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文檔簡介

1、Word文檔 基因組DNA提取純化的注意事項 大多數動物組織可以用裂解緩沖液和蛋白酶/蛋白酶 K 進行高效裂解。在加入裂解液之前需要將組織切成小塊，有條件的話建議使用 TissueLyser 或研缽等提前進行均質化。骨骼肌，心臟，皮膚等組織含有收縮蛋白，結締組織和膠原蛋白，所以利用蛋白酶 / 蛋白酶 K 進行充分消化是必需的。 FFPE 樣本進行 DNA 純化時需要預裂解。福爾馬林可由 PBS 洗滌除去，石蠟可由二甲苯和乙醇進行去除。在蛋白酶消化后提高孵育的溫度有助于逆轉交聯，以便更好的從 FFPE 組織中釋放 DNA，從而有助于提高 DNA 產量和改善下游檢測性能。 從 FFPE 中得到的

2、DNA 通常比從新奇或凍存樣本中得到的 DNA 分子量小；DNA 降解的程度則取決于樣本類型，儲存時間和固定的條件。 從微量樣本中純化 DNA微量樣本中 DNA 的含量很低，通常小于 5 ng DNA, 通常需要使用 carrier RNA 來提高產量（不會影響下游分析檢測）。假如需要使用 carrier RNA，那么在測量 OD 的時候會由于使用 carrier RNA 造成濃度測量有偏差（由于 RNA 在 260 nm 也有汲取）。推舉使用 QIAamp DNA Micro Kit 從微量樣本中進行 DNA 純化，該試劑盒采納 MinElute 硅膠膜柱，洗脫體積可以低至 20 l，同時通

3、過兩步洗滌去除 PCR 抑制劑等污染物，最/大程度從微量樣本中純化 DNA。從血液樣本中純化 DNA血液樣本可以是新奇或凍存全血或干血片，由于血液樣本在采集后會快速凝固，所以通常在采血時使用 EDTA，檸檬酸鹽或肝素進行抗凝。經過抗凝處理的血液樣本可以直接用于 DNA 純化，需要留意的是使用的 DNA 純化方法需要能夠去除上述抗凝劑，以免干擾下游 PCR 檢測。全血也可以在 DNA 純化前先進行白細胞富集等再進行 DNA 純化。從血液中純化 DNA 的產量很大程度上取決于血液中的白細胞數量，而白細胞數量則和血液的供體狀況有很大關聯（如貧血或感染都會造成白細胞數量變化）。上述狀況必需在進行 DNA 純化前就應當考慮到。此外，有些動物有有核血，這意味著這類樣本中含有更多的 DNA，在從今類血樣中純化 DNA，上樣量需要削減 10 倍左右。從細胞中純化 DNA哺乳動物細胞可以使用蛋白酶 K 進行裂解酵母細胞需要首先使用溶/菌酶對細胞壁進行處理，然后使用蛋白酶或蛋白酶 K 進行消化很多細菌細胞可以使用裂解 buffer 和蛋白酶 / 蛋白酶 K 進行裂解，某些細菌如革蘭氏陽性菌需要預先使用溶菌/酶對細胞壁進行處理細菌細胞需要先從生物體液中沉淀，然后從中純化細菌 D

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