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文檔簡介

1、GelDocEZ系統|查看圖像 # #查看圖像 GelDocEZ系統|查看圖像 查看圖像 #查看圖像一旦凝膠成像,圖像便會顯示在工作區中。很多控件都可以優化查看效果并對圖像進行分析。結果槪述BioadRangeDilution(Read-Only)*bandLane這是具有條帶和泳道檢測及注釋功能的凝膠圖像含標記會識別可顯示或隱藏的圖像覆蓋。謂參閱顯示凝膠選項(第48頁)獲取完整信息。有多種方式可以查看與結果關聯的數據可以將數據作為分析表、泳道輪廓、標準曲線和報告進行查看紗譴參閱顯示數據(第54頁)。顯示凝膠GelDocEZ系統|查看圖像 #查看圖像 #顯示在第47頁上的凝膠圖像上方的工具欄圖

2、標。以下部分將對每個工具進行描述。顯示凝膠選項-S注釋可以選擇是否顯示圖像上已繪制的文本和箭頭注釋。泳道和條帶可以打開或關閉任意圖像覆蓋,比如泳道框架、泳道、條帶、泳道標記和分子量圖例。條帶屬性可以顯示所選泳道或所有泳道的以下屬性。條帶數條帶標記分子量相對前沿體積絕對定量相對定量條帶%泳道%體積如果已在凝膠上繪制好體積邊界,則可以顯示體積邊界及其體積標記。縮放工具3縮放工具可以調整凝膠圖像的大小。單擊放大鏡的“+”符號可以放大圖像;單擊“”符號可以縮小圖像。也可以通過鼠標右鍵對圖像進行縮放。右鍵單擊并拖動以選擇要放大的區域。再次右鍵單擊以返回到原始視圖。也可以通過鼠標上的滾輪(如果有的話)調整

3、圖像大小。適合51口B如果當前已對圖像某個區域進行放大,單擊此按鈕便可顯示整個圖像。GelDocEZ系統|查看圖像 # 查看圖像 #GelDocEZ系統|查看圖像 # #查看圖像 #像轉換GelDocEZ系統|查看圖像 #查看圖像 #使用“圖像轉換”對話框可以調整圖像亮度和對比度以優化圖像顯示效果,以便看清模糊圖像。最大和最小范圍會隨圖像現有的明暗度值而改變。注意:這些調整并不會更改數據,只會更改數據的顯示方式。肉眼無法看到圖像包含的完整范圍。頻率分布柱狀圖會顯示圖像中的總數據范圍和范圍內每個點上的數據最。自動縮放”按鈕會自動確定特定圖像的最佳設置.圖像最亮的部分會設置為最小強度,最暗的部分會

4、設置為最大強度高進度指示器會確定凝膠圖像中最大灰度(或其他顏色)下顯示的強度值低進度指示器會確定凝膠圖像中最小灰度(或其他顏色)下顯示的強度值伽馬進度指示器會更改灰度曲線。值1為線性。值v1會將灰度的大部分重新分配到強度值的前半部分。值1會將灰度的大部分重新分配到強度值的后半部分。您也可以在進度指示器旁的文本框中鍵入數值。單擊進度指示條的任意位置可緩慢移動進度指示器選項:圖像反向顯示一將亮背景上的暗色條帶反向為暗背景上的亮條帶,反之亦然高亮顯示飽和像素一選中此復選框時,信號強度為飽和(在可測量范圍之上)的圖像區域會高亮顯示為紅色。線性或對數柱狀圖一此調整會更改柱狀圖上的Y軸,以顯示每個強度值所

5、包含的像素數。圖像顏色GelDocEZ系統|查看圖像 # 查看圖像 #豆圖瞬色m3色旨0GrayEt3fCoonassieStanFree0SYERGreenSYFRORuby0Flonnoo0Slyer0Cokz:Spectrum:GoldSiker此對話框讓您能夠選擇圖像結果文件的色圖。通過不同顏色方案查看圖像可以更容易地看到圖像中的所有元素,且不會更改數據。您可以選擇多種顏色。前八種會模仿染料凝膠的顏色。其余顏色方案會呈現大量的顏色變化,足以高亮顯示圖像數據中的細微差別。可用顏色包括:GelDocEZ系統|查看圖像 #查看圖像 #灰色EtBr(漠乙非唳漠化物)考馬斯免染SYBRGreen

6、SYPRORubyFlamingo熒光凝膠染料銀錯誤顏色光譜金銀偽3-D投影GelDocEZ系統|查看圖像 # #查看圖像 #GelDocEZ系統|查看圖像 # #查看圖像 #單擊3D圖標可將凝膠圖像轉換到固體三維模型中,該模型可在具有x、y和z軸的空間中旋轉。通過向右或向左拉動窗口底部的進度指示器,能夠增加或減少數據點的相對高度。要打開査看器,您可以:從圖像上方的工具欄中選擇3-D圖標。查看各種條帶的強度:拖動模型,將其旋轉到您所需的視圖。單擊圖像,為窗口對好焦。按C可顯示一個綠色圓錐,可以來回拖動圓錐來計算各種條帶的強度。GelDocEZ系統|查看圖像 查看圖像 #圖像信息對話框提供有關活

7、動圖像的信息。單擊圖像工具欄上的圖標可顯示有關圖像信息的三個選項卡。像詳細信息獲取信息和圖像信息會顯示在此選項卡上。分析設置對凝膠進行分析時(例如,執行條帶檢測和分子量分析),此選項卡會顯示所使用的設置,注釋您可以在該選項卡上添加注釋,為每個泳道自定義標記,指出使用的樣本類型,或者顯示其他結果相關詳細信息。顯示數據與凝膠圖像相關的分析數據的結果可以通過使用分析表、泳道輪廊、標準曲線或作為報告進行查看。穿可京ArdysisTcbeLensFrofilcStcrdcrdCurve該報告無法查看泳道輪廊和標準曲線。該報告將替換這些窗口。可以在報告窗口中查看泳道輪廊。打開/關閉這些視圖的按鈕位于主工具

8、欄中。每個選項描述如下:泳道和條帶定義條帶編號一泳道中的每個條帶都具有唯一編號,這些編號按從上到下的順序進行排列條帶標記一用戶可以通過單擊泳道和條帶表的“條帶標記”字段,為每個條帶分配一個自定義標記分子-條帶的分子量根據用戶定義的標準和回歸方法進行計算斜體值表示推測值相對前沿一介于0和1之間的值,表示條帶從上到下的相對位移絕對定量一條帶的絕對定量相對定量一條帶相對于參考條帶的相對定量條帶與泳道中的所有條帶體積相比,此條帶體積所占的百分比泳道與泳道的整個體積相比,此條帶體積所占的百分比體積定義體積編號一每個體積都具有唯一編號休積標記一用戶可以在體積屬性中更改不同體積類型(U-未知、B-背景、S-

9、標準)的軟件生成標記體積一條帶邊界中所有強度的總和已調整體積一背景調整體積平均背景一背景的平均值絕對定體積一基于標準體積和回歸方法的體積定量GelDocEZ系統|查看圖像顯示數據 查看圖像 #相對定量休積一已調整體積和參考體積的已調整體積之間的比率像素數一體積邊界內的像素數量小值一體積內部強度最小的像素強度最大值一體積內部強度最大的像素強度平均值一體積邊界內所有像素的平均值標準偏差一體積邊界內所有像素的標準偏差區域一mm?中的體積區域分析表選項叢與分析相關聯的數值數據可以在分析表中查看。泳道和條帶分析數據可以在泳道和條帶選項卡中查看紗如果執行體積分析,則這些數據可以在體積表選項卡上查看。單擊分

10、析表按鈕可以打開從結果中提取的數據的表格顯示條芾標記分子fi(KDa)相對笳沿舞百分比濁泄百分比111780.260191.540不底用290B.42995030260.695922632820.637130.7841985741750.73883.6341273.751330.507193.187不遲用不運用2938.4牛運61親詣諭號條芾標記分子(KDa)祁對51沿fPUnt栢對走妃條希巨分比懣迪百分比111760.26394.3063794822S503了66.9782693.43133080987.77935245表上方的圖標提供多種顯示和導出分析表數據的方式。設置窗口大小若要更改分析

11、表窗口的大小,譴拖動窗口邊緣,直到顯示所有數據。注意:“實驗協議”對話框打開時,“調整分析表”窗口大小將受到限制。顯示數據選項蚤此對話框有三個選項卡:測量、顯示和導出。測量一通過單擊箭頭按鈕將項從“已顯示”字段移動到“未顯示”字段,來選擇要顯示的測量項。默認顯示設*一是否啟用“將所選泳道移動到頂部”設置取決于是否選中對應的復選框。按測量精度一可以在泳道和條帶表以及體積表中設置測量項的精度(精確到小數位)。示例精度一此字段指明如何以在“按度量精度”中選擇的小數位數顯示測量項。導出格式一該字段提供兩個復選框,以在導出文件中包括泳道標頭(僅限泳道和條帶表選項卡)和/或列標頭。導出分隔符一該字段為導出

12、文件提供三個分隔符選項。以逗號分隔的逗號分隔值(CSV)選項卡分隔其他用戶定義分隔符更改分析表方向使用此按鈕可以在兩個表方向之間切換。水平一以相鄰方式顯示泳道/體積,以便用戶能夠左右滾動分析表。垂直一以上下方式顯示泳道/體積,以便用戶能夠上下滾動分析表。導出分析表下面三個按鈕提供幾種導出分析表中的數據的方法。請參閱第8章導出結果(第85頁,獲取有關導出數據的詳細信息。將分析表復制到剪貼板一單擊此按鈕可將分析表復制到剪貼板.以便將其粘貼到字處理程序或演示應用程序中。當需要復制到8-1/2x11英寸的頁面,以提供足夠的空間顯示列時,使用垂直表方向是最佳選擇。將分析表導出到文件一當作為CSV文件導出

13、時,數據文件可以在數據庫應用程序中打開。將分析表導出到電子表格一此功能讓您能夠使用Excel的排序和公式功能處理數據。如果在計算機上安裝了此程序,則會打開Excel(或Mac上的Numbers),同時顯示相應的電子表格。泳道輪廓選項顯示所選泳道旋轉90后的截面圖。泳道輪廓窗口打開時,可以單擊選擇其他泳道。如果選中“包括背景”復選框,則泳道輪廓窗口會在藍色行下方顯示已扣除的背景,并在紅色行下方顯示用于條帶定量的綠色區域。可以查看泳道輪廓屏幕右下方光標處的當前Rf(相對前沿)值和強度。通過選擇下拉列表中的選項,可以更改標記條帶的方式。默認情況下,條帶會以條帶數進行標記。縮放到適合圖形大小選擇顯示屏

14、的最高點以定義圖形的范圍,從而提供泳道輪廊的最佳視圖。您可以清除“縮放到適合圖形大小”復選框,以便在圖形中顯示可能的強度值的整個范圍。這樣便能夠在不同的泳道之間進行有效的比較。包括背景如果清除“包括背景”復選框,將不會顯示表示圖像背景的泳道輪廊區域。標識條帶的依據您可以在表示下列屬性的泳道輪廊上顯示標注:條帶數條帶標記分子量相對前沿體積絕對定量相對定量條帶%泳道%GelDocEZ系統|查看圖像顯示數據 #查看圖像 #GelDocEZ系統|查看圖像顯示數據 # #查看圖像 #標準曲線caN)tt-(RGelDocEZ系統|查看圖像顯示數據 # #查看圖像 #GelDocEZ系統|查看圖像顯示數據

15、 # 查看圖像 #00.20.40.60.8相劉館沿回,3S:Lrcor(seni-log)公我:“=1.74事X42.51R平方恆0.?=075A分孑魚標建由些八至對定莖聽雀由線八徐不右笊曲線I“標準曲線”對話框會顯示符合您所定義標準的最佳曲線,以及與您在圖像中所選泳道的曲線相關的條帶。選項卡會顯示三種不同分析結果的標準曲線。標準條帶以綠色顯示,未知條帶以紅色顯示。您可以單擊左上方的對數丫軸來更改Y軸上線性和對數標尺之間的分子量顯示。不僅會顯示在分子量分析工具中選擇的回歸方法,還會顯示該回歸方法的公式(如果適用)和R?值。通過此窗口中的選項卡,您可以查看分子量標準曲線、絕對定量標準曲線或體積

16、標準曲線OE報告Report請參閱第7章生成報告(第81頁),以查找能夠添加到報告中的內容。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 分析圖像 分析圖像圖像文件打開并準確對焦后,便會啟用分析工具箱工具。WindowsPC上的活動窗口或對焦窗口上有一個深藍色菜單欄。在Mac上,當窗口處于活動狀態時,窗口控制圖標便會以更亮的顏色顯示。這一差別可幫助您識別工作區中眾多打開的圖像文件中的活動窗口。單擊分析工具箱中的“自動分析”b魴引按鈕,可以執行以下操作:分析使用協議獲取的圖像,不包括用于檢測和分析的步驟更改分析參數以重新分析圖像注意:更改已分析凝膠的任何設置時,會覆蓋初始分析。要保留上述兩種分析

17、結果,請以不同的名稱保存圖像文件。檢測設置條帶檢測選項如下:低條帶檢測靈敏度一此選項為具有明顯條帶的圖像設置低級檢測。不使用此設置檢測模糊條帶。高條帶檢測靈敏度一此選項為模糊圖像設置較高級別的檢測。可以使用分析工具箱中的條帶工具移除無關條帶。譴參閱泳道和條帶工具(第65頁)。自定義一可以設置介于1到100之間的數值以選擇樣本的最佳檢測靈敏度。注意:使用低條帶檢測靈敏度或高條帶檢測靈敏度時,應設置以下數值:低靈敏度二25;高靈敏度=75。分子量分析設置分子標準一運行已在標準列表中放置的許多Bio-Rad標準或其他標準中的任何一種標準。有關詳細信息,請參考標準(第38頁)。標準泳道一選擇或更改在其

18、中放置標準的泳道。回歸方法一可以使用四種回歸方法。有關詳細信息,請參閱“回歸方法”(第39頁)。分析工具箱工具所有的分析工具箱工具都可以自定義圖像文件中的分析數據。僅當圖像文件打開時,這些工具才可用。單擊特定圖像,以在可在工作區中打開的多個窗口中進行選擇。在PC上,選定窗口的菜單欄顏色比其他窗口更深。在Mac上,當窗口處于活動狀態時,窗口控制圖標便會以更亮的顏色顯示。注意:某些工具可刪除現有分析。要訪問某個工具,請執行以下操作:單擊任意一個工具箱圖標要返回分析工具箱菜單,請執行以下操作:單擊工具名稱右側的綠色向上箭頭按鈕圖像工具單擊以返回到分析工具箱菜單要顯示圖像視圖菜單,i青單擊“圖像工具”

19、按鈕。翻轉可以水平或垂直翻轉凝膠圖像。旋轉可以使用“向左旋轉”或“向右旋轉”按鈕將凝膠圖像旋轉90。要校正傾斜的凝膠,請執行以下操作:單擊“自定義”按鈕并執行以下操作:通過單擊并拖動凝膠上方的紅色箭頭,將這些箭頭旋轉0到360。之間的任意角度。右鍵單擊凝膠圖像,并選擇“旋轉”以將凝膠設置到新位置.如果要重置旋轉,系統將提示您“取消”或“繼續”。裁切要僅保留凝膠圖像的一部分,請執行以下操作:單擊“裁切”按鈕。使用方形手柄拖動紅色框,以包括要保留的區域。在紅色框中單擊鼠標右鍵以移除該圖像的其余部分。如果要重置該區域,系統將提示您“取消”或“繼續”。逆變數據逆變數據用于負染色和酶譜。條帶的強度值必須

20、大于背景,才能對凝膠執行分析。將凝膠作為3D投影進行查看,以確定是否必須逆變數據。合并(僅限ChemiDocXRS+系統。)使用此按鈕可以將化學發光印跡圖像與相同印跡的色度圖像合并在一起。如果已對化學發光印跡使用色度預染標準,則可以獲取用于顯示標準的印跡epi白光圖像和用于顯示免疫檢測的化學發光圖像。然后,可以將這兩個圖像合并到具有兩個信號的組合圖像中。注意:合并圖像會對量化產生不利影響。如果需要準確量化,請對各原始圖像執行分析。只能合并大小相同的圖像。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # 分析圖像 #泳道和條帶工具單擊“泳道和條帶工具”按鈕可以選擇一個選項卡,以使用泳道工具和條帶

21、工具。泳道選項卡可以選擇如何使用自動或手動泳道查找程序按鈕來檢測泳道。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #a2肺謚10采爸GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 分析圖像 #對于常見的凝膠圖像,譴單擊“自動”按鈕單擊“手動”按鈕只能檢測特定數量的泳道,或者在自動泳道檢測找不到正確數量的泳道時單擊此按鈕心然后可以通過拖動紅色方框各角處的手柄來調整泳道框架的大小所有泳道調整大小一通過拖動紅色方框各角處的手柄來調整所有泳道的大小,以適合凝膠圖像。調整一如果凝膠圖像呈不規則顯示,則可以通過拖動泳道框架的某

22、個角來調整所有泳道的方向。使用調整泳道工具不會更改泳道寬度。還可以通過單擊泳道框架,在矩形的頂部或底部邊框上添加更多定位點。通過右鍵單擊可以移除任何不需要的定位點。通過拖動這些定位點,可以對所謂的彈性凝膠進行調整。刪除一可以刪除所有泳道。單個泳道添加一可以將單個泳道添加到凝膠圖像中。首先單擊“添加”按鈕,然后單擊要將新泳道放置到其中的泳道框架。將對泳道進行重新編號。注意:要在框架外部添加泳道,請在框架內添加泳道,并使用“移動”工具將泳道擴展到框架邊界外。刪除一可以刪除單個泳道。首先單擊“刪除”按鈕,然后單擊泳道或其編號。將對泳道進行重新編號。彎曲一可以彎曲單個泳道以更適合凝膠圖像。首先單擊“彎

23、曲”按鈕,然后拖動某個方塊定位點以適合圖像。通過左鍵單擊泳道,可以在泳道內添加更多定位點。通過拖動這些定位點調整泳道,以適合凝膠圖像。通過右鍵單擊移除定位點。移動一可以在凝膠圖像上將單個泳道移動到新位置。首先單擊“移動”按鈕,然后單擊要移動的泳道。將其拖動到新位置泳道將按照其新位置重新編號。寬度一可以更改單個泳道的寬度。泳道背景扣除通過選擇“背景扣除”字段中的“啟用扣除”,執行基于泳道的背景扣除。使用“泳道輪廓”視圖可以查看扣除的泳道背景。滾動圓盤一可以指定假設滾動圓盤的大小(介于1和99mm之間),根據泳道長度移除背景。圓盤的大小可確定扣除的背景數量。大圓盤跟隨輪廓軌跡的腳步不是很緊,沿軌跡

24、接觸的點較少,移除的背景也較少。小圓盤跟隨輪廊軌跡的腳步較緊,移除的背景也較多。圓盤半徑太大,會導致背景移除不理想。圓盤半徑太小,可能會扣除實際數據。對于大多數樣本,10mm的大小通常較為合適。可以多次執行此任務,直到您對移除的背景數量感到滿意為止。應用于選定泳道一如果選中此框,則使用上述按鈕指定的背景扣除級別僅應用于選定泳道。您可以使用此選項為每個泳道設置不同的背景扣除級別。條帶選項卡使用此選項卡,可以檢測條帶或重置條帶檢測設置單擊菜單中的某個按鈕,然后在圖像的泳道中單擊。添加一使用此選項可以添加模糊條帶。首先單擊添加”按鈕,然后通過單擊該泳道內的任何位置添加新條帶。注意:可以使整個圖像變暗

25、,以便使用“圖像轉換”對話框中的“伽瑪值”滑塊更方便地查看模糊條帶。有關完整說明,請參閱圖像轉換(第50頁)。刪除一可以刪除與分析無關的條帶。首先單擊“刪除”按鈕,然后單擊要移除的任何條帶。調整一可以調整條帶的高度。首先單擊“調整”按鈕。每個條帶周圍都會出現兩條邊界線。在邊界線上方移動,直到看見雙向箭頭。上下移動邊界線并重新計算中心;條帶會出現在那里。注意:您還可以在“泳道輪廓”視圖中調整條帶邊界。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 分析圖像 #分子量分析工具使用分子量分析工具,可以通過將測試樣本與已知標準進行比較來確定分子量。NW分祈工具T,Lnear(semi-log)J注意:可

26、以在“分析表”視圖中的“泳道和條帶”選項卡的分子量列中查看每個條帶的分子量。分子量標準可以更改用于確定測試樣本分子量的標準在“分子分析工具”對話框中單擊更改”按鈕,可以訪問管理標準”對話框,在該對話框中可以選擇另一個標準或添加第三方標準幼標準泳道默認情況下,標準樣本會放置在第一個和最后一個泳道中。通過選中每個泳道下方的框,或者通過輸入以逗號分隔的標準泳道編號,可以指定其他標準泳道。標準泳道下方標有“std”字樣。回歸方法有四種回歸方法。譴參閱回歸方法(第39頁)。定量工具通過使用定量工具下方的相對值或絕對值選項卡,可以自動測定測試樣本中的條帶的數量。相對定量選項卡要比較條帶的相對定最,謂選擇“

27、相對定量工具”選項卡,如下所示。要從圖像中選擇參考條帶并對與參考條帶有關的所有其他條帶進行定謂執行以下操作:單擊“選擇”按鈕。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 分析圖像 #單擊要用作參考的任何條帶。所選條帶附近會顯示表示參考的小FT(請參閱左側圖像內的紅色圓圈)。圣當弟號條栄標記顧前沿ItKlnt)tew定杜衆芾百分比泳逋百分比1203.90.116180.499車總用302:2116.502561420.673不丹用)23215639S90296545,401不BW89T146S.90.387142,5570.102.31.9$4270.S96486.833不老用0.337.61

28、62S.80.6321.1&2245不色用0.8419.S15.6要查看相對條帶數請執行以下操作:轉到“分析”表的“泳道和條帶”選項卡的相對定量”歹叭相對定量是條帶體積除以參考條帶體積所得到的比率。所有其他條帶現在顯示與參考條帶有關的數值.1.0以上的值表示條帶數量大于參考條帶的數最。1.0以下的值表示條帶數量小于參考條帶的數量。絕對定量選項卡絕對定量用于根據已知標準條帶使用校準曲線對條帶執行定量。要確定條帶的絕對定量,譴首先選擇“絕對定量工具”選項卡,如下所示。要計算條帶的絕對定豎,請執行以下操作:單擊選擇”按鈕。至少選擇兩個標準(已知)條帶并分配定量值。值顯示在“標準條帶”表中。已知條帶的

29、數最越多,其值的范圍越廣,未知條帶的絕對定最計算越準確。注意:可以刪除任何標準條帶選擇。為此,請通過單擊“標準條帶”字段中的相應條目選擇該條目,然后單擊“刪除”按鈕。從“單位”下拉菜單中列出的十個選擇中選擇一個測量單位。從下拉菜單中列出的三個選擇中選擇一種回歸方法。進行選擇時,譴牢記以下準則。線性一此回歸方法將生成一條直線,該直線最適合所提供的值且在大多數情況下是首選項。點到點一此方法可生成一條曲線,該曲線中的每個數據點都直接連接到下一個數據點,不管最終的曲線形狀如何。三次樣條一此方法可生成連接每個數據點的平滑曲線。要使用最小平方多項式擬合,至少需要四個標準點。回歸方法量小標準條帶數最小數經過

30、原點”選項線性21點到點21三次樣條54單擊工具欄中的“標準曲線”按鈕,選擇“絕對定量標準曲線”選項卡,將退示校準曲線。所有標準都用綠色三角形表示。未知值用紅色三角形表不。注意:選中“經過原點”復選框始終可以在0,0處開始繪制標準曲線圖形,不管最佳曲線擬合效果如何。注意:在“標準曲線”表中單擊任何三角形可顯示與該條帶關聯的數值。注釋工具可以用文本和箭頭對結果加以注釋,以便吸引人們關注感興趣的區域。添加注釋文本一可以將文本注釋添加到凝膠圖像以指出重要的詳細信息。首先單擊“文本”按鈕,然后單擊要重點關注的區域。顯示一個帶有點線邊框的文本框。在文本框中鍵入注釋。拖動該框可更改其位置注意:編輯文本時,

31、請按SHIFT-ENTER添加文本。這將在注釋中添加新行。箭頭一要添加箭頭,i青首先單擊“箭頭”按鈕。單擊要讓箭頭開始的區域,然后通過拖動拉伸箭頭,指向要重點關注的區域要移動箭頭,謂單擊箭頭中間并拖動箭頭。要更改箭頭指向的位置,謂單擊箭頭的一端。此時將岀現多個方框:拖動某個框可以更改箭頭的長度或方向。對齊對齊圖標一使用這些圖標,可以對齊多個注釋,如手動添加的泳道編號。選擇注釋一通過按住CTRL鍵(Mac上的Command鍵)并單擊每個注釋,或通過拖動注釋周圍的選擇框,可以選擇多個注釋。復制注釋一可以在圖像內部或圖像之間復制注釋。首先選擇要復制的注釋。然后按CTRL-C(Mac上的Command

32、-C)復制注釋,并按CTRL-V(Mac上的Command-V)粘貼注釋。文本屬性可以更改文本注釋的大小和字體。要選擇多個項進行更改,請按住CTRL鍵(Mac上的Command鍵),并單擊每個項。字體一首先單擊要更改的文本框。然后單擊“字體”下拉菜單以顯示系統中安裝的所有字體。選擇一個字體名稱以更改文本注釋的樣式。大小一首先單擊要調整大小的文本框。單擊“大小”上下箭頭,以放大或縮小文本。可以使用下拉菜單在6和72點之間設置字體大小。顏色可以更改文本注釋的顏色以使用任意顏色方案使它們可見,并通過將顏色添加到注釋的背景(默認情況下不可見)進一步強調這些注釋。要更改多個項的顏色,i青按住CTRL鍵(

33、Mac上的Command鍵),并單擊每個項。前景一單擊文本注釋或箭頭。這將啟用“前景”字段,以便您可以使用下拉菜單選擇不同的顏色。背景一單擊文本注釋。這還將啟用“背景”字段,以便您可以使用下拉菜單選擇背景色。旋轉通過單擊“旋轉”按鈕,可以將文本注釋向左或向右旋轉90%體積工具當自動泳道和條帶分析功能不合適或不可能(如在點圖中)時,可以使用體積工具手動對樣本圖像上的特性執行定量。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 #分析圖像 #可以使用體積工具對條帶、斑點、陣

34、列和其他圖像數據的信號強度進行定最。可以用形狀環繞的方式定義感興趣的區域通過單擊“體積”字段下方的按鈕,可以選擇矩形、圓形或徒手畫形狀。默認標記會出現在繪制的形狀中。體積標記可以是三種類型之一(U表示未知,std表示標準,bfor表示背景)連同按順序分配的編號。最初創建的每個新體積都有紅色邊框,指示已選擇體積。如果單擊圖像的其他位置,則邊框將變為藍色,指示已取消選擇體積。注意:雙擊體積區域可更改其屬性。可以定義體積類型(未知、標準或背景)及其數最,或輸入自定義名稱以替換默認標記。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # 分析圖像 #體積相對定量通過在“體積屬性”對話框中選中“參考體積”

35、復選框,可以選擇任何一個體積作為參考體積。在體積標記上,參考體積以星號表示,例如,U1*0相對定量顯示在“體積表”的“相對定量”列中。相對定量是背景調整體積除以背景調整參考體積所得到的比率所有其他體積現在都顯示相對于參考體積的數值。大于1.0的值指示體積大于參考體積。小于1.0的值指示體積小于參考體積。單擊工具欄中的“標準曲線”圖標時,圖表將顯示所有未知定量和標準定量。對齊可以使用適當的對齊圖標對齊體積。要選擇多個體積,i青按住CTRL鍵,同時單擊每個體積,或拖動這些體積以使用選擇框。可以通過按CTRL-C并按CTRL-V(Mac上的Command-C和Command-V),復制并粘貼選定的體

36、積。體積背景扣除繪制體積時,某些非數據背景像素可能會包括在體積內。這些背景像素通常會有一個不想包括在體積定量中的強度值。為體積計算此背景強度的方式有兩種:局部和全局。局部一局部背景扣除用于計算創建的每個未知體積和標準體積各自的背景強度對于每個體積,會將體積周圍1個像素邊框內的像素強度累加起來,然后除以邊框像素的總數這將得出每個體積周圍背景的平均強度,然后從體積內每個像素的強度扣除這一平均強度。如果背景值大于體積內的像素值,則體積的背景調整數量可能為v0。在這種情況下,應當為此體積重新繪制邊框。全局一全局背景扣除用于計算整個凝膠的單個背景強度。然后從凝膠中的所有體積中扣除這一平均背景強度。Gel

37、DocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 #分析圖像 #要計算全局背景扣除,請執行以下操作:在圖像中具有代表性的背景區域中,使用某個體積工具創建一個體積(即與數據周圍的背景類似的非數據區域)。雙擊該體積。這將打開“體積屬性”對話框。選擇“背景”選項按鈕。系統將計算該背景體積中的像素的平均強度,并從所有標準和未知體積中的每個像素中扣除該平均強度。因此,背景體積區域不必與未知背景體積區域具有相同的大小。注釋:如果在“體積”工具箱中選擇“全局”,但沒有按所述方式定義背景體積,則不會執行背景扣除。如果創建多個背景體積,則這些背景體積中的所有像素都將用于計算平均背景。根據背景體積的創建順序,背景體積的默認

38、名稱為B1、B2,.依此類推。如果定義為背景的區域比數據對象的平均強度值更高,則您將在“分析表”中獲得已調整體積的負值心如果發生這種情況,譴選擇強度小于數據對象的新背景區域。體積標準如果已在已知數量的對象周圍繪制體積,則可以使用它來計算未知體積的數量。要按照標準對特定體積進行分類,譴雙擊它。這將打開“體積屬性”對話框。選擇“標準”選項按鈕,然后在數量字段中輸入數量。單擊“確定”關閉對話框。根據標準體積的創建順序,標準體積的默認名稱為S1、S2,依此類推。未知體積的數最根據標準體積和選定回歸方法進行計算。GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # 分析圖像 #要查看回歸曲線,請打開“標準曲

39、線”窗口,并選擇“體積標準曲線”選項卡GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 # #分析圖像 #1叵3(Z縣示標記丑沖2軸y-6.9EO05x41.29R平方恒1GelDocEZ系統|分析圖像分析工具箱工具 #分析圖像 #廠芬子盤乍冷由經八甸歪玄詣;隹曲盤J回歸方法可以使用三種回歸方法生成體積定量曲線:線性、點到點和三次樣條。要顯示標準曲線,i青單擊工具欄中的標準曲線圖標,并選擇“體積標準曲線”選項卡。有關上述各種方法的計算方式的信息,謂參閱附錄C:回歸計算方法(第99頁)。可以在“體積表”的“絕對定量”列中找到體積標準的數

40、據。注意:選中“經過原點”復選框始終可以在0,0處開始繪制標準曲線圖形,不管最佳曲線擬合效果如何。生成報告生成報告 # 分析圖像 #生成報告查看結果之后,可以生成一個報告,顯示已分析的凝膠圖像、所有的實驗協議設置以及您想要包括的數據的所有信息。可以在“編輯”菜單中的“報告設置”對話框或者從主工具欄的“報告”按鈕中選擇打印報告設置:EReport圖標可生成報告的打印預覽”O生成報告生成報告 # #分析圖像 #生成報告生成報告 # #分析圖像 #嘏色仃印鬥殳民Std.fvRee_湮呂脊DI圖像報吿:EZStain-Free生成報告生成報告 # #分析圖像 #生成報告生成報告 # #分析圖像 #單擊

41、“打印”圖標且可在打印機中打印所有預覽信息。GelDocEZ系統|生成報告 #分析圖像 #從報吿中AM除信息使用以下選項屏幕可以從報告中刪除信息。這不會從分析中刪除數據;它只會從報告中刪除信息。顯示報告常規選項卡默認情況下,包括所有信息。可以自定義報告,以僅包括您想要的信息。清除復選框以刪除報告項。自定義報吿標題一可以提供報告的自定義報告標題。包括凝膠圖像一以下選項控制哪些內容會在凝膠圖像上重疊顯示:顯示泳道和條帶顯示體積顯示注釋GelDocEZ系統|生成報告 # 分析圖像 #移除報告中的信息圖像信息:獲取信息分析設置圖像信息注釋泳道和條帶表選項卡如果沒有完成任何泳道和條帶分析,則此選項卡中的

42、選項顯示為灰色。清除任何框,以從報告中排除信息。包括泳道和條帶表要顯示的泳道:可連續顯示的所有泳道或僅用戶定義的泳道所有泳道或每頁一個泳道(在每個泳道后添加分頁符)顯示泳道輪廓一包括每個泳道的泳道輪廓。如果不想在報告中包括某些列,請將它們的標記移到左側。GelDocEZ系統|生成報告 #分析圖像 #體積表選項卡如果沒有完成任何體積分析,則此選項卡中的選項顯示為灰色。包括體積表一如果不想在報告中顯示此信息,則清除復選框。如果不想在報告中包括體積列,請將體積標記移到左側。打印報告運行實驗協議時,可以自動打印報告。有關詳細信息,請參閱輸出設置(第40頁)。要打印報告,請執行以下操作:單擊打印報告”圖

43、標。在“圖像打印預覽”工具欄中單擊“打印”。要將報告打印到-pdf文件:單擊打印報告”圖標。在“圖像打印預覽”工具欄中單擊“將報告打印到PDF”,以在計算機上將報告保存為.pdf文件。GelDocEZ系統|生成報告 分析圖像 #導岀結果導出結果將實驗相關的完整信息存檔的最簡便的方法是生成報告。但是.可能只需要導出凝膠圖像或分析表數據,以便在諸如QuantityOne.FPQuest或InfoQuestFP等不同的程序中進行分析。或者,可能需要導岀文件以供演示或發布。導出凝膠圖像ImageLab軟件具備以多種方式導出凝膠圖像的功能。可以將顯示的圖像數據導出到發布文件(選擇“導出以便發布”)可以將

44、原始圖像數據作為16位TIFF文件導出(選擇“導出以便分析”)可以將圖像數據導出到PulseNet,這樣會使圖像縮減為8位TIFF文件,分辨率受到限制,且文件大小限定為300Kb可以將泳道和條帶表以及體積表導出到電子表格程序或文件導出凝膠圖像的各種選項在文件菜單的“導出”選項中提供。 # 分析圖像 #GelDocEZ系統|導岀結果下列各節將介紹可用的導出選項。QNewProtocol.Open.RecentImagesRecentFretozdsQrh-rJQrh-0SaveSaveAs.Ctrl+SCloseCloseAllExportImageIrfo.Ctrl十IPageSetup.Print.Qrh-PEitFileEdkV

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