ICS07080

A40.

中華人民共和國國家標準

GB/T34798—2017

核酸數據庫序列格式規范

Formatsspecificationsofnucleotidesequencedatabase

2017-11-01發布2018-05-01實施

中華人民共和國國家質量監督檢驗檢疫總局發布

中國國家標準化管理委員會

GB/T34798—2017

目次

前言

…………………………Ⅲ

范圍

1………………………1

規范性引用文件

2…………………………1

術語和定義

3………………1

縮略語

4……………………2

核酸序列格式規范制定的總則

5…………2

核酸序列描述規范

6………………………2

核酸序列特征描述規范

7…………………3

核酸序列格式規范

8………………………5

核酸序列文件整體格式規范

9……………5

附錄資料性附錄核苷酸含義表

A()……………………6

附錄資料性附錄與核酸相關的特征關鍵詞表

B()……………………7

附錄資料性附錄密碼子表

C()…………10

附錄資料性附錄修飾堿基表

D()………………………11

附錄資料性附錄限定詞中英文對照表

E()……………13

附錄資料性附錄核酸序列文件樣例

F()………………14

附錄資料性附錄行首大寫字母含義表

G()……………15

參考文獻

……………………16

Ⅰ

GB/T34798—2017

前言

本標準按照給出的規則起草

GB/T1.1—2009。

本標準由全國生化檢測標準化技術委員會提出并歸口

(SAC/TC387)。

本標準起草單位深圳華大基因研究院深圳華大基因科技有限公司廣東省標準化研究院廣東產

:、、、

品質量監督檢驗研究院

。

本標準主要起草人魏曉鋒陳鳳珍劉克杜佳婷李倩一沈維燕李啟沅謝強王娟譚嘉力

:、、、、、、、、、、

宋祚錕黃江勇

、。

Ⅲ

GB/T34798—2017

核酸數據庫序列格式規范

1范圍

本標準規定了核酸數據庫的序列格式包括生物體基因組核酸序列特征規范制定的總則序列描述

,、

格式規范序列特征描述規范和序列格式規范等

、。

本標準適用于生物體基因組核酸數據庫序列文件的編寫

。

2規范性引用文件

下列文件對于本文件的應用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件

。,()。

生物信息學術語

GB/T29859

核苷酸和或氨基酸序列表和序列表電子文件標準

ZC0003/

3術語和定義

界定的以及下列術語和定義適用于本文件

GB/T29859。

31

.

核酸數據庫nucleicaciddatabase

以核酸序列為基本內容并附有核酸序列注釋信息的數據庫

,。

32

.

編碼序列codingsequence

編碼一段蛋白產物的序列始于起始密碼子終于終止密碼子

,,。

33

.

序列組裝sequenceassembly

基因組長序列打斷之后形成較短的序列通過算法和計算機的幫助把這些短的序列組裝起來成為

,,

一條完整有序的序列的過程

。

34

.

甲基化methylation

蛋白質和核酸的一種重要的修飾調節基因的表達和關閉

,。

35

.

識別碼identifier

某個體系中相對唯一的編碼

。

36

.

位置location

一個或一