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ICS
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中華人民共和國(guó)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)
GB/TXXXXX—XXXX
常見動(dòng)物源性成分快速測(cè)定膜芯片法
Rapiddetectionofanimal-derivedMaterials—Membrane-basedarrayMethod
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(征求意見稿)
GB/TXXXXX—XXXX
常見動(dòng)物源性成分快速測(cè)定膜芯片法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了豬、黃牛、羊、雞、鴨、兔、驢、貂、狐、鼠、牦牛等常見動(dòng)物源性成分膜芯片檢測(cè)
方法的原理、試樣制備與保存、試劑與儀器設(shè)備、實(shí)驗(yàn)方法和流程、生物安全措施、結(jié)果判讀、確證實(shí)
驗(yàn)、結(jié)果表述。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于肉制品及飼料中11種常見動(dòng)物源性成分的快速和定性檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB/T14699.1飼料采樣
GB/T19495.1轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)通用要求和定義
GB/T19495.2轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要
GB/T19495.7轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)抽樣和制樣方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T20195動(dòng)物飼料試樣的制備
GB/T25165明膠中牛、羊、豬源性成分的定性檢測(cè)方法實(shí)時(shí)熒光PCR法
GB/T27403實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)
SN/T3730(所有部分)食品及飼料中常見畜類品種的鑒定方法
3術(shù)語(yǔ)和縮略語(yǔ)
下列術(shù)語(yǔ)和縮略語(yǔ)適用于本標(biāo)準(zhǔn)。
DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)
dNTP:脫氧核苷酸三磷酸(deoxyribonucleosidetriphosphate)
dATP:脫氧腺苷三磷酸(deoxyadenosinetriphosphate)
dCTP:脫氧胞苷三磷酸(deoxycytidinetriphosphate)
dGTP:脫氧鳥苷三磷酸(deoxyguanosinetriphosphate)
dTTP:脫氧胸苷三磷酸(deoxythymidinetriphosphate)
dUTP:脫氧尿苷三磷酸(deoxyuridinetriphosphate)
bp:堿基對(duì)(basepair)
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18SrRNA:線粒體18SrRNA基因(18SribosomalRNA)
COXⅠ:線粒體細(xì)胞色素氧化酶亞基Ⅰ基因(CytochromecoxidasesubunitI)
Cytb:線粒體細(xì)胞色素b基因(Cytochromeb)
ATPase6:ATP合成酶亞基6(ATPsynthase6)
D-loop:線粒體D-LOOP區(qū)域
PC:陽(yáng)性對(duì)照(Positivecontrol)
NC:陰性對(duì)照(Negativecontrol)
Taq:ThermusAquaticusDNA聚合酶(ThermusAquaticusDNApolymerase)
UDG酶:尿嘧啶-N-糖基化酶(UracilN-glycocasylase)
Biotin:生物素修飾基團(tuán)
AminolinkerC6:6個(gè)碳原子作為連接臂的氨基標(biāo)記(C6Aminolinker)
4原理
待檢樣品經(jīng)抽樣記錄后,提取DNA模板。針對(duì)食品及飼料中常見動(dòng)物源性成分進(jìn)行特異性基因片
段設(shè)計(jì)引物,對(duì)提取DNA模板進(jìn)行多重不對(duì)稱PCR擴(kuò)增。PCR引物上修飾有生物素,若樣本中含有
目標(biāo)片段而得到PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物與固定有目標(biāo)基因特異性探針的膜芯片進(jìn)行雜交,經(jīng)化學(xué)顯
色后可在雜交點(diǎn)上形成肉眼可見的雜交信號(hào)。依據(jù)膜芯片上的雜交點(diǎn)顯色情況,判斷樣本中是否含有待
檢動(dòng)物源性成分,檢測(cè)結(jié)果可以用肉眼直接判斷,或用芯片掃描儀對(duì)雜交芯片進(jìn)行掃描并判定結(jié)果。
5試樣制備與保存
5.1抽樣方法
按GB/T14699.1規(guī)定的方法進(jìn)行樣品采集。
5.2樣品制備
5.2.1食品樣品制備
從原始樣品中取出部分有代表性樣品,將可食部分用絞碎機(jī)絞碎,充分混勻,用四分法縮分出不少
于500g作為試樣。裝入清潔容器中,加封后,標(biāo)明標(biāo)記。
5.2.2飼料樣品制備
按GB/T20195的規(guī)定制備試樣。選取有代表性飼料樣品至少500g,經(jīng)粉碎機(jī)粉碎后,過孔徑為
0.2mm的標(biāo)準(zhǔn)篩。混勻后,裝入清潔容器內(nèi)保存,防止交叉污染。
5.3樣品保存
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5.3.1食品樣品保存
將樣品于-20℃冷凍保存。
5.3.2飼料樣品保存
將樣品于4℃避光保存。
6試劑
6.1試劑組分
試劑組分和存放條件參見附錄A。除非另有規(guī)定,所用試劑均為分析純,水為GB/T6682規(guī)定的三
級(jí)水。
6.2引物
PCR反應(yīng)使用的引物序列應(yīng)符合表1的規(guī)定。
表1PCR反應(yīng)使用的引物序列
擴(kuò)增片段大小
物種目標(biāo)基因引物名稱序列5‘-3‘
(bp)
Forward5'-AGCCTGAGAAACGGCTACC-3'
內(nèi)參18SrRNA180
Reverse5'-biotin-TGCTGGCACCAGACTTGC-3'
Forward5'-ACCGTAGGAATAGACGTG-3'
豬COXⅠ154
Reverse5'-biotin-TGAAGCCCAGAGCTCATAG-3'
Forward5'-TTACAACAATTATCAACATAA-3'
黃牛COXⅠ174
Reverse5'-biotin-CCGGGTCGAAGAAGGTTGTA-3'
Forward5'-GGCCTATACTATGGATCATATAC-3'
羊Cytb159
Reverse5'-biotin-AATTGCTGAAAGGAGGTTGGT-3'
Forward5'-CCACCTCACCTTCCTACAC-3'
雞Cytb77
Reverse5'-biotin-GAAATGGAATTTTGTCA-3'
Forward5'-ACAGAAGGAAACCGAA-3'
鴨ATPase6112
Reverse5'-biotin-TCCGATGATCACGTGGAGTCC-3'
Forward5'-GAAACTGGCTCCAACAAC-3'
兔Cytb96
Reverse5'-biotin-AAGGAAACCTAGGGTGTCTTTG-3'
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Forward5'-TACGCTCCATTCCCAACAAA-3'
驢Cytb134
Reverse5'-biotin-TTTTGACATGTGTAGGGTAGGG-3'
Forward5'-GTCATCTCAGCACTAGCAG-3'
貂Cytb107
Reverse5'-biotin-TAGGGGTGAAAGGGGATTT-3'
Forward5'-TTTGCCCACTGATTCCCCTT-3'
狐ATPase693
Reverse5'-biotin-CATGTTCACCCCTACGAATAT-3'
Forward5'-ACATACGAAAAACACACC-3'
鼠Cytb107
Reverse5'-biotin-TCCTAGAAGGGACCCAA-3'
Forward5’-CTAACAACACACATCCCCAA-3’
牦牛D-loop175
Reverse5’-TTATGTACGATTAATAATT-3’
6.3探針
芯片表面包被的目標(biāo)基因探針序列應(yīng)符合表2的規(guī)定。
表2目標(biāo)基因探針序列
名稱序列修飾基團(tuán)
18SrRNA5'-TGCGCGCCTGCTGCCTTCCT-3'5'-AminolinkerC6
豬5'-GAGCATACTTTACATCTGCCACAATAATCATTGCTATTCCC-3'5'-AminolinkerC6
黃牛5'-AACCCCTCTATTCGTATGATCCG-3'5'-AminolinkerC6
羊5'-TGGATCATATACCTTCCTAGAAACATG-3'5'-AminolinkerC6
雞5'-CCTAGGCATCTCATCCGACTC-3'5'-AminolinkerC6
鴨5'-ACCGCCCTACAAGCAATAGAGTACCATG-3'5'-AminolinkerC6
兔5'-ACAACCCCACAGGAATTCCTTCAAAC-3'5'-AminolinkerC6
驢5'-GCCCTTATCCTTTCCATCTTAATCCTAG-3'5'-AminolinkerC6
貂5'-GGAATCCCATCTGATTCAGAC-3'5'-AminolinkerC6
狐5'-GGGCTACACCCTAAATGACACCTG-3'5'-AminolinkerC6
鼠5'-AAAATTATTAACCACTCAT-3'5'-AminolinkerC6
牦牛5’-CGGAGGAGAATGCTGTTGTTGTATCGGATGT-35'-AminolinkerC6
5'-GCATCCAGATCAGAAGCAATAATGAGCAGTGCGAGAAGAACGAGTGTC
PC5'-AminolinkerC6
CAAAGTACCAG-3'
5'-GGTTCCTTGAGAAATGTTTTACGGGATTACTTCCATGTTTGTTGGATGAT
NC5'-AminolinkerC6
CCTATTTTC-3'
注:陽(yáng)性寡核苷酸單鏈DNA(Positive-Oligo,10μM):核苷酸序列與陽(yáng)性對(duì)照核酸探針(PC)序列互補(bǔ),用于膜芯片雜交
過程質(zhì)量控制,5’端帶生物素(biotin)標(biāo)記,序列如下:
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5'-biotin-CTGGTACTTTGGACACTCGTTCTTCTCGCACTGCTCATTATTGCTTCTGATCTGGATGC-3'
6.4其他試劑
6.4.120xSSPE緩沖液:3mmolNaCl,200mmol/LNaH2PO4,20mmol/LEDTA,pH7.4。
6.4.2十二烷基磺酸鈉(SDS)。
6.4.3乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-2Na,C10H14N2Na2O8)。
6.4.4氫氧化鈉(NaOH)。
6.4.5氯化鈉(NaCl)。
6.4.6磷酸二氫鈉(NaH2PO4.H2O)。
6.4.7多重PCR即用型預(yù)混液(MultiplexPCRMasterMix)。
6.4.8多重PCR引物預(yù)混液(MultiplexPCRPrimerMix):每條引物2μmol。
6.4.9堿性磷酸酶標(biāo)記鏈霉親和素(AP-streptavidin)。
6.4.10堿性磷酸酶化學(xué)顯色底物5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸和氯化硝基四氮唑蘭(NBT/BCIP)。
6.4.11去活化液:100mmol/LNaOH。
6.4.12去活化清洗液:2xSSPE,0.1%SDS。
6.4.13雜交液:2xSSPE,0.1%SDS。
6.4.14雜交清洗液:2xSSPE,0.5%SDS。
6.4.15酶孵育液:2xSSPE,0.5%SDS。
6.4.16孵育洗液1:2xSSPE,0.5%SDS。
6.4.17孵育洗液2:2xSSPE。
6.4.18底物顯色液:堿性磷酸酶化學(xué)顯色底物NBT/BCIP,含0.15mg/mLBCIP,0.30mg/mLNBT,
100mmol/LTris-HCl,5mmol/LMgCl2,pH9.5。
6.4.19苯酚。
6.4.20三氯甲烷。
6.4.21異戊醇。
6.4.22異丙醇。
6.4.23CTAB緩沖液:10%CTAB(m/v),十六烷基三甲基溴化銨。
6.4.24蛋白酶K,20mg/ml。
6.4.25RNA酶,10mg/ml。
6.4.26TE緩沖液,10mMTris-HCl1mMEDTApH8.0。
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6.4.27乙醇。
6.4.28膜芯片耗材:尼龍膜,BiodyneC型號(hào),厚度0.45μm。
7儀器與設(shè)備
7.1基因擴(kuò)增儀。
7.2膜芯片識(shí)讀儀。
7.3臺(tái)式離心機(jī):轉(zhuǎn)速12000rpm。
7.4旋渦儀。
7.5恒溫水浴鍋。
7.6膜芯片自動(dòng)雜交儀。
7.7微量移液器及槍頭。
7.8核酸微量分光光度計(jì)。
7.9純水儀。
7.10分析天平:準(zhǔn)確到0.001g。
8實(shí)驗(yàn)方法和流程
8.1膜芯片法檢測(cè)流程
膜芯片法檢測(cè)流程見附錄B。
8.2樣品
8.2.1實(shí)驗(yàn)室樣品代表性應(yīng)符合GB/T19495.7的規(guī)定。
8.2.2實(shí)驗(yàn)室樣品及測(cè)試樣品的保存應(yīng)按照GB/T19495.1的規(guī)定執(zhí)行。
8.2.3所有測(cè)試樣品的制備操作應(yīng)按照GB/T19495.2的規(guī)定執(zhí)行。
8.3樣品制備
8.3.1DNA提取
稱取50mg已制備好的樣品于2mL離心管中,加入1000μLCTAB緩沖液和40μL蛋白酶K,振蕩
混勻,65℃30min,期間每隔10min振蕩混勻。12000rpm離心10min,轉(zhuǎn)移1mL上清液至2mL離心管
中。加入500μL苯酚、三氯甲烷和異戊醇的混合液,體積比為25:24:1,強(qiáng)烈振蕩,12000rpm離心15min。
加入200μL三氯甲烷-異戊醇(24:1),強(qiáng)烈振蕩,12000rpm離心15min。吸取上清液至一新離心管中,
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加入等體積異丙醇,振蕩均勻,12000rpm離心10min。棄去上清液,70%乙醇洗滌一次,12000rpm離
心1min。棄上清液,晾干,用預(yù)熱至65℃的TE緩沖液溶解DNA。加入5μLRNA酶溶液,37℃30min。
同一天內(nèi)使用的DNA在4℃保存,2天后使用的DNA保存于-20℃。長(zhǎng)期保存的DNA置于-80℃。
可采用同等效果的動(dòng)物基因組DNA提取試劑盒。每個(gè)測(cè)試樣品提取時(shí)應(yīng)做兩個(gè)提取重復(fù)。
8.3.2DNA濃度測(cè)定
取適量DNA溶液原液加雙蒸水稀釋一定倍數(shù)后,使用核酸蛋白分析儀或紫外分光光度計(jì)測(cè)260nm
和280nm處的吸收值,DNA的濃度按式(1)計(jì)算:
c=A260*N*50/1000…(1)
公式中:
c-----DNA濃度,單位為微克每毫升(ug/μL);
A260-----260nm處的吸光值;
N-----核酸稀釋倍數(shù)。
當(dāng)濃度為10ug/mL,A260/A280比值在1.7-1.9之間時(shí),適宜PCR擴(kuò)增。
8.4PCR擴(kuò)增
8.4.1PCR反應(yīng)體系
PCR反應(yīng)體系配制見表3。每次實(shí)驗(yàn)中,利用已知含有11種動(dòng)物源性成分基因組DNA作為陽(yáng)性質(zhì)控,
已知不含有該11種動(dòng)物源成分基因組DNA作為陰性質(zhì)控,用緩沖液或水代替樣品進(jìn)行核酸提取作為空
白質(zhì)控。將8.3.1的核酸提取物加入到PCR反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增。
表3PCR反應(yīng)體系(體積50μL)
反應(yīng)液組成檢測(cè)反應(yīng)陽(yáng)性質(zhì)控陰性質(zhì)控空白質(zhì)控
MultiplexPCRMasterMix25μL25μL25μL25μL
MultiplexPCRprimerMix5μL5μL5μL5μL
檢測(cè)樣品基因組DNA200ng//
含有已知?jiǎng)游镌椿蚪MDNA/200ng//
不含有動(dòng)物源成分基因組DNA//200ng/
核酸提取空白///10μL
無核酸酶滅菌水補(bǔ)充至50μL補(bǔ)充至50μL補(bǔ)充至50μL補(bǔ)充至50μL
注:PCR體系最終含有MgCl21.5mmol/L,dATP、dCTP、dGTP、dTTP和dUTP各0.2mmol/L,UDG
酶1U,Taq酶2U,每條引物終濃度0.2μmol/L。
8.4.2PCR反應(yīng)循環(huán)參數(shù)
PCR反應(yīng)參數(shù)設(shè)置見表4。
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表4PCR反應(yīng)參數(shù)
步驟溫度反應(yīng)時(shí)間
137℃10min
295℃10min
395℃30s
455℃30s
572℃15s
3、4、5循環(huán)35次
672℃10min
7(推薦)4℃保溫
8.5膜芯片雜交
8.5.1膜芯片制備
膜芯片制作與質(zhì)量控制見附錄C。
8.5.2雜交體系
雜交體系液配制見表5。
表5雜交體系
組份體積(μL)
雜交液(2×SSPE,0.1%SDS)949
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物50
陽(yáng)性寡核苷酸單鏈DNA(Positive-Oligo,10μmol/L)1
總體積1000
8.5.3酶孵育體系
酶孵育體系液配制見表6,使用時(shí)重新配制。
表6酶孵育體系
組份體積(μL)
孵育液(2×SSPE,0.5%SDS)999.5
堿性磷酸酶標(biāo)記鏈霉親和素(AP-streptavidin)0.5
總體積1000
8.5.4雜交、酶聯(lián)及顯色
8.5.4.1雜交檢測(cè)方式
可選擇手動(dòng)雜交或自動(dòng)雜交儀。
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8.5.4.2手動(dòng)雜交
將膜芯片置于雜交盒內(nèi),按表7進(jìn)行手動(dòng)雜交。雜交過程在分子雜交爐中進(jìn)行,類似儀器應(yīng)滿足實(shí)
驗(yàn)要求。
表7膜芯片手動(dòng)雜交過程
過程名稱步驟
去活化加入去活化液1mL,37℃,8min,吸除去活化液。
去活化清洗加入去活化清洗液1mL,60℃,5min,吸除去活化清洗液。
雜交加入雜交體系液1mL,42℃,45min,吸除雜交體系液。
雜交清洗(2次)加入雜交清洗液1mL,52℃,5min,吸除雜交清洗液,該過程重復(fù)2次。
酶孵育加入酶孵育體系液1mL,42℃,30min,吸除酶孵育體系液。
孵育清洗1(2次)加入孵育清洗液1(1mL),42℃,5min,吸除孵育清洗液1,該過程重復(fù)2次。
孵育清洗2(2次)加入孵育清洗液2(1mL),37℃,5min,吸除孵育清洗液2,該過程重復(fù)2次。
顯色加入顯色液1mL,37℃,靜止顯色15min,吸除顯色液。
顯色清洗(2次)加入去離子水1mL,37℃,5min,吸除去離子水,該過程重復(fù)2次。
結(jié)果判讀根據(jù)雜交點(diǎn)顯色情況進(jìn)行結(jié)果判讀。
8.5.4.3自動(dòng)雜交儀
按芯片自動(dòng)雜交儀操作說明書進(jìn)行開機(jī)、預(yù)熱后,將包裝有膜芯片的雜交盒放入自動(dòng)雜交儀中開始
雜交過程。依次自動(dòng)完成去活化、雜交、清洗、酶孵育、顯色等雜交過程。具體測(cè)定參數(shù)見表8。
表8自動(dòng)雜交儀測(cè)定參數(shù)
程序名稱試劑名稱溫度(℃)時(shí)間(min)
去活化去活化液378
去活化清洗去活化清洗液605
雜交雜交液4245
雜交清洗雜交清洗液525
雜交清洗雜交清洗液525
酶孵育孵育液4230
孵育清洗1孵育清洗液1425
孵育清洗1孵育清洗液1425
孵育清洗2孵育清洗液2375
孵育清洗2孵育清洗液2375
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顯色顯色液3715
顯色清洗去離子水375
顯色清洗去離子水375
結(jié)果判讀根據(jù)雜交點(diǎn)顯色情況進(jìn)行結(jié)果判讀
8.6膜芯片結(jié)果判讀
8.6.1目測(cè)判讀
顯色后的膜芯片可以用肉眼直接判讀檢測(cè)結(jié)果。陽(yáng)性雜交信號(hào)為肉眼明顯可見的藍(lán)色斑點(diǎn)。如雜交
點(diǎn)部位沒有顯色,并與膜芯片背景相同,則判讀為陰性雜交信號(hào)。
8.6.2膜芯片識(shí)讀儀判讀
膜芯片顯色后,使用芯片識(shí)讀儀進(jìn)行掃描分析。如果雜交點(diǎn)部位顯色,則判讀為陽(yáng)性雜交信號(hào)。如
果雜交點(diǎn)部位沒有顯色,并與膜芯片背景相同,則判讀為陰性雜交信號(hào)。
9生物安全措施
9.1實(shí)驗(yàn)室設(shè)備、設(shè)施要求及廢棄物處理應(yīng)符合GB19489的規(guī)定。
9.2生物芯片檢驗(yàn)工作應(yīng)由具備生物實(shí)驗(yàn)操作經(jīng)驗(yàn)人員承擔(dān)。
9.3檢測(cè)過程中防止交叉污染的措施應(yīng)按照GB/T27403的規(guī)定執(zhí)行。
10結(jié)果判斷
10.1實(shí)驗(yàn)質(zhì)量控制
10.1.1基本要求
實(shí)驗(yàn)中設(shè)置10.1.2~10.1.4中所述的質(zhì)控對(duì)照,膜芯片雜交檢測(cè)結(jié)果應(yīng)符合相應(yīng)要求。如出現(xiàn)非
10.1.2~10.1.4中所述雜交結(jié)果,則判斷實(shí)驗(yàn)不成功,需重做實(shí)驗(yàn)。
10.1.2空白對(duì)照
核酸提取空白對(duì)照和多重PCR擴(kuò)增試劑空白對(duì)照均應(yīng)符合膜芯片上內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性,
靶點(diǎn)基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性,陽(yáng)性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,陰性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性。
10.1.3不含動(dòng)物源成分標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照
不含動(dòng)物源成分標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照應(yīng)符合膜芯片上內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,所有靶點(diǎn)基因探針點(diǎn)雜
交信號(hào)陰性,陽(yáng)性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,陰性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性。
10.1.4含有動(dòng)物源成分標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照
含有動(dòng)物源成分標(biāo)準(zhǔn)品對(duì)照應(yīng)符合膜芯片上內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,相應(yīng)靶點(diǎn)基因探針點(diǎn)雜
交信號(hào)陽(yáng)性,陽(yáng)性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,陰性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性。
10
GB/TXXXXX—XXXX
10.2膜芯片結(jié)果判斷
10.2.1樣本檢測(cè)結(jié)果中陽(yáng)性對(duì)照探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性,可初步判讀膜芯片雜交過程不成功,應(yīng)確認(rèn)各雜
交試劑是否過期或保存條件不當(dāng),更換可疑試劑后重新試驗(yàn)。
10.2.2樣本檢測(cè)結(jié)果中內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性,表明未能從樣本中提取出適宜多重PCR擴(kuò)增的
核酸模板,需要重新進(jìn)行樣本核酸提取和多重PCR擴(kuò)增。
10.2.3樣本檢測(cè)結(jié)果中內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,靶點(diǎn)基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陰性,表明樣本核酸提
取、多重PCR擴(kuò)增和膜芯片雜交過程正常,判斷樣本中未檢出動(dòng)物源成分。
10.2.4樣本檢測(cè)結(jié)果中內(nèi)參基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)陽(yáng)性,靶點(diǎn)基因探針點(diǎn)雜交信號(hào)部分或全部陽(yáng)性,表明
樣本核酸提取、多重PCR擴(kuò)增和膜芯片雜交過程正常,判讀樣本中存在陽(yáng)性信號(hào)點(diǎn)對(duì)應(yīng)的動(dòng)物源成分。
11確證實(shí)驗(yàn)
動(dòng)物源成分膜芯片檢測(cè)陽(yáng)性樣本可進(jìn)一步進(jìn)行確證實(shí)驗(yàn),確證實(shí)驗(yàn)方法按照GB/T25165、SN/T3730
中規(guī)定的方法執(zhí)行。
12結(jié)果表述
12.1未檢出
未檢出本標(biāo)準(zhǔn)所包含的動(dòng)物源成分,陰性質(zhì)控探針雜交點(diǎn)、陽(yáng)性質(zhì)控探針雜交點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果正常。
12.2檢出
檢出××××動(dòng)物源成分,陰性質(zhì)控探針雜交點(diǎn)、陽(yáng)性質(zhì)控探針雜交點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果正常。
11
GB/TXXXXX—XXXX
附錄A
(規(guī)范性附錄)
膜芯片法試劑組分和存放條件
膜芯片法試劑組分和存放條件見表A.1。
表A.1膜芯片法試劑組分和存放條件
序號(hào)名稱存放條件
1多重PCR即用型預(yù)混液-20℃
2無核酸酶滅菌水-20℃
3多重PCR引物預(yù)混液-20℃
4陽(yáng)性寡核苷酸單鏈DNA(Positive-Oligo,10μmol/L)-20℃
5去活化液室溫
6去活化清洗液室溫
7雜交液室溫
8雜交清洗液室溫
9酶孵育液室溫
10堿性磷酸酶標(biāo)記的鏈霉親和素4℃
11孵育清洗液1室溫
12孵育清洗液2室溫
13BCIP/NBT顯色底物4℃
14膜芯片室溫
12
GB/TXXXXX—XXXX
附錄B
(資料性附錄)
膜芯片法檢測(cè)流程
B.1膜芯片法檢測(cè)按照?qǐng)DB1步驟進(jìn)行。
待測(cè)樣品
核酸提取
多重PCR擴(kuò)增
膜芯片雜交
芯片結(jié)果判讀
陰性陽(yáng)性
報(bào)告結(jié)果
圖B.1膜芯片法檢測(cè)流程
13
GB/TXXXXX—XXXX
附錄C
(資料性附錄)
膜芯片制作與質(zhì)量控制
C.1膜芯片制作
采用微定量噴點(diǎn)式膜芯片點(diǎn)樣儀,將各個(gè)核苷酸探針(探針終濃度25μmol/L)分布在尼龍膜芯片上
的特定位置區(qū)域。芯片表面包被的探針布局如表C.1。
內(nèi)參對(duì)照:18SrRNA,指膜芯片上用來質(zhì)控PCR擴(kuò)增過程是否正常的對(duì)照,內(nèi)參基因18SrRNA擴(kuò)
增片段互補(bǔ)的一段寡核苷酸作為探針。
陽(yáng)性對(duì)照:PC,監(jiān)測(cè)芯片雜交過程是否正常。
陰性對(duì)照:NC,指膜芯片上用來質(zhì)控探針雜交特異性的對(duì)照。一般使用一段與靶標(biāo)分子序列相近
或無關(guān)的寡核苷酸作為探針。
表C.1芯片探針布局
內(nèi)參豬黃牛羊
雞兔驢貂
狐鼠牦牛鴨
空白空白PCNC
C.2膜芯片質(zhì)量控制
膜芯片點(diǎn)樣后掃描無漏點(diǎn)、連點(diǎn),位點(diǎn)規(guī)則,大小均勻一致,點(diǎn)與點(diǎn)的距離為300μm~500μm;雜
交后陽(yáng)性質(zhì)控實(shí)驗(yàn)雜交信號(hào)清晰可見。
_________________________________
14
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1-2009給出的規(guī)則起草。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化研究院提出并歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)的附錄A為規(guī)范性附錄、附錄B和附錄C為資料性附錄。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草單位:中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化研究院、四川華漢三創(chuàng)生物科技公司、山東省食品藥品檢驗(yàn)研究
院、安徽省食品藥品檢驗(yàn)研究院、安徽出入境檢疫檢驗(yàn)局、濱州市食品藥品檢驗(yàn)檢測(cè)中心、成都市食品
藥品檢驗(yàn)研究院、江西省食品藥品檢驗(yàn)研究院、上海市獸藥飼料檢測(cè)所等。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:
GB/TXXXXX—XXXX
常見動(dòng)物源性成分快速測(cè)定膜芯片法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了豬、黃牛、羊、雞、鴨、兔、驢、貂、狐、鼠、牦牛等常見動(dòng)物源性成分膜芯片檢測(cè)
方法的原理、試樣制備與保存、試劑與儀器設(shè)備、實(shí)驗(yàn)方法和流程、生物安全措施、結(jié)果判讀、確證實(shí)
驗(yàn)、結(jié)果表述。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于肉制品及飼料中11種常見動(dòng)物源性成分的快速和定性檢測(cè)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
GB/T14699.1飼料采樣
GB/T19495.1轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)通用要求和定義
GB/T19495.2轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)要
GB/T19495.7轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè)抽樣和制樣方法
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
GB/T20195動(dòng)物飼料試樣的制備
GB/T25165明膠中牛、羊、豬源性成分的定性檢測(cè)方法實(shí)時(shí)熒光PCR法
GB/T2
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