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文檔簡介
STR序列結構一、概念
基因組DNA中,由不同堿基結構的等位基因所形成的多態性叫做DNA多態性(DNApolymorphisms)突變遺傳差異一、概念
/人類染色體簡圖2011年發布的黑猩猩測序圖2.5%0.1%一、概念
DNA長度多態性(DNAlengthpolymorphisms)指同一基因座上各等位基因之間的DNA片段長度差異構成的多態性
靶序列主要是可變數目串聯重復序列(variablenumberoftandemrepeats,VNTR),存在于微衛星DNA中的稱為短串聯重復序列(shorttandemrepeat,STR)一、概念
RFLP,restrictionfragmentlengthpolymorphism,限制性片段長度多態性DNA紋印,DNAprofileDNA指紋,DNAfingerprint二、STR序列結構特點
重復單位2~6bp二、三、四、五、六核苷酸序列重復單位堿基的組成形式稱為基序(motif)理論上有4n種基序因為是短串聯重復形式,所以表面不同,實際是一種核心序列,且有互補因素存在(4、10、33、102和350種)三、STR序列結構類型
CategoryExampleRepeatStructure13CODISLociSimplerepeats–containunitsofidenticallengthandsequence(GATA)(GATA)(GATA)TPOX,CSF1PO,D5S818,D13S317,D16S539,D2S441,D10S1248,PentaD,PentaE,D19S253Simplerepeatswithnon-consensusalleles
(e.g.,TH019.3)(GATA)(GAT-)(GATA)TH01,D18S51,D7S820,D19S433,Compoundrepeats–comprisetwoormoreadjacentsimplerepeats(GATA)(GATA)(GACA)VWA,D3S1358,D8S1179,D1S1656,D12S391,D22S1045,D6S1043Complexrepeats–containseveralrepeatblocksofvariableunitlength(TCTA)(GACA)(TA)(CATA
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