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文檔簡介

醫學文獻檢索前景第一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日內容提要1.搜索引擎(1)搜索引擎(2)醫學搜索引擎(3)BIOME系列搜索引擎概況(4)瑞士網上健康基金會及其搜索引擎第二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日2.主要基礎醫學網絡資源3.主要臨床醫學網絡資源4.循證醫學信息資源5.生物信息數據庫6.網上免費信息資源內容提要第三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日教學基本要求掌握主要網絡搜索引擎及各類網絡信息資源的使用方法。熟悉主要的基礎醫學和臨床醫學網絡信息資源的檢索方法和結果處理,熟悉生物信息數據庫的使用方法。了解搜索引擎的分類和原理以及發展趨勢,了解循證醫學網絡資源及使用方法。第四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第一節搜索引擎一、搜索引擎1.搜索引擎定義搜索引擎又稱檢索引擎、查詢引擎,其英文譯名為SearchEngine,廣義上是指一種基于Internet上的信息查詢系統,包括信息存取、信息組織和信息檢索;狹義上是指一種為搜索Internet上的網頁而設計的檢索軟件(系統)。搜索引擎實際上為專用的Web服務器,它利用網絡自動快速索引技術、動態緩存技術、分布計算技術、內容評價技術等多種技術手段,能夠不斷地適應快速增長的用戶需求,對互聯網各種資源進行有效地組織、標引,并為檢索者提供檢索。第五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日2.搜索引分類(按工作方式)搜索引擎全文搜索引擎(FullTextSearchEngine)目錄索引類搜索引擎(SearchIndex/Directory)元搜索引擎(MetaSearchEngine)第一節搜索引擎第六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日3.搜索引擎工作原理用戶搜索數據從互聯網上抓取網頁數據庫建立索引數據庫Web服務器查找數據和關鍵字反饋用戶結果第一節搜索引擎第七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日4.搜索引擎發展趨勢著力提高信息查詢結果的精度,提高檢索的有效性基于智能代理的信息過濾和個性化服務采用分布式體系結構提高系統規模和性能重視交叉語言搜索的研究和開發學術研究第一節搜索引擎第八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日5.通用搜索引擎的使用方法在搜索引擎中keyword(關鍵詞)至關重要,無論每一個搜索引擎的制作過程還是搜索過程都離不開keyword,所以在進行搜索之前,選對、選準keyword至關重要。使用搜索引擎的分類索引,只要找準類別后,一層一層打開即可。第一節搜索引擎第九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(1)全文搜索引擎(以google為例)關鍵詞輸入框:多個詞中間加空格表示“and”,“+”表示”or”,“-”表示“not”。第一節搜索引擎第十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(2)分類目錄式搜索引擎(以DMOZ為例)根據檢索需求,按照分類目錄導航,層層點擊,直到找到所需信息。也可以在目錄查詢輸入框中鍵入關鍵詞條,進行查詢。第一節搜索引擎第十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日分類目錄導航區分類詞條查詢區第一節搜索引擎第十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(3)元搜索引擎(以BBMAO為例)元搜索引擎在接受用戶查詢請求時,同時在其他多個引擎上進行搜索,并將結果返回給用戶。在搜索結果排列方面,有的直接按來源引擎排列搜索結果,有的則按自定的規則將結果重新排列組合。第一節搜索引擎第十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第一節搜索引擎第十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日二、醫學搜索引擎1.MedicalMatrixMedicalMatrix全稱是“MedicalMartrix-Ranked,peer-Reciewed,Annotated,UpdatedClinicalMedicalResources”(經過分級和專家評價、由美國醫學信息學會主辦,其收集的內容專業、全面,是較重要的醫學專業搜索引擎,提供了關鍵詞搜索和分類目錄,非常適合臨床醫師使用。第一節搜索引擎第十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日MedicalMatrix主頁第一節搜索引擎第十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(1)檢索方法①簡單檢索在輸入框中輸入關鍵詞,然后選擇關鍵詞匹配方式和限定檢索范圍,點擊“Search”開始檢索,即可獲得相應的信息。匹配方式有ExactPhrase(精確詞組或完整句子)、AllWords(全部單詞)和AnyWords(含有任何一個或多個單詞)。通過檢索范圍下拉菜單可以選擇下面資源的全部(EntireSite)或某一部分。第一節搜索引擎第十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日關鍵詞輸入框關鍵詞匹配方式檢索范圍限定第一節搜索引擎第十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日②高級檢索點擊首頁的AdancedSearchingOptions可進入高級檢索界面,高級檢索提供了比簡單檢索更完善詳盡的檢索功能,在高級檢索中除簡單檢索的匹配方式外還增加了“Alsosearchforsynonymsofsearchterm”(同時檢索檢索詞的同義詞,即支持模糊查詢)。檢索范圍比簡單檢索更加完善,并可以對資源的類型或性質進行全部選擇和部分選擇(可多選)。第一節搜索引擎第十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第一節搜索引擎第二十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(2)分類檢索分類目錄是其主要特色,按各種醫學領域分為Specialties(專業)、Diseases(疾病種類)、ClinicalPractice(臨床應用)、literature(文獻)、Education(教育)、HealthcareandProfessionals(健康和職業)、MedicalComputing,InternetandTechnology(醫學和計算機)、Marketplace(市場)等8大類。每一大類下再根據內容的性質分為若干亞類,并按英文字順列。第一節搜索引擎第二十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日分類目錄第一節搜索引擎第二十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(3)檢索結果首先是網站在檢索結果中的序號,序號后面的黑體字為資源名稱,可以通過點擊它進網站,下面的紅星代表該網站的質量級別,級別后面是網站介紹和點評,“(……)”中分別是該網站中與查詢最相關資源的鏈接點和該網站在MedicalMatrix資源數據庫中的詳細著錄信息。第一節搜索引擎第二十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第一節搜索引擎第二十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日2.MedscapeMedscape是最早的優秀的醫學專業門戶之一(2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第4),目前是WebMD的一部分。主要為臨床醫生和其它醫學工作者提供高質量的及時的專業醫學信息。第一節搜索引擎第二十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日資源分類主頁關鍵詞輸入框數據庫選擇第一節搜索引擎第二十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日3.SCIRUS()

Scirus是目前互聯網上最全面、綜合性最強的科技文獻門戶網站之一,由Elsevier科學出版社開發。Scirus除收錄大量(超過3億)科技相關網頁(其中包括4300萬個edu站點、580萬個org站點、570萬個ac.uk站點、450萬個com站點和200萬個gov站點以及1700萬個其它信息源)外,還包括MEDLINE、Pubmed、PubMedCentralBioMedCentral、ScienceDirect、MDConsult等幾十家數據庫服務商、出版商及大學擁有的數字化信息。第一節搜索引擎第二十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日

主頁高級檢索基本檢索首先配置第一節搜索引擎第二十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日高級檢索邏輯運算符詞組限定字段限定其它限定日期類型格式內容領域第一節搜索引擎第二十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日檢索結果第一節搜索引擎第三十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、BIOME系列搜索引擎概況

BIOME是一個針對互聯網上優秀醫藥衛生和生命科學資源的搜索引擎系列。服務對象是學生、研究人員、大學教師和執業醫師。該網站由諾丁漢大學GreenfieldBIOME核心工作組創立并維護。該工作組得到了聯合信息系統委員會的資助。后由英國七所大學資源進行整合,共同構成綜合性網絡資源搜索門戶Intute,包含科學技術、人文藝術、社會科學、健康與生命科學(BIOME)4個服務模塊。

或第一節搜索引擎第三十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日BIOME系列搜索引擎由BIOME(即HealthandLifeSciences)本身和6個專業引擎和3個附屬搜索引擎BioethicsWeb、MedHist和psci-com組成。第一節搜索引擎第三十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日搜索引擎網址內容BIOME現改為Health&LifeScienceshttp://biome.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences涵蓋了其它五個專業引擎的所有資源OMNI現改為Medicinehttp://OMNI.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences/medicine/醫藥衛生、人類健康Nursing,Midwifery&AlliedHealthute.ac.uk/healthandlifesciences/nursing/護理學、產科學及相關醫學Bioresearchhttp://Bioresearch.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences/bioresearch/生物學、生物醫學科學Agrifor現改為AgricultureFood&Forestryhttp://Agrifor.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences/agriculture/農業科學、林業科學、食品科學Vetgate現改為Veterinaryhttp://Vetgate.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences/veterinary/獸醫學NaturalSelection現改為NaturalHistoryhttp://nature.ac.ukute.ac.uk/healthandlifesciences/nature/自然史BioethicsWebute.ac.uk/healthandlifesciences/bioethicsweb生物倫理學MedHistute.ac.uk/healthandlifesciences/medhist/醫學史psci-comute.ac.uk/healthandlifesciences/pscicom/科學交流和社會中的科學BIOME(HealthandLifeSciences)系列搜索引擎第一節搜索引擎第三十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日OMNI(Medicine)檢索方法:OMNI提供給用戶3種檢索方法,即SimpleSearch(簡單檢索)、AdvancedSearch(高級檢索)和Browsing(分類瀏覽)。簡單檢索和高級檢索都對大小寫不敏感,為用戶提供了方便。第一節搜索引擎第三十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日簡單檢索高級檢索主題分類瀏覽第一節搜索引擎第三十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日高級檢索資源類型限定字段限定數據源限定第一節搜索引擎第三十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日四、瑞士網上健康基金會及其搜索引擎網上健康基金會(TheHealthOntheNetFoundation,HON)是一個非營利性的國際組織。該組織于1995年創建于瑞士,是為了提高網上醫學健康信息的質量,方便病人和醫學專業人員能夠快速地檢索到最新的相關醫學研究成果。HON制定了醫藥衛生網站開發者的道德規范。HON網站有英文版、法文版、德文版、西班牙文版,統一的網址是:。HON網站提供了相當豐富的資源和服務,其中最重要的是網上資源搜索引擎(MedHunt和HONselect)、醫學圖像資源(HONmedia)和專題檔案(HONDossier)。此外還有新聞、醫學會議消息等內容。第一節搜索引擎第三十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第一節搜索引擎第三十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日1.Medhunt()MedHunt是致力于醫藥衛生領域、全文匹配的搜索引擎,它使用網際“機器人”技術自動從網上搜索醫藥衛生資源并進行處理。該搜索引擎有英文、法文、德文和中文版本(這里的講解和示例使用英文版,中文版是檢索界面)。第一節搜索引擎第三十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日檢索方法:

MedHunt檢索方法簡單,檢索方法遵從以下規則:檢索式對字母大小寫不敏感;一些虛詞(冠詞、介詞、代詞、連詞以及網頁中的導航詞back、top、up等)由于沒有實際意義而被忽略,醫學術語中的虛詞除外。第一節搜索引擎第四十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日“allthewords”(邏輯與)、“anyofthewords”(邏輯或)“adjacentwords”(檢索詞之間緊密相連)。

限定檢索范圍顯示方式地理位置和領域限定第一節搜索引擎第四十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日“機器人”自動獲得的站點和網頁數量遵守“醫藥衛生網站開發者道德規范(HONcode)”的網站數量HON訪問并描述過的網站數量檢索結果結果顯示區第一節搜索引擎第四十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日2.HONselect()

HONselect是一個多語種、智能型、功能強大的針對醫藥衛生領域中不同種類網絡資源的搜索引擎,它具有英文、法文、德文、西班牙文、葡萄牙文、意大利文和荷蘭文等7個版本。HONselect檢索的核心是NLM的33000多個醫學主題詞(MeSH)。HONselect不僅允許讀者查訪醫學主題詞的等級結構和釋義,而且通過MeSH系統將四個分散異構的數據庫整合到一起。第一節搜索引擎第四十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日檢索方法

HONselect提供了分類月錄式檢索和關鍵詞檢索方法。分類目錄式檢索有4個入口:Diseases(疾病)、Viruses&Drug(病毒和藥物)、Anatomy(解剖)、PsychiatryandPsychology(精神病學和心理學)。關鍵詞檢索可以在表單中輸入單詞和詞組,其中的虛詞一般會被忽略,另外通過下拉菜單進一步限定。第一節搜索引擎第四十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日分類檢索區關鍵詞檢索區第一節搜索引擎第四十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日檢索結果如果MeSH中有不止一個主題詞含有讀者的檢索詞,則全部列出;與檢索詞密切相關(但不含有檢索詞)的主題詞也全部列出。讀者可根據需要選擇其中的一個主題詞進入。各種檢索方法顯示結果的頁面結構基本相同。第一節搜索引擎第四十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日HONselect關鍵詞檢索結果顯示點擊第一節搜索引擎第四十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第二節主要基礎醫學網絡資源一、GrossAnatomyGuidesatTufts(Tufts大學人體解剖學指導)

由位于美國波士頓的Tufts大學醫學院解剖學與細胞生物學系主辦。該網站提供有關解剖學的站點鏈接,其中包含豐富的參考資料。主要內容有:Tufts大學解剖學系頭頸部解剖學課程內容、斷面解剖學、Tufts大學解剖學系人體解剖過程指導、3D解剖學圖片、解剖學相關網址。第四十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第二節主要基礎醫學網絡資源第四十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日二、TheAmericanAssociationAnatomists

(美國解剖學家協會,AAA)

美國解剖學家協會是美國最大的解剖協會,l888年始建于美國華盛頓,初始目的在于促進解剖科學的發展。其成員來自世界各國的相關專業,包括醫學基礎教育、醫學圖像工作、細胞生物學、遺傳學、分子發育學、內分泌學、組織學、神經科學、法醫學、顯微鏡、自然人類學等。今天它已成為那些致力于解剖學形態、功能的研究及教育人員的家園。第二節主要基礎醫學網絡資源第五十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日AAA主辦的會刊一般用戶可免費獲取出版一年后的全文

第二節主要基礎醫學網絡資源第五十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、TheAmericanPhysiologicalSociety(美國生理學會,APS)

美國生理學會成立于1887年,是FASEB的成員之一,其宗旨是通過最新的有價值的生理學信息促進生理學信息交流及科研與教育的快速發展。APS提供出版物包括APS出版發行16種涉及生理學各個方面的學術性期刊,其中包括美國生理學期刊(AJP)的8個分冊。普通用戶可以閱讀出版后一年之前的全文資源,部分新資源可以在線全文閱讀。第二節主要基礎醫學網絡資源第五十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第二節主要基礎醫學網絡資源第五十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日四、CollegeofAmericanPathologists(美國病理醫師學會,CAP)

美國病理醫師學會是世界上最大的由病理醫師組成的聯合會,包括世界各國l5000多個會員及實驗室團體。學會致力于臨床實驗室步驟的標準化和改進,被公認為是實驗室質量保證的領導者。CAP的電子出版物-病理與實驗室醫學雜志“ArchivesofPathologyandLaboratoryMedicine”刊載病理學及醫學實驗相關的文章,該電子版雜志不僅可瀏覽論文摘要,還可免費瀏覽全文。第二節主要基礎醫學網絡資源第五十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索基本檢索第二節主要基礎醫學網絡資源第五十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日五、美國藥理學與實驗治療學學會ASPET

ASPET成立于1908年,目前是由4800成員組成,其中包括藥學研究領域、醫藥工業和政府代表組成,以對抗疾病致力開發新藥與治劑為宗旨。該網站內容主要包括:會議與產品、出版物、藥理學教育資源、藥學資源鏈接、培訓計劃、政府與公共事務等,其中出版物包括該學會的5種期刊。第二節主要基礎醫學網絡資源第五十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日關鍵詞檢索第二節主要基礎醫學網絡資源第五十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日六、AmericanSocietyforBiochemistryandMolecularbiology(美國生物化學與分子生物學會,ASBMB)

美國生物化學與分子生物學會成立于1906年,是一個非盈利性的科學與教育組織,擁有來自學院、大學、政府研究室及等研究機構的會員10000多人。學會的目標是通過出版物、學術會議和人才培養促進生物化學與分子生物學的發展。第二節主要基礎醫學網絡資源第五十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日出版1期以后對網絡用戶開放免費試用,網上檢索閱讀文獻全文免費檢索閱讀該刊1997年至距今最新一期以前發表的論文全文免費檢索閱讀該刊論文全文第二節主要基礎醫學網絡資源第五十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第三節主要臨床醫學網絡資源一、InternalMDLinx(內科醫學網)

MDLinx由近40個專業網站組合而成,IntemalMDLinx只是其中的一個關于內科學的網站。該網站由內科臨床醫師自發組織創建,其目的是為內科醫師提供最集中的專業信息資源:各種內科疾病的診斷、治療等臨床信息。其主要讀者對象為臨床醫師、護士。該網頁定期更新,用戶可在網頁左側的目錄中選擇所需內容來查看最新的消息、文摘或全文(部分全文是免費的),同時還可輸入關鍵詞進行檢索。第六十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日主題分類類目區關鍵詞檢索結果排序方式資源庫選擇第三節主要臨床醫學網絡資源第六十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日二、AmericanCollegeofPhysicians-AmericanSocietyofInternalMedicine(美國醫師學會-美國內科學會,ACP-ASIM)成立于1915年,是美國最大的醫學專業協會。它的宗旨是培養高超的行業水平和職業的醫學道德來促進國民的健康水平。該網站的主要讀者對象為內科醫生和內科各專業的醫務人員,包括心血管學、胃腸病學、腎病學、肺病學、內分泌學、血液學、風濕病學、神經學、腫瘤學、傳染病學、變態反應和免疫病、老年病學等學科。該網站提供的服務很多,內容涉及臨床、科研和教育各方面。第三節主要臨床醫學網絡資源第六十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索高級檢索期刊和出版物第三節主要臨床醫學網絡資源第六十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、TheMerckManualofDiagnosisandTherapy(Merck診療手冊)

《默克診療手冊》(主網站2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第23)作為美國默沙東公司(在美國稱為默克公司)對醫療界提供的非營利性服務,自1899年出版第一版《默克診療手冊》以來至今已再版了17版。并翻譯成16種語言,發行量超過了一千萬本,它也是英語中連續出版的最古老的醫學參考書。讀者可免費閱讀全文,可輸入關鍵詞對該書進行檢索。第三節主要臨床醫學網絡資源第六十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日關鍵詞檢索概念索引章節目錄癥狀索引第三節主要臨床醫學網絡資源第六十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第三節主要臨床醫學網絡資源第六十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日四、AmericanHeartAssociation(美國心臟協會,AHA)

美國心臟協會美國心臟協會是美國全國性的非政府衛生機構,是國際學術影響較大、歷史悠久的心血管學術團體,目的是降低心血管疾病的致殘率和死亡率。該協會網站提供了豐富的科研、醫療、教學資源和信息。第三節主要臨床醫學網絡資源第六十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第三節主要臨床醫學網絡資源基本檢索高級檢索期刊及出版物信息第六十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日五、AmericanCollegeofCardiology(美國心臟病學會,ACC)

美國心臟病學會網站的主要功能是為心血管專業人員提供高質量的繼續教育機會,并為心血管疾病的治療提供權威的臨床實踐指南、治療標準和最新信息,以促進心血管疾病的基礎和臨床研究。該網站提供的主要服務包括三個方面,即臨床實踐、繼續教育和信息服務。第三節主要臨床醫學網絡資源第六十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日在線教育臨床實踐出版物基本檢索高級檢索第三節主要臨床醫學網絡資源第七十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日六、NationalHeart,LungandBloodInstitute(美國國立衛生研究院心肺血液研究所,NHLBI)

美國國立衛生研究院心肺血液研究所是美國國立衛生研究院的下屬機構之一,是世界最大的心肺血液研究機構。為患者和專業醫學人員提供關于心臟、血管、肺臟、血液、血液研究和睡眠障礙的內容。另外還有鏈接到關于NHLBI基礎研究、臨床試驗和教育計劃等內容。NHLBI提供的信息資源包括會議消息、臨床診療指南、臨床試驗、最新信息、NHLBI下屬各實驗室的科研情況等。第三節主要臨床醫學網絡資源第七十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、TheMerckManualofDiagnosisandTherapy(Merck診療手冊)

《默克診療手冊》(主網站2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第23)作為美國默沙東公司(在美國稱為默克公司)對醫療界提供的非贏利性服務,自1899年出版第一版《默克診療手冊》以來至今已再版了17版。并翻譯成16種語言,發行量超過了一千萬本,它也是英語中連續出版的最古老的醫學參考書。讀者可免費閱讀全文,可輸入關鍵詞對該書進行檢索。基本檢索高級檢索第三節主要臨床醫學網絡資源第七十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日七、TheCardiothoracicSurgeryNetwork(心胸外科網,CTSNet)

心胸外科網由心胸外科專業的三個主要學會,即:胸外科醫師學會(TheSocietyofThoracicSurgeons)、美國胸外科協會(AmericanAssociationforThoracicSurgery)、歐洲心胸外科協會(TheEuropeanAssociationforCardio-thoracicSurgery)主辦,其他30多個心胸外科組織協辦。該網站的主要用戶為臨床心胸外科醫師及其相關專業人員,同時也向患者及家屬介紹心、肺、食管等疾病的診治信息。第三節主要臨床醫學網絡資源第七十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日在線繼續醫學教育資源關鍵詞檢索普通用戶可免費瀏覽圖書內容第三節主要臨床醫學網絡資源第七十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日八、TheSocietyofThoracicSurgeons(胸外科醫師學會,STS)

胸外科醫師學會是一個非營利性組織,成立于1964年,目前由全世界5400多名會員,包括外科醫生、研究員及專家等,該學會目的是通過教育、科研及倡導以提供醫學的能力,該網站在促進學科發展上起著舉足輕重的作用。第三節主要臨床醫學網絡資源第七十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第三節主要臨床醫學網絡資源第七十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日九、AmericanAssociationforThoracicSurgery(美國胸外科協會,AATS)

美國胸外科協會成立于1917年,該協會由來自于解剖、生理、病理、內科、外科、放射、麻醉等專業成員組成,AATS重視其教育職能,舉辦的年會、學會等在專業領域內有享有較高聲譽。在網站首頁上提供了此方面的大量信息,如:在華盛頓舉行的第82屆、81屆年會網絡出版物、2001年度報告等。在第81屆年會出版物中設7個專題列出相關文獻,即成人心臟外科、先心病、胸外科總論、科技全會、住院醫師論壇、急癥搶救與技術論壇和爭鳴等。第三節主要臨床醫學網絡資源第七十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第三節主要臨床醫學網絡資源第七十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日一、循證醫學概念

循證醫學(Evidence-BasedMedicine,EBM)又稱為“證據醫學”、“實證醫學”、“求證醫學”,即遵循遵循科學依據的醫學,是在個人經驗基礎上,借助科學依據做出醫療決策、處置患者的過程。“慎重、準確和明智地應用當前所能獲得的最好的研究依據,同時結合醫生的個人專業技能和臨床經驗,考慮病人的價值和愿望,將三者完美地結合制定出病人的治療措施”-----DavidSackett《怎樣實踐和講授循證醫學》第四節循證醫學信息資源第七十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第四節循證醫學信息資源二、循證醫學產生的背景信息與網絡的迅猛發展人類疾病譜發生變化臨床科研方法學興起Meta分析引入臨床研究臨床經濟學的發展對臨床醫療實踐及衛生管理提出新的要求制藥業的蓬勃發展給臨床決策帶來困惑臨床證據的出現第八十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、實施循證醫學實踐步驟(1)確定臨床實踐中的問題(2)檢索有關醫學文獻(3)嚴格評價文獻(4)應用最佳證據,指導臨床決策(5)通過實踐,提高臨床學術水平和醫療質量第四節循證醫學信息資源第八十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日四、循證醫學網絡資源(一)循證醫學圖書館Cochrane圖書館(CochraneLibrary,CL)是國際Cochrane協作網的主要產品,CL是協作網以光盤(CD-ROM)或網絡形式發表的電子刊物,目前Cochrane圖書館包含以下幾個數據庫其中只有CochraneDatabaseofSystematicReviews(又稱為CochraneReviews)及CochraneDatabaseofMethodologyReviews(又稱為MethodsReviews)這兩個數據庫提供提供全文,其他子資料庫只提供摘要。第四節循證醫學信息資源第八十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第四節循證醫學信息資源第八十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日1.CochraneReviews(CochraneDatabaseofSystematicReviews,CDSR)該庫收集了各Cochrane系統評價組在統一工作手冊指導下對各種健康干預措施所作的系統評價,包括全文(CompletedReviews)和研究方案(Protocols)。檢索方式有分類瀏覽和關鍵詞檢索兩種(其它幾種數據庫檢索方式與本數據庫類似):第四節循證醫學信息資源第八十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(1)分類瀏覽①ByTopic:按照CRG的主題分組,分成50組主題,再分別依照組的疾病或部位作逐級分組。第四節循證醫學信息資源第八十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日②NewReviews:本季新的文章,包括Review、Protocols、methodology、Methodology(評價方法,并在題名后標注,格式有網頁和PDF兩種。第四節循證醫學信息資源第八十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日③UpdatedReviews:上一季有更新的文章,與NewReviews排列方式相似。第四節循證醫學信息資源第八十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日④A-Z:所有系統評價文獻,按英文字母排序。與NewReviews排列方式相似,并且還可以按照Protocol、Review、ProtocolsandReviews分組進行瀏覽。第四節循證醫學信息資源第八十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日⑤ByReviewGroup:依照CRG的51個分組,將Reviews和Protocols的文章按照字母排列。第四節循證醫學信息資源第八十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日關鍵詞檢索(2)關鍵詞檢索關鍵詞檢索有簡單檢索、高級檢索、主題詞檢索等。①簡單檢索:在輸入框中輸入關鍵詞,點擊GO即可檢索,檢索歷史可以存儲。在此方式下,通過下拉菜單,可以進行限定檢索,可以將檢索詞在標題、著者、摘要、出版類型等范圍內限定。檢索結果可以顯示和存儲。檢索結果界面第四節循證醫學信息資源第九十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日②高級檢索:可以進行布爾邏輯檢索、限定數據庫和時間范圍等。檢索結果與簡單檢索類似。第四節循證醫學信息資源第九十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日③Mesh檢索:方法與Pubmed的檢索方法類似,檢索結果同簡單檢索相同。第四節循證醫學信息資源第九十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日2.OtherReviews(DatabaseofAbstractsofReviewsofEffects,DARE)該庫是經過嚴格審核的系統評價摘要數據庫;每個摘要包括總結概述,以及標準的說明,與CDSR不同的是它只收集了評論性摘要、題目及出處,而沒有全文。瀏覽內容需要注冊。第四節循證醫學信息資源第九十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第四節循證醫學信息資源第九十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日3.ClinicalTrials(CochraneCentralRegisterofControlledTrials,CENTRAL)CENTRAL資料來源于各系統小組和其它組織的專業臨床試驗資料庫以及在MEDLINE、EMBASE上被檢索出的臨床試驗報告。還包括全世界Cochrane協作網成員從有關醫學雜志、會議論文集和其尚未出版的臨床試驗計劃。內容包括文獻標題、出版來源及文獻摘要,不包含全文。第四節循證醫學信息資源第九十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索基本檢索基本檢索第四節循證醫學信息資源第九十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日4.MethodsStudies(CochraneMethodologyRegister,CMR)該庫匯集已出版的且針對產生對照試驗方法使用的書目信息,信息來源包括,圖書、期刊、會議記錄等,部分有摘要,不包含全文。需才能注冊使用。第四節循證醫學信息資源第九十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日5.TechnologyAssessments(HealthTechnologyAssessmentDatabase)該庫收錄全球健康技術管理評價(即醫療技術評價)的信息,其中包括進行中的計劃和健康技術評價的出版信息和摘要,需注冊才能使用。第四節循證醫學信息資源第九十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日6.EconomicEvaluations(NHSEconomicEvaluationDatabase,NHSEED)該庫收錄衛生經濟評估相關的文獻摘要,文獻主要來自重要醫學期刊及書目數據庫,包含治療方式的比較、成本和治療效果等。需注冊才能使用。第四節循證醫學信息資源第九十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(二)TRIP數據庫TRIP數據庫收錄70個以上的高質量醫學信息資源,并與相關雜志和電子教科書進行鏈接。其中有Cochrane系統評價摘要,也有循證醫學方面的雜志和相關網站上的系統評價、相關問題問答、在線高質量醫學專業雜志的原始研究和評價性文章、指南、電子教科書等,因此既可直接檢索出二級研究雜志上的系統評價等,也可對一些在線的高質量的原始研究雜志進行檢索。檢索時可一次打開多個數據庫,每種數據庫及其檢索結果用不同的顏色加以區別,十分方便選擇性瀏覽相關內容。第四節循證醫學信息資源第一百頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索高級檢索分類瀏覽第四節循證醫學信息資源第一百零一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(三)Sumsearch

該網站是搜索循證醫學資源的元搜索引擎,最大優點是能幫助臨床醫生快速獲得所需的證據,對臨床實踐很有幫助。可同時檢索Cochrane系統評價(DARE摘要,PubMed,NGC,),可針對病因、診斷、治療、預后等進行檢索。該網站支持布爾邏輯運算符和模糊檢索,并可以對年齡、人類、語種等進行限定。對輸入的檢索詞可以進行通過鏈接NIH的Mesh主題詞庫進行檢查,規范用詞。檢索結果按類別列出,如將系統評價、指南、原始研究論文等分類列出。第四節循證醫學信息資源第一百零二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第四節循證醫學信息資源第一百零三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(四)ClinicalTrialsClinicalTrials數據庫美國國立衛生研究院提供的臨床研究信息的數據庫,記錄了病人使用新藥及新的治療方案的信息。目前包含154個國家52832條試驗記錄。信息量大,更新迅速。檢索方法:包括分類瀏覽和關鍵詞檢索。第四節循證醫學信息資源第一百零四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日分類瀏覽:按照Conditions(疾病名稱)、DrugInterventions(藥物干擾)、Sponsors(發起者)、Locations(試驗地點)分成四大類別,在每個類別分別按字順進行排列,檢索者點擊“StudyTopics”進入分類瀏覽界面,根據需要點擊相關主題即可找到所需信息。第四節循證醫學信息資源第一百零五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索第四節循證醫學信息資源第一百零六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫醫學生物信息學是醫學、生物學、計算機科學和信息科學等多學科交叉而形成的一門新興科學。它對各種醫學和生物學的信息、資料、數據進行搜集、儲存、整理計算和分析,形成可再生的資源,為醫學科學的發展提供全方位的支持。數據是醫學生物信息學的基礎,建立以疾病為中心,貫穿病理、藥理、基因、蛋白、調控等方面數據的數據庫是醫學生物信息的核心。數據庫是生物信息學的主要內容,各種數據庫幾乎覆蓋了生命科學的各個領域。第一百零七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日一、基因和基因組數據庫(一)GenBank

GenBank(2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第43)庫包含了所有已知的核酸序列和蛋白質序列,以及與它們相關的文獻著作和生物學注釋。它是由美國國立生物技術信息中心(NCBI)1982年建立和維護的。它的數據直接來源于測序工作者提交的序列,由測序中心提交的大量EST序列和其他測序數據,以及與其他數據機構協作交換數據而來。GenBank每天都會與歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的核酸序列數據庫、日本國立遺傳學研究所的DNA數據庫(DDBJ)交換數據,使這3個數據庫的數據同步。GenBank的數據可以從NCBI的FTP服務器上免費下載,可以是完整庫或積累的新數據。NCBI還提供廣泛的數據查詢、序列相似性搜索以及新序列提交,用戶可以從NCBI的主頁上找到這些服務。第五節生物信息數據庫第一百零八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫第一百零九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(二)人類基因組數據庫(TheGenomeDatabase,GDB)

人類基因組數據庫(GDB)(2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第46)于1990年初建于美國約翰·霍普金斯大學,以支持國際合作的人類基因組計劃,是一個專門匯集存儲人類基因組數據的數據庫,其中包括了全球范圍內致力于人類DNA結構和100,000種人類基因序列研究的分析成果。對從事相關領域的研究人員具有重要的參考作用。GDB的目標是構建關于人類基因組的百科全書,除了構建基因組圖譜之外,還開發了描述序列水平的基因組內容的方法,包括序列變異和其他對功能和表型的描述。第五節生物信息數據庫第一百一十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日基本檢索高級檢索第五節生物信息數據庫第一百一十一頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日二、蛋白質數據庫(一)UniProt蛋白質數據倉庫

蛋白質數據倉庫UniProt是美國國家衛生研究院(NIH)、歐洲生物信息學研究所等多家研究中心和研究院EBI將PIR、SWISS-PROT和TrEMBL統一起來而建立的。UniProt包含3個部分:(1)UniProtKnowledgebase(UniProtKB),這是蛋白質序列、功能、分類、交叉引用等信息存取中心;(2)UniProtNon-redundantReference(UniRef)數據庫,該數據庫將密切相關的蛋白質序列組合到一條記錄中,以便提高搜索速度;(3)UniProtArchive(UniParc),是一個資源庫,記錄所有蛋白質序列的歷史。用戶可以通過文本查詢數據庫,可以利用BLAST程序搜索數據庫,也可以直接通過FTP下載數據,另外提供相關分析工具及蛋白質數據提交工具。第五節生物信息數據庫第一百一十二頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫第一百一十三頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日二、蛋白質數據庫(二)PDB

PDB是國際上惟一的生物大分子結構數據檔案庫,由美國Brookhaven國家實驗室建立。PDB收集的數據來源于X光晶體衍射和核磁共振(NMR)的數據,經過整理和確認后存檔而成。目前PDB數據庫的維護由結構生物信息學研究合作組織(RCSB)負責。RCSB的主服務器和世界各地的鏡像服務器提供數據庫的檢索和下載服務,以及關于PDB數據文件格式和其他文檔的說明。使用Rasmol等軟件可以在計算機上按PDB文件顯示生物大分子的三維結構。第五節生物信息數據庫第一百一十四頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫第一百一十五頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日三、功能數據庫(一)KEGG(京都基因與基因組百科全書)

KEGG是基因組破譯方面的數據庫。PATHWAY數據庫整合當前在分子互動網絡(比如通道,聯合體)的知識;BRITE數據庫提供蛋白質功能分類的知識;GENES數據庫提供關于在基因組計劃中發現的基因和蛋白質的相關知識;KEGG的COMPOUND、GLYCAN、REACTION數據庫提供生化復合物及反應方面的知識;LIGAND數據庫,包含關于化學物質、酶分子、酶反應等信息。KEGG提供了Java的圖形工具來訪問基因組圖譜,比較基因組圖譜和操作表達圖譜,以及其他序列比較、圖形比較和通路計算的工具,可以免費獲取。第五節生物信息數據庫第一百一十六頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫第一百一十七頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日(二)DIP(DatabaseofInteractingProteins)

DIP是相互作用的蛋白質數據庫,收集了由實驗驗證的蛋白質-蛋白質相互作用。數據庫包括蛋白質的信息、相互作用的信息和檢測相互作用的實驗技術三個部分。用戶可以根據蛋白質、生物物種、蛋白質超家族、關鍵詞、實驗技術或引用文獻來查詢DIP數據庫。第五節生物信息數據庫第一百一十八頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第五節生物信息數據庫第一百一十九頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日第六節網上免費信息資源一、HighWirePress

HighWirePress(2007年AmedeoCommunity測評的最好醫學網站排名第40)是斯坦福大學圖書館于1995年開始建立的科學與醫學文獻庫,是目前世界上兩個最大的免費科技期刊文獻全文數據庫之一,收錄內容涉及物理、生物、醫學和社會學等領域的期刊,目前收錄論文460多萬篇,可提供免費期刊論文180多萬篇。整合免費期刊314種:其中43種完全免費,22種免費試用,249種某特時間后免費(時間從3個月至三年不等)。在免費期刊中包括很多核心期刊。第一百二十頁,共一百三十一頁,2022年,8月28日免費期刊列表鏈接第六節網上免費信

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