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文檔簡介
《生物化學》(張洪淵)講義-川大
上冊
第一章緒論(L2節)
一.如何學好生化課
1.生物化學的特點
.內容分布:生物化學這門課,從教材上看,通常都分為上下兩集,
上集談的是生物分子的結構、性質、功能,很少涉及它們的變化,這
些生物分子包括糖、脂、蛋白質、核酸、酶、激素、維生素以及抗生
素等,叫做靜態生化,以DNA結構為例。而下集則講的是這些生物
分子的來龍去脈,即合成與分解,叫動態生化,以DNA的復制為例。
.特點:概念性描述性的內容居多,很少有推導性或計算性的內容,
因此,它不同于理科而更近似于文科,記憶的東西多,女生常常比男
生學得好,巧妙記憶成為學好生化的一個重要方法,學完生化課后,
你們應該有一種意外的驚喜,阿,我的腦子咋變得這樣好使呢?2.
師生合作
.老師備課:由于生物化學是我院最重要的課程(課時多以及研考跑
不掉),所以我得竭盡全力準備,既要完成大綱規定的內容又不能照
本宣科,注意理論和實踐、經典與前沿的融合,使生化課變得興趣盎
然而不是枯燥無味,要做到這些,備課是相當辛苦的,且聽我來表一
表,我在四川大學上了320節生化課(200節理論,120節實驗),上
課筆記成了現在的講課筆記的一部分,后來臨時抱佛腳,又到南大進
修了200學時的生化理論課(生化專業用)以及120學時的理論課(非
生化專業用),講課教師叫楊榮武,是個教書天才(合作文章(在我
兒十篇文章中,這是最得意的一篇)、同學的師弟、上海生化所),聽
課筆記真是一摞一摞,從中精煉出我們現在的6-70學時理論課(難
吶),還要增補一些名人趣聞、科學前沿之類的味精,總的算來,我
給你們講一節課,自己要聽7節課,再準備三小時一,代價不菲,所以
我常掛在嘴邊的一句話就是,你們一定要學好這門課,學不好很對不
起人,在你最對不起的人里面,我應該列在前三名。
.學生學習:看小說似的預習兒遍,尤其上課要用心聽講(省時省力),
當場或課后整理筆記(重要性),擇重記憶(注意方法),兒個小竅門:
早上多吃糖(原因,腦血糖),站立聽課(腎上腺,恐怖電影,我講
課)。業遠遠落后于日本和歐美列強,給畢業生就業帶來了困難。喜
者是許多有識之士已經看到了生化的光輝前景,紛紛搶灘這塊寶地,
生化工業也在艱難的條件下起步并有蓬勃發展之勢,以我們身邊的人
物為例,歐陽老師和我們的專業發展。
第二章糖類
§1.糖的概念
一.糖的種類和功能
1.糖的定義
2.糖的功能:能源結構信息傳遞
3.糖的種類:
單糖:定義醛糖酮糖丙、丁、戊、己、庚糖及其兩者的組合,重
要單糖的舉例
寡糖:定義舉例
多糖:定義同多糖雜多糖舉例
結合糖:定義舉例
4.碳水化合物:carbohydrate
二.糖的構型
1.兒個概念:
同分異構體
結構異構
立體異構
兒何異構
旋光異構
差向異構
2.糖的構型
不對稱碳原子旋光異構體的性質
甘油醛的構型(D\L)意義
葡萄糖的構型
§2.單糖的結構和性質
單糖舉例
一.葡萄糖的結構
1.鏈式結構:條件結構式構型旋光異構體和自然選擇簡化結構式
2.環狀結構:條件毗喃型和吠喃型及自然選擇a型和B型異頭物
3.投影式(Haworth式)鏈式與環式的互變規則
4.變旋現象:現象本質
5.葡萄糖的構象:船式和椅式
6.兒種重要單糖的結構式(默認為D-型):甘油醛二羥丙酮核糖!脫
氧核糖!葡萄糖甘露糖半乳糖果糖!鏈式和環式都要,請大家自
己在書上將其找到。
二.單糖的性質
1.物理性質:
旋光性(特例)
甜度:標準以及順序(果糖〉蔗糖〉葡萄糖)
溶解性
2.化學性質
.與強酸的作用:形成糠醛及其衍生物
反應式及其原理:書P16
糖的鑒定:
Molish反應:糠醛及其衍生物與a-蔡酚反應作用生成紫色的化合物,
原理是好基于酚類進行了縮合,這樣,將糖與濃酸作用后再與a-蔡酚
反應作用就能生成紫色的化合物,可鑒別糖。(多羥、醛基)
Seliwanoff反應:同樣的原理,將糖與濃酸作用后再與間苯二酚反應,
若是酮糖就顯鮮紅色,若是醛糖就顯淡紅色,由此可鑒別酮糖和醛糖。
.形成糖甘:糖的半縮醛羥基與其它物質的羥基或氨基脫水縮合形成
的化合物。
舉例:麥芽糖的結構式:見書P22
葡萄糖a-1,4-葡萄糖昔,a-葡萄糖出半縮醛羥基,另一葡萄糖(a、P
可互變)出4位上的羥基。
反應部位
主體、配體、糖昔鍵的鍵型(半縮醛羥基的構型-半縮醛羥基的位置,
另一羥基的位置)
全名:配體半縮醛羥基的構型-半縮醛羥基的位置,另一羥基的位置-
主體昔
.糖的還原性
費林反應(Fehling):見P15費林試劑反應式定量法
與鐵氟化鉀的反應:
將葡萄糖與鐵氟化鉀(K3Fe(CN)6)溶液共熱時,鐵氧化鉀被還原
成亞鐵氟化鉀(K4Fe(CN)6)。
反應式:K3Fe(CN)6+葡萄糖-K4Fe(CN)6+葡萄
糖酸
.形成糖豚
糖與三分子苯明的反應
反應式:見P17
用途:鑒定單糖的種類:糖月殺為黃色的不溶于水的晶體,不同的糖豚
其晶型和熔點均不同,由此可鑒別單糖的種類。
思考題:葡萄糖、果糖、半乳糖、甘露糖哪兒種可被糖豚反應所鑒別,
哪些不能?
其余的反應如酯化作用、對堿的作用、糖的氧化性等,請大家自己看
看O
§3.寡糖
定義
結構單位:環狀的糖
糖昔鍵
主體和配體
寡糖(以及淀粉)中的單糖叫殘基
一.兒種重要的二糖
1.麥芽糖:見P22葡萄糖a-1,4-葡萄糖昔:是直鏈淀粉的形成方式
2.異麥芽糖:葡萄糖a-1,6-葡萄糖昔:是枝鏈淀粉分支處的的形成方
式
3.蔗糖:a-葡萄糖p-2,1果糖普般-果糖a-1,2葡萄糖昔
4.乳糖:見P22葡萄糖-1,4-半乳糖昔
5.纖維二糖:見P22葡萄糖B-1,4-葡萄糖昔:是纖維素的形成方式。
§4.多糖
定義
一.同多糖
即均一多糖:定義
1.淀粉
結構單位:a-D-葡萄糖(在淀粉和寡糖中叫做葡萄糖殘基)
連接方式(即糖背鍵型):直鏈淀粉:a-1,4糖昔鍵,枝鏈淀粉a-1,6
糖昔鍵(僅出現在分支處)和a-1,4糖背鍵(除了分支處以外的地方)
直鏈淀粉的結構:見P24還原端和非還原端各一
枝鏈淀粉的結構:見P25還原端一個,非還原端多個
淀粉的二級結構(空間結構):見P24右手螺旋(像個彈簧),每一
圈含有6個葡萄糖殘基
碘顯色機理:鉆圈,圈越多(分子量越大即葡萄糖殘基越多)色越深
淀粉水解碘顯色的變化:淀粉(藍色或紫色)一紅色糊精一無色糊精
一寡糖一葡萄糖
性質:與葡萄糖相比,它沒有還原性、有旋光性但無變旋現象、溶解
度降低
2.糖原:結構上完全同枝鏈淀粉,只是分子量要大得多
3.纖維素:見P27
結構單位:0-D-葡萄糖
連接方式:P-1,4糖昔鍵
分子量:上萬個葡萄糖殘基
二級結構:鋸齒帶狀,交織在一起,強度很大。
4,其余多糖:半纖維素和兒丁質等,請大家自己回去看看。
二級結構:鋸齒的鏈狀,由于它們互相纏繞和交織,因此,強度很大。
性質:不溶于水,僅能被高溫的強酸和少數兒種纖維素酶所水解
二.雜多糖
通常與蛋白質形成具有粘性的物質,故稱粘多糖,在體內起潤滑作用
(胃部以及關節處的粘夜,鼻涕等)
例如:透明質酸、硫酸軟骨素和肝素等
三.結合糖:糖脂、糖蛋白、蛋白多糖等,自己看。
布置作業:重要單糖的結構,糖月殺反應的思考題。抽查
第三章脂類
§1.概述
定義:由脂肪酸和醇作用生成的酯及其衍生物統稱為脂類,這是一類
一般不溶于水而溶于脂溶性溶劑的化合物。
一.脂類的類別
1.單純脂:定義:脂肪酸與醇脫水縮合形成的化合物
蠟:高級脂肪酸與高級一元醇,幼植物體表覆蓋物,葉面,動物體表
覆蓋物,蜂蠟。
甘油脂:高級脂肪酸與甘油,最多的脂類。
2.復合脂:定義:單純脂加上磷酸等基團產生的衍生物
磷脂:甘油磷脂(卵、腦磷脂)、鞘磷脂(神經細胞豐富)
3.脂的前體及衍生物
高級脂肪酸
甘油
固醇
菇類
前列腺素
4.結合脂:定義:脂與其它生物分子形成的復合物
糖脂:糖與脂類以糖背鍵連接起來的化合物(共價鍵),如霍亂毒素
脂蛋白:脂類與蛋白質非共價結合的產物如血中的兒種脂蛋白,
VLDL、LDL、HDL、VHDL是脂類的運輸方式。
二.脂類的功能
1.最佳的能量儲存方式
體內的兩種能源物質比較
單位重量的供能:糖4.1千卡/克,脂9.3千卡/克。
儲存體積:1糖元或淀粉:2水,脂則是純的,體積小得多。
動用先后:糖優先,關于減肥和辟谷
2.生物膜的骨架:細胞膜的液態鑲嵌模型:磷脂雙酯層,膽固醇,蛋
白質。見HP34
3.電與熱的絕緣體
電絕緣:神經細胞的鞘細胞,電線的包皮,神經短路
熱絕緣:冬天保暖,企鵝、北極熊
4.信號傳遞:固醇類激素
5.酶的激活劑:卵磷脂激活隹羥丁酸脫氫酶
6.糖基載體:合成糖蛋白時,磷酸多菇醇作為埃基的載體
§2.甘油脂
定義:高級脂肪酸與甘油,其中甘油三脂就是油脂。
一.脂肪酸:結合態、游離態(FFA)
1.性質
偶數
順式
雙鍵的位置9、12、15
溶點與結構的關系:鏈長(長-高),飽不飽和(飽-高)
2.簡單表達式:
簡單結構式:波浪形,注意雙鍵的構型
簡單表達式:鏈長:雙鍵數△雙鍵位置
舉例:油酸18:1A9
3.常見脂肪酸和必需脂肪酸
常見:
軟脂酸16:0,
硬脂酸18:0
必須脂肪酸:(Vf):人和哺乳動物不可缺少但又不能合成的脂肪酸,
必須從食物(尤其是植物)中攝取。包括:
亞油酸18:2A9,12
a-亞麻酸18:3A9,12,15
y-亞麻酸18:3A6,9,12
素油比葷油營養價值大
二.甘油脂(脂酰甘油)
甘油的寫法和性質:P33
甘油脂的通式:MG、DG、TG:P33
油脂:油(植物)+脂肪(動物),脂肪酸的飽和性決定了它們的狀態
1.油脂的物理性質
.溶解度:不溶于水,而溶于乙醇、乙酸、氯仿、表面活性劑(雙親
性物質)等,對比MG和DG
.溶點:植物的油與動物的脂肪的溶點,由脂肪酸的飽和性決定
.旋光性:前題,書寫方式(L)與構型無關,這是規定,P33。
2.化學性質
.皂化與皂化值
定義:油脂與堿共熱時,產生甘油和脂肪酸鹽(肥皂),實際上是堿
催化的水解反應
反應式:P36
皂化值:加熱,KOH(mg)/油脂(g),可以反映油脂的量(摩爾數)
.酸敗與酸值
油脂長期擱置時會產生酸臭味就是酸敗
原因是油脂受空氣和光照作用,部分發生分解,不飽和脂肪酸被氧化
成為醛或酮以及竣酸,產生酸臭味。P37
桐油的應用
酸值:不加熱,KOH(mg)/油脂(g),可以反映油脂的新鮮程度。
.加成反應與碘值
油脂中的不飽和雙鍵可以與H2、12、HC1、C12等發生加成反應
鹵化作用:P36
碘值:12(g)/油脂(百克)
反映油脂的不飽和程度
§3.磷脂
復合脂中最重要的一族
組成基團:脂肪酸、醇(甘油、鞘氨醇等)、磷酸根、X(醇類)
一.甘油磷脂(磷脂酰甘油)
1.結構通式:P39
命名:磷脂酰X
X為其它的醇類,通過磷酸二酯鍵與甘油連接。
天然磷脂均為L型構型
2.兒種重要的磷脂
X膽堿乙醇胺(膽胺)絲氨酸肌醇H
結構式P40P40P41P41
名稱磷脂酰膽堿(卵磷脂)生物膜、卵黃中的重要成分,良性的脂
溶性溶劑,常用于治療心腦血管疾病P40磷脂酰乙醇胺(腦磷脂)
P40磷脂酰絲氨酸P41磷脂酰肌醇P41磷脂酸
3.兒種重要的磷脂酶及其作用特點:PLA1、PLA2(PLB)、PLC、PLD
作用位點:P397或P39+
溶血磷脂
蛇毒與磷脂酶
二.神經鞘磷脂:神經鞘氨醇P42、脂肪酸、磷酸、膽堿
神經鞘氨醇P42(+脂肪酸)-神經酰胺P42(+磷酸+膽堿)-神經鞘磷
脂P42
三.磷脂的特性
1.溶解性:表面活性劑,雙親化合物(親油親水)
氯仿+甲醇是提取磷脂的有效溶劑
2.解離:兩性電解質,解離后磷酸基團帶負電,X基團帶正電(見X
的結構)
3.水解反應:堿解(皂化)、酶解
§4.其它脂類
一.結合脂
1.糖脂
.甘油糖脂:甘油磷脂的磷酸X被糖所取代的產物,即第三個羥基與
糖的半縮醛羥基脫水縮合的產物(P39),因此,也屬于糖昔。
.糖鞘脂:鞘磷脂的磷酸+膽堿被糖所取代的產物,糖也是出的半縮醛
羥基,也屬于糖昔。例如:腦背脂和神經節背脂P47(霍亂毒素受體
GMI)等。
2.脂蛋白:血液中的四種脂蛋白。
二.固醇類:環戊烷多氫菲的衍生物P42。編號
功過是非:癌癥(黃曲霉素),心血管疾病(高血壓),結石;腦細胞、
膽汁酸、激素、VDo
固醇(留醇):環戊烷多氫菲上3位接-OH,10、13位上接-CH3,17
位上接一烷鏈P42o
.膽固醇:固醇上的17位上接一異辛烷P43。游離膽固醇和膽固醇脂
均不溶于水。
膽固醇在紫外線的作用下可以轉化成VD,VD的作用,嬰兒曬太陽。
.膽汁酸:膽固醵衍生的一類固醇酸。
膽酸:P43略
三.菇類:異戊二烯的衍生物P45,衍生方式為異戊二烯首尾相連或尾
尾相連P45+O
單菇(2個異戊二烯單位)、倍半葩(3個異戊二烯單位),胡羅卜
素為4菇,天然橡膠為上千拓。
霍亂病:
病征:上吐下瀉,全是水,若不補充水,一天之內即死亡
病理:腸內大量失水,水壓過高,排泄物中有大量的霍亂弧菌。
分子基礎:小腸上皮細胞的外表面結構如圖(講義稿P5),具有霍亂
毒素的受體,霍亂毒素的結構是個七聚體蛋白,與受體結合后解離,
穿過細胞膜,刺激腺普酸環化酶,提高cAMP,使鈉/水泵失調,向腸
內排水,又向周圍組織以及血管中抽水
第四章蛋白質
一.蛋白質是生命的表征,哪里有生命活動哪里就有蛋白質
1.酶:作為酶的化學本質,溫和、快速、專一,任何生命活動之必須,
酶的另一化學本質是RNA,不過它比蛋白質差遠了,種類、速度、
數量。
2.免疫系統:防御系統,抗原(進入“體內”的生物大分子和有機體),
發炎。
細胞免疫:T細胞本身,分化,膿細胞。
體液免疫:B細胞,釋放抗體,導彈,免疫球蛋白(1g)。
3.肌肉:肌肉的伸張和收縮靠的是肌動蛋白和肌球蛋白互動的結果,
體育生化。
4.運輸和儲存氧氣:Hb和Mbo
5.激素:含氮類激素,固醇類激素。
6.基因表達調節:操縱子學說,阻遏蛋白。
7.生長因子:EGF(表皮生長因子),NGF(神經生長因子),促使細
胞分裂。
8.信息接收:激素的受體,糖蛋白,G蛋白。
9.結構成分:膠原蛋白(肌腱、筋),角蛋白(頭發、指甲),膜蛋白
等。生物體就是蛋白質堆積而成,人的長相也是由蛋白質決定的。
10.精神、意識方面:記憶、痛苦、感情靠的是蛋白質的構象變化,
蛋白質的構象分類是目前熱門課題。
11.蛋白質是遺傳物質?只有不確切的少量證據。如庫魯病毒,怕蛋
白酶而不怕核酸酶。
二.構成蛋白質的元素
1.共有的元素有C、H、O、N,其次S、稀有P等
2.其中N元素的含量很穩定,16%,因此,測N量就能算出蛋白質
的量(實驗四,修改預定表)。
三.結構層次
1.一級結構:AA順序
2.二級結構:主干的空間走向
3.三級結構:肽鏈在空間的折疊和卷曲形成的形狀,所有原子在空
間的排布。
4.四級結構:多條肽鏈之間的作用。
§1.氨基酸蛋白質的結構單位、水解產物
一.氨基酸的結構通式:P50
a-碳原子,a-竣基,a-氨基
氨基酸的構型:自然選擇L型,D型氨基酸沒有營養價值,僅存在
于繳氨霉素、短桿菌肽等極少數寡肽之中,沒有在蛋白質中發現。
二.氨基酸的表示法
生物體中有20種基本氨基酸(合成蛋白質的原料),還有其它非基本
氨基酸,20種基本氨基酸的表示方法有下列兒種:
1.中文名:X(X)氨酸,如甘氨酸、半胱氨酸。20種要會背。
2.英文名:3字名,如Gly、Cys等,20種要會背。
3.按順序演示,記憶技巧。
AlaArgAspAsnCysGluGinGlyHislie
丙精天天冬酰氨半谷谷氨酰氨甘組異亮
LeuLysMetPheProSerThrTrpTyrVai
亮賴甲硫苯丙膈絲蘇色酪繳
三.氨基酸的具體結構:20種全部記住,僅注意R。
P51?53
講解順序:
甘Gly(最特殊,唯一無旋光性)、丙Ala(顧名思義)、苯丙Phe(顧
名思義)。
酪Tyr(有供苯酚基)、半胱Cys(0-毓基)、絲Ser(彷羥基)、蘇Thr
(B-羥基)、天冬Asp(酸性氨基酸,供竣基)、天冬酰氨Asn(隹酰
氨)、色Trp(中口引蛛基P66)、組His(隹咪哇基P66)。
谷Glu(酸性氨基酸,y-竣基)、谷氨酰氨Gin(y-酰氨)、甲硫Met
(「甲硫基)。
金Arg(3理I基P66)o
賴Lys(堿性氨基酸,。氨基)。
綴Vai、亮Leu、異亮lie:都是烷煌鏈。
脯Pro(亞氨基)。
四.氨基酸的分類
1.結構上
脂肪族氨基酸:酸性氨基酸(2竣基1氨基:Glu、Asp),堿性氨基
酸(2氨基1竣基:Arg、Lys),中性氨基酸(氨基酸基各一:很多)
芳香族氨基酸:含苯環:Phe>Tyr
雜環氨基酸:His(也是堿性氨基酸)、Pro、Trp
2.R基的極性
極性氨基酸:親水氨基酸:溶解性較好,酸性氨基酸、堿性氨基酸、
含筑基、羥基、酰胺基的氨基酸,Glu、Asp、Arg、Lys、His、Cys、
Ser、Thr、Tyr、Gln>Asn
非極性氨基酸:疏水氨基酸:溶解性較差,具有烷煌鏈、甲硫基、蚓I
喙基等的氨基酸,Gly、Ala、Leu>lie、Val>Pro>Met、Trp
3.營養價值
必需氨基酸:人和哺乳動物不可缺少但又不能合成的氨基酸,只能從
食物中補充,共有8種:Leu、Lys、Met、Phe>lie、Trp、Thr、Vai
半必需氨基酸:人和哺乳動物雖然能夠合成,但數量遠遠達不到機體
的需求,尤其是在胚胎發育以及嬰幼兒期間,基本上也是由食物中補
充,只有2種:Arg、Hiso有時也不分必需和半必需,統稱必需氨基
酸,這樣就共有10種。記法:TipMTVHall
非必需氨基酸:人和哺乳動物能夠合成,能滿足機體需求的氨基酸,
其余10種
從營養價值上看,必需〉半必需,非必需
五.非基本氨基酸
1.氨基酸的衍生物:蛋白質化學修飾造成的,有P-Ser、P-Thr、P-Tyr、
OH-Pro.OH-Lys,最為重要的是Cyss胱氨酸,是由2分子Cys通過
二硫建連接起來的,P54
2.非蛋白氨基酸:僅游離存在,瓜氨酸、鳥氨酸、隹丙氨酸
3.D-氨基酸:綴氨霉素、短桿菌肽中含有。
六.氨基酸的性質
1.物理性質
紫外吸收:有共甄雙鍵的物質都具有紫外吸收,在20種基本aa中,
有4種是具有共甄雙鍵的,Trp、Tyr、Phe、His,其中His只有2個
雙鍵共飄,紫外吸收比較弱,Trp、Tyr、Phe均有3個雙鍵共加,紫
外吸收較強,其中Trp的紫外吸收最厲害,是蛋白質紫外吸收特性的
最大貢獻者,此3種氨基酸的紫外吸收特點如下:
Aa(氨基酸)Am(最大吸收波長:nM)E(消光系數:A/Mol/L)
Phe2572*102
Tyr2751.4*103
Trp2805.6*103
旋光性:僅Gly不具旋光性,其它19種都有,且自然選擇為L-型。
溶解性:溶解于水,特別是稀酸稀堿溶液,不溶于乙酸、氯仿等有機
溶劑。
熔點:均大于200C,也就是說氨基酸都是固態,而同等分子量的其
它有機物則是液態,這說明了氨基酸與氨基酸之間的結合力很強,是
離子鍵,即氨基酸是以離子狀態存在的,而不是以中性分子存在的。
2.化學性質
解離和等電點:
氨基酸是個兩性電解質,既可進行酸解離也可進行堿解離,用解離方
程式表示就是:見P57,這樣,氨基酸在水溶液中就可能帶電,+或
以及呈電中性,到底是什么情況,完全由溶液的PH值來決定。
等電點:如果調節溶液的PH值使得其中的氨基酸呈電中性,我們把
這個PH值稱為氨基酸的等電點:PLPI是氨基酸的重要常數之一,
它的意義在于,物質在P1處的溶解度最小,是分離純化物質的重要
手段。
思考題:
當溶液的PH值〉PI時,aa帶電為+/-?
當溶液的PH值=<8?
等電點的計算:對于所有的R基團不解離的氨基酸而言(即解離只
發生在a-竣基和a-氨基上),計算起來非常簡單:
PI=(PKF+PK2,)/2
若是碰到R基團也解離的,氨基酸就有了多級解離,這個公式就不
好用了,比如Lys、Glu、Cys等。
aaCysAspGluLysHisArg
PK'a-竣基1.712.692.192.181.822.19
PKb-氨基8.339.829.678.959.179.04
PIC-R-基團10.78(-SH)3.86(B-COOH)4.25(y-COOH)10.53
(E-NH2)6(咪哇基)12.48(肌;基)
在這種情況下可以按下面的步驟來計算:
由PK?值判斷解離順序,總是PKiyPK2yPK3,PI時,aa帶-電;
PH值
氨基酸的重要化學反應
反應基團試劑主要產物應
用P
a-NH2年三酮紫色、紅色物對氨
基酸顯色63
a=NH2瑋三酮黃色物
Pro的鑒定
a-NH2HNO2N2等游離aa定量,
蛋白質水解程度59
a-NH2DNFB二硝基氟苯Sanger試劑DNP-aa二硝基苯黃色物蛋
白質N端測定一級結構分析標準圖譜
6181
a-NH2PITC苯異硫氟酸酯Edman試劑PTC-aa在無水的酸中環化
成PTH-aa蛋白質N端測定一級結構分析aa順序自動分析儀標準圖
譜82
a-NH2甲醛羥甲基-aa和二羥甲基-aa甲醛滴定aa含量(封閉氨基)
60
Arg的肌;基a-蔡酚次澳酸鈉坂口試劑桃紅色物鑒定Arg
Met的-S-CH3H202過氧化物吸煙有害,煙中的過氧化物,彈性蛋
白酶,抑制劑Met,肺氣腫。
Cys的-SH碘代乙酸ICH2coOH過甲酸HCOOOH乙酸硫基
H00C-CH2-S-磺基HS3O-肽鏈拆分,作用與CYSS上的二硫鍵65
His的咪唾基重氮苯磺酸Pauly試劑櫻紅色物(IHis連2重)鑒定
His65-66
Tyr的酚基重氮苯磺酸Pauly試劑桔黃色物鑒定Tyr
Tyr的酚基磷鋸酸、磷鴇酸Folin試劑蘭色物質定量測定蛋白質、
Tyr
Trp的U引喙基對二甲基氨基苯甲醛蘭色物質鑒定Trp
-OHSer.Thr、Tyr激酶、ATPP-aa調節酶的活性,測定酶的活性中
心65
§2.肽
一.肽與肽鍵
氨基酸的竣基與另一氨基酸氨基脫水縮合形成的化合物就是肽,其實
就是一種酰胺化合物,其酰胺鍵就是肽鍵,它的特點是剛性平面、反
式構型。見補頁。
肽中的氨基酸叫氨基酸殘基,兒個氨基酸殘基就叫兒肽。
二.肽的種類
寡肽:2-10,無構象,谷胱甘肽是3肽
多肽:10-50,介于之間,胰高血糖素是29肽
蛋白質:50以上,有特定的構象,胰島素是51肽
三.肽的表示法
LN端、C端的概念:肽鏈的兩個端點,N端的氨基酸殘基的a-氨基
未參與肽鍵的形成,C端的氨基酸殘基的a-竣基未參與肽鍵的形成。
2.寫法和讀法:規定書寫方法為N端一C端,例如:Ala-Gly-Phe,
讀作:丙氨酰甘氨酰苯丙氨酸。
注意有時會看到一些奇怪的寫法,比如:NH2-Ala-Gly-Phe-COOH,
或H-Ala-Gly-Phe-OH,均屬于畫蛇添足,但Ala-Gly-Phe-NH2則表
示C端被酰胺化了。
若有必要從C端一N端寫,則必須標明,如(C)Phe-Gly-Ala(N)
四.肽的性質
1.酸堿性:肽至少有一個游離的氨基和游離的竣基,也是兩性化合物,
至少有2級解離,通常都有多級解離。因此,肽在水溶液中也能夠帶
電,也有自己的等電點PI,其計算與測定完全同氨基酸的。
例如:谷胱甘肽,Glu-Cys-Gly,其結構見P72,注意Glu-Cys之間的
肽鍵(Y-,而不是正常的a-),各解離基團的PK,值見P72,PI=
(2.13+2.34)/2=2.235,很酸。
2.雙縮服反應:見筆記P33,雙縮胭(相似于三肽,即2個肽鍵)、堿
性銅離子、紫紅色化合物。凡大于三肽的肽都能發生此反應,2肽不
行。
3.水解反應:肽可以被酸、堿、酶所水解,其優劣性如下:
酸水解:濃酸(6N以上,解釋一下N=M/價),高溫(110℃以上),
長時(24-36小時),污染,Trp遭到破壞,不消旋,水解徹底
堿水解:濃堿(6N以上),高溫(100℃以上),6小時、污染,含-OH
和-SH的氨基酸均遭到破壞,Ser、Thr、Tyr、Cys,消旋,水解徹底。
酶水解:胰酶,常溫常壓,常PH,不消旋、不破壞、不徹底。
常用的蛋白酶,即工具酶:
外切酶:氨肽酶:從N端開始一個個水解肽鍵
竣肽酶:從c端開始一個個水解肽鍵:
竣肽酶A:Arg、Lys>Pro除外的氨基酸殘基
竣肽酶B:僅Arg、Lys
竣肽酶C:所有的氨基酸殘基
內切酶:胰蛋白酶:僅作用于Arg、Lys的竣基與別的氨基酸的氨基
之間形成的肽鍵。產物為C端Arg、Lys的肽鏈。
糜蛋白酶:僅作用于含苯環的氨基酸的竣基與別的氨基酸的
氨基之間形成的肽鍵。Trp、Tyr、Phe,產物為C
端Trp、Tyr、Phe的肽鏈。
五.肽的實例
1.谷胱甘肽:其結構見P72,注意Gki與Cys的連接(y-,而不是正
常的a-),還原型GSH和氧化型GSSG,多種酶的激活劑,參與體內
多項代謝,主要作用是還原劑,消除體內的自由基(過氧化物,抽煙,
黑坳)。
2.催產素和加壓素:9肽或環8肽,都是腦垂體后葉激素,結構見《生
化制藥工藝》P?都有升血壓、抗利尿、刺激子宮收縮、排乳的作用,
催產素促進遺忘,加壓素增強記憶。
3.短桿菌肽和繳氨霉素
4.促甲狀腺素釋放因子:TRF,是個三肽,TRF一促甲狀腺素一甲狀
腺素
5.胰高血糖素:29肽,存在,見《生化制藥工藝》P?,升高血糖,
作用同腎上腺素。
§3.蛋白質
一.種類和性質
1.種類
組成上分:簡單蛋白:僅由aa構成
結合蛋白:簡單蛋白與其它生物分子的結合物,糖蛋白(共價)、脂
蛋白(非共價)
形態上分:球蛋白:長/寬。?4,血紅蛋白
纖維蛋白:長/寬>10,血纖蛋白、絲蛋白
功能上分:酶、抗體、運輸蛋白、激素等
理化性質上分:HDL、VHDL、LDL、VLDL
構象上分:國際上有蛋白質構象庫。
2.性質
紫外吸收:280nm,貢獻者是Trp、Tyr、Phe,最主要的是Trp,核酸
的紫外吸收峰在260nmo
兩性解離:有PL不能計算,只能測定(等電聚焦)。
等電點沉淀法:PI處蛋白質的溶解度最低。
膠體性質:大分子,多于51個aa殘基,最小平均分子量為5000D;
在水中能兩性解離故而帶電,又親水,所以是膠體,分散好。有電泳、
布朗運動、丁達爾現象、不能通過半透膜等等典型的膠體性質。
沉淀反應:凡是能破壞水化膜以及能中和電荷的物質均可使蛋白質沉
淀
等電點沉淀:PH值,中和電荷
鹽析:高濃度的鹽溶液使蛋白質沉淀,離子中和電荷,如(NH4)2SO4
鹽溶:低濃度的鹽溶液使蛋白質溶解,蛋清的溶解。
有機溶劑沉淀:降低溶液的介電常數。
蛋白質變性:蛋白質在某些外界因素的影響下,理化性質改變、生物
活性喪失的現象。這些因素包括熱、酸、堿、有機劑等。
蛋白質變性理論:吳憲,1931年提出。蛋白質的功能直接由蛋白質
的構象來決定,某些外界因素改變了蛋白質的獨特構象,因而使生物
活性喪失。但不改變蛋白質的一級結構(即共價結構)。蛋白質的變
性與水解是不同的。
當環境條件恢復時,蛋白質的生物活性有可能也恢復,這就是蛋白質
的復性。
這一理論在實踐中有很重要的指導意義,能夠解釋酶為什么有最適的
PH和最適的溫度。
蛋白質的顏色反應:可以用來定量定性測定蛋白質
雙縮版反應:紅色,Xm=540nm
黃色反應:與HNO3的反應,生成硝基苯,呈黃色。皮膚遇到HNO3
的情況,白一黃一橙黃。
米倫氏反應:與HgNO3或HgNO2的反應,呈黃色,原理同上。
與乙醛酸的反應:紅色,Trp的口引噪基的特定反應。
坂口反應:紅色,Arg的?]I基的反應。
福林反應:藍色,是Tyr的酚基與磷鋁酸和磷鴇酸的反應。
印三酮反應:紫紅色
Pauly反應:櫻紅色,His的咪哇基。
二.蛋白質的一級結構及其測定
1.蛋白質的結構層次:1、2、超2、結構域、3、4
2.一級結構:即蛋白質的共價結構或平面結構,核心內容就是aa的排
列順序,它的改變涉及到蛋白質共價鍵的破壞和重建。
一級結構的全部內容包括:肽鏈的個數、aa的順序、二硫鍵的位置、
非aa成分。
3.蛋白質一級結構的測定
間接法:通過測定蛋白質之基因的核甘酸順序,用遺傳密碼來推斷
aa的順序。這是因為核甘酸的測序比蛋白質的測序工作要更方便、更
準確。
直接法:用酶和特異性試劑直接作用于蛋白質而測定出aa順序。
第一步:前期準備
分離純化蛋白質:純度要達到97%以上才能分析準確。
蛋白質分子量的測定:滲透壓法、凝膠電泳法(聚丙烯酰胺、SDS)、
凝膠過濾法、超離心法等
aa組成的測定:氨基酸自動分析儀
肽鏈拆分:非共價鍵的如氫鍵、離子鍵、疏水鍵、范德華力4種,可
用尿素或鹽酸服等有機溶液來拆分。共價鍵的僅二硫鍵1種,可用筑
基乙醇、碘代乙酸、過甲酸來拆分。
第二步:肽鏈的端點測定
N端測定:Sanger法,DNFB—DNP-肽一水解一乙醛萃取一層析鑒定
Edman法,PITC-PTC-肽―PTH-aa一層析鑒定
C端測定:明解法,P83,唯有C端aa與眾不同,酰腫化合物與游離
aa,再通過Sanger法來鑒定。Asn>Gin、Cys、Arg將被朋破壞,不
能分析。
竣肽酶法:配合動力學控制。
竣肽酶A:Arg、Lys>Pro除外的氨基酸殘基
竣肽酶B:僅Arg、Lys
竣肽酶C:所有的氨基酸殘基
每條肽鏈aa順序的測定:aa順序自動分析儀只能準確測定50aa以下
的肽鏈,而一般的蛋白質都含有100以上的aa殘基,所以,事先要
將蛋白質打斷成多肽甚至寡肽,再上機分析,而且要2套以上,便于
以后拼接。
常用的工具酶和特異性試劑有:
胰蛋白酶:僅作用于Arg、Lys的竣基與別的氨基酸的氨基之間形成
的肽鍵。
糜蛋白酶:僅作用于含苯環的氨基酸的竣基與別的氨基酸的氨基之間
形成的肽鍵。Trp、Tyr、Phe
CNBr:僅作用于Met的竣基與別的氨基酸的氨基之間形成的肽鍵。
拼接:將2套多肽的aa順序對照拼接,舉例:
156987351256984523->156987351256984523
―156987351256984523
第四步:二硫鍵位置的確定:包括鏈內和鏈間二硫鍵的位置,用對角
線電泳來測。在肽鏈未拆分的情況下用胃蛋白酶水解之,可以得到被
二硫鍵連著的多肽產物。先進行第一向電泳,將產物分開。再用過甲
酸、碘代乙酸、筑基乙醇處理,將二硫鍵打斷。最后進行第二向電泳,
條件與第一向電泳完全相同。選取偏離對角線的樣品(多肽或寡肽),
它們就是含二硫鍵的片段,上機測aa順序,根據已測出的蛋白質的
aa順序,把這些片段進行定位,就能找到二硫鍵的位置。如下圖:
4.蛋白質一級結構測定的意義
分子進化:將不同生物的同源蛋白質的一級結構進行比較,以人的為
最高級,從而確定其它物種的進化程度,也可以制成進化樹,由于這
是由數據決定的,因此比形態上確定的進化更加科學和精確。
證明了一個理論,即蛋白質的一級結構決定高級結構,最終決定蛋白
質的功能。
疾病的分子生物學:鐮刀型貧血癥的內因是血紅蛋白的B6VaL正常
的血紅蛋白的P6G1U
三.蛋白質的二級結構
1.二級結構概論
二級結構的定義:肽鏈主干在空間的走向。主干指的是肽平面與a-C
構成的鏈子,見P95。
二級結構的內容:空間走向以及維持這種走向的力量:氫鍵和R基
團的影響(離子鍵、疏水鍵、空間障礙等)
二級結構的數學描述:小角:肽平面繞N-Ca單鍵旋轉的角度
V角:肽平面繞Ca-C竣基單鍵旋轉的角
度,見P95。
至于+-方向的規定,0度角的規定太復雜,不作要求。
這樣,一個肽平面的空間位置可以被2個二面角來確定,如果每個肽
鏈的兩個二面角(巾,<|/)都相同,則構成了規則的空間走向,所以可
以用(4),w)來描述肽鏈的二級結構。
2.二級結構的常見類型
Pauling的貢獻,X光衍射法是研究蛋白質構象的最好技術,羊毛蛋
白和蠶絲蛋白,單調一致,諾貝爾化學獎。
a-右手螺旋
a-螺旋即像彈簧一樣的螺旋,有右手與左手之分,自然選擇蛋白質的
a-螺旋為右手螺旋。示范。
a-右手螺旋的數據:每一圈含有3.6個aa殘基(或肽平面),見P96
的b,每一圈高5.4A,即每一個aa殘基上升1.5A,旋轉了100度,2
個二面角個,V)=(-570,-480)o
維持a-右手螺旋的力量是鏈內氫鍵,它產生于一個肽平面的C=O與
相鄰一圈的在空間上鄰近的另一個肽平面的N-H之間,見P96b,它
的方向平行于螺旋軸,因此,a-右手螺旋的外觀是個筒狀的簾子,見
P96co每個氫鍵串起的長度為3.6個肽平面或3.6個aa殘基,被氫鍵
串起來的這個環上含有13個原子,故a-右手螺旋也被稱為3.613螺
旋。
R基團對a-右手螺旋的影響:破壞者Pro,該處折斷,因為亞氨基不
能形成氫鍵;不穩定者酸性、堿性、太大、太小:Glu、Asp、Arg、
Lys、Gly、lie。其它都是起穩定作用的。
分布:毛發中的a-角蛋白,例如頭發中的a-角蛋白。見沈同P155。
供折疊:肽鏈在空間的走向為鋸齒折疊狀,見P97。跟纖維素的相似。
二面角(巾,w)=(-119℃,+113℃)o
維持折疊的力量:鏈間的氫鍵,它產生于一個肽平面的c=o與相
鄰肽鏈的在空間上鄰近的另一個肽平面的N-H之間,見P98,兩條肽
鏈上的肽平面互相平行,形成片層結構。見P97。
隹折疊有平行式和反平行式兩種見P98o
平行式:兩條鏈的走向相同,N-C
N-C
反平行式:兩條鏈的走向相反,N-C
C-N
反平行式的快折疊比平行式的更穩定
一條肽鏈回折后就可形成兩條走向相反肽段,就可以形成反平行式的
折疊,隹折疊不限于兩條肽鏈之間,多條肽鏈可以形成很寬的供折
疊片層,片層與片層之間以范德華力相互作用,形成厚厚的墊子。
a-右手螺旋與隹折疊相比更具彈性,不易拉斷,供折疊易拉斷,a-右
手螺旋經加熱后可變成隹折疊,長度增加,毛衣越洗越長也是這種變
化。
左手螺旋:存在于膠原蛋白中,aa殘基組成為(-Gly-Pro-Y-),Y為
HyPro或HyLys靠鏈間氫鍵和范德華力來維持。見沈同P158。
U型回折:也叫B-轉角,肽鏈在某處回折1800所形成的結構。這個
結構包括的長度為4個aa殘基,其中的第三個為Gly,穩定該結構的
力量是第一和第四個aa殘基之間形成的氫鍵。在黑板上演示。
310螺旋:是a-右手螺旋的過渡形式,又瘦又長,每個氫鍵串起的長
度為3個肽平面或3.6個aa殘基,被氫鍵串起來的這個環上含有10
原子。
無規卷曲:無固定的走向,但也不是任意變動的,它的2個二面角
有個變化范圍。
從結構的穩定性上看a-右手螺旋邛-折疊〉U型回折〉無規卷曲,而從
功能上看正好相反,酶與蛋白質的活性中心通常由無規卷曲充當,a-
右手螺旋和折疊一般只起支持作用。
3.超二級結構:空間相鄰的兒個2級結構形成的更復雜的結構,其類
型有
左手超螺旋:3根a-右手螺旋擰到一起形成一個左手超螺旋,如頭發
中的角蛋白,見沈同P155。
右手超螺旋:3根左手螺旋擰到一起形成一個右手超螺旋,如膠原蛋
白,見沈同P158。本教材P103有誤。
aa:相鄰的2根a-右手螺旋擰到一起形成一個左手超螺旋,見P98。
Pxp:一個連接鏈連著2個p折疊,平行式,這個連接鏈可以很長。
見P98。
Pap:3段0折疊和2段a螺旋相間形成,見P98。
W:以2段U-型回折連接著的3段p折疊,反平行式。見P98。
4.結構域:長肽鏈(多于150個aa),在二級結構的基礎上通過多次
折疊,在空間上形成一些半獨立的球狀結構,叫結構域,它是三級結
構的一部分,結構域之間靠無規卷曲連接。也就是說將三級結構拆開
后首先看到的結構。草圖顯示。
四.蛋白質的三級結構和四級結構
1.三級結構:即蛋白質的三維結構、構象,指其中所有原子的空間排
布,是結構域再經過卷曲和折疊后形成的。如果蛋白質是單條肽鏈,
則三級結構就是它的最高級結構,三級結構由二硫鍵和次級鍵(氫鍵、
疏水鍵、離子鍵、范德華力)維持。P99是肌紅蛋白的三級結構。
2.四級結構:多條肽鏈通過非共價鍵(氫鍵、疏水鍵、離子鍵、范德
華力)形成的聚合體的結構就是四級結構,注意,由二硫鍵連接的兒
條肽鏈不具有四級結構。每條肽鏈都有自己的三級結構,稱為亞基或
亞單位,一般情況下,具有四級結構的蛋白質含有的肽鏈不會太多,
故稱這類蛋白質為寡聚蛋白,如寡聚酶等。
五.蛋白質的結構與功能
1.蛋白質的結構與功能的關系
每一種蛋白質都具有特定的結構,也具有特定的功能。
蛋白質的結構決定了蛋白質的功能。
蛋白質的功能直接由其高級結構(構象)決定。例子,蛋白質的變性
現象。
蛋白質的一級結構決定高級結構(構象),因此,最終決定了蛋白質
的功能。例子,人工合成胰島素,A、B鏈分別合成,等比例混合后
就有活性。而生物合成胰島素則是先合成一條長肽鏈,形成正確的二
硫鍵,而后再剪去中間的c肽才形成胰島素的。草圖顯示。
2.蛋白質結構與功能實例
免疫球蛋白G:即抗體G,IgG(Immunoglobe),由免疫細胞B分泌
出的蛋白質,可以特異的結合抗原并消滅之,這就是免疫反應。
IgG的一級結構:四條肽鏈,2重2輕(L2H2),對稱排列,LHHL,
有12條鏈內二硫鍵,4條鏈間二硫鍵,見草圖。對其aa的分析發現,
IgG分為V區(可變區)和C區(恒定區)。
二級結構:兒乎全是P折疊,由無規卷曲連接。
結構域:有12個球體,每個均被二硫鍵鎖住。
三級結構:T型和Y型,屬于球蛋白。
沒有四級結構。
IgG的功能:V區負責結合抗原,像鉗子一樣夾住抗原,體現了IgG
的特異性,2價。C區負責結合補體(一種酶,可以水解抗原),也
是2價,結合部位在寡糖鏈處的錢鏈區。IgG的動態作用過程用人體
演示。
肌紅蛋白:Mb(Myoglobin),哺乳動物的肌肉中儲存氧氣的蛋白質,
水生的哺乳動物體內尤為發達(如鯨魚),因此,它們可以憋氣很長
時間,研究用Mb一般由鯨魚提供。
一級結構:單條肽鏈,153個aa,其中的83個aa為保守序列(即同
源蛋白質均相同,是決定功能的最重要序列),含有一分子血紅素輔
基,見P104,其中保持Fe2+,血紅素通過Fe2+以配位鍵吊在肽鏈的
His的咪唾基上,示意。02將結合在Fe2+上。
二級結構:兒乎全是a-右手螺旋,中間由無規卷曲和結來連接。
三級結構:扁平的菱形,見P99或沈同P172,屬于球蛋白。
功能:儲存氧氣。其三級結構在分子表面形成一個疏水的空穴,血紅
素即藏在其中,該空穴允許02進入而拒絕水的進入,保證了Fe2+
結合02而避免了Fe2+—Fe3+。
Mb結合氧氣的特征可以由氧合曲線來描述,見P104,為雙曲線形。
其中的氧飽和度(飽和百分數)為Mb02/(Mb02+Mb),P02為
氧的分壓。從圖中可以看出,Mb傾向于結合氧氣而不愿意放出氧氣,
所以它的功能是儲存氧氣,只有在P02極低的時候(體內缺氧的時
候)它才釋放出氧氣。另外,C0可以與02競爭性的結合Mb。
血紅蛋白:Hb(Hemoglobin),在人體中有三種,HbA,HbA2,HbF
(僅存于胎兒中),三者的結構和功能大同小異,此處以HbA為例。
一級結構:4條鏈,a2p2oal41,13146,每條肽鏈都結合著一分子的
血紅素,兩條B鏈之間還夾著一分子DPG(二磷酸甘油酸),每條肽
鏈都有保守序列。
二級結構:4條鏈均同Mb,兒乎全是a-右手螺旋,中間由無規卷曲
和結來連接。
三級結構:4條鏈均同同Mb,扁平的菱形,見沈同P181,屬于球蛋
白。
四級結構:4個亞基占據著4面體的4個角,鏈間以離子鍵結合,
條a鏈與一條P鏈形成二聚體,Hb可以看成是由2個二聚體組成的
(印)2,在二聚體內結合緊密,在二聚體之間結合疏松。
功能:運輸氧氣,4價。其三級結構在每個肽鏈的分子表面形成一個
疏水的空穴,血紅素即藏在其中,該空穴允許02進入而拒絕水的進
入,保證了Fe2+結合02而避免了Fe2+一Fe3+。
其氧合曲線見P104,為S形曲線,只有在PO2很高的情況下(在肺
部)Hb才結合氧氣,而P02一降低(在外周血管中),它就釋放02,
而此時的Mb卻紋絲不動。就結合02的能力而言,4價的Hb還不如
1價的Mbo
Hb的氧合曲線形狀與Mb不同是因為它有著Mb所不具有的一些特
性,如:
協同效應:Hb分子中一條鏈結合02后,可以導致其構象的變化,
使其它兒條鏈結合02的結合能力突然增強,表現出其氧合曲線為S
形曲線。對Hb協同效應的解釋為:在沒有結合氧氣時、Hb的四條
鏈之間結合緊密,這種構象稱為T態,這種緊密是由離子鍵和DPG
(位于2條p鏈之間)造成的,屏蔽了分子表面疏水的空穴,使Hb
分子結合02的能力降低(游離的a鏈和0鏈結合氧氣的能力與Mb
相同)。當一條鏈結合了氧氣之后,鐵嚇琳把His的咪哇基向下一扯,
導致該肽鏈的三級結構發生變化(牽一發而動全局),肽鏈之間的離
子鍵被破壞,Hb的四級結構也隨之改變,2個二聚體(ap)之間發
生錯位,擠出DPG,四級結構進一步變化,每條鏈表面疏水的空穴
暴露在外,這種構象稱為R態,結合氧氣的能力得以增強。
別構效應:是某些寡聚蛋白質特有的現象。是指蛋白質與效應物結合
改變蛋白質的構象,進而改變蛋白質的生物活性。
Hb的活性中心:Hb每個亞基上血紅素存在的那個疏水空穴是結合氧
氣的地方,稱之為活性中心,也叫活性部位。
別構中心:在Hb分子的其它地方還有結合效應物的部位,如結合
H+、CO2、DPG甚至02,這些部位結合了效應物之后,可以改變蛋
白質的構象,進而影響到活性中心與氧氣的結合,這些部位就叫別構
中心。活性中心與別構中心可以重合也可以不重合,在Hb中是不重
合的。
因此,別構效應可以說成是別構中心結合了效應物之后影響了活性中
心與氧氣的結合。協同效應實際上就是一種別構效應。Mb只有活性
中心沒有別構中心,它的氧合曲線就是雙曲線形的。
Hb的另一個別構效應是波爾效應:H+和CO2對Hb與氧氣結合的影
響。具體的影響見P105的方程式,敘述為H+和CO2促進Hb釋放
02,這也解釋了Hb為什么在肺中吸氧排CO2,而在肌肉中吸C02排
氧°
另外,DPG降低Hb與02的結合能力。
關于鐮刀形細胞貧血癥:紅細胞減少,只有正常人的1/2,無力,劇
烈運動會導致死亡。Hbs與Hb在結合02的能力方面并沒有區別,
區別在于Hbs造成紅細胞溶血,溶血后的Hb不能像紅細胞中的Hb
一樣正常運輸02。Hbs導致溶血的原因在于其B6Val,正常的血紅蛋
白的B6Ghi,紅細胞表面的Hbs由于疏水鍵而聚集,使細胞膜破裂。
鐮刀形細胞貧血癥在非洲某些地區居然是自然選擇的結果,是與瘧疾
抗爭的產物。
Hbs純合子:B6Val「6ValHbs雜合子:B6Glu「6Val正常人B6Glu|36Glu
童年死,抗瘧疾死亡分布年齡廣,抗瘧疾長壽,一得瘧疾立即死
瘧疾桿菌只能利用正常人的Hb,不能利用Hbs,所以Hbs者是不感
染瘧疾的。在該地,Hbs純合子和正常人都經不起自然選擇,只有
Hbs雜合子存活了下來。
六.多肽的固相合成
1.多肽的液相合成:aa1-aa2-aa3-aa4-aa5
aal+aa2—aal-aa2+aa2-aal+aal+aa2,得率很低而且分離出2肽aal-aa2
很煩,合成越到后面,分離工作越困難。
2.經過保護和活化處理的多肽的液相合成:
保護氨基aal活化竣基+aa2保護竣基一
保護氨基aal-aa2保護竣基+保護氨基aal活化竣基+aa2保護竣基
分離2肽“保護氨基aal-aa2保護竣基”,去掉氨基保護,再與“保護
氨基aa3活化竣基”反應。
得率提高,分離簡化,但仍然很煩。
3.多肽的固相合成:主要就是解決了分離提取方面的難題。
整個過程見草圖,其中□表示保護,△表示活化,合成的方向為C-N,
與生物合成多肽的方向相反。
多肽的固相合成思路誕生于洛克菲勒大學主教學樓的電梯中,該大學
的教授、諾貝爾獎金獲得者與其老板洛克菲勒的一段對話。因此,現
在人們還能在電梯的內壁上看到“Solid-phasepeptidesynthesizewas
bomhere!”
布置本章作業:
1.用下列實驗數據推導某肽鏈的一級結構:
完全酸水解后產生的aa組成為:Ala、Arg、2Ser、Lys、Phe、Met、
Pro
用DNFB處理并水解得到DNP-Ala和e-DNP-Lys
竣肽酶A和B都對此肽不作用
用CNBr處理獲得2個片段,其中一個片段含有Pro、Trp、Ser
用糜蛋白酶作用產生3個片段,1個含有Pro、Ser;另1個含有Met、
Trp;最后一個含有Phe、Lys>Ser、Ala>Arg
用胰蛋白酶處理產生3個片段,1個含有Ala、Arg;另1個含有Lys、
Ser;最后一個含有Phe、Trp、Met、Ser、Pro
2.根據書上P59給出的PK,值,計算正常的二肽Glu-Lys以及Lys-Glu
的PI值。
若有時間就介紹一下參考書。見本講義P2
第五章酶
§1.酶的概論
一.酶是生物催化劑
二.酶的特點
1.效率高:用轉換數來衡量,即每個酶分子每秒鐘催化底物的量(uM),
比其它催化劑高出107?1013倍。
2.具有專一性:每一種酶只能作用與一種或一類相似的物質,稱為底
物。專一性表現在對某一種鍵的催化上(如水解糖昔鍵、肽鍵),高
度專一性的酶不僅對化學鍵有要求,對該鍵兩側的基團也有要求(胰
蛋白酶),甚至對基團的構型也有嚴格要求(體內所有蛋白質合成或
分解的酶都只認L型AA)
3.條件溫和:室溫、常壓、溫和的PH,劇烈條件反而使酶失活。對
比蛋白質的酸堿水解。
三.酶的化學本質
1.是蛋白質:酶的性質符合蛋白質的特性,為主,80年代以前的書籍
都認為酶的本質就是蛋白質。
2.是RNA:新發現的某些酶的成分是RNA,稱為核糖酶。
對比而言,蛋白質作為的酶種類多,數量大,效率高,是酶中的主力。
核糖酶僅限于水解酶類,且效率低。
四.酶的分類
1.按組成成分分:
簡單蛋白質:只有蛋白質成分。
結合蛋白質:蛋白質+非蛋白成分=全酶,蛋白質部分稱為酶蛋白。
非蛋白成分稱為輔酶:與酶蛋白結合疏松
或輔基:與酶蛋白結合緊密
通過透析可以鑒別兩者。
2.按分子結構分:
單體酶:酶蛋白只是一條單肽鏈,如胃蛋白酶、胰蛋白酶、溶菌酶等。
寡聚酶:酶蛋白是具有4級結構的蛋白質,有兒條?兒十條彼此非共
價連接的肽鏈,如糖原磷酸化酶等。這種酶便于進行調節。
多酶體系:由兒種獨立的酶彼此結合形成的聚合體,后一種酶的底物
正好是前一種酶的產物,多酶體系的效率極高,很像是流水作業。
3.按反應性質分:6大類,很重要。
氧化還原酶類:催化氧化還原反應的酶,以催化脫氫為主加氧為次(包
括其逆反應:就是加氫脫氧)。用方程式表示就是:A-2H+B<-->A+
B-2H
這類酶通常都需要輔酶幫忙,輔酶有下列兒種:NAD(尼克酰胺
腺喋吟二核甘酸)、NADP(尼克酰胺腺喋吟二核甘酸磷酸)、FAD(黃
素腺喋吟二核甘酸)、FMN(黃素腺喋吟單核甘酸),這些都是維生
素的衍生物。
具體例子:乳酸發酵的最后一步,見草圖。
轉移酶類(移換酶類):催化基團轉移反應的,用方程式表示為:AB
+CD<-->AC+BD
具體例子:aa代謝中的轉氨反應:見草圖。
水解酶類:催化水解反應。用方程式表示為:AB+HOH-AOH+BH
例子太多。
裂解酶類:從底物中移去一個基團并形成雙鍵的反應,無方程式可表
/hO
例子:見草圖。
異構酶:催化同分異構反應。用方程式表示為:A<-->B例子:見
草圖。
合成酶:催化2種物質合成一種物質,又必須由ATP水解提供能量
的反應,無方程式可表示。例子:見草圖。
六大類酶的記憶訣竅:Z字訣:O2+H2<-->H2O氧轉水,裂亦
入口。
思考題:催化ATP+G<-->G-6-P+ADP反應的酶是那一類酶。
五.酶的命名
1.習慣名:規律性不強,搶先原則,比較亂,會出現一酶多名或一名
多酶,優點是簡單明了。
2.系統命名:酶與名一一對應,要求標名所有底物的名
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