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文檔簡介
1、醫學研究數據管理與統計分析Data management & analysis,1,高等課堂,搜集資料,整理與分析資料,調查(研究)項目,分析表(指標,研究目的,回答,統計分析步驟,調查研究步驟,研究設計思路與數據管理分析步驟,解釋、呈現結果,2,高等課堂,確定調查和研究的目的是選定研究指標的依據 研究指標又是研究目的的具體體現,一、明確調查和研究的目的,了解參數,用以說明總體。 研究變量間的關系,通過確立統計學聯系來 探索病因或驗證療效等。,3,高等課堂,二、確定研究對象和觀察單位,研究對象:對象來源總體是什么? 抽樣方法:如何抽樣?代表性? 觀察單位:個體?群體,4,高等課堂,三、研究設計
2、類型的選擇,根據研究目的選擇合適的設計類型: 描述疾病的或健康狀況的三間分布 探討病因 驗證預防和控制措施的效果 評價疫苗的效果 新藥上市前臨床試驗,5,高等課堂,6,高等課堂,四、確定研究項目,擬定調查表(問卷,調查和研究項目的確定:分析項目、備選項目 調查表和原始數據記錄表的設計,7,高等課堂,根據研究設計類型確定所需樣本量計算公式。 相關參數: 一類錯誤的概率:即檢驗水準,越小所需樣本含量越多,對于相同的檢驗水準,雙側檢驗比單側檢驗所需的樣本含量更大,通常取0.05。 把握度(power) 1-,一般0.8-0.9 單側檢驗還是雙側檢驗,單側檢驗所需樣本量小,雙側檢驗所需樣本量大,五、樣
3、本含量的估計,8,高等課堂,常用樣本含量的估計軟件:EpiCalc 2000,9,高等課堂,常用軟件:EPI INFO,10,高等課堂,常用軟件:OPENEPI,11,高等課堂,直接觀察法 采訪法 包括面訪、調查會及信訪、電話訪問等,六、原始資料的收集,原始資料的收集方式,12,高等課堂,七、調查和研究的質量控制,真實性(效度) 可靠性(信度,偏倚及其如何控制,如何評價,13,高等課堂,錄入前的核對 錄入計算機,建立數據庫(database) Excel、Access、EpiData、STATA、SPSS、SAS軟件等 錄入后的核對和整理 邏輯檢查、核對 排序(sorting) 建立新變量 數
4、據的編碼和轉換 缺失值的處理,八、 數據資料的整理,14,高等課堂,Dbase, FoxBase,Visual FoxPro,Lotus,數據錄入和管理軟件,15,高等課堂,用Epidata構建調查表數據庫,16,高等課堂,用Epidata錄入調查表,17,高等課堂,統計分析常用軟件,18,高等課堂,讓我們從一個簡單的調查開始,研究目的:了解本班同學年齡、性別、身高等信息。 Step1: 建立調查表 文本編輯軟件:Word,19,高等課堂,Step 2:調查表數據錄入,20,高等課堂,EpiData軟件概述,一、EpiData的設計 設計者:丹麥的Jens M、Michael Bruus和英國
5、的Mark Myatt 編程者:丹麥的Michael Bruus 開發思路和原理:基于Epi Info 6.0 二、軟件下載和登記注冊 下載地址:http:/www.epidata.dk/ download.htm 三、版本信息 EpiData 1.5(2001年2月22日);EpiData 2.1a(2002年) EpiData 3.02(2004); EpiData 3.10(NOW) 四、安裝和系統要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP/7等操作系統下運行,21,高等課堂,EpiData軟件概述,EpiData軟件安裝如同拷貝程序文檔一樣簡單。例如,它可以從U盤運行,
6、并且占用內存很小(2.5M)。 由于捐助和志愿者的工作,軟件免費發布,22,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,http:/www.epidata.dk,23,高等課堂,EpiData程序下載與安裝,數據錄入,24,高等課堂,EpiData 軟件,EpiData 軟件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 軟件優點基礎上開發研制的 Windows版軟件,25,高等課堂,EpiData 軟件,它一方面吸收了Epi Info軟件的長處,同時又極具自身特色。 與 視窗版Epi Info軟件相比,占用空間小,更加簡單易學,且界面友好,可以很方便的對數據進行儲存、核對和管理等,26,高等課堂,
7、用EpiData軟件進行數據錄入和管理,將產生三種基本的文件; 每種文件具有固定的后綴,在數據錄入和管理中發揮不同作用。 (1)調查表文件:后綴為.QES。通過建立調查表文件,系統根據特定規則自動定義數據文件的結構,包括變量名、變量類型和長度等,用于數據錄入。 (2)數據文件:后綴為.REC。數據文件包含錄入的數據信息以及已經定義好的編碼,用于數據的統計分析。 (3)核對文件:后綴為.CHK。通過建立核對文件,系統將定義數據錄入的有效性規則,EpiData Entry 的文件組成,27,高等課堂,EpiData Entry 的特點,調查表設計便捷 數據核查功能強大且實現簡便 與調查表形式一致的
8、可視數據錄入界面 數據轉換功能強大,28,高等課堂,講了半天, EpiData究竟長什么樣,29,高等課堂,請打開電腦上EpiData主程序,為何我的電腦上沒有歡迎使用EpiData,30,高等課堂,EpiData軟件的窗口介紹,31,高等課堂,編輯過程工具條,工具欄,數據表預覽,粘貼,字段編輯器,編碼編輯器,32,高等課堂,調查表文件的建立,數據文件: 原始數據 文件結構(庫結構) 字段名 字段類型 字段長度,調查表信息 數據文件,33,高等課堂,建立調查表文件,建立調查表文件是建立數據庫、實現數據錄入和管理的第一步,34,高等課堂,建立調查表文件有以下幾種方法,第一種:在菜單中,點擊 “文
9、件”(File)“生成調查表文件QES文件” 第二種:在工作欄的工作流程中,點擊“1. 打開文件”(1.Define Data)“建立新QES文件” 第三種:在按鈕欄中,點擊 ,這時窗口中會在工作區顯示一個空白的文檔,你可以在此文檔中鍵入調查表內容和框架,編輯完成后,將調查表文件保存,文件的擴展名統一為.QES,35,高等課堂,假定現有一調查表如下,如何建立.QES文件,調查表 姓名:_ 性別:(1)男 (2)女 身高:_._ CM 出生日期:_年_月_日,36,高等課堂,如果按原調查表格式直接建立數據庫,結果會怎樣,37,高等課堂,必須定義字段名和字段類型,38,高等課堂,調用字段編輯器:
10、第一種方法:直接按CTRL-Q鍵。 第二種方法:在編輯器工具條上點擊字段編輯器圖標,手工輸入或使用字段編輯器,39,高等課堂,字段類型介紹,數值型字段:#,#.# ;僅接受數字和空格,不輸按空格處理,分析時作缺失值處理,以“.”顯示。數字位數由“#”個數決定,小數位數由小數點右邊的“#”個數確定。最長可達14位,小數點按1個字符計算,40,高等課堂,文本型字段:包括三種。一種是常用的文本(或下劃線、或底線)型字段:_;該型字段由連續下劃線來定義,長度由下劃線字符個數決定,最大值為80,空白字段(字段內容空缺)時,數據管理時將按缺失值處理。另一種為大寫文本型字段,41,高等課堂,日期型字段:包括
11、兩種。一種為常用日期字段:、,分美式、英式兩種,輸入時即進行合法性檢驗;只需輸入日期,系統自動插入斜杠。另一種為自動日期型字段:、 ;儲存或修改數據時該字段自動輸入系統日期,如系統日期正確,也即當天日期,42,高等課堂,自動ID號型字段:;這是一種專用字段,用作記錄識別號,文件的第一個記錄為1,以后記錄自動賦值順次較前增加1,并自動保證編號的唯一性。輸入數據時光標跳過此字段。如需使第一個記錄號大于1,則可在“文件”菜單“選擇項”中的“高級設置”中設置。 邏輯型字段(即布爾函數型字段):;只接受Y、N、空格或回車鍵。后兩者作缺失值處理。Y、N字符輸入后即轉為大寫字母,43,高等課堂,我們按照這些
12、要求重新建立數據庫,這次應該成功了吧,先預覽一下,44,高等課堂,怎么會這樣,45,高等課堂,定義字段名(Field Names,以調查表中字段的第一個詞命名 (First word in question is field names) 使用 內的內容自動添加字段名(Automatic field names,46,高等課堂,定義字段名(Field Names,文件”(File)“選項”(Option)“生成REC文件”(Create data file) 在“如何生成字段名”(How to generate field names)中選擇字段的命名方式,47,高等課堂,更新問題為實際文件名
13、”如果未勾選,48,高等課堂,預覽顯示的并非真實的字段名,如“姓名”, 真實的字段名是Field1,49,高等課堂,50,高等課堂,按 命名規則修改調查表,然后預覽生成REC文件,51,高等課堂,別忘了修改“選項,否則會是這樣的,52,高等課堂,制作調查表文件可用EpiData編輯器進行。 也可用Word或其它文本編輯器編寫。注意,必須以純文本格式存盤,文件后綴名必須是“.qes”。 也可在其它文本編輯器編寫,再粘貼到EpiData編輯器窗口,如何編寫調查表文件,53,高等課堂,編寫調查表文件注意事項(一,編寫過程中及時保存文件,文件類型為.qes文件。 系統只會根據“特殊符號”來定義一個輸入
14、字段(包括類型和長度),并根據符號前的字符給字段命名。建議在編寫過程中利用“字段快速清單”插入“特殊符號”,即:選擇字段類型,定義好長度后,按“插入”圖標,可避免由于“特殊符號”輸入錯誤而不能產生有效的輸入字段。 調查表用中文編寫時,可用定界符(“”)將字段名定義為英文字符(英文字母或英文字母阿拉伯數字),有利于數據庫的管理和其他軟件的統計分析。注意:“”必須為半角型,而不能是全角型(“”,54,高等課堂,盡可能把字段定義數值型,有利于統計分析。如糖尿病史“dmhis”可定義為數值型字段,“1”表示“有”,“0”表示“無”。 調查表文件格式盡可能和原調查表一致,有利于直觀錄入數據。 如果用其他
15、文本編輯器編寫.qes文件,在運行EpiData后,打開該.qes文件即可編輯。 調查表文件的編寫是否符合要求,可通過“數據表預覽”來查看,編寫調查表文件注意事項(二,55,高等課堂,數據文件的產生和修改,主菜單選擇數據導入/導出菜單“根據QES文件生成REC文件” 在工作過程工具條按第二個按鈕“生成REC文件” 在編輯器菜單REC文件菜單選擇“生成REC文件,56,高等課堂,生成REC文件,57,高等課堂,58,高等課堂,請大家根據EPIDATA建立調查表庫data.qes,生成數據庫,保存為data.rec,調查表 姓名:_ 性別:(1)男 (2)女 身高:_._ CM 出生日期:_年_月
16、_日,59,高等課堂,現在我們已經有了兩個文件: *.QES 調查表文件 *.REC 數據文件 *.REC文件是根據QES文件生成的,用于數據錄入,萬一我的QES文件丟了怎么辦,60,高等課堂,數據文件結構的修改,61,高等課堂,調查表結構重新修改后怎么辦,數據庫建立后,錄入了一部分分數據,發現漏掉了一個字段,于是重新修改調查表,這里可以根據修改后的QES文件更新REC文件,62,高等課堂,我一邊QQ聊天,一邊錄入數據,萬一錄錯了,軟件會通知我嗎,嗨!有第3種人嗎,63,高等課堂,核對文件的建立,核對文件:CHECK文件或 .CHK文件,范圍/合法值(Range/Legal) 跳轉(Jumps
17、) 必須輸入(MustEnter) 重復輸入(Repeat,64,高等課堂,65,高等課堂,光標懸停,會提示你命令格式,66,高等課堂,錄入錯誤時,軟件會彈出警告,67,高等課堂,試試,如果將1改為20會怎樣?改為15會怎樣,關鍵字段的定義,以編號code2為例,這個編號具有唯一性,為避免重復輸入,可在CHK文件中定義: code2 KEY UNIQUE 1 MUSTENTER END,68,高等課堂,練習,請大家根據下列調查表內容,利用EPIDATA建立調查表數據庫,保存為data1.qes,并生成data1.rec用于錄入資料,69,高等課堂,調查表 1.地區號: N J 2.調查表編號:
18、 3. 錄入ID號: 4.姓名:_ 5.性別:(1)男 (2)女 6.你吸煙嗎? (1)否跳問7 (2)是 續問6.1 6.1 你多在年齡開始吸煙的? _ 歲 6.2 平均每天吸煙支數? _ 支 7.身高:_._ CM 8.血壓值(收縮壓/舒張壓): _ /_mmHg 9.出生日期:_月_日_年 10. 你是否具有下列癥狀?如有請在相應癥狀前打勾。 咳嗽 咳痰 發熱 胸痛 呼吸困難 咯血 11.調查表錄入日期: _月_日_年,錄入時自動編碼,70,高等課堂,請大家根據data1.rec數據庫,建立CHK文件,保存為data1.chk 要求: (1)地區號自動錄入 (2)編號、姓名必須錄入 (3
19、)性別只能填1或2 (4)是否吸煙只能填1、2或9 (5)是否吸煙能夠實現跳轉 (6)平均每天吸煙支數的范圍在1-40之間或填99 并請嘗試錄入35份調查表,存盤,71,高等課堂,記錄刪除,此處僅是在記錄加上刪除標記, 徹底刪除需至“工具”清理REC文件,點擊,72,高等課堂,如果研究對象是(1)男性,而我卻錄成了(2)女性,軟件好象不會彈出警告嘛,73,高等課堂,雙錄入核對 double entry,為了確保錄入質量,可以采用雙人錄入法進行核對。 首先利用工具-復制REC文件結構,復制已建立好的數據庫(包括CHK文件),另存為一新庫,但已錄入的數據不會被復制,74,高等課堂,雙錄入核對 do
20、uble entry,如需要,可不復制字符型變量 因為家庭住址、工作單位等很少有人愿意錄入兩次,75,高等課堂,兩次錄入的一致性檢驗,雙軌錄入完成后可進行一致檢驗 比較兩次錄入不同的地方 注意選擇兩數據庫中的匹配字段用于比較,76,高等課堂,77,高等課堂,78,高等課堂,調查表錄入兩次,比較后發現錯誤再修改,好象太麻煩! 有沒有邊錄入邊比較的方法,79,高等課堂,雙錄入實時校驗,先點擊工具-準備雙錄入實時校驗,80,高等課堂,雙錄入實時校驗,指定第1 次已錄入的REC文件 創建1新的REC文件,用于雙錄入,81,高等課堂,雙錄入實時校驗,應注意錄入調查表的順序,82,高等課堂,顯示數據,瀏覽數據庫,83,高等課堂,其它一些常用功能,打印調查表
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