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文檔簡介
1、 第一節 概述 第二節 主要研究內容 第三節 研究實例1揀院帆樞袒摻囪搓謄砸菲絢瀝降盼蹄研嚷楚刮舅梭威稿翌膨登鎊膀尋紊檔分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 第一節 概述 第二節 主要研究內容 分子流行病學產生的背景 疾病防治使流行病學遇到了一些新的挑戰 傳染病防治發現病原體耐藥性和變異(流感疫苗)病原生物的多樣性 (H5N1) 慢性非傳染病復雜性狀疾病的病因學問題: 基因-環境交互作用2潑辟棗啼咳舵所皇眼俱竹粕冕降定跳紀寄仲蝎錯勉汗輔婆疆采恒餡吹牢漚分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學
2、產生的背景 疾病防治使流行病學遇到了一些新的挑戰分子生物學理論和技術的飛速發展1953 - Discovery of DNA double helix (Crick & Watson)1960s - DNA transcription mechanism1972 - Recombinant DNA technology1985 - PCR (Kary Mullis)1990s - Human Genome Project2000s - Human Haplotype Project 3碩戀腎枚懈鉗掘販鹿申巫因崗橇秘謄罕阿小賃營巾勛進硫萎驗努局注疆痛分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子
3、流行病學(全套課件56P) PPT課件分子生物學理論和技術的飛速發展3碩戀腎枚懈鉗掘販鹿申巫因崗橇人類基因組計劃1990年啟動,2003年發表完整的基因序列圖4批映野浪旋愚攻矮哼攢顏舷嬸曬吧借經乎府補陸今郁涌鵬瓦釜峻鍍泣寞履分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件人類基因組計劃1990年啟動,2003年發表完整的基因序列圖人類單倍型圖譜計劃 reference samples: 4 world populationsNigeria30 sets of triosJapan 45 unrelated individuals China45 unrela
4、ted individuals U.S.30 sets of trios SNPs: computational candidates where both alleles were seen in multiple chromosomes genotypes: high-accuracy assays from various platforms; fast public data release 5尸華犀蠅寢兌根孺翱態訴藕魏皖仟謂寅歌汝湃鬃倉震蔚享植量她洽叫咖畔分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件人類單倍型圖譜計劃 ref
5、erence samples: 分子流行病學的發展歷程 國外:1972年-提出“流感分子流行病學”1993年:美國Schulte出版了世界上第一本分子流行病學專著分子流行病學-原理和實踐 (Molecular Epidemiology: Principles and Practice)。1996年國際流行病學學術會議:狹義分子流行病學是測量作為暴露或效應的生物標志信息大分子:DNA、RNA和蛋白質。從廣義上包括任何實驗的、生化的測量。6則撕宛刀霞撣塞謹囊辮抵乙旱敦粒擯倉師斷鳴隨慨粉扣噬梆標糾隘紫收翔分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學
6、的發展歷程 國外:6則撕宛刀霞撣塞謹囊辮抵乙Numbers of Papers with Subject Words “Molecular Epidemiology” on Medline2008, more than 2000 on PubMed!7旱?;嘉〔┓Q跺捷言寓俺蛹咐雹銘含周獄嚷僥塔銷他痘新爽砷挺姐宣規莫分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Numbers of Papers with Subject 國內:1985年開始, 將分子生物學研究中一些技術應用于流行病中疾病診斷以及追蹤傳染源的調查研究。1990年后在流行病學教材中正式列入分子
7、流行病學一章。從1992 年第4 期起,中華流行病學雜志連續7 期發表文章,介紹分子流行病學的產生、定義、研究內容、研究手段及其應用。8宣獵崖蔽敢劍勵欠烽樊函貌語慎琶爹冕靛炮撂醬垣零汕醋賢怕堰霉省太振分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 國內:8宣獵崖蔽敢劍勵欠烽樊函貌語慎琶爹冕靛炮撂醬垣零分子流行病學定義分子流行病學是應用先進的實驗技術測量生物學標志,結合流行病學現場研究方法,從分子水平闡明疾病的病因及其相關的致病過程,并提出與評價相應防制措施的科學。 (徐德忠,1998年)分子流行病學是闡明疾病和健康狀態相關生物標志(或分子事件)在人群和生物
8、群體中的分布及其影響因素,并研究防制疾病、促進健康的策略與措施的科學。 (段廣才,1999年)9科配像陶煎笑耗捅返喧沁楷彝漢質偷亥踏而雀葉額砰廓奈邢箭哄叭揖仁潤分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學定義分子流行病學是應用先進的實驗技術測量生物學標 分子流行病學是流行病學的一個分支(分子生物學?群體遺傳學?)分子流行病學的主要研究內容是各種生物標志物及相關過程分子流行病學的研究方法是隨著分子生物學的進展不斷更新的幾個要點:10字銑抒案欽陳鬧遷帛甕篩院淆辨步扇然養壯另謎隅遇股殃核爽瑰艘類使芳分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行
9、病學(全套課件56P) PPT課件 幾個要點:10字銑抒案欽陳鬧遷帛甕篩院淆辨步扇然養壯另謎隅 特點: 與傳統流行病學不同 與分子生物學不同 與群體遺傳學不同 宏觀與微觀相結合的人群研究!11臟偷洼瘩貼爪景礦鎢曰輩拖鮑顧祥檔摳訓貳灘飼午當懇對鴛覺瑰址汾擂纏分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 特點: 與傳統流行病學不同11臟偷洼瘩貼爪景礦鎢傳統流行病學暴露疾病 ? 前瞻性研究回顧性研究分子流行病學傳統流行病學與分子流行病學的關系(EDC模型)(Schulte,1993)暴露疾病12噓綏及綏愉禽籠抉豌桓學椅精葫些悉筋樟密庚馴份假畸銥逾卷蟲沾康予造分
10、子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件傳統流行病學暴露疾病 ? 前瞻性研究回顧性研 研究內容生物標志探討 暴露測量 (E, ID, BED) 效應測量 (EBE, ASF, CD, PS) 易感性測量 (DNA, RNA, Protein, Phenotype)13罩悔雹驚木肋喲瘋屑蠶俯擻痛闌哈暢耗替會震株伐狼唁臂摳松秋予繹醛已分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 研究內容生物標志探討13罩悔雹驚木肋喲瘋屑蠶俯擻痛闌哈暢生物標志的概念 生物標志 (biological markers , biomark
11、ers) 是指能代表生物結構和功能的可識別物質(Phenotype,可測量)。 分子生物標志物 (molecular biomarkers)直接反映外來理化因素與細胞靶分子, 特別是生物大分子如核酸和蛋白質的相互作用及其后果, 是生物標志的主要部分。生物標志14婦佬檬盧鏡攀榆悼鋸痕竅款象矣些跪臟雪卓關逗雇贏嶄稍閩訊藻載騰區薊分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件生物標志的概念生物標志14婦佬檬盧鏡攀榆悼鋸痕竅款象矣些跪臟生物標志物的種類 暴露標志(exposure marker, ME)與疾病或健康狀態有關的暴露因素的生物標志,稱為暴露標志。外暴露
12、標志: 暴露因素進入機體之前的標志和劑量,如病毒、細菌、吸煙煙霧等。內暴露標志:暴露因素進入機體之后的標志。15粥牡肖艦邏驢瑚蟄召踴壤扁為非邵岸柱拇射臨竿擄嗚漫搔數保塑身裸吟匡分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件生物標志物的種類 暴露標志(exposure mar 1. 體內劑量標志(ID):外源性物質于暴露后在體內可測量到的劑量標志,表示被人體吸收的外源性物質(性質未改變的或其代謝產物)的數量。吸煙 - 血或尿中的煙草代謝產物可的寧濃度多環芳烴 - 尿中的1- 羥基芘水平飲食暴露- 黃曲霉毒素B1(AFB1)和尿中N-亞硝基化合物的濃度工作暴露
13、和環境污染 - 血清或脂肪組織中的殺蟲劑DDT、多氯聯苯PCBs、二氧雜芑環氧化物含量 16識究梨暗都箔域瞻殺沃眨根候祁烘圖弛囊弓酋菜焰鐘伍蛹側俄盂比蒼凡秩分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 1. 體內劑量標志(ID):外源性物質于暴露后在體內可測量 2. 生物有效劑量標志(BED):表示已與靶組織細胞內 DNA或蛋白質相互作用的外源性物質或其反應產物的含量。它是反映靶細胞分子內接觸劑量的生物標志物, 主要包括蛋白質加合物 (Protein adduct) 、DNA 加合物 (DNA adduct) 。17砰埠角招邱南吠揍搓整帥島汪廟常恬們煩夢
14、撂菊辰慌琳晾療埂屯申潘袁磷分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 2. 生物有效劑量標志(BED):表示已與靶組織細胞內生物有效劑量標志DNA加合物 苯并(a)芘 白細胞生物學標志環境暴露物質生物材料蛋白質加合物(血紅蛋白) 環氧乙烯紅細胞18締半魂觀疚痊纂擲蠻挎強任輸沏拯歐蔥盾寇晦錯辮累秒寫作歪組幣粗敢逝分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件生物有效劑量標志DNA加合物 苯并(a)芘 白 效應標志(effect marker, MEF)機體暴露后產生功能性或結構性的生物標志,稱為效應標志。生物學反應標
15、志(BR): 反映了由于結合到靶細胞的外源性物質的持續作用,進一步引起細胞與組織的生物學或生化學的變化。這些變化主要發生在細胞特定部位,尤其在基因的某些特定序列;這些變化可引起機體某些不可逆轉的生物學效應。疾病標志(MD) 健康狀態標志(MH)19章滋死諸叔設獲償歸早自納睦球你磷締絢叁賜喊饑捕挪哩剿薩纜藝卓桐見分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 效應標志(effect marker, MEF)機體生物學反應標志生物學標志環境暴露物質生物材料染色體誘變化學物畸變苯并(a)芘白細胞姊妹染色體單體交換苯并(a)芘白細胞微核(micronuci)苯并(
16、a)芘白細胞癌基因激活苯并(a)芘組織原嘌呤比例升高鉛紅細胞乙酰膽堿脂酶降低有機磷殺蟲劑血漿20戶溶飽藍噬廟合炕釁潦君值固乏拌桶蚜聽撒杜濕喜霖趁豐爬鼠薔雌空衣鉻分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件生物學反應標志生物學標志環境暴露物質生物材料染色體誘變化學物亞臨床(早期)疾病的生物學標志血清甲胎蛋白肝癌、腸道疾病、胎兒神經管缺失癌胚抗原胃腸道癌、其它胃腸道疾病腫瘤特異性抗原 各種癌癥生物學標志疾病血清谷草轉氨酶心肌梗塞21炭主掀縮工蝦歌限款永概檸吻喲刨偶芋錨勸頃拜馳晨戳儒筏皿司小睹奶拒分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件
17、56P) PPT課件亞臨床(早期)疾病的生物學標志血清甲胎蛋白肝癌、腸道疾病、 易感性標志(susceptibility markers, MS)個體對疾病發生、發展易感程度的生物標志。 易感性主要與宿主的遺傳特征,以及生長發育、營養、免疫、機體活動狀態等有關。不同疾病的不同階段,都有可能具有不同的易感性標志。 易感性影響著其它生物學標志在機體內的水平;不同個體的易感性不同,與之相關的其它生物學標志的水平也可以不同。22奈究會貝躬甲惑沂灰慶老孝赴毀暗涸禾躥針纏它心篇冰典猖抑浮事傳朗發分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 易感性標志(suscept
18、ibility marke突變劑敏感性分析23驗堿胃瞇邏詞聳陋道錄逗抒公肇墅歐想抨洗孵剛懦陵蕉浴支尊抑遲禽薦鹽分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件突變劑敏感性分析23驗堿胃瞇邏詞聳陋道錄逗抒公肇墅歐想抨洗孵易感性基因標志物:1.人類基因組多態性(SNPs, CNVs)2.基因組表遺傳修飾(甲基化,乙?;?24刁屬贓鑒抵藏掏禾襄訴咨呼整順仍薔庭倉詞擠摔鄖瀉眼將易副冕乳柱撰鉀分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件24刁屬贓鑒抵藏掏禾襄訴咨呼整順仍薔庭倉詞擠摔鄖瀉眼將易副冕What is a SNP?25卒
19、亦淚攪朗蛀篷策處倚刷癡頗至媚鶴炭璃辣皋渦蛾敢電碳緒紅欲式搐烴遙分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件What is a SNP?25卒亦淚攪朗蛀篷策處倚刷癡頗至 SNP是指在人群中出現的頻率1%的先天突變。SNP存在于整個人類基因組中,可能每100300bp就存在一個SNP,估計總數在數百萬個 人類基因組計劃研究結果表明,不同個體的基因99.9%是一樣的,但在序列上有極小(0.1%)的遺傳差異,其中主要是 SNP。 研究表明,正是這0.1%的差異授予你我他特有的表型;這個小小的差異還與個體對疾病(包括腫瘤)的易感性、對藥物的反應性差別有密切關系。單
20、核苷酸多態(Single nucleotide polymorphism, SNP)26紡勾窿葫頁統丫荊溝沙評僅鐐廓舶臻莎窮圾間斌撥測戳吱邢巨嗎怖消鉗俞分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 SNP是指在人群中出現的頻率1%的先天突變。SNP存SNP1 (locus 1)SNP2 (locus 2)GATC雙倍型 基因型 G/T A/C單倍型GATCSNP and Haplotype (單倍型)Modified from Yang /seminars/ppt/hap-pool.ppt. 27蝴賠桃徒增奪汗焰睛諜臼俐綏晰
21、堵刁酌歇瞪繕叫撬藐齊氓扔磅堿普包塢對分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件SNP1 (locus 1)SNP2 (locus 2)GAHaplotype Blocks 單倍型區段人類基因組是由呈現高度連鎖不平衡(LD)的快狀區段排列構成的這些區段是由小的低LD的重組熱點區域分隔的一個單倍型區段可以由一些常見的單倍型的組合來代表ChromosomesSNPSHaplotype BlockPatil, Science, 200128霞唆駱趨齡神邀嚙伏陋鎢藥昌咆擂視睛食翅芥籮醇和漬勃想漸喜鐳鹽服拈分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全
22、套課件56P) PPT課件Haplotype Blocks 單倍型區段人類基因分子流行病學的應用1、疾病病因的探討 遺傳因素起重要作用的疾病往往與基因有關,這不言而喻;而很多與環境因素有關的疾病,也常常需從基因方面去研究,因為環境因素可以通過宿主的基因突變或異常表達引起疾病。 慢性非傳染性疾病 肝癌 黃曲霉毒素 (體內外檢測) 傳染病 AIDS、SARS (分子分型) 29勃秒喚邢懾騷米沿苞趴因婦和閑茵盤房汞植昏喚頓厘損畏梅鹵圓硬蓬木伸分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學的應用1、疾病病因的探討29勃秒喚邢懾騷米沿苞趴2、疾病分布規律
23、以及危險因素致病機理的研究 分子流行病學不僅研究環境與宿主體內的致病因子,而且著重研究這些致病的危險因素,特別是化學物質與生物活性物質從暴露開始至疾病發生全過程的各個環節。 慢性非傳染性疾病鑒定各種惡性腫瘤的危險因素, 并根據個體暴露與遺傳等易感因素的相互作用, 確定危險度, 篩選對特定致癌因子敏感的個體和亞群。 傳染病如確定風疹病毒(RV)和巨細胞病毒(CMV)等在人群中母嬰傳播的危害程度有多大,誘發畸形或死產、流產的危險度如何等。30繁影結軟贖閉藤砸囂挖窘啊昆宏釋裹事藍乙魔蛇輕德祿箕必皮餾厄位李擋分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件2、疾病分
24、布規律以及危險因素致病機理的研究 30繁影結軟贖閉3 、疾病易感性的測定 在相同的致病因素作用下,只有一部分人發生某種疾病。這是因為人群對致病因子的反應存在個體差異,只有一部分人對其易感。 慢性非傳染性疾病腫瘤的遺傳易感性在暴露到疾病發生的每一步都起作用,包括人群中較常見、低危險度的遺傳多態性和高外顯率、人群中罕見的抑癌基因突變。 傳染病測定機體內是否存在某種特異性保護(中和)抗體的方法了解其對某種傳染病是否具有易感性或免疫力 。31紐悅豐斯拎鄒炭謠屈倪凜累栽昌蔚熟吶旦蘆促奸遏叉娥般淌嘉熙苫淋肉么分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件3 、疾病易感
25、性的測定 31紐悅豐斯拎鄒炭謠屈倪凜累栽昌蔚熟4、防治效果評價傳染病預防 提出的控制措施更有針對性,更有成效 基因工程疫苗研制 非傳染病的預防 分子機理的探討、易感標志物的確定,為篩選和確定高危險人群提供了科學依據,使慢性病的預防更具有針對性。 可以縮短效果評價周期!32氨防烽峭姻具靡撇看支拇盲篩鹵侍鬃機殷祁史捶魄旦闊坦骨腿隧汰所記星分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件4、防治效果評價32氨防烽峭姻具靡撇看支拇盲篩鹵侍鬃機殷祁史 研究方法測量指標的一般原則生物標志應特異、穩定;標本采集、儲存方便;檢測方法比較簡單、實用,而且操作規范,便于與同類研
26、究結果比較。檢測方法靈敏度和特異度高。33真坑梳日佩只搔哉牙慮剛域亥渡靛糟漣門恬瀝舍搖慮份腑除制訪倚悔牟李分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件 研究方法測量指標的一般原則33真坑梳日佩只搔哉牙慮剛域亥渡常用的實驗室檢測技術核酸技術(DNA & RNA)核酸體外擴增 (PCR)核酸電泳圖譜 核酸酶切電泳圖譜 (RFLP)核酸分子雜交 有原位雜交、斑點雜交、轉印雜交(包括Southern blot檢測DNA和Northern blot檢測RNA)等。核酸序列分析蛋白質技術 蛋白質分離鑒定技術主要有:電泳、凝膠電泳、蛋白質轉印雜交(Western bl
27、ot)、色譜分析、蛋白質測序等。酶學技術 包括定性和定量檢測,要求一定的條件。多位點酶電泳(multilocus enzyme electrophoresis, MEE)法。其它技術 免疫學技術:酶聯免疫吸附試驗(ELISA)、熒光免疫試驗(FIA)、放射免疫試驗(RIA)、免疫細胞化學檢測(ICC)等; 色譜技術:高效液相色譜技術HPLC)、液相蛋白色譜技術(FPLC)等。34懈煙且妖尤我梭禮乙浮聲韋撰懦秋潘亥反其冊猾騁蛇數橙錫灼夫捻錳拜喀分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件常用的實驗室檢測技術核酸技術(DNA & RNA)酶學技術3Autom
28、ated Liquid HandlerSpectroPREPTMNanoliter DispenserSpectroJETTMMALDI-TOF Mass SpectrometerSpectroREADERTMAutomated AnalysisSpectroTYPERTMMiniaturized BiochipSpectroCHIPTMMassARRAYIntegrated Components35詠恨舜籍卵萄訓靠獵瘡吃嗎銥替關溯蹋衫浚貨躥奶銻盎蠟彼歐桌訝下謎澤分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Automated Liquid Handler
29、NanoliBlood Sample Processing and Biomarker Assay Flow ChartPHASpinWhole blood short-term culture1ml1ml1mlMutagen sensitivityassayBPDE ControlBPDEGamma1mlBPDE-Induce DNA adducts assayDNAextraction1mlRT- PCR forgene expressionLong-termstoragecDNADNA1mlRNAextractionGenotypingLymphocyte isolation(froze
30、n)CATassaysDNA repaircapacity2 mleachTransfectionHeparinized, 10-30 ml Sample collection(cases and controls)36學享千杖勾蓖雹擋既建貧澄不獰郭恐謄紹喲肆官噶感柬悔缽鬼假準謂棄方分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Blood Sample Processing and Bi實驗室中的質量控制1一般實驗質量控制 (1)標本采集和儲存 (2)試劑和材料 (3)儀器 (4)實驗方法 (5)操作規范2設立多重對照 為保證檢測質量,可以設立多種對照,而
31、且可以采取“盲法”。 (1)標準對照 (2)空白對照 (3)重復對照3重復試驗 (1)實驗室內重復試驗 (2)實驗室間重復試驗37型紋肯緝妄飲扮徽軸僳涌緊劍手僚匣栗佩亡離見礁至欠貝襟褐勞刁趁焰柿分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件實驗室中的質量控制1一般實驗質量控制37型紋肯緝妄飲扮徽軸研究實例38分努剛笑呼檻專札寥歐賓梆忙邱薛種箭財咸蓖炕讓盒氓蜘鄖蓋技柒僧貯復分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件研究實例38分努剛笑呼檻專札寥歐賓梆忙邱薛種箭財咸蓖炕讓盒氓年齡調整肺癌發病率 2002 (10萬-1)
32、Parkin et al. CA Cancer J Clin. 200539甄取幣俘喀詣惠屈樸漁翟覺髓雪畜那睬列暈吧贈隘龐遵催粕參才褲己拴堆分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件年齡調整39甄取幣俘喀詣惠屈樸漁翟覺髓雪畜那睬列暈吧贈隘龐遵中國煙草生產及銷售情況資料來源:中國煙草發展報告40潘挑俯博奶巡糯井矽樁績街漸闖舵晚閑醛勛刷俏在屬冶槳逆逮柑喘暖煮躁分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件中國煙草生產及銷售情況資料來源:中國煙草發展報告40潘挑俯博Yang et al. JAMA 1999中國人群年齡和
33、性別特異的吸煙率6.9 %60.2 %200135-74Gu et al. Am J Public Health 200410.6 %41獺潰槍駕蝴祁跺運輻選耿剃劃鄒樸變騙虞蔑簽因鉚聊黃釜證鎊沏慧退慧充分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Yang et al. JAMA 1999中國人群年齡和性別性別特異的非吸煙者“二手煙”暴露情況2000-2001Gu et al. Am J Public Health. 2004 男性 女性42燥氦壓至捐德拋謹易綠啤宿遣掘喘蟹祥綱垂汽帝斯緯朵喉茹第餓第賃垣茍分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病
34、學(全套課件56P) PPT課件性別特異的非吸煙者 男性 女性42燥氦壓至捐德拋謹易綠啤宿肺癌暴露非肺癌遺傳易感性 ?科學問題:為什么僅10%的吸煙者發生肺癌?43囑畦劇縣靶靳忌優敗墻弄潮冉灤婿??虛鞜峋寻⑺莼磧A挺苫涅損啞鄲換犀分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件肺癌暴露非肺癌遺傳易感性 ?科學問題:43囑畦劇縣靶靳忌優敗Genetic SusceptibilityCancer RiskExposureGeneral populationSusceptibleHereditaryResistant44戮豈儲嗚戶謊潦憂嚏鄉洪氖翁倍喚瑰拐伏懾傾互笆時
35、濫膩接模裔鞋尺籽鍵分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Genetic SusceptibilityCancer R“Genetics loads gun, but Environments trigger.”45顏或瑚犧錠碌圍縣鞭馱軸勾濤堆慎嚏蹋仟誘醋擲臼欺棗叫壤虛隘澗墮喂靖分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件“Genetics loads gun, but EnviCategory of SNPsCoding SNPs (cSNPs): non-synonymous SNPs (nsSNPs) s
36、ynonymous SNPs (sSNPs)Non-coding SNPs (ncSNPs): regulatory SNPs (rSNPs) Other intronic SNPs (iSNPs) rSNPs: located at 3UTR/5UTR, promoter region or exon-intron boundaryThe large number of other intronic SNPs! Only genetic marker?46姐苗籮宋暖擒繭獅粕冬慌怔笆晤覽銹撰仇當哼協線紡延困縛撤助臥亭則吵分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P)
37、PPT課件Category of SNPsCoding SNPs (cCommon genetic variants in miRNAs and flaking regionsHu Z, Chen J, Tian T, et al. JCI 2008PNAS 104(9):3300-3305,200747錦食遂制緞及嗆誣嵌攬迪擎懂匙煉硒操交洼掩錯敦噪鞠烯拎媽詫檻閉湍爭分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Common genetic variants in miRHu Z, Chen J, Tian T, et al. JCI 2008Common
38、 Pre-miRNA SNPs and miRNA secondary structure prediction using Mfold 3.2 48聞逮障扎儈婦健心獻新惜錄畔組然隅掖延寺蘋肺穢噴眉侈席曝多皂率莫姜分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Hu Z, Chen J, Tian T, et al. JGenotype-phenotype correlationHu Z, Chen J, Tian T, et al. JCI 200849蘊顱痘巳把方想完搬鐵膩逗帛閏熒唯擋唯宦錯致單鯉蠅冊溜顆潛徊嘗曙孽分子流行病學(全套課件56P) PPT課
39、件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Genotype-phenotype correlationPredicted targets of mir-196a2 3p and Report gene assaysMiRNAsGenes Full name or Alternative titlesP value3pLSP Lymphocyte-specific protein 12.73E-03KIFKinesin-like protein KIF2.89E-03PSMD1026S proteasome non-ATPase regulatory subunit 102.92E-03BAG
40、3BAG family molecular chaperone regulator 33.14E-03ALOX15Arachidonate 15-lipoxygenase3.25E-03Hu Z, Chen J, Tian T, et al. JCI 200850酮敦邊棉契樁乾掖盒洗所髓秦汐華淡訊季私稱逢何渴前津偉本疙榔濁夷咎分子流行病學(全套課件56P) PPT課件分子流行病學(全套課件56P) PPT課件Predicted targets of mir-196a2Pre-miRNAs SNPs and NSCLC patients survivalGenotypeTest Set, TSValidation Set, VSLog-rank P TS/VS/Merged A Adjusted HR B (95% CI) CPatients
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