與地理研究所、廣州能源研究所。例如，在原數學研究所、應用數學研究所、計算數學與工程計算研究所和系統科學研究所合并的基礎上組建數學與系統科學研究院，有利于集中優勢力量，解決重大數學科學問題，推進數學在國民經濟和社會發展中的應用研究。在原遺傳研究所和發育生物學研究所基礎上，整合原石家莊農業現代化研究所，組建遺傳與發育生物學研究所，顯著提升了研究所在水稻基因組功能基因的分離鑒定、轉基因技術、作物優良品種選育和推廣等領域創新能力。同期，7個法人科研機構定位調整并更名：過程工程研究所、微電子研究所、上海微系統與信息技術研究所、上海應用物理研究所、亞熱帶農業生態研究所、國家授時中心、對地觀測與數字地球科學中心。4.新建共建科研機構中國科學院瞄準世界科技發展前沿和經濟社會發展需要，布局新建青藏高原研究所、國家納米科學中心、光電研究院、地球環境研究所、北京基因組研究所5個法人研究機構，與地方政府共建煙臺海岸帶研究所、蘇州納米技術與納米仿生研究所、深圳先進技術研究院、青島生物能源與過程研究所、寧波材料技術與工程研究所、廣州生物醫藥與健康研究院、城市環境研究所7個法人研究機構。在交叉新興學科方向新建了30多個非法人研究單位。（八）創新國內外開放合作模式1.探索與國內其他創新主體合作新模式按照“優勢互補、合作雙贏”的思路，著力加強院校和院地合作。拓展前沿交叉領域研究，促進成果轉化。提升滿足需求的能力。依托大科學裝置，通過共建機構、合作培養人才、聯合承擔國家任務等多種方式，與大學建立起了功能互補、競爭合作、聯合互動的關系，與北京大學、清華大學共建了國家納米科學中心，與上海交通大學醫學院共建了上海健康科學研究所，與大學共同籌建了2個國家實驗室、6個國家重點實驗室以及82個聯合研究中心1萬多名客座研究員和高級訪問學者。構建院地合作工作體系，實施以地方需求為牽引的東、中、西三大板塊的院地合作、科技成果轉移轉化戰略，建設產業技術創新與育成中心、科技園區和中介型技術轉移中心等成果轉化平臺，為區域創新發展提供科技支撐。2.探索對外合作交流新模式中國科學院堅持“獨立自主、合作共贏，立足前沿、著眼長遠，突出重點、注重實效”的原則，加強與國際科技界共同開展戰略研究，與德國馬普學會、英國皇家學會建立戰略研究機制，定期與日本、美國、澳大利亞等召開雙邊高層戰略研討會，實施“中國科學院外國專家特聘研究員計劃”“中國科學院外籍青年科學家計劃”“中國科學院愛因斯坦講席教授計劃”“中國科學院國際組織梯隊建設計劃”“中國科學院國際組織任職人員出訪資助計劃”“中國科學院—發展中國家科學院獎學金計劃”“中國科學院對外合作重點項目計劃”等，與法國、俄羅斯、德國、美國等國的科研機構、大學和企業等共建聯合實驗室（研究所），與香港大學等6所大學成立了13個聯合實驗室，設立了“中國科學院國際科技合作獎”等國際獎項，推動國際合作，與港澳臺合作逐步從一般性交流向實質性合作轉變，從分散合作向重大集成合作轉變，從單邊合作向多邊合作轉變，從跟蹤模仿向牽頭組織轉變，從學術合作為主向學術、技術合作并重轉變，從短期合作為主向短期、長期合作結合轉變，提高了中國科學院創新能力和在國際學界中的地位。三知識創新工程試點工作成效與影響中國科學院知識創新工程試點不僅顯著提升了中國科學院的科技創新能力，帶動了國家創新體系與基礎能力建設以及中國全社會創新意識的提升，增強了中國科技界創新自信，擴大了中國科學家的國際影響力，而且為深化科技體制機制改革和推進創新文化建設提供了寶貴實踐經驗，對其他科研機構和大學的改革創新發展有重要的引領示范作用。（一）知識創新工程試點的總體成效中國科學院知識創新工程試點（1998～2010年）成效顯著，總體呈現良好發展態勢。一是重大創新成果不斷涌現，取得了一批事關現代化全局的戰略高技術創新成果和一批事關經濟社會全面協調可持續發展的重大公益性科技創新成果，在重要基礎前沿領域取得了一批原創成果。二是科技布局更加合理，確立了新的科技創新目標，培育了一批新的科技生長點，學科布局更加適應世界科技發展趨勢和國家經濟社會發展需要。三是體制機制改革取得突破，用人制度、分配制度、資源配置制度、評價獎勵制度改革探索，加速了創新資源向創新能力強、創新效率高的創新單元集聚，形成了競爭向上、協同發展的良好局面。四是科技創新隊伍代際轉移順利完成，人才結構日趨合理，一批青年科研和管理帶頭人嶄露頭角，創新能力顯著提高，在國際科學界的學術地位與影響顯著提高。五是創新文化建設成效日益顯現，“科學、民主、愛國、奉獻”的傳統、“唯實、求真、協力、創新”的院風和“依法辦院、以德興院”的理念逐步深入人心，科研人員精神面貌煥然一新。從科研產出來看，中國科學院科技產出數量快速提升，產出質量呈現較快提升勢頭，國際學術影響力顯著提升。中國科學院在86個國立科研機構學術影響力排名中，有14個學科居于前10位，化學、材料科學、數學、工程學、計算機科學、環境與生態學、地球科學、物理學8個學科位居前5位。1999年1月至2009年2月，按入圍《工程科學索引（ESI）》論文被引頻次世界科研機構排名，中國科學院材料科學、化學位居第1位，物理學、工程學、數學分別位居第6位、第7位、第8位。1998～2010年，累計申請國內專利47119件，其中83.7%為發明專利，累計獲國內專利授權22546件。1998～2010年共獲得國家自然科學獎、國家技術發明獎和國家科學技術進步獎367項，其中獲國家自然科學獎數量占全國總數的40%。2014年以來連續4年獲得國家自然科學一等獎。2016年獲得8435件發明專利授權，自2014年自然出版集團首次發布自然指數榜單以來，中國科學院一直名列全球學術機構首位。[3]（二）知識創新工程試