1、分子生物學(xué)結(jié)構(gòu)分子生物學(xué)部分緒論總述：進(jìn)化論、細(xì)胞學(xué)說(shuō)、生化遺傳學(xué)、DNA勺發(fā)現(xiàn)分子生物學(xué)：定義、研究?jī)?nèi)容（四方面）發(fā)展史：里程碑三個(gè)相關(guān)學(xué)科：生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、遺傳學(xué)中心法則：經(jīng)典、現(xiàn)代IDNA結(jié)構(gòu)：堿基比率、配對(duì)規(guī)則、種數(shù)（4n）、0.34nm的應(yīng)用（堿基對(duì)M/2x,長(zhǎng)度0.34乂M/2x）三類(lèi)DNA（ABZ:結(jié)構(gòu)、形成、特點(diǎn)及Z-DNA的作用質(zhì)粒超螺旋：正負(fù)超螺旋定義、轉(zhuǎn)化、意義、計(jì)算、主要以負(fù)超螺旋存在其它：0.34nm的計(jì)算、必DNAB定因素（PO3-）與TmZ-DNA不穩(wěn)性質(zhì)復(fù)性：五條件、機(jī)制（Cot曲線）、三個(gè)吸光度修飾：甲基化（ACG變性：DNAB性全變性、90°

2、C以上全變性增色37%增色效應(yīng)（Tm水解：酸（PH<1,=4,甲基化DNA®水解用處）；堿（RNAPH:13,11,DNA去堿基易）酶（內(nèi)切、外切）DNA1定因素：對(duì)應(yīng)核甘酸的P同電相斥、Na>Tm分子伴侶：作用、分類(lèi)（熱休克蛋白、伴侶素）、作用機(jī)理（四條）IItRNA形成：轉(zhuǎn)錄成三類(lèi)，3'去尾，5'斬頭，化學(xué)修飾成稀有堿基（I、少）二級(jí)結(jié)構(gòu)：四個(gè)臂（受體臂、反密碼子臂、D臂、T6C臂），多余臂（2類(lèi)），tRNA長(zhǎng)度決定因素（D臂、多余臂）三級(jí)結(jié)構(gòu)：特點(diǎn)、二三級(jí)氫鍵、兩個(gè)雙螺旋、轉(zhuǎn)折處（）、兩端點(diǎn)（）受體臂與反密碼子臂距離遠(yuǎn)及原因功能：轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸（受體臂3

3、'-CCA）、解讀密碼子（反密碼子臂）種類(lèi)：tRNAi/tRNAe（起始/延伸），同工tRNA（定義）tRNA性質(zhì)由反密碼子決定m核糖體核糖體的細(xì)胞學(xué)知識(shí)：見(jiàn)細(xì)胞生物學(xué)三個(gè)位點(diǎn)：A、P、E作用原核30S小亞基上16SrRNA反SD序列：結(jié)構(gòu)（3/富含喀咤區(qū)GAUCACCUCCUU梅用IVmRNA真原核比較：帽、尾、單多順?lè)醋印⑵鹗济艽a子個(gè)數(shù)原核有三個(gè)起始密碼子（AUG>GUG>UUGT1/2、原核特有SD序歹U真核mRN聯(lián)類(lèi)帽：0、1、2類(lèi)定義原核mRNA勺SD序列：5作用，結(jié)構(gòu)V蛋白質(zhì)與核酶結(jié)構(gòu)域：分子伴侶：分類(lèi)、作用機(jī)制核酶：定義、分類(lèi)（剪接、剪切）剪切分三類(lèi)：錘頭、發(fā)

4、夾、丁肝病毒核酶基因組學(xué)部分I染色體觀察：有絲分裂中期光學(xué)顯微鏡可見(jiàn)功能：遺傳載體作為遺傳物質(zhì)所需四要素：穩(wěn)定、半保留復(fù)制、產(chǎn)生蛋白質(zhì)、可變異n真核基因組組成：DNA（或RNA+Protain（組、非組）DNAC值與C值反常現(xiàn)象、三序列（不重復(fù)、中度重復(fù)、高度重復(fù)）占序列比例，單/多拷貝組蛋白：六種、特征（保守、特例、氨基酸不對(duì)稱、修飾、H5-賴氨酸）非組蛋白：三種常見(jiàn)，DNA吉合蛋白的定義真核基因組結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)-核小體組成：200bpDNA隊(duì)聚體八聚體：2X（H2A+H2B+H3+H4結(jié)構(gòu)：顆粒（八聚體+120bpDNAl,直徑10nmDNA1繞1.65圈）連接DNA（80bpDNAH+H1,H

5、1作用）是負(fù)超螺旋染色單體：螺線管、螺旋n倍端粒與端粒酶端粒：真核基因組末端，功能（防真核基因組末端結(jié)合）端粒酶：反轉(zhuǎn)錄酶、功能（反轉(zhuǎn)錄成端粒、連接后隨鏈所得的岡崎片段）、反轉(zhuǎn)錄機(jī)理（m原核基因組真原核基因組比較：大小（真核大，原核小）復(fù)雜度（斷裂/連續(xù)、大多為調(diào)控/表達(dá)區(qū)、重復(fù)序列/重疊基因）復(fù)制（真核多向，原核單向）轉(zhuǎn)錄（單順?lè)醋?多順?lè)醋樱┱婧颂厥猓―NA態(tài)性、端粒）真原核基因表達(dá)的比較：復(fù)制、表達(dá)連續(xù)性及機(jī)理IV真核基因組結(jié)構(gòu)hnRNArt含子：GU-AGt則，3'喀咤區(qū)，5'保守區(qū)、3'上游18-50處的保守區(qū)啟動(dòng)子：核心（TATA決定轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)）、識(shí)別RN

6、A聚合酶（CGCAAT決定轉(zhuǎn)錄起始頻率）增強(qiáng)子：定義、結(jié)構(gòu)、作用機(jī)制、特點(diǎn)、代表（B-珠蛋白基因）終止子：兩類(lèi)（依賴/不依賴p因子）、結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、作用機(jī)理、窮追模型V原核基因組結(jié)構(gòu)啟動(dòng)子：-35區(qū)（識(shí)別RN咪合酶），-10區(qū)（結(jié)合RN咪合酶）VI基因組學(xué)幾個(gè)定義：重疊基因、斷裂基因、基因家族、基因簇、超基因家族、假基因、管家基因、奢侈基因、組織特異性基因順式與反式作用因子：順式作用元件：定義，啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、沉默子反式作用元件：定義，轉(zhuǎn)錄復(fù)合物人類(lèi)基因組計(jì)劃：比較基因組學(xué)：基因表達(dá)部分IDN心制半保留復(fù)制：定義、意義、發(fā)現(xiàn)（N4N5）半不連續(xù)復(fù)制：前導(dǎo)鏈、后隨鏈、岡崎片段、過(guò)程、實(shí)驗(yàn)證明（電泳、

7、30s）復(fù)制起點(diǎn)：復(fù)制叉、復(fù)制子、復(fù)制起點(diǎn)特征復(fù)制方式：線性-眼形，環(huán)狀-3種（0型、滾環(huán)型、D環(huán)型；各對(duì)應(yīng)DNA中類(lèi)、機(jī)制）復(fù)制方向、速度：三種，以定點(diǎn)反向等速為主復(fù)制所需酶、蛋白：拓?fù)洚悩?gòu)酶（兩類(lèi)）、解旋酶、SSB（作用）；引發(fā)酶；DN峨合酶（見(jiàn)下）、DNAS接酶DN咪合酶：原核：IV結(jié)構(gòu)與功能（聚合酶活性、外切酶活性），田最主要真核：a§丫3B,aS最主要功能總結(jié)：與連接酶共同作用（合成子鏈、損傷修復(fù)校正、補(bǔ)岡崎片段的連接處）原核DNA®制過(guò)程及酶的作用：DNAB旋（三種酶）一引發(fā)（引物的作用）一延伸一終止復(fù)制特點(diǎn)：子鏈復(fù)制方向：5'-3原核、真核連續(xù)性復(fù)制的

8、調(diào)控：原核：復(fù)制叉多少?zèng)Q定起始頻率，起始頻率直接調(diào)控因子一RNP真核：三個(gè)水平（細(xì)胞周期、染色體、復(fù)制子）nDNA損傷與修復(fù)損傷：三種（紫外線、脫氨、甲基化、氧化機(jī)制，對(duì)應(yīng)修復(fù)法）：堿基異常（U-GT-G）變異：基因突變基礎(chǔ)、突變類(lèi)型、突變后果修復(fù)：切除（堿基、核甘酸），錯(cuò)配（Dam5'GATC3）,重組（先復(fù)制后修復(fù)），直接（光修復(fù)、去甲基化），SOSO；各修復(fù)機(jī)理（所需酶）mDNA轉(zhuǎn)錄與逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄的定義：轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄單元轉(zhuǎn)錄特點(diǎn)：不對(duì)稱（正負(fù)鏈定義、負(fù)鏈為模板，多基因DNAE負(fù)鏈相間）；連續(xù)單向（mRNA5'-3'）;有起始終止位點(diǎn)（啟動(dòng)子、終止子定義）；能力（雙鏈強(qiáng)

9、于單鏈及原因）；不需完全解鏈轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)：定義、上下游表示法（-n/+n）;原核啟動(dòng)子（-10區(qū)、-35區(qū)結(jié)構(gòu)、功能，兩區(qū)最佳間距）、真核啟動(dòng)子（TATAK、CAATX、GCK結(jié)構(gòu)、功能）；啟動(dòng)子的上升/下降突變轉(zhuǎn)錄所需酶、復(fù)合物：RN咪合酶（見(jiàn)下）；復(fù)合物（轉(zhuǎn)錄因子定義、分類(lèi)、結(jié)構(gòu)與功能）RN咪合酶：真核：In田（對(duì)應(yīng)三種內(nèi)含子），n最主要，對(duì)應(yīng)三種RNA（rRNA、hnRNAtRNA）,對(duì)a-鵝膏蕈堿敏感度（三類(lèi)）原核：（“2B6）（T：“236為核心酶，3&與原核啟動(dòng)子識(shí)別、結(jié)合，（T協(xié)助36與原核啟動(dòng)子識(shí)別b因子：結(jié)構(gòu)、作用機(jī)理；P因子：結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄過(guò)程概述：識(shí)別一起始一延伸-終止

10、（各步定義）轉(zhuǎn)錄過(guò)程詳解：RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)子區(qū)白識(shí)別：原核（-35區(qū)）；真核（CAATCG區(qū)）RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合：原核（-10區(qū)）；真核（需轉(zhuǎn)錄因子形成復(fù)合體相互作用使酶與啟動(dòng)子結(jié)合TAAT區(qū)）不需引物轉(zhuǎn)錄的延伸：RNA聚合酶催化下合成RNA鏈。先合成一段>9/<9的片段-繼續(xù)/停止轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄的終止：兩類(lèi)終止（依賴/不依賴p因子）【見(jiàn)基因組學(xué)部分】；抗終止（定義、兩方式）增強(qiáng)子、終止子：見(jiàn)基因組學(xué)部分轉(zhuǎn)錄的調(diào)控：見(jiàn)基因表達(dá)調(diào)控部分RNA的轉(zhuǎn)錄后加工：真原核mRNAE較：見(jiàn)基因組學(xué)部分hnRNArt含子：見(jiàn)基因組學(xué)部分mRNA勺剪接：剪接因子及作用（UISnRNPUISnoR

11、NAU2AFU4-U5-U6-SnRNP三聚體），SnRNA（U1-U10）,變位剪接（跳過(guò)某特殊剪接位點(diǎn)）三類(lèi)rRNA內(nèi)含子的剪接：對(duì)應(yīng)三類(lèi)RNAPok用于、兩次轉(zhuǎn)脂及后處理（機(jī)理）、RNA的編輯：定義（加、減、換一位）、兩機(jī)制（甲基化、脫氨）、意義RNA的再編碼：定義、三方式（+1/-1移碼、核糖體跳躍、終止子通讀）RNA的化學(xué)修飾：方式種類(lèi)、產(chǎn)物、適用于SnoRNAk白Dbox:甲基化酶結(jié)合位點(diǎn)轉(zhuǎn)錄的抑制：抑制物種類(lèi)（利福平、利迪鏈霉素、放射線素D、a-鵝膏蕈堿）、作用位置IVDNA翻譯綜述：幾個(gè)定義（三聯(lián)子密碼、可讀框）；起始密碼子：AUG原核三個(gè)；三個(gè)終止密碼子（學(xué)名、使用頻率uaa

12、>uga>uag三聯(lián)密碼子：破譯過(guò)程（推理、驗(yàn)證、破譯技術(shù)）；性質(zhì)【普遍與特殊性、連續(xù)與方向性、擺動(dòng)性（擺動(dòng)假說(shuō)、tRNA可識(shí)別密碼子數(shù)）、簡(jiǎn)并性（簡(jiǎn)并、同義密碼子及特點(diǎn)、與氨基酸出現(xiàn)率關(guān)系精氨酸例外）、偏好性】翻譯（蛋白合成）機(jī)制：起始（真原核起始因子）一延長(zhǎng)（真原核延長(zhǎng)因子）一終止（真原核釋放因子）蛋白前體加工N端起始氨基酸的切除：fMet在脫甲酰化酶作用下脫甲酰基，在肽鏈合成完成前剪切，有些病毒切除后成多段功能蛋白二硫鍵的形成：半胱氨酸間成二硫鍵一胱氨酸一蛋白質(zhì)修飾：磷酸化、糖基化、甲基化切除非功能區(qū)：蛋白折疊：見(jiàn)結(jié)構(gòu)分子生物學(xué)部分分子伴侶蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)與降解：見(jiàn)分子筆記（中）P

13、31翻譯-轉(zhuǎn)運(yùn)同步機(jī)制：適用于原核生物；信號(hào)肽（定義、特點(diǎn)）；信號(hào)肽假說(shuō)；幾個(gè)結(jié)論；SR可口DP的作用翻譯后轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制：適用于真核生物線粒體、葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)；線粒體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)【過(guò)程特征、前導(dǎo)肽（轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程、特性）】；葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)【過(guò)程特征、葉綠體定位信號(hào)肽（兩部分、小亞基前體）】核蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)：蛋白降解：大腸桿菌Lon（）;蛋白質(zhì)半衰期（）；泛蛋白（真核蛋白降解、結(jié)構(gòu)、機(jī)理）；N端結(jié)構(gòu)與蛋白穩(wěn)定性（賴精不穩(wěn)）翻譯的抑制：抗生素（氯霉素、四環(huán)素、鏈霉素、新霉素、卡那霉素）、競(jìng)爭(zhēng)氨酰tRNA類(lèi)似物（嗯吟霉素）青霉素、紅霉素作用機(jī)理真原核mRNAt核糖體的結(jié)合的區(qū)別：真核：帽蛋白作用下使5'帽與核

14、糖體小亞基結(jié)合原核：SD序列與16SrRNA結(jié)合VDNA轉(zhuǎn)座幾個(gè)定義：轉(zhuǎn)座、轉(zhuǎn)座子發(fā)現(xiàn)：1940,玉米實(shí)驗(yàn)轉(zhuǎn)座子結(jié)構(gòu)：有獨(dú)立復(fù)制、移動(dòng)基因兩類(lèi)轉(zhuǎn)座子：插入型（IS）（兩端反向重復(fù)序列）、復(fù)合型（IS-功能基因-IS）TnA家族及其它：轉(zhuǎn)座機(jī)制：復(fù)制型、非復(fù)制型、過(guò)程轉(zhuǎn)座遺傳效應(yīng)：插入突變、產(chǎn)生新基因、染色體畸變、生物進(jìn)化、發(fā)生頻率低基因調(diào)控部分I基因表達(dá)與調(diào)控總述定義：基因表達(dá)、基因表達(dá)的調(diào)控基因表達(dá)的時(shí)間性與空間性：真核不連續(xù)，原核連續(xù)基因表達(dá)類(lèi)型：組成型（定義、管家基因）；適應(yīng)型（定義、奢侈基因）調(diào)控的分類(lèi)：正控、負(fù)控；阻遏、誘導(dǎo)n原核基因調(diào)控轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控一乳糖操縱子學(xué)說(shuō)操縱子結(jié)構(gòu)：PI

15、-POZYAI、OZ、Y、A作用核心思想：I編碼阻遏蛋白與O結(jié)合，阻礙ZYA三基因表達(dá)；ZYA編碼三種酶，用于消化乳糖必Z、Y、A對(duì)應(yīng)的三種酶及功能：Z-B半乳糖昔異構(gòu)酶；Y-B半乳糖背透過(guò)酶；A-B半乳糖昔乙酰基轉(zhuǎn)移酶只有乳糖時(shí)：乳糖在Z酶催化下成異構(gòu)乳糖，異構(gòu)乳糖在Y酶催化下進(jìn)入基因組，與O區(qū)上的阻遏蛋白結(jié)合，使阻遏蛋白脫離O區(qū)，使ZYA可表達(dá)異構(gòu)乳糖是效應(yīng)物兩個(gè)矛盾：定義、解釋（阻遏蛋白與O區(qū)非共價(jià)結(jié)合，不穩(wěn)）有葡萄糖、乳糖時(shí)（代謝產(chǎn)物阻遏作用）：雖然可通過(guò)上述機(jī)理使阻遏蛋白脫離O區(qū)，但葡萄糖分解產(chǎn)物可與O結(jié)合，阻礙ZYA表達(dá)降解物敏感型操縱子：定義CAMP-CRP!控：CAMPt義；正

16、調(diào)控機(jī)理；抗解鏈蛋白的阻遏轉(zhuǎn)錄終止水平的調(diào)控一色氨酸操縱子學(xué)說(shuō)細(xì)菌SOS®急反應(yīng)：弱化作用：弱化子結(jié)構(gòu)（前導(dǎo)區(qū)，10、11位為色氨酸密碼子，表達(dá)出前導(dǎo)肽）轉(zhuǎn)錄的弱化作用：作用于前導(dǎo)肽的翻譯合成過(guò)程前導(dǎo)肽合成受tRNATe影響：10、11位為色氨酸密碼子，翻譯過(guò)程中，色氨酸濃度影響核糖體在mRNAt的移動(dòng)速度（見(jiàn)下）當(dāng)色氨酸少時(shí)：tRNATrp少一核糖體在10、11位移動(dòng)速度小-4區(qū)轉(zhuǎn)錄完后，核糖體到1區(qū)（10、11位之間）-2區(qū)與3區(qū)配對(duì)-繼續(xù)轉(zhuǎn)錄色氨酸操縱子，自己繼續(xù)合成色氨酸當(dāng)色氨酸多時(shí)：核糖體在10、11位移動(dòng)速度快-4區(qū)轉(zhuǎn)錄前，核糖體已到2區(qū)-2區(qū)與3區(qū)不能配對(duì)-3區(qū)與4區(qū)配對(duì)成莖環(huán)終止結(jié)構(gòu)一