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文檔簡介
[10]的思想,編碼階段,輸入大小為H×W×3的彩色皮膚圖像,經過三次二維卷積(核大小為3)和最大池化操作后,再進行三次GHPA和兩次最大池化;同時SCB做橋接,解碼階段進行三次DGA、IEA操作和兩次雙線性插值后,再進行三次二維卷積操作和兩次雙線性插值后,最后最大池化輸出一個二元掩膜分割圖像。1)DGA(DilatedGatedAttentionBlock)圖17DGA模塊示意圖如圖17是DGA模塊示意圖。模塊的前半段SDC(SplitDilatedConvUnit)將輸入圖像按照通道劃分為四個區域,并利用擴張率分別為7、5、2、1的深度可分離卷積來獲取圖像整體和部分特征;連接操作后,實現圖像尺寸重構,卷積再融合信息,后半段GA(GatedAttentionUnit)通過深度可分離卷積(DW)產生符合圖像特征的圖像,去除無關的信息,使得模型關注更加關鍵的信息,最終殘差連通輸出結果,數學公式如公式14-17。 x1,x2 x1' X'= Att=σ(DW(X' Out=DWDWX'其中Clunk4是將輸入圖片沿通道分為4部分(x1,x2,x3,x4),Wi擴張卷積且2)IEA(InvertedExternalAttentionBlock)模塊是基于外界關注來表征數據集,增強樣本之間聯系。ExternalAttention指的是外部注意力,如圖18是IEA模塊示意圖。圖18IEA模塊示意圖該方法采用兩個儲存單元(Conv1D共用參數),來描述整體的特性。給定的輸入X(尺寸C×H×W)經過1*1卷積核復制操作后,改變他的大小為C×HW。MemoryUnit1是內存單元1,可以將特征圖通道數量擴大到原來4倍(尺寸變為4C×HW)。MemoryUnit2還原尺寸大小,再將圖像恢復到C×HW,最后1*1卷積后殘差運算,將圖像特征信息融合融合特征信息。3)SCB(SpatialandChannelAttentionBridgeBlock)模塊由SAB(SpatialAttentionBridge)和CAB(ChannelAttentionBridgeBlock)兩部分組成,兩部分分別對特征圖進行不同的信息提取和融合操作,從而獲得圖像更有代表性的特征。SAB通過共享二維卷積,對特征圖多階段信息融合,生成空間軸上的特征圖。如圖19是SAB結構圖。圖19SAB示意圖如上圖,每個階段的特征圖,沿通道維度分別采用最大池化和平均池化,再將其串聯得到具有兩個通道的特征圖(寬度和高度保持不變)。然后,利用共享的擴張卷積(擴張率是3)和sigmoid激活函數生成每個階段的空間注意力圖,最后空間注意力圖和原始特征圖內積后殘差連接輸出。CAB可以將圖像分割過程中各階段特征進行整體和局部融合,生成通道上的特征圖,如圖20是CAB結構示意圖。圖20CAB示意圖如上結構GAP是全局平均池化,Concat連接后,Con1D將多階段信息融合,FC全連接輸出后sigmoid回歸操作,最后殘差輸出。4)GHPA(Groupmulti-axisHadamardProductAttentionmodule) 模塊沿著通道維度將輸入均分為四組,并對前三組的高度-寬度、通道-高度、通道-寬度軸分別進行HPA(HadamardProductAttention),最后一組則只在特征映射上使用DW。最后,沿著通道維度將四組連接起來,并應用另外一個DW從不同角度整合信息。其中,DW的所有核大小為3,如公式19-22。 x1,x4= x2=x x3=x Out=DW(LN(cat([x1,x2 其中,BI是雙線性插值(BilinearInterpolation);permute是將tensor的維度換位的操作;Pxy是隨機初始化張量大小[1,C//4,a,b];Pzx是隨機初始化張量大小[1,1,C//4,a];Pzy是隨機初始化張量大小[1,1,C//4,b];LN如上公式所示,模塊的HPA操作就是給定一個輸入x和一個隨機初始化可學習張量p,首先對p進行雙線性插值操作,以調整p的大小適應于x,然后對p進行DW運算,最后x和p進行標準積運算獲得輸出。3.4模型損失函數 皮膚病分割是一個二分類分類任務,因此用到的損失函數是BceLoss(BinaryCrossEntropyLoss),但醫療圖像中常出現類別不均衡的情況,因此訓練結果常會被像素更多的類別主導,對于較小的類別學習不到位,從而降低了網絡的有效性,而DiceLoss正好可以解決這個問題,但對反向傳播會造成不利影響,因此研究人員將兩者融合在了一切,提出了BceDiceLoss函數,如公式23-25。 LBce=?1 LDice=1?2 LBceDice=λ其中,λ1和λ4結果分析本章將使用malunet模型在ISIC2018數據集上進行訓練,并對訓練結束后的損失函數和模型性能指標進行評價,另外對所使用的四個模塊進行功能對比,證明所用方案的合理性,最后將測試結果和其他模型比較,驗證所用模型在皮膚病灶分割輕量化方面的優勢。4.1數據集預處理Pytorch中的torchvision主要用于對圖像進行處理,為了提高模型的泛化能力,我們使用torchvision中的transforms模塊對數據進行預處理,比如:歸一化(ToTensor)、水平翻轉(RandomHorizontalFlip)、垂直翻(RandomVerticalFlip)和縮放(Resize)等。數據集結構如圖:,train是訓練數據集,分為圖像和相應二元掩膜存放,測試集和驗證數據集共用val文件數據。數據集結構如圖21。圖21數據集結構圖4.2訓練和測試4.2.1對比實驗 關于每個模塊在實驗中的分割效果這里做出可視化對比,如圖。通過圖示對比發現,GHPA、IEA和DGA在提取全局信息上都有一定的優勢,但GPHA在局部信息提取優勢更加突出,因此GHPA則單獨用于編碼部分,提取更多更據有代表性的信息,IEA和DGA置于解碼階段,橋接模塊SCB在局部信息提出優勢大其余三者,因此保持原有功能結構不變,如圖22是模塊分割效果對比圖。原圖PredDGAIEAGHPASCB組合圖22模塊分割效果對比圖4.2.2訓練結果訓練開始前需要設置的初始參數如表1。表1網絡各參數設定值超參數設定值學習率0.005最大訓練輪次300批尺寸8優化器種類AdamW權重衰減1e-5損失函數BceDiceloss訓練數據和測試數據的實驗后得到的損失和性能指標如下:圖23(a)模型訓練集和測試集損失變化圖23(b)模型訓練集和測試集mIoU變化由圖23(a)模型訓練集和測試集損失變化圖可知,隨著訓練次數的增加模型訓練損失和測試損失下降速度越來越快,越往后下降速度越來越慢,因為測試數據較少,所以兩者的損失差距會比較大。由圖23(b)模型訓練集和測試集mIoU變化圖可知,隨著訓練次數增加,模型的mIoU逐漸增加,最終可達到80%左右,結果表明,分割結果和真實情況非常相似。表2各模型在ISIC2018上的性能指標對比ModelParamsGFLOPsmIoUDSCUNetUNet++Attention-UnetUNeXt-SMyUnet7.7713.7877.8687.559.1634.9078.3187.838.7316.7478.4387.910.300.1079.0988.330.120.06779.2688.67從表2各模型在ISIC2018上的性能指標對比表可知,MUnet的Params和GFLOP相比于Unet縮減了64x和205x,同時相比于近年的輕量化網絡UNeXt-S減小了0.18M和0.033GFLOPs,而MyUnet的分割精度都比其余網絡有少量的提升。5總結與展望5.1總結本文就目前皮膚病灶分割算法在臨床下的應用情況和發展現狀為依據,設計了一套基于多種注意力機制的輕量化分割模型,在原有的Unet框架上加入了四個模塊,作用分別是:1)提取整體和局部特征;2)描述整個數據集的特征,加強樣本之間的聯系;3)將多階段,多尺度的特征信息融合在一起;4)將不同軸的特征信息融合。通過搭建此模型,本文實現了在平衡模型分割精度的同時,降低模型參數量和計算復雜度,從而達到輕量化的目標。對訓練后的模型進行測試,相比于原始的UNet模型的參數量降低了64倍,計算復雜度降低了205倍;同時,mIoU和DSC增加了1.7%和1.27%。5.2展望雖然目前的設計能夠實現輕量化目標,但它在分割精度上的提升并不是很顯著,且僅可用于皮膚病灶分割,不可用于其他醫療分割場景。因此,在未來的研究中,期望能結合更多優越的方法,在其他分割領域設計出更多性能優越的輕量化神經網絡模型模型。參考文獻鄧輝.基于深度學習的黑色素瘤分類算法研究[D].南京郵電大學,2023.DOI:10.27251/ki.gnjdc.2023.002076.蔣宏達,葉西寧.一種改進的I-Unet網絡的皮膚病圖像分割算法[J].現代電子技術,2019,42(12):52-56.DOI:10.16652/j.issn.1004-373x.2019.12.013.LONGJ,SHELHAMERE,DARRELLT.Fullyconvolutionalnetworksforsemanticsegmentation[C];Proceedingsofthe2015IEEEConferenceonComputerVisionandPatternRecognition.Piscataway:IEEE,2015:3431-3440.RONNEBERGERO,FISCHERP,BROXT.U-net:Convolutionalnetworksforbiomedicalimagesegmentation[C];Proceedingsofthe2015InternationalConferenceonMedicalImageComputingandComputer-AssistedIntervention.Cham:Springer,2015:234-241.MILLETARIF,NAVABN,AHMADISA.V-net:Fullyconvolutionalneuralnetworksforvolumetricmedicalimagesegmentation[C];Proceedingsofthe2016fourthInternationalConferenceon3DVision(3DV).Piscataway:IEEE,2016:565-571.曹玉紅,徐海,劉蓀傲等.基于深度學習的醫學影像分割研究綜述[J].計算機應用,2021,41(08):2273-2287.高明昊,逯洋.皮膚病灶圖像分割方法的分析與探討[J].福建電腦,2024,40(03):24-29.DOI:10.16707/ki.fjpc.2024.03.005.HuisiW,ShihuaiC,GuilianC,etal.FAT-Net:FeatureAdaptiveTransformersforAutomatedSkinLesionSegmentation[J].MedicalImageAnalysis,2021,76(prepublish):102327-.EGH,SimonO,Yee-WhyeT.Afastlearningalgorithmfordeepbeliefnets.[J].Neuralcomputation,2006,18(7):1527-54.RUANJ,XIANGS,XIEM,etal.MALUNet:AMulti-AttentionandLight-weightUNetforSkinLesionSegmentation[C].2022IEEEInternationalConferenceonBioinformatics
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