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文檔簡介
1、 本章主要內(nèi)容 轉(zhuǎn)錄是基因表達的中心環(huán)節(jié)轉(zhuǎn)錄是基因表達的中心環(huán)節(jié) 轉(zhuǎn)錄涉及的酶與過程轉(zhuǎn)錄涉及的酶與過程 轉(zhuǎn)錄后的加工轉(zhuǎn)錄后的加工第1頁/共23頁 轉(zhuǎn)錄(轉(zhuǎn)錄(transcription) 以以DNA為模板,在為模板,在RNA聚合酶(聚合酶(RNA polymerase)的作用下合成)的作用下合成mRNA,將遺傳信息從,將遺傳信息從DNA分子上轉(zhuǎn)移到分子上轉(zhuǎn)移到mRNA分子上,這一過程稱為轉(zhuǎn)分子上,這一過程稱為轉(zhuǎn)錄。錄。第2頁/共23頁1 轉(zhuǎn)錄是基因表達的中心環(huán)節(jié)轉(zhuǎn)錄是基因表達的中心環(huán)節(jié) 轉(zhuǎn)錄是以轉(zhuǎn)錄是以 DNA為模板合成為模板合成RNA, 并且只是并且只是以單股以單股DNA 為模板,為模板,因
2、此具有不對稱性;因此具有不對稱性; 用以轉(zhuǎn)錄的單鏈用以轉(zhuǎn)錄的單鏈DNA, 稱為模板鏈稱為模板鏈, 與復(fù)制不同,與復(fù)制不同,轉(zhuǎn)錄是轉(zhuǎn)錄是局部的局部的,從啟動子開始到終止子結(jié)束從啟動子開始到終止子結(jié)束,為一個轉(zhuǎn)錄單位為一個轉(zhuǎn)錄單位; 轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄不需要引物不需要引物; 轉(zhuǎn)錄的忠實性相對弱;轉(zhuǎn)錄的忠實性相對弱; 轉(zhuǎn)錄首先得到轉(zhuǎn)錄首先得到RNA前體,然后再進行加工轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓那绑w,然后再進行加工轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓腞NA. .第3頁/共23頁被轉(zhuǎn)錄成單個被轉(zhuǎn)錄成單個RNA分子的一段分子的一段DNA 稱為一個轉(zhuǎn)錄單位稱為一個轉(zhuǎn)錄單位(transcript)第4頁/共23頁 分子量分子量48萬,萬,5種亞基:種亞基:
3、 全酶全酶= 核心酶(核心酶(2)+ 因子因子 亞基決定轉(zhuǎn)錄的基因亞基決定轉(zhuǎn)錄的基因 亞基在亞基在53方向上延長多核苷酸鏈,其方式與方向上延長多核苷酸鏈,其方式與DNA 聚合酶相同,原料為聚合酶相同,原料為NTP,沒有糾錯的功能。,沒有糾錯的功能。 亞基結(jié)合亞基結(jié)合DNA模板模板 因子識別因子識別“啟動子啟動子”并與之結(jié)合并與之結(jié)合2 RNA聚合酶聚合酶( RNA polymerase )2.1 原核的原核的RNA聚合酶聚合酶第5頁/共23頁聚合酶聚合酶I :轉(zhuǎn)錄:轉(zhuǎn)錄45S rRNA 聚合酶聚合酶II:轉(zhuǎn)錄:轉(zhuǎn)錄mRNA的前體的前體(核不均核不均RNA, hnRNA)聚合酶聚合酶III:轉(zhuǎn)錄
4、:轉(zhuǎn)錄tRNA 和和5S rRNA 等等 (注意:(注意: S)2.2 真核的真核的RNA聚合酶聚合酶第6頁/共23頁 沉降系數(shù)沉降系數(shù) S 生物大分子在離心場中沉降,受到三種力的影響,它們是離生物大分子在離心場中沉降,受到三種力的影響,它們是離心力,浮力和摩擦力。物質(zhì)在單位離心力場下的沉降速度是個定心力,浮力和摩擦力。物質(zhì)在單位離心力場下的沉降速度是個定值,稱為沉降系數(shù)(值,稱為沉降系數(shù)(sedimentation coefficient) 。 蛋白質(zhì)、核酸等的沉降系數(shù)在蛋白質(zhì)、核酸等的沉降系數(shù)在1 X 10-13到到 200 X 10-13秒秒 之間。之間。為方便將為方便將10-13秒作為
5、一個單位,稱秒作為一個單位,稱Svedberg單位,用單位,用S表示。表示。 其數(shù)值不僅與物質(zhì)分子的質(zhì)量有關(guān),也與分子的形狀有關(guān)。其數(shù)值不僅與物質(zhì)分子的質(zhì)量有關(guān),也與分子的形狀有關(guān)。 第7頁/共23頁 DNA上的轉(zhuǎn)錄起始序列,稱為啟動子,有序列上的轉(zhuǎn)錄起始序列,稱為啟動子,有序列保守性,不僅是轉(zhuǎn)錄起始的位置,而且影響轉(zhuǎn)錄的保守性,不僅是轉(zhuǎn)錄起始的位置,而且影響轉(zhuǎn)錄的活性。活性。RNA聚合酶結(jié)合在啟動子聚合酶結(jié)合在啟動子上上上游上游下游下游3 啟動子啟動子( promoter )第8頁/共23頁注意原核啟動子在注意原核啟動子在-35 和和-10區(qū)域的保守序列區(qū)域的保守序列Pribnow box第
6、9頁/共23頁 真核轉(zhuǎn)錄啟動子的保守序列真核轉(zhuǎn)錄啟動子的保守序列 (TATA box,TATA盒)盒) 并非所有的真核基因都有典型的并非所有的真核基因都有典型的TATA box,不同生物,不同生物的基因有不同的上游的基因有不同的上游DNA序列序列第10頁/共23頁 4.1 轉(zhuǎn)錄開始轉(zhuǎn)錄開始 由由因子辨認并且結(jié)合到啟動子上因子辨認并且結(jié)合到啟動子上,局部解鏈(,局部解鏈(10-20bp),拓樸異構(gòu)酶等也參與。),拓樸異構(gòu)酶等也參與。 4.2 RNA鏈的延伸鏈的延伸 由核心酶催化,以其中的一股由核心酶催化,以其中的一股DNA 單鏈作為模板鏈,以單鏈作為模板鏈,以NTP為原料,按照堿基互補配對的原則
7、,為原料,按照堿基互補配對的原則,通常是由通常是由5ppp嘌呤嘌呤核苷(核苷(G 或或A )開頭向著)開頭向著3方向延長多核苷酸鏈方向延長多核苷酸鏈,合成開始后,合成開始后,因子從模板上脫離下來(可以重復(fù)利用)。因子從模板上脫離下來(可以重復(fù)利用)。 核心酶覆蓋雙鏈核心酶覆蓋雙鏈DNA和和RNA復(fù)合物,向前推進,一邊解復(fù)合物,向前推進,一邊解開螺旋,一邊釋放出新合成的開螺旋,一邊釋放出新合成的RNA鏈,后面已經(jīng)轉(zhuǎn)錄的區(qū)域中鏈,后面已經(jīng)轉(zhuǎn)錄的區(qū)域中分開的分開的DNA鏈又重新形成雙螺旋。鏈又重新形成雙螺旋。4 轉(zhuǎn)錄過程及其特點轉(zhuǎn)錄過程及其特點第11頁/共23頁“轉(zhuǎn)錄泡(轉(zhuǎn)錄泡(transcript
8、ion bubble)”第12頁/共23頁轉(zhuǎn)錄過程中的模板識別、起始和延伸轉(zhuǎn)錄過程中的模板識別、起始和延伸第13頁/共23頁 A. 依賴依賴因子的終止因子的終止 新生新生RNA上有上有因子的識別位點。它與聚合酶因子的識別位點。它與聚合酶-DNA-RNA復(fù)復(fù)合物結(jié)合,向合物結(jié)合,向3端移動,并解開端移動,并解開DNA-RNA雜交體,需雜交體,需ATP。 B. 依賴于特定序列的終止依賴于特定序列的終止 轉(zhuǎn)錄終止區(qū)有特殊結(jié)構(gòu)。終止區(qū)的上游有轉(zhuǎn)錄終止區(qū)有特殊結(jié)構(gòu)。終止區(qū)的上游有GC二重對稱區(qū),轉(zhuǎn)二重對稱區(qū),轉(zhuǎn)錄的錄的RNA容易形成多個容易形成多個“發(fā)卡發(fā)卡”結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu), 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的3端有端有p
9、olyU序列。這種特殊的二級結(jié)構(gòu)阻止了轉(zhuǎn)錄向下游繼續(xù)推進。序列。這種特殊的二級結(jié)構(gòu)阻止了轉(zhuǎn)錄向下游繼續(xù)推進。 4.3 轉(zhuǎn)錄的終止轉(zhuǎn)錄的終止第14頁/共23頁AB轉(zhuǎn)錄終止的兩種方式轉(zhuǎn)錄終止的兩種方式第15頁/共23頁 轉(zhuǎn)錄得到的只是轉(zhuǎn)錄得到的只是RNA的初級產(chǎn)物,通常要經(jīng)過加工,的初級產(chǎn)物,通常要經(jīng)過加工,才能轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓牟拍苻D(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓腞NA。tRNA 和和rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工比較簡的轉(zhuǎn)錄后加工比較簡單單. 5 RNA后的加工(后的加工( post-transcriptional processing)原核前體原核前體RNA的加工的加工第16頁/共23頁tRNA轉(zhuǎn)錄后的加工與修飾轉(zhuǎn)錄后的加工與
10、修飾 注意注意tRNA上的修飾和稀有堿基上的修飾和稀有堿基第17頁/共23頁 mRNA轉(zhuǎn)錄后的加工轉(zhuǎn)錄后的加工 原核生物的結(jié)構(gòu)基因(編碼的)是多順反子(原核生物的結(jié)構(gòu)基因(編碼的)是多順反子(poly-cistron),通常是將幾個相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因一起轉(zhuǎn)錄得到多個),通常是將幾個相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因一起轉(zhuǎn)錄得到多個mRNA。 (順反子(順反子cistron 一詞可以視作基因的同義詞)。一詞可以視作基因的同義詞)。 而真核基因是單順反子(而真核基因是單順反子(mono-cistron),其),其mRNA 的轉(zhuǎn)的轉(zhuǎn)錄比較復(fù)雜錄比較復(fù)雜, 因為真核通常只轉(zhuǎn)錄出一個結(jié)構(gòu)基因因為真核通常只轉(zhuǎn)錄出一個結(jié)構(gòu)基因,而
11、且其結(jié)構(gòu)基因而且其結(jié)構(gòu)基因通常又是斷裂基因通常又是斷裂基因, 即是由編碼的外顯子(即是由編碼的外顯子(exon)和不編碼的內(nèi)含)和不編碼的內(nèi)含子(子(intron)間隔排開組成的。因此)間隔排開組成的。因此, 轉(zhuǎn)錄得到的僅僅是轉(zhuǎn)錄得到的僅僅是mRNA的的“毛坯毛坯”,稱為核不均,稱為核不均RNA(hnRNA),要進行轉(zhuǎn)錄后的加工),要進行轉(zhuǎn)錄后的加工-在其在其5端加上鳥嘌呤端加上鳥嘌呤“帽子帽子”,3端加上端加上polyA的的“尾巴尾巴”,再切除內(nèi)含子,將外顯子拼接,才能成為一個成熟的再切除內(nèi)含子,將外顯子拼接,才能成為一個成熟的mRNA。第18頁/共23頁真核真核mRNA前體轉(zhuǎn)錄后加工前體轉(zhuǎn)
12、錄后加工(以卵清蛋白以卵清蛋白mRNA的轉(zhuǎn)錄為例的轉(zhuǎn)錄為例)外顯子外顯子內(nèi)含子內(nèi)含子53第19頁/共23頁真核生物真核生物mRNAmRNA的轉(zhuǎn)錄后加工,的轉(zhuǎn)錄后加工,包括:包括:1.1.在在55端加鳥嘌呤端加鳥嘌呤“帽帽”結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)2.2.在在33端加端加polyApolyA的的“尾尾”3.3.切除內(nèi)含子;切除內(nèi)含子;4.4.拼接外顯子。拼接外顯子。5 帽結(jié)構(gòu)帽結(jié)構(gòu)第20頁/共23頁 在原生動物四膜蟲(在原生動物四膜蟲(tetrahymena)中,)中,26S rRNA分子是分子是有一個的前體經(jīng)切除有一個的前體經(jīng)切除1個個414nt的內(nèi)含子后形成的的內(nèi)含子后形成的,在此在此過程中過程中, RNA進行了自我剪接(進行了自我剪接(s
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