分子生態(tài)學名詞解釋1.allele等位基因一個位點的序列變異。2.Effectivepopulationsize(Ne)有效種群大小在一個具有相等性比、隨機交配的理想種群中表現(xiàn)出與特定統(tǒng)計（全部成體數(shù)目）規(guī)模相對應的真實的種群雜合性隨時間喪失的速率相同的個體數(shù)。3.F-statisticsF統(tǒng)計檢驗用于評估個體間、亞種群間和整個種群間雜合性的分布的統(tǒng)計方法，被廣泛應用于定量亞種群的遺傳分化。4.Geneticload遺傳負荷相對于理論最佳值來說降低了的基因型適合度。5.Hardy-Weibergequilibrium哈溫平衡當所有等位基因頻率是已知的時候，在一個大的隨機交配種群中的純合子和雜合子的預期比例。假設沒有遷移、突變或選擇作用，哈溫平衡定律則認為等位基因頻率從一個世代到下一個世代應該保持不變。6.Bottleneckeffect瓶頸效應種群的規(guī)模大為縮小，隨后常常有一個（種群的）恢復。7.7.Selectionsweep選擇掃蕩。課件：Occurrenceofabeneficialmutation，Onlyindividualscarryingthemutationreproduce，‘Populationbottleneck’，Mainlyaffectslinkedloci。8.IAM無限等位基因模型其中突變不是以可預料的方式一個接一個發(fā)生，而大多數(shù)突變是像產(chǎn)生SNP（單核苷酸多態(tài)性）那樣出現(xiàn)的。9.Linkagedisequilibrium(LD)連鎖不平衡。Linkageequilibrium連鎖平衡：由重組促成的情形，其中遺傳位點在繁殖期相互獨立分離。當兩個位點上的等位基因一起分離時，如他們在同一個染色體上的物理位置太接近時，則發(fā)生不平衡。連鎖平衡：?不同的各在人群中以一定的出現(xiàn)。在某一群體中，不同座位上某兩個出現(xiàn)在同一條染色體上的高于預期的隨機頻率的現(xiàn)象，稱連鎖不平衡(linkagedisequilibrium)。由于HLA不同的某些經(jīng)常連鎖在一起遺傳，而連鎖的基因并非完全隨機地組成單體型，有些基因總是較多地在一起出現(xiàn)，致使某些單體型在群體中呈現(xiàn)較高的，從而引起連鎖不平衡。10.Metapopulation復合種群種群再分為多個同類群，至少其中的一些偶爾滅絕，隨后通過從其他同類群遷入再11.Microsatellite微衛(wèi)星帶有單序列（通常為2-，3-或4-核苷酸）重復多次的遺傳位點。12.MtDNA線粒體DNA存在于線粒體中的環(huán)狀染色體。13.Non-synomousmutation非同義突變由一個三聯(lián)密碼變化使特定氨基酸改變的突變。14.PCR聚合酶鏈式反應用寡核苷酸引物和耐熱的DNA聚合酶擴增大量DNA序列的一種方法。15.SNP單核苷酸多態(tài)性在DNA序列中一個特殊位點上出現(xiàn)不同核苷酸堿基的等位基因。16.RFLP限制性片段長度多態(tài)性用限制性酶和凝膠電泳鑒定DNA序列多態(tài)性的方法。17.Transition轉換一個嘌呤核苷酸被另一個嘌呤核苷酸替代，或一個嘧啶核苷酸被另一個嘧啶核苷18.Transversion顛換一個嘌呤核苷酸被另一個嘧啶核苷酸取代或相反過程的突變。19.19.Molecularecology分子生態(tài)學課件:分子生物學是應用分子生物學的原理和方法來研究生命系統(tǒng)與環(huán)境系統(tǒng)相互作用的生態(tài)機理及其分子機制的科學。它是生態(tài)學與分子生物學相互滲透而形成的一門新興交叉學科,其研究內(nèi)容包括種群在分子水平的遺傳多樣性及遺傳結構，生物器官變異的分子機制、生物體內(nèi)有機大分子對環(huán)境因子變化的響應、生物大分子結構、功能演變與環(huán)境長期變化的關系以及其它生命層次生態(tài)現(xiàn)象的分子機理等。分子生態(tài)學的理論和方法對傳統(tǒng)學科有巨大的促進作用，同時，對解決諸如轉基因、克隆技術應用中的生態(tài)安全、環(huán)境與人類健康等重大問題將產(chǎn)生深刻的影響。20.20.Functionalecologicalandevolutionarygenomics(FEEG)生態(tài)和進化基因組學21.PhylogeographicPhylogeographiy親緣地理學研究調(diào)控系譜世系的地理分布的原理和過程的科學。22.Monophyly單系類群中的所有個體是從同一個祖先來的，并且從這個祖先來的所有存活的后代都真核生物的結構基因間的非編碼DNA序列。內(nèi)含子被轉錄但它們的RNA拷貝在功24.Introgression漸滲雜交等位基因從一個種群或物種向另一個種群或者物種的擴散，而產(chǎn)生像種群間或物種間的近交或雜交這樣的結果。25.25.Geneticdrift遺傳漂變《生物多樣性導論》：在有性生殖的群體中，每個世代的基因庫是對上一個世代基因庫的隨機抽樣和復制。在世代交替過程中，不同的等位基因遺傳到下一代的偶然性對種群遺傳結構有可能產(chǎn)生顯著影響。Wright把這種由于配子產(chǎn)生及結合過程中的隨機性導致的基因頻率的波動稱為遺傳漂變(geneticdrift)，也稱隨機漂變、遺傳偏離或Wright效應。26.Haplotype單（倍體）型源于同一染色體或染色體單倍體組的一套等位基因。27.ESU(EvolutionarySignificantUnit)進化顯著單元分類學上對保護重要類群的一種嘗試性定義。28.Metagenomics宏基因組學百度：宏基因組學（Metagenomics）又叫微生物環(huán)境基因組學、元基因組學。它通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA,構建宏基因組文庫，利用基因組學的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。它是在微生物基因組學的基礎上發(fā)展起來的一種研究微生物多樣性、開發(fā)新的生理活性物質(zhì)（或獲得新基因）的新理念metagenomic）進行克隆，并通過構建宏基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質(zhì)；或者根據(jù)rDNA數(shù)據(jù)庫設計引物，通過系統(tǒng)學分析獲得該環(huán)境中微生物的遺傳多樣性和分子生態(tài)學信息。29.CpDNA葉綠體DNA存在于葉綠體內(nèi)的環(huán)狀染色體。30.Heterosis雜種優(yōu)勢，雜合體優(yōu)勢雜合子比純合子有較高的適合度的情形。31.Recombination重組二倍體生物中減數(shù)分裂期間同源（配對）染色體間的DNA交換。32.rRNA核糖體RNA核糖體中的RNA分子…………33.SNP單核苷酸多態(tài)性在DNA序列中一個特殊位點上出現(xiàn)不同核苷酸堿基的等位基因。34.Sympatricspeciation同域發(fā)生（物種形成）生活在同一地區(qū)的個體中形成的新物種。35.Vicariance地理隔離種群或物種被環(huán)境事件，如山脈形成造成的物理隔離注：描黃部分為術語表中無相關解釋的，僅供參考。分子生態(tài)學簡答題教材的定義:分子生物學是應用分子生物學的原理和方法來研究生命系統(tǒng)與環(huán)境系統(tǒng)相互作用的生態(tài)機理及其分子機制的科學。它是生態(tài)學與分子生物學相互滲透而形成的一研究內(nèi)容：包括種群在分子水平的遺傳多樣性及遺傳結構，生物器官變異的分子機制、生物體內(nèi)有機大分子對環(huán)境因子變化的響應、生物大分子結構、功能演變與環(huán)境長期變化的關系以及其它生命層次生態(tài)現(xiàn)象的分子機理等。分子生態(tài)學的理論和方法對傳統(tǒng)學科有巨大的促進作用，同時，對解決諸如轉基因、克隆技術應用中的生態(tài)安全、環(huán)境與人類健康等重大問題將產(chǎn)生深刻的影響。2.什么是宏基因組學，其主要研究過程如何？宏基因組學（Metagenomics）又叫微生物環(huán)境基因組學、元基因組學。它通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA,構建宏基因組文庫，利用基因組學的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。宏基因組學的研究過程：構建宏基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質(zhì)；或者根據(jù)rDNA數(shù)據(jù)庫設計引物，通過系統(tǒng)學分析獲得該環(huán)境中微生物的遺傳多樣性和分子生態(tài)學信息。3.什么是生態(tài)和進化基因組學，其主要研究內(nèi)容如何？4.什么是親緣地理學，其研究內(nèi)容是什么？研究調(diào)控系譜世系的地理分布的原理和過程的科學。5.什么是數(shù)量性狀？數(shù)量性狀有那些類型？數(shù)量性狀又稱為適應性性狀，通常由互相影響的多個基因控制，并會明顯受到環(huán)境的數(shù)量性狀的類型：連續(xù)型、閾值型、間斷型（或離散型）連續(xù)型：數(shù)量性狀的表現(xiàn)為連續(xù)分布，群體中個體數(shù)足夠多時，連續(xù)型數(shù)量性狀基本符合正態(tài)分布，如：身高、體重、奶牛產(chǎn)奶量等。閾值型數(shù)量性狀：此種數(shù)量性狀的表現(xiàn)會受到潛在風險因素的影響，具有最低或最高閾值，例如：生物的性成熟年齡，疾病的易感率等。間斷型數(shù)量性狀：只能用離散的數(shù)值或數(shù)組表示其表現(xiàn)型的數(shù)量性狀，如動物每胎產(chǎn)仔個數(shù)、果蠅足上的剛毛數(shù)等。6.影響種群等位基因頻率變化的進化過程有哪些？種群進化的主要動力有：突變、遺傳漂變、選擇、基因的遷移（基因流動）。突變：生物核酸序列上堿基種類或數(shù)目發(fā)生改變，導致新等位基因產(chǎn)生或原有等位基息在通過配子傳遞給子代時會由于這種不確定性而丟失，導致部分等位基因在整個種群的下一代中頻率降低甚至消失。遺傳漂變現(xiàn)象在小種群中表現(xiàn)尤其明顯。不能使生物較好地適應生存環(huán)境，自然選擇就會逐步淘汰這些等位基因。基因流動：種群內(nèi)個體在不同種群之間進行遷移時，會造成不同種群之間等位基因的混合。整體而言，大規(guī)模的種群之間個體遷移能夠調(diào)和等位基因頻率分布的不均衡現(xiàn)象，有利于提高種群等位基因多樣性。AselectivesweepisthereductionoreliminationofvariationamongthenucleotidesinneighboringDNAofamutationastheresultofrecentandstrongpositivenaturalselection.Aselectivesweepcanoccurwhenanewmutationoccursthatincreasesthefitnessofthecarrierrelativetoothermembersofthepopulation.Naturalselectionwillfavourindividualsthathaveahigherfitnessandwithtimethenewlymutatedvariant(allele)willincreaseinfrequencyrelativetootheralleles.Asitsprevalenceincreases,neutralandnearlyneutralgeneticvariationlinkedtothenewmutationwillalsobecomemoreprevalent.Thisphenomenoniscalledgenetichitchhiking.Astrongselectivesweepresultsinaregionofthegenomewherethepositivelyselectedhaplotype(themutatedalleleanditsneighbours)isessentiallytheonlyonethatexistsinthepopulation,resultinginalargereductionofthetotalgeneticvariationinthatchromosomeregion.選擇掃蕩或選擇性清除：種群中產(chǎn)生了能夠提高個體適合度的有利變異后，該有利變異以及與之連鎖的中性和近中性變異的等位基因頻率逐漸提高，從而導致其他等位基因頻率的降低乃至喪失，最終造成種群遺傳多樣性整體顯著降低的現(xiàn)象。當種群中產(chǎn)生了可提高個體適合度的新變異（即有利變異）時，選擇性掃蕩就可能發(fā)生。攜帶了這種有利變異的個體在自然選擇中更具優(yōu)勢，擁有更高繁殖成功率，因此隨著時間推移，該有利變異在同位點等位基因中的頻率逐漸提高，并且與其可連鎖遺傳的其他中性和近中性等位基因頻率也會相應提高。強烈的選擇性掃蕩作用會導致基因組整體遺傳多樣性的大幅降低乃至喪失，因為它往往會最終導致種群中只剩下具有少數(shù)幾種有利突變8.什么是瓶頸效應？產(chǎn)生瓶頸效應的原因有哪些？規(guī)模較大、具有高度遺傳多樣性的種群，由于干擾等因素導致種群個體數(shù)量急劇減少后，雖然個體數(shù)目可以在后來逐漸恢復至原來的水平，但由于大量個體喪失而同時導致的種群遺傳多樣性的損失卻再也無法恢復。導致瓶頸效應產(chǎn)生的原因：破壞性自然災害、傳染病、大規(guī)模捕殺或采集、棲息地的破壞等均可造成種群數(shù)量急劇減少，從而導致瓶頸效應。FST是用于衡量種群分化程度的F-統(tǒng)計方法所用的統(tǒng)計量之一，定義為：T一個大種群內(nèi)部各個亞種群之間的分化程度。若FST=0，則有HS=HT，原種群無分化現(xiàn)象；若FST→1，則有HS→0，表示亞種群雜合度極低，原種群已發(fā)生高度分化。10.舉例說明常用的分子標記及其在分子生態(tài)學研究中的應用。RFLP(Restrictionfragmentlengthpolymorphism)限制性片段長度多態(tài)性SSLP(Simplesequencelengthpolymorphism)簡單序列長度多態(tài)性AFLP(Amplifiedfragmentlengthpolymorphism)擴增片段長度多態(tài)性RAPD(RandomamplificationofpolymorphicDNA)隨機擴增的多態(tài)性DNAVNTR(Variablenumbertandemrepeat)可變數(shù)目串聯(lián)重復序列Microsatellitepolymorphism,SSR(Simplesequencerepeat)簡單重復序列多態(tài)性（微衛(wèi)星）SNP(Singlenucleotidepolymorphism)簡單核苷酸多態(tài)性STR(Shorttandemrepeat)短串聯(lián)重復序列SFP(Singlefeaturepolymorphism)單一特征多態(tài)性DArT(DiversityArraysTechnology)多樣性陣列技術RADmarkers(RestrictionsiteassociatedDNAmarkers)與DNA相關的限制性位點分子標記分子標記的應用：研究動植物交配機制、遺傳漂變、親緣地理學、種群生態(tài)學、保護生物學、宏基因組學研究（例如微生物群落組成與功能的研究）等。普遍性、穩(wěn)定性、高度多態(tài)性、可遺傳性、可區(qū)分由于遺傳和生存環(huán)境導致的相似性（區(qū)）；對于絕大多數(shù)種類難以進行培養(yǎng)的微生物，可利用分子標記，直接建立環(huán)境樣品中的微生物宏基因組文庫，以便研究環(huán)境中微生物群落的組成、結構與功能。此外，分子標記還是基因組學分析的重要工具。顯。補充：群體很大時，數(shù)量性狀的表型分布規(guī)律基本為正態(tài)的。基因型與表性關系涉及等位基因位點數(shù)環(huán)境效應描述參數(shù)舉例連續(xù)或離散較多通常明顯均值、方差、遺傳生長率、身高、繁殖適合度定義：生物核酸序列上核苷酸種類的改變或少數(shù)幾個核苷酸的插入或缺失現(xiàn)象。按突變發(fā)生機制，可以分為堿基替換(Substitution)、插入與刪除(Indels)堿基替換：又稱錯誤配對。分為轉換（一種嘌呤替換為另一種嘌呤，或一種嘧啶替換為另一種嘧啶）和顛換（嘌呤和嘧啶之間的替換）替換不改變核苷酸數(shù)目，可能導致對應密碼子和氨基酸的改變。按突變結果，可以分為：同義突變（或沉默突變）、錯義突變（對應氨基酸改變）、無義突變（對應的密碼子變?yōu)榻K止子，使轉錄停止）。插入與刪除：即在DNA新鏈合成時，由于復制錯誤，在新鏈中添加或遺漏了若干個核苷酸。這將導致新鏈核苷酸數(shù)目改變，造成密碼子讀取順序隨之發(fā)生變化，又稱為移碼突按突變發(fā)生場所，亦可分為體細胞突變與生殖細胞突變。分子生態(tài)學論述題回答參考思路1.舉例說明分子生態(tài)學在解決經(jīng)典生態(tài)學問題中的優(yōu)勢和局限是什么？經(jīng)典生態(tài)學的研究層次：個體、種群、群落、生態(tài)系統(tǒng)。個體生態(tài)學：個體的形態(tài)結構、生理功能、生態(tài)習性多樣性及分布；種群生態(tài)學：種群組成與結構、種群動態(tài)（出生與死亡、遷移）、種群行為（交配機制、種間關系等）；生態(tài)系統(tǒng)生態(tài)學：生態(tài)系統(tǒng)的組成與結構（生產(chǎn)者、消費者、分解者）、生態(tài)過程（物質(zhì)循環(huán)、能量流動、信息傳遞）※分子生態(tài)學的直接研究對象是生物大分子（如核酸序列、蛋白質(zhì)）。優(yōu)勢：從分子生態(tài)學的主要研究手段方面考慮，分子生態(tài)學的最大特點是應用分子生物學原理和技術手段，上述研究方向，哪些可以應用局限性：起步相對較晚，缺乏原始數(shù)據(jù)（沒有建立完善的數(shù)據(jù)庫），因此進行基礎性研究仍存在一定難度。2.舉例說明分子生態(tài)學方法在微生物學中的應用。（1）宏基因組學：提取環(huán)境樣品中的全部微生物基