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文檔簡介
第十六章蘇州大學衛生統計學教研室隨訪資料的分析第16章生存分析前言為什么要引入生存分析方法?臨床上有許多隨訪資料,如有兩組肺癌病人,病情、性別、年齡等因素齊同,一組并病人用單純手術治療,另一組用手術+放療,隨訪5年,怎樣綜合評定治療效果?第16章生存分析表16-1甲(手術組)、乙(手術+放療)兩組治療方案肺癌病人臨床隨訪結果第16章生存分析什么是生存時間資料?所以疾病預后的好壞,出現這種結局所需要的時間。慢性疾病,如惡性腫瘤、糖尿病、高血壓、心血管等疾病療效的分析,單純的治愈率不能敏感地反映出治療的效果。有一類資料含有結局和時間兩方面的信息,它源于壽命統計,通過隨訪收集,特稱為生存時間資料(survivaldata)。生存時間資料的分析方法簡稱為生存分析。第16章生存分析某臨床醫生將22例肺癌患者隨機分成兩組,分別采用化療和放化療聯合治療,從緩解出院日開始隨訪,隨訪時間(月)如下(帶“+”號的數據表示患者至少活了多少個月)。化療組1,2,3,5,6,9+,11,13,16,26,37+放化療聯合組10,11+,14,18,22,22,26,32,38,40+,42+5第16章生存分析共同特點①蘊涵有結局和時間兩個方面的信息;②結局為兩分類互斥事件;③一般是通過隨訪收集得到,隨訪觀察往往是從某統一時間點(如確診、入院或實施手術等某種處理措施后)開始,觀察到某規定時間點截止;④常因失訪等原因造成某些研究對象的生存時間數據不完整,分布類型復雜。6第16章生存分析第一節生存分析中基本概念2.起始事件:反映研究對象生存過程起始特征的事件如疾病“確診”、“開始治療”、“接觸毒物”等。3.終點事件(死亡事件、失效事件):反映研究對象生存過程特定結局的事件,如“死亡”、“痊愈”、“出現毒性反應”。1.生存時間(失效時間):起始事件與終點事件的時間間隔t。時間的尺度可以是分、小時、天、月、年等。、基本概念第16章生存分析截尾值(censoredvalue)(終檢)隨訪過程中,由于某種原因未能觀察到所期望的事件發生,這些個體所提供的數據稱截尾值或刪失值。刪失原因:
1.隨訪對象失訪、死于其他疾病
2.隨訪結束時對象仍存活
3.治療措施改變4.生存資料的類型完全數據:是指在整個隨訪研究期間能夠觀察到終點事件,即能夠觀察到從起點到終點的生存時間第16章生存分析5.1觀察對象同時進入研究,即研究起始時間相同,這類研究常見于:隊列研究、動物實驗等。5.隨訪研究的模式5.2觀察對象逐個進入研究,即研究起始時間不同,多見于臨床隨訪研究。
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起始事件
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╳
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終點事件
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失
訪
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╳
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╳
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截
尾
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研究時間
研究時間
研究起點
研究終點
研究起點
研究終點
圖15-1隊列研究示意
圖15-2
臨床隨訪研究示意
第16章生存分析死亡率:死亡概率:q=年內死亡人數/年初觀察人數生存概率:P=該年活滿一年的人數/年初觀察人數=1-q第16章生存分析6.生存函數(survivalfunction)生存函數又稱累積生存概率,記為S(tk),是病人活到t時刻仍然存活的概率常用S(tk)=P(Ttk)。實際應用中計算:tk時刻仍然存活的例數/觀察總例數。其中T為病人存活的時間。但如果含有截尾數據,分母分段校正。故采用概率乘法原理計算生存率,生存概率用p表示,生存率估計的應用公式為:
S(tk)=P(T
tk)=p1p2…pk
S(0)=1S()=0第16章生存分析生存曲線:各時點的累積生存概率連接在一起的曲線圖。半數生存期
中位生存期(mediansurvivaltime):即壽命表中的中位數,表示有50%的個體存活的時間。第16章生存分析第16章生存分析7.死亡函數:表示一個觀察對象從開始觀察到時間t為止的死亡概率,隨時間上升的函數F(t,X)=P(Tt,X),t+時,F(t,X)=1
生存函數與死亡函數的關系:S(t,X)=1-F(t,X)
8.死亡密度函數:所有觀察對象在t時刻的瞬時死亡率
第16章生存分析9.風險函數:生存時間達到t的一群觀察對象在t+?t區間內死亡的概率極限。第16章生存分析例16-1現有40個肝癌病人的隨訪資料,見表16-2,試估計生存函數、死亡密度函數和風險函數。表16-240個肝癌病人的隨訪資料第16章生存分析二、生存分析的基本內容
2.生存過程的比較1.生存過程的描述3.影響因素的分析生存分析已形成了一套較為完善的理論體系,可概括如下:第16章生存分析三、生存分析的基本方法研究目的非(半)參數方法參數方法生存過程的描述乘積—極限法(Kaplan-Meier)指數分布壽命表法Weibull分布Turnbull估計(危險率估計)Gamma分布Logistic分布對數正態分布第16章生存分析研究目的非(半)參數方法參數方法生存過程的比較對數秩(log-rank)檢驗指數分布分層對數秩檢驗Weibull分布Gehan檢驗Gamma分布廣義Wilcoxon檢驗Logistic分布Mantel-Haenszel檢驗對數正態分布第16章生存分析研究目的非(半)參數方法參數方法影響因素的分析Cox比例風險模型指數分布非比例風險模型Weibull分布Logistic回歸模型第16章生存分析第二節生存率的估計一、小樣本生存率的乘積極限法(Kaplan-Meier)例16-2在兒童急性淋巴細胞白血病(ALL)的生存研究中,有21例高危兒童ALL的臨床隨訪資料。生存時間定義為確診日期到病人死亡日期的時間跨度,得到的生存時間(月),見表16-3第(1)欄,其中有“+”者是截尾數據,表示病人仍生存或失訪。試計算其生存率與標準誤。第16章生存分析表16-3高危ALL兒童生存率計算方法
第16章生存分析生存率的標準誤計算表示把小于和等于t時刻的各種非截尾值所對應的全部加起來(式15-6)(式15-7)第16章生存分析總體生存率的可信區間計算公式:第五個月總體生存率的95%CI:(1)正態分布法第16章生存分析(2)尾部總體率的區間估計G(T>t)的漸近標準誤為:生存率的對數變換公式G(T>t)的95%CI:總體生存率95%CI:第16章生存分析生存曲線高危兒童ALL病人生存曲線
0.000.250.500.751.00month020406080100120140CensoredObservations第16章生存分析中位生存時間的計算采用內插法:t=15.5(月)第16章生存分析二、大樣本生存資料的壽命表估計法
在樣本較大時,隨訪病例的生存時間常可按年、月或日進行分組,得出具有若干時間段的頻數表。例16-4某研究收集了1980-1993年中山市肺癌新發患者2238例,經隨訪將有關資料整理后列于表16-5,其中生存時間是以月計算的,試計算其生存率及其標準誤。第16章生存分析表16-52238例肺癌病人生存率及其標準誤計算29第16章生存分析
圖16-42238例肺癌病人生存率曲線30第16章生存分析第三節生存曲線的比較
兩組及多組生存曲線的比較一般用log-rank檢驗。log-rank檢驗是以生存時間的對數為基礎推導出來的,其基本思想是實際死亡數與期望死亡數之間的比較。v=組數-131第16章生存分析
例根據例16-2和例16-3的隨訪資料,問高危兒童和標危ALL兒童的生存率有無差別?第16章生存分析注意事項對于大樣本資料生存率比較,可以將其整理成頻數表形式,其基本原理與上述方法相同。用log-rank檢驗對樣本生存率進行比較時,要求兩組生存曲線不能交叉,生存曲線的交叉提示有某種混雜因子存在。此時應采用分層的方法或多因素的方法來校正混雜因素。另外,當假設檢驗推斷有差別時,可以通過生存曲線、半數生存期及相對危險度等指標來評價其效果。第16章生存分析對于生存分析數據,國外學者提出針對具體問題提出了許多處理方法,包括統計描述和統計推斷在實踐中,人們發現許多生存分析資料,尤其是醫學隨訪資料有其特殊性:生存時間分布復雜;存在截尾數據;有時需要將多個因素同時考慮1972年英國統計學家Cox提出了比例風險模型(Cox’sproportionalhazardregressionmodel),解決了上述的問題如何進行生存時間的影響因素分析?第四節Cox比例風險模型第16章生存分析Cox模型的基本形式生存分析的目的在于研究因素X與觀察結果之間的關系;當累積生存率或稱生存函數S(t,X)受到因素的影響時,傳統的方法是考慮回歸分析,即各因素對S(t,X)的影響Cox模型不直接考察生存函數S(t,X)與因素之間的關系,而用風險率函數h(t,X)作為應變量第16章生存分析Cox模型的表達形式及含義中,右側可以分為兩部分:h0(t)沒有明確定義,其分布與形狀無明確的假定,這是非參數部分;另一部分是參數部分,其參數可以通過樣本的實際觀察值來估計。由于h0(t)分布類型未知,將它移到等式左邊,并取自然對數,得到:由式中可以看到,
j
表示當協變量Xj每改變一個單位時,所引起的相對危險度的自然對數值的改變。t時刻個體暴露于危險因素與非(低)暴露狀態下發病的風險比第16章生存分析參數估計與假設檢驗Cox模型中的參數是在偏似然函數(Partiallikelihoodfunction)的基礎上采用最大似然法估計的,在得到參數后,還需對參數進行假設檢驗。1.似然比檢驗2.得分檢驗3.Wald檢驗第16章生存分析例16-5為了探索影響兒童急性淋巴細胞白血病(ALL)長期生存的預后因素。采用回顧性隊列研究,對1990年1月1日至1995年12月30日期間在蘇州大學附屬兒童醫院血液科就診,治療時間大于2周,年齡<15周歲獲得有效隨訪的118例ALL初診患兒進行生存分析。通過設計調查表調查:人口學特征資料如性別、年齡、家庭年收入;臨床資料包括ALL類型、初診白細胞數等,可通過摘錄病史獲得;而調查對象的存活狀態及死亡時間通過隨訪的方式獲得,本研究通過信訪、電話和上門采訪相結合的方式,以提高應答率(92%)。表16-6顯示了部分調查對象的關鍵變量調查信息。本研究的起始時間為ALL的確診日期,終點日期為病人的死亡日期;如果研究對象仍存活,研究的截尾日期設定為2000年6月30日。38第16章生存分析表16-7變量賦值表39第16章生存分析擬合Cox模型的方法和策略一般先做
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