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文檔簡介
生存分析
張俊輝
2011.11.22
生存分析中的幾個基本概念“死亡”事件——失敗事件(failureevent)生存時間(survivaltime):完全數據、截尾數據、截尾死亡概率(mortalityprobability)
生存概率(survivalprobability)生存率(survivalrate)中位生存時間(mediansurvivaltime)
(一)死亡事件(deathevent)
又稱失效事件(failureevent)或終點事件。死亡事件是一個廣義的概念,不單是指通常意義下的生物體死亡,而是泛指標志某種處理措施失敗或失效的特征事件。(二)生存時間(survivaltime):指觀察到的存活時間。生存時間是一個廣義概念,不單是指通常意義下生物體的存活時間,而是泛指研究者所關心的某現象的持續時間。生存時間的兩種類型完全數據(completedata):指從觀察起點到發生死亡事件所經歷的時間。截尾數據(censoreddata):簡稱截尾值(censoredvalue),又稱刪失值或終檢值。生存時間觀察過程的截止不是由于死亡事件,而是由于其他原因引起的,稱為截尾(censored)。截尾的原因包括失訪、退出和終止。截尾數據指從觀察起點到截尾所經歷的時間。死亡概率:指在某單位時段開始時存活的個體在該時段內死亡的可能性大小。生存概率
:指某單位時段開始時存活的個體到該時段結束時仍存活的可能性大小。生存率:指觀察對象活過tk時刻的概率。生存率也是一個廣義概念,研究者定義的死亡事件不同,其含義也不同,可以是緩解率或有效率。中位生存時間又稱半數生存期,是指生存率為0.5時對應的生存時間,表示有50%的觀察對象可活這么長時間。主要內容1.未分組資料數據的生存分析
(Kaplan-Meier過程)2.分組資料數據的生存分析
(LifeTables過程)3.生存曲線的比較
(log-rankTest)未分組資料的生存分析特點:每個觀察個體都有一個生存時間例15.1某醫師采用手術療法治療12例宮頸癌患者,隨訪時間(月)記錄如下:1,2,4,5,7,8+,11,15,18,33+,36,38+。試估計各時點生存率及其標準誤、各時點總體生存率的95%置信區間、中位生存時間,并繪制生存曲線。
未分組資料的生存分析乘積極限法——由Kaplan-Meier于1958年首先提出,又稱Kaplan-Meier法(簡記為KM法)
SPSS操作步驟:設置兩個變量:生存時間(time)
結局(status):死亡=1,截尾=0SPSS操作步驟:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時間變量timeStatus框選入結局變量statusDefineEvent(定義死亡事件的取值)按鈕Singlevalue框輸入1
ContinueOptions按鈕勾選Survivaltables(生存分析表)默認
Meanandmediansurvival(均數和中位數)默認
Survival(生存曲線圖)
ContinueOK結果解釋生存曲線表平均生存時間(mean)和中位生存時間(median)生存曲線分組資料的生存分析例15.2某醫師對110例原發性肺癌患者確診后進行隨訪,得資料見表15.3第(2)欄~第(4)欄,試估計各時點生存率及其標準誤、各時點總體生存率的95%置信區間、中位生存時間,并繪制生存曲線。壽命表法SPSS操作步驟設置3個變量:時間time(采用組段的下限)
結局status(死亡=1,截尾=0)
頻數fSPSS操作步驟指定頻數變量fDataWeightCases
選中WeightcasesbyFrequencyvariable框:選入fSPSS操作步驟AnalyzeSurvivalLifeTablesTime框:選入時間變量timeDisplayTimeIntervals框:輸入10by1Status框:選入結局變量statusDefineEvent按鈕:SingleValue框輸入1ContinueOptions按鈕勾選Lifetables、SurvivalContinueOK
結果解釋此為SPSS作的分組資料的生存率曲線,為階梯型曲線。
注意:分組資料繪制的生存曲線應該是折線連接,因為估計的是時段右點的生存率。因此需要對該曲線進行編輯。通過點擊右鍵進行編輯:
Charteditor→elements(format)→InterpolationLine
并刪掉短線,可得到折線形生存率曲線如下圖:對數秩檢驗例15.3某臨床醫生將22例肺癌患者隨機分成兩組,分別采用化療和放化療聯合治療,從緩解出院日開始隨訪,隨訪時間(月)如下,試比較化療和放化療聯合治療的療效是否有差別。化療組1,2,3,5,6,9+,11,13,16,26,37+放化療聯合組10,11+,14,18,22,22,26,32,38,40+,42+SPSS操作步驟設置3個變量:時間time
結局status(死亡=1,截尾=0)
組別groupSPSS操作步驟:AnalyzeSurvivalKaplan-MeierTime框選入時間變量timeStatus框選入結局變量statusDefineEvent按鈕Singlevalue框輸入1
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