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一.轉(zhuǎn)錄的基本特征真核生物:細(xì)胞核
rRNA——核仁中
mRNA、tRNA——核質(zhì)中原核生物:細(xì)胞質(zhì)的核質(zhì)區(qū)1.轉(zhuǎn)錄的部位一.轉(zhuǎn)錄的基本特征2.轉(zhuǎn)錄的反應(yīng)n1ATPn2GTPn3CTPn4UTPRNA聚合酶(DNA模板)RNA+(n1+n2+n3+n4)PPi一.轉(zhuǎn)錄的基本特征以DNA鏈作為模板RNA鏈的延長(zhǎng)方向也是5′→3′RNA鏈合成的起始不需要引物每次被轉(zhuǎn)錄的DNA只是一個(gè)區(qū)段,而且是其中的一條鏈3.轉(zhuǎn)錄的方式一.轉(zhuǎn)錄的基本特征3.轉(zhuǎn)錄的方式sensestrandantisensestrand一.轉(zhuǎn)錄的基本特征3.轉(zhuǎn)錄的方式注意:對(duì)于整個(gè)DNA雙鏈,每條鏈上有的區(qū)段用作有義鏈,有的區(qū)段用作反義鏈。二.原核生物參與轉(zhuǎn)錄的酶細(xì)菌中負(fù)責(zé)mRNA、rRNA和tRNA鏈的合成的酶只有一種:RNA聚合酶1.亞基組成a2bb’
s
=a2bb’
+s全酶核心酶s因子二.原核生物參與轉(zhuǎn)錄的酶+HoloEnzyme
bb’asasCoreEnzymebb’aa一.RNA聚合酶2.亞基組成3.各亞基的主要功能s因子全酶中的s因子能識(shí)別啟動(dòng)子a亞基參與酶的聚合、DNA的解鏈等bb'
亞基催化RNA的合成二.原核生物參與轉(zhuǎn)錄的酶三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程●
啟動(dòng)子(promoter):DNA上的特殊序列,是轉(zhuǎn)錄的起始信號(hào)●
終止子(terminator):DNA上特殊序列,是轉(zhuǎn)錄的終止信號(hào)●
轉(zhuǎn)錄單位(transcriptionalunit):從啟動(dòng)子到終止子的區(qū)段●
轉(zhuǎn)錄原點(diǎn)記為+1,其上游記為負(fù)值,下游記為正值+1-10
+10upstreamstartpointdownstream幾個(gè)概念1.轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄是由RNA聚合酶全酶結(jié)合于啟動(dòng)子而被啟動(dòng)的。啟動(dòng)子不被轉(zhuǎn)錄。s因子能識(shí)別啟動(dòng)子(位于有義鏈上)。三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程2.轉(zhuǎn)錄的起始由全酶在啟動(dòng)子附近將DNA局部解鏈。第一個(gè)NTP(常常是GTP或ATP)結(jié)合到全酶上,形成“啟動(dòng)子-全酶-NTP”三元復(fù)合物。第二個(gè)nt進(jìn)入,連結(jié)到第一個(gè)nt的3'-OH上,形成了第一個(gè)磷酸二酯鍵。s因子從全酶上掉下,又去結(jié)合其它的核心酶。三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程3.鏈的延伸當(dāng)s因子從核心酶上脫落后,核心酶與DNA鏈的結(jié)合變得疏松,可以在模板鏈上滑動(dòng),方向?yàn)镈NA模板鏈的3′→5′。三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程
DNA上的解螺旋區(qū)保持約17個(gè)堿基對(duì)的長(zhǎng)度。隨著核心酶的移動(dòng),雜交區(qū)也往前延伸,隨著DNA雙螺旋的回復(fù),RNA鏈逐漸被置換出來(lái)。三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程3.鏈的延伸RNA-DNA雜交區(qū)剛合成出來(lái)的RNA鏈與解開的DNA模板鏈之間可形成一小段RNA-DNA雜交區(qū)。核心酶能識(shí)別終止子,停止轉(zhuǎn)錄。
這一過(guò)程有時(shí)需要一種蛋白質(zhì)——r因子的幫助(當(dāng)終止信號(hào)較弱時(shí));有時(shí)不需要(當(dāng)終止信號(hào)較強(qiáng)時(shí))。核心酶釋放出RNA,自己也離開DNA。DNA上的解鏈區(qū)重新形成雙螺旋。三.轉(zhuǎn)錄的過(guò)程4.轉(zhuǎn)錄的終止四.真核生物的轉(zhuǎn)錄1.真核RNA聚合酶酶位置產(chǎn)物-amanitinRNAPolI核仁45SrRNA不敏感RNAPolII核質(zhì)mRNA前體敏感RNAPolIII核質(zhì)tRNA、5SRNA等介于I、II間四.真核生物的轉(zhuǎn)錄2.真核啟動(dòng)子TATA框-25bp處幫助識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)CAAT框-75bp處決定起始頻率四.真核生物的轉(zhuǎn)錄3.增強(qiáng)子位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游,又稱上游激活序列,它通過(guò)啟動(dòng)子來(lái)增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄效率。四.真核生物的轉(zhuǎn)錄4.轉(zhuǎn)錄因子真核生物的基因轉(zhuǎn)錄需要一系列轉(zhuǎn)錄因子的參與,即聚合酶必須在特定的轉(zhuǎn)錄因子參與下起始轉(zhuǎn)錄。五.真核轉(zhuǎn)錄后加工pre-RNAcappingtailingsplicingmethylationediting
matureRNA
五.真核轉(zhuǎn)錄后加工1.mRNA前體的加工5’pppXpY---------------------(30Nt)-3’(pre--RNA)
pippXpY-----
GTPSAMppXpYp-----------
GpppXpYp----------------RNAguanylyl
transferaseRNAG-7-methyltransferaseSAH
ppiGpm7Nt-phosphohydrolasecapping五.真核轉(zhuǎn)錄后加工1.mRNA前體的加工真核mRNA存在加尾信號(hào)AAUAA
tailing需要特異核酸內(nèi)切酶多聚A聚合酶
ATP等參與五.真核轉(zhuǎn)錄后加工1.mRNA前體的加工真核mRNA在非編碼區(qū)有一些甲基化核苷酸。甲基化RNA編輯核苷酸的插入、刪除或取代。去除內(nèi)含子序列五.真核轉(zhuǎn)錄后加工2.tRNA前體的加工從5′,3′端切除多余的核苷酸去除內(nèi)含子而進(jìn)行剪接3′端添加CCA(核苷酸殘基轉(zhuǎn)移酶)核苷酸的修飾五.轉(zhuǎn)錄后加工3.rRNA前體的加工多拷貝;每一個(gè)基因內(nèi)含有3-4段rRNA的編碼區(qū);間隔區(qū)有些無(wú)轉(zhuǎn)錄功能,有的編碼tRNA。rRNA基因的特點(diǎn)五.轉(zhuǎn)錄后加工3.rRNA前體的加工原核生物:30SrRNA核酸酶16St
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