NCBI數據庫2021/8/231精品PPT模板NCBI分子生物學數據庫

/美國國立醫學圖書館(NLM)于1988年11月4日建立國家生物技術信息中心(NationalCenterofBiotechnologyInformation，簡稱NCBI)2021/8/232精品PPT模板NationalCenterofBiotechnologyInformationNCBI的任務：建立關于分子生物學，生物化學，和遺傳學知識的存儲和分析的自動系統實行關于用于分析生物學重要分子和復合物的結構和功能的基于計算機的信息處理的先進方法的研究加速生物技術研究者和醫藥治療人員對數據庫和軟件的使用全世界范圍內的生物技術信息收集的合作努力2021/8/233精品PPT模板NCBI首先創建GenBank數據庫，在重點開發GenBank的同時，又于1991年開發了Entrez數據庫檢索系統。該系統整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等數據庫的序列信息以及MEDLINE有關序列的文獻信息，并通過相關鏈接，將他們有機地結合在一起。NationalCenterofBiotechnologyInformation2021/8/234精品PPT模板2021/8/235精品PPT模板以IL6基因為例：如何查找基因序列、mRNA、Promoter如何查找連續的mRNA、cDNA、蛋白序列2021/8/236精品PPT模板Mapviewer是NCBI網站上提供的一個非常有用的尋找基因的工具，通過Mapviewer你可以了解你感興趣基因在基因組中所處的位置、基因序列、內含子及外顯子的排列、基因的細胞遺傳學圖、EST、SNP等等許多有用的信息。利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter2021/8/237精品PPT模板利用Mapviewer查找基因序列、mRNA序列、啟動子Promoter2021/8/238精品PPT模板2021/8/239精品PPT模板2021/8/2310精品PPT模板2021/8/2311精品PPT模板2021/8/2312精品PPT模板2021/8/2313精品PPT模板2021/8/2314精品PPT模板如何查找連續的mRNA、cDNA、蛋白序列2021/8/2315精品PPT模板2021/8/2316精品PPT模板蛋白序列：mRNA序列：2021/8/2317精品PPT模板已知一基因序列：CCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCACCCCGGAGCGGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCCACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCTGGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATAGAGGAACATAAAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAAGAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAACAAAATTGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTGAGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATGGATTGAGGCCTCTGGC1、這是哪個基因？2、編碼的蛋白質序列是怎么樣的?3、有沒有保守的功能結構域？4、它的功能是怎樣的？5、有沒有三級結構？2021/8/2318精品PPT模板2021/8/2319精品PPT模板BLAST可以對核酸和蛋白的多種數據庫操作。有幾種比較方法可選擇：Blastp：一個氨基酸序列與一個蛋白數據庫比較Blastn：一個核酸序列與一個核酸數據庫比較。Blastx：一個核酸的所有讀框與一個蛋白數據庫比較，可以用來發現未知核酸可能的蛋白產物。Tblastn：一個蛋白序列與翻譯成所有讀框的核酸數據庫比較。Tblastx：一個核酸的六種讀框與一個核酸據庫的六種讀框比較，但由于計算太復雜在網頁中不能應用。2021/8/2320精品PPT模板2021/8/2321精品PPT模板2021/8/2322精品PPT模板2021/8/2323精品PPT模板2021/8/2324精品PPT模板Geneinfo：17號染色體2021/8/2325精品PPT模板功能注釋：GeneOntology該基因定位于人體第17條染色體，基因表示符為：NM-001168.2初步的功能分析：細胞周期，caspase酶的抑制因子等2021/8/2326精品PPT模板獲取蛋白質的序列信息該蛋白質中包含142個氨基酸，序列標識符為：NP-001159.22021/8/2327精品PPT模板獲取FASTA序列2021/8/2328精品PPT模板Finddomain2021/8/2329精品PPT模板填入蛋白質的FASTA序列并提交2021/8/2330精品PPT模板BIRdomain具有保守的功能結構域BIR2021/8/2331精品PPT模板2021/8/2332精品PPT模板2021/8/2333精品PPT模板2021/8/2334精品PPT模板三級結構顯示2021/8/2335精品PPT模板Thanks2021/8/2336精品PPT模板9、人的價值，在招收誘惑的一瞬間被決定。03-2月-2303-2月-23Friday,February3,202310、低頭要有勇氣，抬頭要有低氣。***2/3/20234:38:35PM11、人總是珍惜為得到。03-2月-23**Feb-2303-Feb-2312、人亂于心，不寬余請。***Friday,February3,202313、生氣是拿別人做錯的事來懲罰自己。03-2月-2303-2月-23**03February202314、抱最大的希望，作最大的努力。03二月2023**03-2月-2315、一個人炫耀什么，說明他內心缺少什么。。二月23*03-2月-23*03February202316、業余生活要有意義，不要越軌。**2/3/202317、一個人即使已登上頂峰，也仍要自強不息。***03-2月-23謝謝大家2021/8/2337精品PPT模板9、人的價值，在招收誘惑的一瞬間被決定。03-2月-2303-2月-23Friday,February3,202310、低頭要有勇氣，抬頭要有低氣。***2/3/20234:38:35PM11、人總是珍惜為得到。03-2月-23**Feb-2303-Feb-2312、人亂于心，不寬余請。***Friday,February3,202313、生氣是拿別人做錯的事來懲罰自己。03-2月-2303-2月-23**03February202314、抱最大的希望