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單基因遺傳病發病風險的估計

bayes公式的應用唐吟宇2/5/20231遺傳教研室一、概念前概率:根據親代的情況計算出來的概率條件概率:根據自己或子代情況計算出來的概率聯合概率:前概率與條件概率的乘積后概率:聯合概率的相對頻率2/5/20232遺傳教研室二、舉例說明Ex1:慢性進行性舞蹈病(AD)已知(條件):30歲以前發病的占1/3。一位女性,父親是患者,本人已到30歲尚未發病。問:該女性發病的風險還有多大?2/5/20233遺傳教研室解:30歲以前發病的占1/3可以從4個方面來理解1)30歲以前發病的可能性1/32)30歲以前不(沒有)發病的可能性2/33)30歲以后發病的可能性2/34)30歲以后不(沒有)發病的可能性1/3?ⅠⅡ

Aa(前提)2/5/20234遺傳教研室根據題目所給條件即:30歲尚未發病,與2)相符,所以2)即是本題的條件概率。Bayes方法首先要作“假設”,其依據是要回答的問題只有在哪種“情況”下才會發生,就假設這種“情況”,另一個是相反的假設,該女性表型正常,基因型為aa或Aa.2/5/20235遺傳教研室假設:是Aa不是Aa(是aa)前概率:1/21/2條件概率:2/31聯合概率:1/2*2/3=1/31/2*1=1/2后概率:

1/31/3+1/2

1/21/3+1/2=0.40=0.602/5/20236遺傳教研室所以Aa的概率為0.40,即發病的風險為40%原來的方法50%Bayes方法40%(降低)2/5/20237遺傳教研室Ex2.Hurler綜合癥(AR)12?21ⅠⅡⅢⅣ2/5/20238遺傳教研室已知(條件):Ⅳ1正常(若Ⅳ1是患兒,不必再算)問:Ⅳ2發病的風險(Ⅳ3

Ⅳ4……

)解:Ⅲ1與Ⅲ2表型正常,基因型組合三種可能性AA*AAAA*AaAa*Aa均不能生患兒,與問題不符2/5/20239遺傳教研室假設Ⅲ1和Ⅲ2同為AaⅢ1和Ⅲ2不同為Aa前概率(2/3*1/2*1/2)*(2/3*1/2*1/2)=1/36

1-1/36=35/36條件概率

3/4

1聯合概率

1/36*3/4

35/36*1后概率

3/143

140/1432/5/202310遺傳教研室Ⅳ2是患兒的風險:3/143*1/4=3/572原來的方法1/6*1/6*1/4=1/144(0.69%)Bayes方法3/572=0.52%(降低)2/5/202311遺傳教研室Ex3.自毀容貌綜合癥(XR)214XAXaⅠⅢⅡⅣ2/5/202312遺傳教研室已知(條件):Ⅲ24個弟弟均正常問:Ⅳ1發病的風險關鍵是求Ⅲ2是XAXa的概率,這取決于Ⅱ4

是XAXa的概率。且若對Ⅲ2作假設,則其4個弟弟均正常的條件就無法用。因此只能對Ⅱ4作假設(才能用條件)2/5/202313遺傳教研室假設:Ⅱ4是XAXaⅡ4不是XAXa前概率:

1/21/2條件概率:

1/2*1/2*1/2*1/2=1/161聯合概率:1/2*1/16=1/321/2*1=1/2后概率:

1/17

16/172/5/202314遺傳教研室Ⅲ2是概率:1/17*1/2=1/34Ⅳ1

(兒子)是患兒的概率:1/34*1/2=1/68原來的方法1/2*1/2

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