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文檔簡介
1、生物化學名詞解釋.氨基酸(am i no acid ): 是含有一個堿性氨基(-N H 2 ) 和一個酸性竣基(-COOH) 的有機化合物,氨基一般連在a -碳上。氨基酸是蛋白質的構件分子.必需氨基酸(essential am i no acid): 指人(或其它脊椎動物)(賴氨酸, 蘇氨酸 等)自己不能合成,需要從食物中獲得的氨基酸。.非必需氨基酸(n onessential am i no aci d ):指人(或其它脊椎動物)自己能由簡 單的前體合成,不需要從食物中獲得的氨基酸。.等電點(pI,isoel ectric poi nt):使氨基酸處于兼性離子狀態,在電場中不遷移(分子的靜電
2、荷為零)的pH值。.苗三酮反應(ninhydrin reacti on ):在加熱條件下,氨基酸或肽與苛三酮反應生成紫色(與脯氨酸及羥脯氨酸反應生成黃色)化合物的反應。.層析(ch rom at og raphy ):按照在移動相和固定相(可以是氣體或液體)之間的分配比例將混合成分分開的技術。.離子交換層析(ion-exc hange colum n ): 一種用離子交換樹脂作支持劑的層析技術。.透析(dialysis ):利用蛋白質分子不能通過半透膜的性質,使蛋白質和其他小分子物質如無機鹽、單糖等分開的一種分離純化技術。.凝膠過濾層析(gel filtration ch rom at og
3、raphy, GPC):也叫做分子排阻層析 /凝膠滲透層析。一種利用帶孔凝膠珠作基質,按照分子大小分離蛋白質或其它分子混合物的層析技術。.親合層析(affinity chrom atog raph ):利用共價連接有特異配體的層析介質,分離蛋白質混合物中能特異結合配體的目的蛋白質或其它分子的層析技術。.高壓液相層析(HPLC :使用顆粒極細的介質,在高壓下分離蛋白質或其他分子混合物的層析技術。.凝膠電泳(gel elect roph oresis ):以凝膠為介質,在電場作用下分離蛋白質或核酸的分離純化技術。.SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳 (SDS:在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰氨 凝膠
4、電泳。SDS只是按照分子的大小,而不是根據分子所帶的電荷大小分離的。14.等電聚焦電泳(IEF):利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質)在聚丙烯酰氨凝膠制造 一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質遷移到它的等電點( pI)處,即梯度為某一 pH時, 就不再帶有凈的正或負電荷了。1 5.雙向電泳(tw o-dim ension al electroph orese ):等電聚焦電泳和 SDS的組 合,即先進行等電聚焦電泳(按照pI )分離,然后再進行SDS按照分子大小分離)。 經染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質圖。1 6.Edm an降解(Edm an deg radation ):從多肽鏈游離的 N末
5、端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氟酸酯(PITC)修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環。1 7.同源蛋白質(hom olog ous protein ):在不同 生物體內行使相同或相似功能的蛋白質,例如血紅蛋白。1 8.構型(configu ration):有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。 這種排列不經過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構型的改變往往使分子的光學活性發生變化。1 9.構象(conform ation):由于單鍵旋轉引起的組成原子的不同排列。一種構象改變為另一種構象時,不要求共價
6、鍵的斷裂和重新形成。構象改變不會改變分子的光學活性。.蛋白質一級結構(prim ary structure ):指多肽鏈的氨基酸序列。.蛋白質二級結構:蛋白質主鏈的折疊產生由氫鍵維系的有規則的構象。常見的二級結構有a -螺旋、3 -折疊片、3 -轉角和無規卷曲。.蛋白質三級結構(prot ein tertiary structure ):多肽鏈借助各種非共價鍵彎曲、折疊成具特定走向的緊密球狀構象。它包括一級結構中相距較遠的肽段之間的幾何相互關系和側鏈在三維空間中彼此間的相互關系。三級結構主要是靠氨基酸側鏈之間的疏水相互作用、氫鍵、范德華力和鹽鍵(離子鍵)維持的。.蛋白質四級結構(prot ei
7、n quatern ary structure ):寡聚蛋白質所有,eg:血紅蛋白,寡聚蛋白質中各亞基之間在空間上的相互關系和結合方式。. a -螺旋(a -h eliv ):蛋白質中常見的一種二級結構,肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤 繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結構,螺旋是靠鏈內氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的玻基氧與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第n+4個)的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手a -螺旋結構中,螺距為 0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的 長軸上升0.15nm。.超二級結構(super-sec ondary structure ):在蛋白質中, 特別是球蛋
8、白中, 經常 可以看到由若干相鄰的二級結構單元組合在一起,彼此相互作用, 形成有規則的, 種類不多的二級結構組合或二級結構串,在各種蛋白質中充當三級結構的構件。分為a a ,3 a 3,33 三種.結構域(domain ):多肽鏈在二級結構或超二級結構的基礎上形成三級結構的局部折疊 區,它是相對獨立的緊密球狀實體。.疏水相互作用(hydroph obi c interaction ):水介質中球狀蛋白質的折疊總是傾向于把疏水殘基埋藏在分子的內部的現象。.蛋白質變性(denatu ration ):天然蛋白質受到某些物理因素如加熱、紫外線照射、高溫和表面張力等或化學因素如有機溶劑、月尿、月以 酸
9、、堿等的影響時,生物活性喪失,溶解度降低,不對稱程度增高以及其他的物理化學常數發生改變,這種過程稱蛋白質變性。其實質是次級鍵被破壞,但一級結構仍完好。.蛋白質的三維結構:蛋白質分子所有原子和基團在三維空間結構的構象及走向。.肌紅蛋白(m yoglobi n ):是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結合蛋白,是肌肉內儲存氧的蛋白質,它的氧飽和曲線為雙曲線型。31復性(renat uration ):當變性因素除去后,變性的生物大分子恢復成具有 生物活性的天然構象的現象。.波爾效應(B ohr effect ):增加CO2濃度和降低pH都能提高血紅蛋白亞基的協同 效應,引起紅細胞內血紅蛋白氧親和力下
10、降,促進血紅蛋白釋放氧,反之,增加氧氣的濃度,使血紅蛋白釋放H+及CO2,這種現象稱波爾效應。.血紅蛋白(hemogl obin ):是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的結合蛋白。血紅蛋白負責將氧由肺運輸到外周組織,它的氧飽和曲線為 S型。.別構效應(allosteric effect ):又稱為變構效應,寡聚蛋白質一般具多個結合部位,結合在蛋白質分子的特定部位上的配體對該分子的其他部位所產生的影響。.酶(enzym e):由活細胞產生的在細胞內、外一定條件下,都能起催化作用,具有極高的催化效率的高度專一性的生物大分子。它使錯綜復雜的生化反應變得順利和迅速。.全酶(holoenzym e ):脫
11、輔酶與輔因子結合后形成的復合物。.活性部位(中心)(active energy ):酶中含有底物結合部位和參與催化底物轉化為產 物的氨基酸殘基部分。活性部位通常位于蛋白質的結構域或亞基之間的裂隙或是蛋白質表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很近的一些氨基酸殘基組成。.酸-堿催化(acid-base cat alysis ):質子轉移加速反應的催化作用。.共價催化(c ovalent catalysis ): 一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然后被轉移給第二個底物。許多酶催化的基團轉移反應都是通過共價方式進行的。.靠近效應(proxim i ty effect ):非酶促催化反應
12、或酶促反應速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應劑有效濃度增大的結果,這將導致更頻繁地形成過度O41寡聚蛋白質:兩條或兩條以上的具三級結構的多肽鏈組成的蛋白質。.米氏方程(Michaelis-Ment ent equation ):表示一個酶促反應的起始速度(u )與 底物濃度(s)關系的速度方程:u = u m axs/(Km +s).米氏常數(Mich aelis constant ):對于一個給定的反應,酶促反應的起始速度 (u 0)達到最大反應速度(u m ax ) 一半時的底物濃度。.有氧氧化:葡萄糖在有氧條件下徹底氧化成H 2O和CO2并放出大量能量的過程。.雙倒數彳
13、圖(double-reciprocal plot ):又稱為 Li new eaver_Burk 作圖。 一個酶 促反應的速度的倒數(1/V)對底物濃度的倒數(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距 分別代表米氏常數和最大反應速度的倒數。.競爭性抑制作用(com petitive inhibition ):通過增加底物濃度可以逆轉的一種酶促反應抑制類型。競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質的結合部位。這種抑制使K m增大而u m ax不變。.非競爭性抑制作用(non com petitive inhibition ):抑制劑不僅與游離酶結合,也可以與酶-底物復合物結合的一種酶促反應
14、抑制作用。這種抑制使Km不變而u m ax變小。.反競爭性抑制作用(un com petitive in hibition ):抑制劑只與酶-底物復合物結合 而不與游離的酶結合的一種酶促反應抑制作用。這種抑制使Km和u m ax都變小但u max/K m不變。.酶原(zym og en):通過有限蛋白水解,能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。50.調節酶(reg ulatory enzym e ):位于一個或多個代謝途徑內的一個關鍵部位的酶,它的 活性根據代謝的需要而增加或降低。51別構酶(allosteric enzym e ):活性受結合在活性部位以外的部位的其它分子調節的 酶。.抗體酶
15、(abzym e):又稱催化性抗體,為在易變區被賦予了酶屬性的免疫球蛋白。.同工酶(isoen zym e isozym e ):催化相同的化學反應但其在蛋白質分子結構、理化性質和免疫性能等方面都存在著明顯差異的一組酶。.別構調節酶/劑(allosteric m odulat or):稱為別構效應物。結合在別構酶的調節部 位,調節酶催化活性的 生物分子。別構調節物可以是是激活劑,也可以是抑制劑。55.維生素(vitam in ):維持細胞正常功能所必需的需要量很小、機體不能合成或合成量 很小,需由食物中供給的一類小分子有機化合物。56水溶性維生素(w at er-soluble vitam i
16、 n ) 一類能溶于水的有機營養分子。其中包 括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸(維生素C)及硫辛酸。57脂溶性維生素(lipid vitam in ):由長的碳氫鏈或稠環組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括 A, D, E,和K,這類維生素能被動物貯存。58輔酶(conzym e):某些酶在發揮催化作用時所需的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔酶與酶結合松散,可以通過透析除去。59輔基(prosth etic g roup ):是與酶蛋白質共價結合的金屬離子或一類有機化合物, 用透析法不能除去。輔基在整個酶促反應過程中始終與酶的特定部位結合。.尼克酰胺腺喋吟二核甘酸(
17、NAD+和尼克酰胺腺喋吟二核甘酸磷酸( NADP+ :含有尼 克酰胺的輔酶,在某些氧化還原中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔酶。.黃素單核甘酸(FMN 一種核黃素磷酸,是某些氧化還原反應的輔酶。.硫胺素焦磷酸(t hiam i n e phosphate ): 是維生素B 1的輔酶形式,參與轉醛基反應。.黃素腺喋吟二核甘酸(FAD:是某些氧化還原反應的輔酶,含有核黃素。.磷酸口比哆醛(pyidoxal ph osphat e ): 是維生素B 6 (口比哆醇) 的衍生物,是轉氨 酶,脫竣酶和消旋酶的酶。.生物素(biotin ):參與脫竣反應的一種酶的輔助因子。.輔酶A(coen
18、zym e A): 一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應中作為酰基的載體。.轉氨酶(t ransam i nase):稱為氨基轉移酶,在該酶的催化下,一個a -氨基酸的氨基可轉移給別一個a-酮酸。.糖類:多羥醛或多羥酮及其縮聚物和某些衍生物的總稱。.變旋(m utarotation ):一種具旋光性的物質的溶液,經放置,其旋光率發生改變的現象。.糖昔(dlyc oside ):單糖半縮醛羥基與另一個分子的羥基,胺基或疏基縮合形成的含糖衍生物。71肽聚糖(peptidog lycan ) : N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰胞壁酸交替連接的雜多糖與不 同的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細菌細胞壁的
19、主要成分。.糖蛋白(glycoprotein ):含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質。.糖胺聚糖:由含己糖醛酸和己糖胺成分的重復二糖單位構成。.蛋白聚糖(proteoglycan ): 一類特殊的糖蛋白,由一條或多條糖胺聚糖和一個核心蛋白共價連接而成。.三脂酰甘油(triacylglyc erol ):稱為甘油三酯。一種含有與甘油酯化的三個脂酰基的酯。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。.生物膜(bioligic al m em brane ):鑲嵌有蛋白質的脂雙層,起著劃分和分隔細胞和細胞器作用,生物膜也是與許多能量轉化和細胞內通訊有關的重要部位。.內在膜蛋白(integ ral m em bran
20、 e prot ein ):插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。.外周膜蛋白(periph eral m em brane protei n ):通過與膜脂的極性頭部或內在的膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內或外表面弱結合的膜蛋白。.流動鑲嵌模型(fluid m osaic m odel ):針對生物膜的結構提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質的流體脂雙層,脂雙層在結構和功能上都表現出不對稱性。有的蛋白質“鑲“在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內部,有的則橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白可以進行橫向擴散。.通透系數(perm eability coefficient
21、 ):是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。通透系數大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。.通道蛋白(ch an nel prot ein ):是帶有中央水相通道的內在膜蛋白,它可以使大小適合的離子或分子從膜的任一方向穿過膜。.(膜) 孔蛋白(pore protein ):其含意與膜通道蛋白類似,只是該術語常用于細菌。.被動轉運(passive transport ):稱為易化擴散。是一種轉運方式,通過該方式溶質特異的結合于一個轉運蛋白上,然后被轉運過膜,但轉運是沿著濃度梯度下降方向進行的,所以被動轉達不需要能量的支持。.主動轉運(active transport ): 一種
22、轉運方式,通過該方式溶質特異的結合于一個 轉運蛋白上然后被轉運過膜,與被動轉運運輸方式相反,主動轉運是逆著濃度梯度下降方向進行的,所以主動轉運需要能量的驅動。在原發主動轉運過程中能源可以是光,ATP或電子傳遞;而第二級主動轉運是在離子濃度梯度下進行的。.協同運輸(c ont ransport ): 兩種不同溶質的跨膜的耦聯轉運。可以通過一個轉運蛋白進行同一方向(同向轉運)或反方向(反向轉運)轉運。.胞吞(信用)(en docytosis ):物質被質膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物質在 囊泡內)被帶入到細胞內的過程。.核昔(n ucl eoside ):是喋吟或喀咤堿通過共價鍵與戊糖連接組成
23、的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與喀咤的N-1或喋吟的N-9之間形成的3 -N-糖鍵連接。.核甘酸(un cleoside ):核昔的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。89.cAMP(cycleAMP): 3 ,5 -環腺甘酸,是細胞內的第二信使,由于某部些激素或其它分子信號刺激激活腺甘酸環化酶催化ATP環化形成的。.磷酸二酯鍵(ph osph odiest er linkage ): 一種化學基團,指一分子磷酸與兩個醇(羥基) 酯化形成的兩個酯鍵。該酯鍵成了兩個醇之間的橋梁。例如一個核昔的3 /羥基與另一個核昔的 5,羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個磷酸二酯鍵。.脫氧核糖核酸(
24、DNA :含有特殊脫氧核糖核甘酸序列的聚脫氧核甘酸,脫氧核甘酸之間是是通過3 ,5 -磷酸二酯鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。.核糖核酸(RNA :通過3 ,5 -磷酸二酯鍵連接形成的特殊核糖核甘酸序列的聚核 糖核甘酸。.核糖體核糖核酸(rRNA,ribonu cleic aci d ): 作為組成成分的一類 RNA, rRNA是 細胞內最豐富的 RNA .信使核糖核酸(m RNA,messen ger ribonu cleic acid): 一類用作蛋白質合成模板的 RNA 95.轉移核糖核酸(tRNA,transfer ribonu clei c acid ): 一類攜帶激活氨基酸,將它
25、帶到蛋白質合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上RNA。tRNA含有能識別模板mRNA上互補密碼的反密碼。.轉化(作用)(transform ation ): 一個外源DNA通過某種途徑導入一個宿主菌,引起該菌的遺傳特性改變的作用。.轉導(作用)(transducti on ):借助于病毒載體,遺傳信息從一個細胞轉移到另一個細胞。.堿基對(base pair ):通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核甘酸,例如A與T或U ,以及G與C配對。.DNA的雙螺旋(DNAdou ble helix ):兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個右 手的雙螺旋結構。堿基位于雙螺旋內側,磷酸與糖基在外側,通
26、過磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架。雙螺旋的直徑為2n m ,堿基堆積距離是 0.34nm ,兩核甘酸之間的夾角是 36。,每對螺旋由10對堿基組成,堿基按A=T, G-C配對互補,彼此以氫鍵相聯系。 維持DNA 雙螺旋結構的穩定的力主要是堿基堆積力。.熔解溫度(m elting tem peratu re,Tm ): 在DNA熱變性中,紫外吸收增加的中點值所對應的溫度。或稱熱解鏈溫度。.增色效應hyperch rom i c effect:當DNA變性后,對260n m 處紫外光光吸收度增加的現象。.減色效應(hypoc hrom i c effect ):隨著核酸復性,紫外吸收降低的現象。.
27、核酸內切酶(exonu clease ):核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內 磷酸二酯鍵的酶。.核酸外切酶(exonu clease ):從核酸鏈的一端逐個水解核甘酸的酶。.限制性內切酶 r restriction endon uclease ): 一種在特殊核甘酸序列處水解雙鏈 DNA 的內切酶。 I型限制性內切酶既能催化宿主 DNA的甲基化, 又催化非甲基化的 DNA的 水解;而H型限制性內切酶只催化非甲基化的 DNA的水解。.重組 DNA技術 (rec om bination DNA technology ): 也稱之為基因工程 (genom i c en gin eerin
28、 g ).利用限制性內切酶和載體,按照預先設計的要求, 將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉入另一 生物細胞中進行復制、轉錄和表達的技術。.基因(gen e):泛指被轉錄的一個 DNA片段。 在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或DNA分子的DNA片段。.新陳代謝:生物體與外界環境不斷進行的物質和能量交換過程。.巴斯德效應(Pasteur effect ): 氧存在下,酵解速度放慢的現象。.糖醛酸途徑(gluc uronate pat hw ay ):從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1 -磷酸開始,經UDP葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸的
29、動物體內,才可以通過該途徑合成維生素Co.呼吸電子傳遞鏈/(氧化) 呼吸鏈: 需氧細胞內代謝物被脫氫酶脫氫,經一系列電子傳遞體(遞氫體+遞電子體)傳遞作用,最終將質子和電子傳遞給被激活的氧原子,從而生成H 2O,并放出能量的全過程.酮體(acet on e body):在肝臟中由乙酰 CoA合成的燃料分子(3 -羥基丁酸,乙酰乙酸和丙酮)。在饑餓期間酮體是包括腦在內的許多組織的燃料,酮體過多會導致中毒。.生物固氮作用(bi ologic al nitrogen fi xatio ):大氣中的氮被原還為氨的過程。物固氮只發生在少數的細菌和藻類中。.尿素循環(u rea cycle ):是一個由4
30、步酶促反應組成的,可以將來自氨和天冬氨酸的氮轉化為尿素的循環。此循環是發生在脊椎動物的肝臟中的一個代謝循環。.脫氨(deam i nation ):在酶的催化下從 生物分子(氨基酸或核甘酸)中除去氨基 的過程。.氧化脫氨(oxidative deam i nation ) : a -氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應的 a -酮酸的過程。 氧化脫氨實際上包括氧化和脫氨兩個步驟。(脫氨和水解).轉氨(transam i nation ): 一個a -氨基酸的a -氨基借助轉氨酶的催化作用轉移 到一個a -酮酸的過程。.生糖氨基酸(gluc on genic am i n o acid):降解可生成能
31、作為糖異生前體的分子,例如丙酮酸或檸檬酸循環中間代謝物的氨基酸。.生酮氨基酸(acet one genic ami no acid):降解可生成乙酰 CoA或酮體的氨基酸。.核甘酸磷酸化酶(n ucl oside ph osph oryalse ): 能分解核昔生成含氮堿基和戊糖 的磷酸酯的酶。.核昔水解酶(nu closide hydrolase ):能分解核昔生成含氮堿基和戊糖的酶。.從頭合成(de novo synt hesis ):生物體內用簡單的前體物質合成生物分子的途徑,例如核甘酸的從頭合成。.激素(h orm on e): 一類由內分泌器官合成的微量的化學物質,它由血液運輸到靶組
32、織起著信使的作用,調節靶組織(或器官)的功能。.激素受體(h orm on e rec ept or ):位于細胞表面或細胞內,結合特異激素并引發細胞響應的蛋白質。.第二信使(sec on d m essen ger ):響應外部信號(第一信使),例如激素,而在細胞內合成的效應分子, 例如cAMP,肌醇三磷酸或二酰基甘油等。第二信使再去調節 靶酶,引起細胞內各種效應。.級聯放大(cascade amplification ):在體內的不同部位,通過一系列酶的酶促反應來傳遞一個信息,并且初始信息在傳遞到系列反應的最后時,信號得到放大,這樣的 一個系列叫作級聯系統。. G蛋白(Gprotein )
33、:地細胞內信號傳導途徑中起著重要作用的GTP結合蛋白,由“ ,3 , 丫三個不同亞基組成。激素與激素受體結合誘導GTP跟G蛋白結合的GDP進行交換結果激活位于信號傳導途徑中下游的腺甘酸環化酶。G蛋白將細胞外的第一信使腎上腺素等激素和細胞內的腺甘酸環化酶催化的腺甘酸環化生成的第二信使cAMP聯系起來。G蛋白具有內源GTP酶活性。.半保留復制(sem i conservative replication ) : DNA復制的一種方式。 每條鏈都可用作合成互補鏈的模板,合成出兩分子的雙鏈 DNA,每個分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。. DNA聚合酶(DNApolym erase):以DNA
34、為模板,催化核甘酸殘基加到已存在的聚核甘酸3 ,末端反應的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用來校正新合成的核甘酸的序列。.前導鏈(leadin g stran d ):與復制叉移動的方向一致,通過連續的5 x -3 x聚合合成的新的DNA鏈。.滯后鏈(l aggin g stran d ):與復制叉移動的方向相反,通過不連續的5 -3,聚合合成的新的 DNA鏈。.復制體(replisom e): 一種多蛋白復合體, 包含DNA聚合酶, 引發酶, 解旋酶, 單鏈結合蛋白和其它輔助因子。 復制體位于每個復制叉處進行細菌染色體 DNA復制的聚合 反應。.單鏈結合蛋白(SSB : 一種與單
35、鏈DNA結合緊密的蛋白,它的結構可以防止復制叉處單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區。.逆轉錄酶(reverse transcript ase ): 一種催化以 RNA為模板合成 DNA的DNA聚 合酶, 具有RNA指導的DNA合成, 水解RNA和DNA指導的DNA合成的酶活性。.互補NDA (cDNA : 通過逆轉錄酶由 m RNA模板合成的雙鏈 DNA。.聚合酶鏈式反應(PCR :擴增樣品中的 DNA量和富集眾多 DNA分子中的一個特定的 DNA序列的一種技術。在該反應中,使用與目的DNA序列互補的寡核甘酸作為引物,進行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性,引物退火和在 Tap DNA聚合酶催化
36、下的 DNA合 成。.遺傳學中心法則(g en etic central dogm a ): 描述從一個基因到相應蛋白質的信 息流的途徑。遺傳信息貯存在 DNA中,DNA被復制傳給子代細胞,信息被拷貝或由DNA轉錄成RNA,然后RNA翻譯成多肽。 不過,由于逆轉錄酶的反應,也可以以RNA為模板合成DNA=.轉錄(transcription ): 在由RNA聚合酶和輔助因子組成的轉錄復合物的催化下, 從雙鏈DNA分子中拷貝生物信息生成一條 RNA鏈的過程。.模板鏈(t em plate strand ): 可作為模板轉錄為 RNA的那條鏈該鏈與轉錄的 RNA 堿基互補(A-U, G-C)。在轉錄
37、過程中,RNA聚合酶與模板鏈結合,并沿著模板鏈的3一5方向移動, 按照5 一3方向催化RNA的合成。.編碼鏈(coding strand ): 雙鏈DNA中, 不能進行轉錄的那一條DNA鏈, 該鏈的核昔酸序列與轉錄生成的RNA的序列一致(在 RNA中是以U取代了 DNA中的T)。.核心酶(c ore enzym e): 大腸桿菌的 RNA聚合酶全酶由5個亞基組成(a 2 3, 3 8 ),沒有8基的酶叫核心酶。 核心酶只能使已開始合成的 RNA鏈延長, 但不具有 起始合成RNA的能力,必須加入8 基才表現出全部聚合酶的活性。. RNA聚合酶(RNA polym erase ):以一條DNA鏈或
38、RNA為模板催化由核昔-5-三 磷酸合成RNA的酶。.啟動子(prom ot er ):在DNA分子中,RNA聚合酶能夠結合并導致轉錄起始的序 列。.內含子(intron ):在轉錄后的加工中,從最初的轉錄產物除去的內部的核甘酸序列。 術語內含子也指編碼相應RNA外顯子的DNA中的區域。.外顯子(exon):既存在于最初的轉錄產物中,也存在于成熟的 RNA分子中的核昔酸序列。術語外顯子也指編碼相應RNA內含子的DNA中的區域。.終止因子(term i nation factor ): 協助RNA聚合酶識別終止信號的的輔助因子 (蛋白質)。.核酶(ribozym e ): 具有催化功能的 RNA
39、分子。.翻譯(translation ):在蛋白質合成期間,將存在于m RNA上代表一個多肽的核甘酸殘基序列轉換為多肽鏈氨基酸殘基序列的過程。.遺傳密碼(gen etic c ode ):核酸中的核甘酸殘基序列與蛋白質中的氨基酸殘基序 列之間的對應關系。;連續的3個核甘酸殘基序列為一個密碼子,特指一個氨基酸。標準的遺傳密碼是由 64個密碼子組成的,幾乎為所有 生物通用。.起始密碼子(iniation c odon ):指定蛋白質合成起始位點的密碼子。最常見的起始密碼子是蛋氨酸密碼:AU Go.終止密碼子(term i nation codon): 任 何tRNA分子都不能正常識別的,但可被特殊
40、的蛋白結合并引起新合成的肽鏈從翻譯機器上釋放的密碼子。存在三個終止密碼子:UAG ,UAA 和 UGA=.密碼子(c on don) : m RNA (或DNA) 上的三聯體核甘酸殘基序列,該序列編碼著一個指定的氨基酸 ,tRNA的反密碼子與m RNA的密碼子互補。.反密碼子(antic odon ) : tRNA分子的反密碼子環上的三聯體核甘酸殘基序列。在翻譯期間,反密碼子與 m RNA中的互補密碼子結合。.簡并密碼子(de generate c odon): 也稱為同義密碼子。是指編碼相同的氨基酸的幾個不同的密碼子。. SD序列(Shine-Dalg arno sequ en ce) :
41、m RNA中用于結合原核 生物核糖體的序列。.信號月太(sign al pepti de):常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質跨膜轉移(定位)的N-末端氨基酸序列(有時不一定在N端)。.轉錄因子(transcription fact or ): 在轉錄起始復合物的組裝過程中,與起動子區結合并與RNA聚合酶相互作用的一種蛋白質。某些轉錄因子在RNA延伸時一直維持著結合狀態。.操縱子(operon ):是由一個或多個相關基因以及調控他們轉錄的操縱因子啟動子序 列組成的基因表達單位。.操縱因子 (operat or ):與特定阻遏蛋白相互作用調控一個基因或一組基因表達的 DNAJXo.結構基因(str
42、uctu ral g en e ): 編碼一個蛋白質或一個 RNA的基因。165一阻遏物(repressor ):與一個基因的調控序列或操縱基因結合以阻止該基因轉錄的 一類蛋白質。.脂肪動員:貯存在脂肪細胞中的甘油三酯中激素敏感脂肪酶(HSD 的催化下水解并釋放出脂肪酸,供給全身各組織細胞攝取利用的過程。. a -氧化: 脂肪酸在微粒體中由單加氧酶和脫竣酶催化生成a-羥脂肪酸或少一個碳原子的脂肪酸的過程。.三竣酸循環(TCA。:在線粒體中, 乙酰CoA首先與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,然后經一系列代謝反應, 乙酰基被氧化分解, 而草酰乙酸再生的循環反應過程,或稱檸檬酸循環/Krebs循環。. DN
43、A探針: 被32P、35S或生物素標記單鏈末端或全鏈的一小段多聚核甘酸。.分子雜交: 利用核酸變性、 復性的性質, 根據堿基互補配對原則, 將兩條不同來源 的核甘酸鏈在試管中經變性后慢慢冷卻讓其復性,若這些異源DNA之間在某些區域有相同的序列, 則可形成雜合雙鏈分子,發生于DNA與DNA或DNA與RNA間。.酶的專一性:酶對催化的反應和反應物有嚴格的選擇性,其往往只能催一種或一類反應,作用于一種或一類物質。包括結構專一性和立體異構專一性(旋光異構專一性+幾何異構專一性)。.多酶體系:是由幾種酶彼此嵌合形成的復合體。它有利于一系列反應的連續進行。.逆向轉錄:在逆轉錄酶作用下,以RNA為模板,按照
44、RNA中的核甘酸順序合成 DNA,這與通常轉錄過程中遺傳信息流從DNA到RNA的方向相反。.不對稱轉錄:轉錄通常只在 DNA的任一條鏈上進行。.糖酵解:葡萄糖在無氧條件下,在細胞質一系列酶的作用下,生成丙酮酸并釋放出能量的過程。.戊糖磷酸途徑(PPP :葡萄糖在細胞質內直接氧化分解,并以戊糖磷酸為重要中間產物的有氧呼吸途徑。又稱己糖磷酸途徑(H MB。.乙醛酸循環(GAC :脂肪酸氧化分解生成的乙酰CoA,在乙醛酸體內生成琥珀酸、乙醛酸和蘋果酸等化合物的循環過程。其中生成的琥珀酸可用以生成糖,二竣酸與三竣酸循環。此循環發生僅在某些植物和微生物中。.糖異生作用:生物體中多種非糖物質(乳酸、丙酮酸
45、、 生糖氨基酸及甘油)轉變為糖的過程。.生物氧化:糖、脂肪、蛋白質等物質在生物體內通過酶的催化,實現的一系列釋放能量的化學反應過程。.氧化磷酸化: 在線粒體內膜上經電子傳遞鏈傳遞給分子氧生成水,并偶聯ADP和Pi生成ATP的過程。 它是需氧生物生物氧化生成ATP的主要方式。181一底物水平磷酸化:ATP的形成直接與一中間代謝物上的磷酸基團的轉移相偶聯的作用。182.P/O比:在氧化磷酸化中,一對電子呼吸鏈傳遞至氧時所產生的ATP分子數,每消耗1 m ol氧原子產生 ATP的摩爾數。.反饋調節:指反應體系中的某些中間產物或終產物對其前面某一步反應速度的影響。使反應加速的物質稱為正效應物。.溫度系
46、數(Q1 0):表示生物體內的生化反應與溫度關系的指標,指溫度每升高1 00 C,呼吸速率所增加的倍數。其關系式為:Q1 0=(t +1 0)0C 時的速率/t0C 時的速率。.乳酸循環(可立氏循環):肌肉缺氧條件下產生大量乳酸,大部分經血運到肝臟,通過糖異生作用肝糖原或葡萄糖補充血糖,血糖可再被肌肉利用,這樣形成的循環稱乳酸循環。.分子伴侶:一類能特異地結合和釋放底物蛋白的蛋白分子,它們幫助底物蛋白實現正確折疊、寡聚體組裝、向特定細胞器轉運或變換活化 /去活化構象等.肽平面:由于肽鍵具有部分雙鍵性質,不能自由旋轉,所以連接在肽鍵兩端的基團處于一個平面上,這個平面稱為肽平面。.聯合脫氨基作用:
47、許多氨基酸不能直接進行氧化脫氨基作用,但可以和a -酮戊二酸進行轉氨基作用,生成相應的a -酮酸和谷氨酸.谷氨酸可在谷氨酸脫氫酶的作用下進行氧化 脫氨基作用,又生成a -酮戊二酸,并放出氨,谷氨酸脫出的氨實際來自a -酮戊二酸進行轉氨基作用的氨基酸.可見,轉氨基作用與谷氨酸氧化脫氨基作用聯合作用,此過程稱氨基酸的聯合脫氨基作用.凡能與a -酮戊二酸進行轉氨基作用的氨基酸,都可以通過聯合脫氨基作用分解為a -酮酸和氨,所以這種作用是谷氨酸以外的多種氨基酸脫氨基的主要方式。.谷胱甘肽(GSH):是由谷、 半胱的甘氨酸組成的三肽。半胱氨酸的疏基是該化合物的主要功能基團。GSH的前基具有還原性,可作為
48、體內重要的還原劑保護體內蛋白質或酶分子中疏基免被氧化,使蛋白質或酶處于活性狀態。.脂肪酸的3 -氧化:長鏈脂肪酸降解首先在鄰近竣基的第二個 C原子(3位)開始 脫氫氧化后, 經一系列反應逐步氧化成乙酰 CoA的過程, 由于氧化作用是從3 -C開始 的,故稱3 -氧化。.粘性末端:當一種限制性內切酶在一個特異性的堿基序列處切斷DNA時, 就可在切口處留下幾個未配對的核甘酸,叫做粘性末端。故稱半保留. DNA半保留半不連續復制:DNA復制時子鏈雙鏈中有一條鏈來源于母鏈,故稱半保留復制。以DNA母鏈雙鏈為模板合成子鏈時,其中一條子鏈的合成是不連續的,而另一條鏈的合成是連續的,故稱半不連續復制,合稱半
49、保留半不連續復制。.共價修飾調節:酶蛋白分子中的某些基團可以在其他酶的催化下發生共價修飾,從而導致酶活性的改變,稱為共價修飾調節。其特點是:酶以兩種不同修飾和不同活性的形式存在;有共價鍵的變化;受其他調節因素的影響(如激素);一般為耗能過程;存在放大效應。.寡聚酶:有幾個或多個亞基組成的酶。其中亞基可以相同,也可以不同亞基間以共價鍵結合,容易為酸堿及高濃度的鹽或其他的本性劑分離。.增強子:是一種能夠提高轉錄效率的順式調控元件。其在多種真核 生物,甚至在原核生物中也發現有增強子。. C3植物:植物通過還原型戊糖磷酸循環而進行CO2固定的植物。.同促效應:別構效應可分為同促效應和異促效應兩類。相同
50、配體引起的反應稱為同促效應,例如寡聚酶或蛋白質各亞基之間的協同作用即是同促效應。其是同一種物質作用于不同 亞基的相同部位而發生影響,因此屬別構效應。.轉換數:酶的催化效率可用酶的轉換數表示,在酶濃度一定,底物濃度大大大于酶濃度Et 情 況下,Vmax=K 3Et.K 3表示酶被底物完全飽和時,每單位時間內、 每個酶分子所能轉化底物的分子數,稱為轉換數(TN ),也稱催化常數(Kcat).它相當于一旦底物-酶中間物形成后,酶對特定底物的最大反應速度(Vm ax)也是 一個常數。此時酶將底物轉化為產物的效率,K cat值愈大表示酶的催化效率愈高。.暗反應(dark reactions ):利用光反
51、應生成的 ATP和NADPHH勺化學能使 CO2還原成糖 或其它有機物的一系列酶促過程。.光反應(light reactions ):合色素將光能轉變成化學能并形成ATP和NADPH勺過程。.氨基酸臂(amino arm):也稱之接納莖(acceptor stem) 。 tRNA分子中靠近 3,端的 核甘酸序列和5,端的序列堿基配對,形成的可接收氨基酸的臂(莖)。.氨酰-tRNA (aminoacyl-tRNA ):在氨基酸臂的 3 ,端的腺甘酸殘基共價連接了氨基酸 的tRNA分子。.氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase ):催化特定氨基酸激活并共價結合 在
52、相應的tRNA分子3 /端的酶。.擺動(wobble):處于密碼子 3/端的堿基和與之互補的反密碼的5/端的堿基之間的堿基配對有一定的寬容性,即處于反密碼的5,端的堿基(也稱之擺動位置),例如 I可以與密碼子上3,端的J C和A配對。由于存在擺動現象所以使得一個tRNA反密碼子可以和一個以上的 mRN的碼子結合。.伴娘蛋白(chaperone ):與一種新合成的多肽鏈形成復合物并協助它正確折疊成具有 生物功能構象的蛋白質。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確的聚集,協助多肽鏈跨膜轉運以及大的多亞基蛋白質的組裝和解體。.半乳糖血癥(galactosemia ):人類
53、的一種基因型遺傳代謝缺陷,特點是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿甘酰轉移酶導致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。.苯酮尿癥(phenylketonuria ):是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酮酸堆積的代謝 遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶,苯丙氨酸只能靠轉氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對神經有毒害,智力發育出現障礙。.比活(specific activity ):每分鐘每毫克酶蛋白在25c下轉化的底物的微摩爾數(科m)。比活是酶純度的測量。.別喋吟醇(allopurinol ):是結構上(喋吟環上第 7位是C,第8位是N)類似于次黃 喋吟的化合物,對黃喋吟氧化酶有很強抑制作用
54、,常用來治療痛風。.補救途徑(salvage pathway ):與從頭合成途徑不同,生物分子的合成,例如核甘酸 可以由該類分子降解形成的中間代謝物,如堿基等來合成,該途徑是一個再循環途徑。.查格夫法則(Chargaffs rules ):所有DNA中腺喋吟與胸腺喀咤的摩爾含量相等,(A=T),鳥喋吟和胞喀咤的摩爾含量相等(G= C),即喋吟的總含量與口咤的總含量相等( A+ G= T+Q 。 DNA勺堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外生長發 育階段、營養狀態和環境的改變都不影響DNA的堿基組成。.初速度(initial velocity ):酶促反應最初階段底物轉化為產物
55、的速度,這一階段產 物的濃度非常低,其逆反應可以忽略不計。.錯配修復(mismatch repair ):在含有錯配堿基的DNA分子中使正常核甘酸序列恢復的修復方式。這種修復方式的特點是:識別出正確的鏈,切除掉不正確鏈的部分,然后通過DNAm合酶和DNA連接酶的作用合成正確配對的雙鏈DNA.大溝(major groove )和小溝(minor groove ):繞B-DNA雙螺旋表面上出現的螺旋槽 (溝),寬的溝稱之大溝,窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對堆積和糖-磷酸骨架扭轉造成的。.單糖(monosaccharide ):由三個或更多碳原子組成的具有經驗公式( CH2O n的簡單 糖。
56、.寡糖(oligoccharide ):由2個20個單糖殘基通過糖昔鍵連接形成的聚合物。.淀粉(starch ): 一類可作為植物中貯存多糖的葡萄糖殘基的同聚物。由兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分支的只是通過“-(1-4)糖昔鍵連接的葡萄糖殘基聚合物。另一種是支鏈淀粉,是含有分支的a - (1-4)糖昔鍵連接的葡萄糖殘基聚合物,支鏈在分 支點處通過a - (1-6)糖昔鍵與主鏈相連。.等電點(pI , isoelectric point ):使分子處于兼性分子狀態,在電場中不遷移(分 子的凈電荷為零)的 pH值。.讀碼框(reading frame ):代表一個氨基酸序列的mRNA子的
57、非重疊密碼序列。一個mRNA勺讀碼框是由轉錄起始位置(通常是AU儒碼)確定的。.多糖(polysaccharide ) : 20個以上的單糖通過糖昔鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可 以是線性的或帶有分支的。.二硫鍵(disulfide bond):通過兩個(半胱氨酸)疏基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵在穩定某些蛋白的三維結構上起著重要的作用。.發酵(fermentation ):營養分子(例如葡萄糖)產能的厭氧降解,在乙醇發酵中,丙酮酸轉化為乙醇和CO2.翻譯起始復合體(translation initiation complex ):由核糖體亞基、一個mRNA板、一個起始的tRNA分子和起始因子組成
58、并組裝在蛋白質合成起始點的復合體.反饋抑制(feedback inhibition ):催化一個代謝途徑中前面反應的酶受到同一途徑 的終產物抑制的現象。.反向重復序列(inverted repeat sequence ):在同一多核甘酸鏈內的相反方向上存在 的重復的核甘酸序列。在雙鏈DNA中反向重復可能引起十字形結構的形成。.光合磷酸化(photophosphorylation ):在葉綠體 ATP合成酶催化下依賴于光的由ADP和Pi合成ATP的過程。.光呼吸(photorespiration ):植物依賴光攝取氧進行磷酸乙醇酸代謝的過程。光呼吸之所以發生是由于 O2可以與CO2競爭核酮糖-1
59、,5-二磷酸竣化氧化酶的活性部位。.滾環復制(rolling-circle replication):復制環狀 DNA的一種模式,在該模式中,DNAm合酶結合在一個缺口鏈的 3,端,繞環合成與模板鏈互補的 DNA每一輪都是新合成 的DNA取代前一輪合成的 DNA.化學滲透理論(chemiosmotic theory ): 一種學說,主要論點是底物氧化期間建立的 質子濃度梯度提供了驅動由AD刖Pi形成ATP的能量。.還原糖(reducing sugar):厥基碳(異頭碳)沒有參與形成糖昔鍵,因此可被氧化充當還原劑的糖。.回補反應(anaplerotic reaction ):酶催化的補充檸檬酸循
60、環中間代謝物的供給的反應,例如由丙酮酸竣化生成草酰乙酸的反應。.合成代謝反應(anabolic reaction ):合成用于細胞維持和生長所需要的分子的代謝反應。.順反子(cistron )。泛指被轉錄的一個DNM段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或 RNA分子的DNM段。.激素受體(hormone receptor ):位于細胞表面或細胞內結合特異激素并引發細胞響應 的蛋白質。.激素效應元件(hormone response elements, HRE :是指類固醇、甲狀腺素等激素受體結合的一段短的DNA列(1220bp),這類受體結合 DN而可改變相鄰基因的表達。.極限糊精(
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