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文檔簡介
藥學與生物信息學教材:胡育筑主編《計算藥物分析》
中國醫藥科技出版社,2006年8月參考書目:程翼宇翟海斌《醫藥分析信息學及信息處理技術》化學工業出版社
2006年9月蔡祿《生物信息學教程》化學工業出版社2008年5月課時:34/34教師:趙迪思
課程名稱:藥學與生物信息學
簡介:研究應用數學、統計學和計算機科學的方法,設計或者選擇優化的藥學和化學實驗方法,并通過解析實驗數據獲取有關信息,內容包括藥學中的誤差和分析數據處理,實驗設計和優化,模式識別,分析質量控制方法及有關應用等。學時:34教學內容簡介化學計量學的興起和發展教學任務與特點主要內容與安排教學要求和方法4123第一章緒論分析化學今昔分析化學的三次變革分析化學擴展邊界---形成交叉學科分析化學延伸邊界形成許多交叉學科M/S——Math./StatisticsE——ElectronicsC——ComputerAC——AnalyticalChemistryE——EnvironmentalScienceLS——LifeScienceP/M——Physics/Material化學計量學的誕生交叉學科奠基人:瑞典-S.Wold美國-B.R.Kowalski1974年,由美國的B.R.Kowalski和瑞典的S.Wold等發起,在美國華盛頓大學成立了國際化學計量學學會。
背景:數據處理與信息提取計算機科學的發展化學測量數據維數的變化經典的二維圖譜A~;A~t;E~pH三維圖譜(DAD)HPLC-DAD什么是化學計量學?接口—交叉學科,邊緣學科定義—應用數學、統計學與計算機科學的方法,來設計或選擇最優的化學實驗方法,并從測量數據中最大限度地獲取化學及相關信息。概念說明化學計量關系化學統計學計算分析化學
由于化學計量學并不局限于統計分析,還包括許多其他數學方法,是一門通過學科交叉發展起來的新興化學學科。越來越多的化學工作者贊成使用化學計量學或分析化學計量學這個名稱,也有的建議使用計算分析化學或計算化學作為學科名稱。近年來,以化學信息為主要內容的一門信息學科——化學信息學(chemo-informatics)正在形成和興起。化學信息學的內容包括化學計量學的基本內容,還包括化學化工文獻學、化學數據庫、化學圖形學、化學教育的現代技術和遠程信息資源,本質上是國際互聯網網絡資源、化學數據庫和化學計量學的結合。在藥學學科的專業課程中,計算藥物分析實際就是藥學中的化學計量學,側重于化學計量學在藥學中的應用理論和方法的研究。化學計量學的任務與特點樣品分析的過程圖中成藥中硒的測定化學計量學的任務選擇或設計優化的實驗方法獲取分析對象的化學及相關信息化學計量學的理論和方法貫穿于整個分析測試過程中!首先必須建立方法,如確定用比色法、原子吸收分光光度法等。假設決定使用原子吸收分光光度法,我們必須選擇實驗條件,包括樣品制備方法、儀器條件等,以便確定實驗方案,即設計分析方法。分析方法建立后還要對方法進行優化和驗證。下一步分析測定,包括測試樣品的制備和測定。分析采樣理論是指試樣采集的數學統計理論。分析測定必須制備樣品并使用分析儀器。化學計量學更多地應用于分析的第三步——數據處理。分析檢測理論提供了對測量樣品分析檢測的數學統計基礎;校正則是從化學測量數據中取得有關物質系統成分定量信息的基本手段,化學計量學的理論和方法也就顯得更為重要。方法科學研究的
從人類基因組計劃(HGP)說起生物信息學曼哈頓原子彈計劃(1942-46)阿波羅登月計劃(1961-69)人類基因組計劃(1990-2003)20世紀三大科學計劃
生物信息學(bioinformatics)有許多不同的定義。基于生物信息學與分子生物學的密切關系,狹義的生物信息學專指應用信息技術儲存和分析基因組測序所產生的分子序列及其相關數據,也被稱為分子生物信息學。
廣義的生物信息學是指以核酸、蛋白質等生物大分子為主要研究對象,以信息、數理、計算機科學為主要研究手段,以計算機網絡為主要研究環境,以計算機軟件為主要研究工具,對序列數據進行儲存、管理、注釋、加工,對各種數據庫進行查詢、搜索、比較、分析,建構各種類型的專用數據庫信息系統,研究開發面向生物學家的新一代計算機軟件;并利用數理統計、模式識別、動態規劃、密碼解讀、語義解析、信令傳遞、神經網絡、遺傳算法以及隱馬氏模型等各種方法,對序列、結構數據進行定性和定量分析,從中獲取基因編碼、基因調控、序列-結構-功能關系等理性知識,闡明細胞、器官和個體的發生、發育、病變、衰亡的基本規律和時空聯系,探索生命起源、生物進化、生命本質等重大理論問題,最終建立“生物學周期表”。本課程的主要內容基本內容統計學與統計方法試驗設計與優化分析信號處理化學模式識別人工智能經典統計分析回歸和相關多元統計分析方差分析響應面理論析因試驗序貫優化方法并行優化方法計算分光光度法分析檢測理論濾波、平滑與求導因子分析法聚類分析線性學習機法K-最近鄰法定量構效關系人工神經網絡化學專家系統數據庫和譜圖檢索化學計量學在藥學中應用的理論、方法和技術
藥學專業藥物分析方向和中藥學專業中藥分析方向的一門專業課。上世紀80年代中期(1983年)由我國著名藥物分析學家安登魁教授創建。選修課---必修課。特色:學科交叉性、新穎性和藥學特色;強調方法學,重視綜合素質和能力的培養
學習這門課的目的與要求掌握計算藥學的基本原理和方法及其應用拓寬自己的知識面和視野,向通才發展TREETrendExchangeReviewExperiment
&Experience要求:知識+能力實用性+實踐性完成要求的基本習題熟練使用常用工具軟件(EXCEL、WORD、POWERPOINT)
初步掌握常用計算編程軟件(可選用Matlab、VB、SAS)
考核辦法:
平時(作業)
+考試聯系方式:
手機/p>
郵箱zhaodisi@163.com
Excel電子表格在定量分析中的應用
最為實用,最普遍應用:繪圖、統計、數據庫國際權威分析化學教材理論學習的基本內容,自20世紀90年代初期,Excel就被歐美分析化學教材推薦,應用于計算、統計和繪圖,成為分析化學工作者必不可少的計算機工具。藥學實驗室:質量標準、穩定性研究中的數據運算、繪圖、統計、貯存----研究資料1.1數據的輸入和計算輸入計算函數的應用格式averagestdev(插入-函數-統計)1.2數據的管理
1.編輯國際IUPAC原子量表
,搜索“iupacatomicweights”編輯/復制(或快捷鍵[Ctrl+c])把
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