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文檔簡介
ICS
11.220CCS
B
41DB42 DB42/T
—2022家禽疫病診斷技術規(guī)程第
2
測Code
diseases
seriesPart
Testmethodof
dual
probe
for
detecting
coli 湖北省市場監(jiān)督管理局 發(fā)
布DB42/T
1864.2—2022 前言
.................................................................................
II引言
.................................................................................
IV1
范圍
................................................................................
12
規(guī)范性引用文件
......................................................................
13
術語和定義
..........................................................................
14
縮略語
..............................................................................
15
原理
................................................................................
16
試驗條件
............................................................................
27
儀器設備
............................................................................
28
試劑或材料
..........................................................................
29
試驗步驟
............................................................................
310
結果判定
...........................................................................
411
生物安全措施
.......................................................................
4DB42/T
1864.2—2022 本文件按照GB/T
—《標準化工作導則 第1部分:標準化文件的結構和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。本文件DB42/T
1864《家禽疫病診斷技術規(guī)程》為系列標準。本部分為DB42/T
18642部分。DB42/T
1864發(fā)布了以下部分:——第
1
部分:家禽主要腫瘤病病原鑒別。——第
2
部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢測——第
3
部分:雞沙門氏菌、產氣莢膜酸菌和空腸彎曲菌三重熒光
PCR
檢測方法。——第
4
部分:禽白血病抗原
檢測方法。請注意本文件的某些內容可能涉及專利,本文件的發(fā)布機構不承擔識別專利的責任。本文件由湖北省農業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所提出。本文件由湖北省農業(yè)農村廳歸口管理。本文件起草單位:湖北省農業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所、湖北省動物疫病預防控制中心。本文件主要起草人:張文婷、羅青平、邵華斌、周艷君、金鑫、張騰飛、溫國元、王紅琳、商雨、汪宏才、張蓉蓉、盧琴、羅玲。本文件實施應用的疑問,可咨詢湖北省農業(yè)農村廳,聯(lián)系電話:,郵箱:hbsnab@126.co郵箱:IIDB42/T
1864.2—2022 2012~2020禽疫病診斷技術規(guī)程》系列標準,擬由4個部分構成。——
J
網狀內皮組織增生癥病毒的快速檢測,指導家禽腫瘤病的快速鑒別診斷。——第二部分:禽大腸桿菌致病群雙重探針法檢測。目的在于檢測家禽泄殖腔拭子和糞便中的致病群大腸桿菌,指導家禽致病群大腸桿菌的快速檢測。——第三部分:雞沙門氏菌、產氣莢膜梭菌和空腸彎曲菌三重熒光
PCR
檢測方法。目的在于檢測雞肉及相關產品、雞泄殖腔拭子和糞便中的沙門氏菌、產氣莢膜梭菌和空腸彎曲菌,指導雞肉及相關產品細菌性疾病的快速檢測。——第四部分:禽白血病抗原
ELISA
檢測方法。目的在于檢測種雞群蛋清、血漿、精液、胎糞、肛拭子中禽白血病抗原
檢測,指導種雞場禽白血病的凈化檢測。IVDB42/T
1864.2—2022
1 范圍定。本文件適用于檢測家禽泄殖腔拭子和糞便中的致病群大腸桿菌。2 規(guī)范性引用文件文件。GB/T
6682 分析實驗室用水規(guī)格和試驗方法GB
19489 實驗室生物安全通用要求GB/T
27403 實驗室質量控制規(guī)范食品分子生物學檢測NY/T
動物產品中大腸菌群、糞大腸菌群和大腸桿菌的檢測方法3 術語和定義下列術語和定義適用于本文件。3.1大腸桿菌致病群
coli
phylogenetic
group根據(jù)系統(tǒng)進化分類,將大腸桿菌分為B2、D、B1和A群,其中B2D群大腸桿菌稱為致病群大腸桿菌。3.2熒光 realtime
PCR一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質測每次聚合酶鏈式反應()循環(huán)后產物總量的方法。4 縮略語下列縮略語適用于本文件。BHQ1:黑洞淬滅劑-l(
Hole
Quencher-1)Ct值:循環(huán)閾值(Cycle
threshold)FAM:熒光素酰胺(
Amidite)HEX:六氯熒光素(
Fluorescein)5 原理chuAyiaATspE4.
C2B2B1
DB42/T
1864.2—2022本文件采用TaqmanchuA基因、yiaA基因和TspE4.
C2菌可被分為B2、D、B1和A1B2群和D大腸桿菌毒力島基因chuA和yiaA,設計特異的引物和熒光探針,建立了一種禽大腸桿菌致病群篩選的Taqman雙重探針檢測方法,根據(jù)對應的熒光曲線反應和Ct值來判斷禽大腸桿菌的致病群。表1 大腸桿菌種群的判定6 試驗條件7儀器設備7.1
熒光定量
PCR
7.2
二級生物安全柜。7.3
渦旋震蕩器。7.4
微量移液器(規(guī)格為
1
mL、100
μL、50
μL
和
2.5
μL)。7.5
恒溫培養(yǎng)箱:36℃±1℃。7.6
臺式冷凍小型離心機(轉速≥12
000
)。8 試劑或材料8.1 試劑配制本方法試驗用水應按照
6682GB/T27403規(guī)定實施。8.2 試劑或材料8.2.1 Cary-Blair
運送培養(yǎng)基。8.2.2 熒光定量
探針預混物。8.2.3 商品化的細菌基因組
DNA
提取試劑盒。8.2.4 chuA
基
因
引
物
與
探
針
:
上
游
引
物
,
下
游
引
物
:5’-TGCCGCCAGTACCAAAG-3’,探針:5’3’。8.2.5 yjaA
基
因
引
物
與
探
針
:
上
游
引
物
5’-GAAAGCAAACGTGAAGTGTCAG-3’
,
下
游
引
物
:DB42/T
1864.2—20225’-GGTGGAGTTGCAGAACAAGA-3’,探針:5’-HEX-CCAGCGCCTGTTAATCGCCAATTT-BHQ1-3’。8.2.6 陽性對照
1:chuA
基因的陽性克隆分子
或陽性標準菌株
。8.2.7 陽性對照
2:yjaA
基因的陽性克隆分子
或陽性標準菌株
。8.2.8陰性對照:無菌蒸餾水或去離子水。8.2.9 無
DNase/RNase
的
qPCR
EP
管(
)、微量移液器對應的槍頭。9 試驗步驟9.1 樣品的采集與前處理9.1.1 泄殖腔拭子樣品用無菌的棉拭子插入雞泄殖腔內2
cm至3
處并輕輕旋轉,將有可見糞便的棉拭子放入含有1
mL~2
mL運送培養(yǎng)基中,冷藏箱保存,樣品保存時間不超過24
h。9.1.2 糞便樣品先采集雞新鮮糞便1
g~2
g于一次性無菌采便管內,然后轉移至含有1
mL~2
運送培養(yǎng)基中,冷藏箱保存,樣品保存時間不超過24
h。9.2 大腸桿菌的分離鑒定大腸桿菌的分離鑒定按照NY/T
9.3 樣品
的制備9.3.1
℃±1℃培養(yǎng)
h~24
h。12
r/min
2
min,去盡上清,沉淀用于核酸提取。9.3.2 在沉淀中,加入
100
μL
提取液充分混勻,沸水浴
10
min,在
4
離心
5min,上清可直接用于熒光
反應。9.3.3 也可以使用商品化的
DNA
提取試劑盒提取
DNA
模板,具體步驟參照說明書。9.4 熒光
9.4.1 反應體系以制備的為模板進行雙重熒光定量PCR25
10
mmol/L)各0.6
μL,探針(
0.8
μL,熒光定量PCR探針預混物12.5
μL,模板DNA1
μL。用滅菌的去離子水補足體積至25
μL。9.4.2 反應條件熒光反應在多通道熒光定量儀上進行,選擇熒光信號和(分別檢測chuA-FAM,yjaA-HEX反應參數(shù):95℃預變性5
;然后95℃
變性10
,58.1℃退火并延伸30
,擴增40個循環(huán);延伸結束時開始進行雙重熒光信號檢測。閾值設置為閾值線超過正常陰性樣品擴增曲線的最高點。9.4.3對照通道Ct
FAM≤35
chuA
Ct
40
chuA
35Ct
35
CtchuAchuA
HEX≤35
yjaA
Ct
40
yjaA
35Ct
35
CtyjaAyjaA
B2
chuA
yjaA
chuA
yjaA
chuA
yjaA
DB42/T
1864.2—2022檢測過程中分別設陽性對照1、陽性對照2與陰性對照。10 結果判定1
溫馨提示
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