標準解讀

《LY/T 3191-2020 林木DNA條形碼構建技術規(guī)程》是由國家林業(yè)和草原局提出并歸口的一項標準，旨在規(guī)范林木DNA條形碼的構建過程。該標準詳細規(guī)定了從樣本采集到數(shù)據(jù)處理的一系列步驟和技術要求，適用于森林資源調(diào)查、林木種質(zhì)資源保護與利用等領域中的物種鑒定工作。

在樣本采集方面，標準強調(diào)了選取具有代表性的個體進行采樣，并對不同類型的植物材料（如葉片、果實等）提出了具體的保存方法，以保證后續(xù)實驗中DNA的質(zhì)量。對于DNA提取，則推薦使用高效且適合多種植物材料的方法，并對試劑的選擇、操作流程進行了指導，確保能夠獲得足夠純度和濃度的DNA用于分析。

PCR擴增是構建DNA條形碼的關鍵步驟之一。本標準列出了幾個常用的基因片段作為候選條形碼區(qū)域，并針對每個區(qū)域給出了相應的引物序列；同時，也提供了關于反應體系優(yōu)化、退火溫度設置等方面的建議，以提高擴增效率和特異性。

測序完成后，需要將原始數(shù)據(jù)轉化為可比對的標準格式。《LY/T 3191-2020》介紹了如何去除低質(zhì)量讀段、拼接contig等基礎生物信息學處理手段，并指出應利用公共數(shù)據(jù)庫或自建參考庫來比對未知樣本的序列，從而實現(xiàn)準確分類。此外，還特別提到了建立和完善本地化林木DNA條形碼數(shù)據(jù)庫的重要性，這對于促進國內(nèi)相關研究領域的發(fā)展具有重要意義。


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....

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  • 現(xiàn)行
  • 正在執(zhí)行有效
  • 2020-03-30 頒布
  • 2020-10-01 實施
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文檔簡介

ICS65020

B60.

中華人民共和國林業(yè)行業(yè)標準

LY/T3191—2020

林木DNA條形碼構建技術規(guī)程

TechnicalregulationsofDNAbarcodesinwoodyspecies

2020-03-30發(fā)布2020-10-01實施

國家林業(yè)和草原局發(fā)布

LY/T3191—2020

前言

本標準按照給出的規(guī)則起草

GB/T1.1—2009。

本標準由國家林業(yè)和草原局提出

。

本標準由全國林木種子標準化技術委員會歸口

(SAC/TC115)。

本標準起草單位中國林業(yè)科學研究院熱帶林業(yè)研究所湖南省林業(yè)科學院中國科學院華南植物

:、、

園中國科學院植物研究所江西農(nóng)業(yè)大學林學院

、、。

本標準主要起草人裴男才梁軍生陳步峰葛學軍米湘成劉娟

:、、、、、。

Ⅰ

LY/T3191—2020

林木DNA條形碼構建技術規(guī)程

1范圍

本標準規(guī)定了林木條形碼構建中樣本采集策略核心條形碼片段選取標準提取

DNA、DNA、DNA

技術和保存序列測定和編輯方法系統(tǒng)發(fā)育關系構建等技術要求

、、。

本標準適用于林木條形碼的構建

DNA。

2規(guī)范性引用文件

下列文件對于本文件的應用是必不可少的凡是注日期的引用文件僅注日期的版本適用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改單適用于本文件

。,()。

本文件無規(guī)范性引用文件

。

3術語和定義

下列術語和定義適用于本文件

。

31

.

DNA條形碼DNAbarcodes

從線粒體葉綠體或核基因組區(qū)域中篩選的一段短的通用的序列以期對現(xiàn)存生物在物種水

、DNA,

平上進行快速而準確的識別和鑒定

。

32

.

引物primer

一小段單鏈或作為復制的起始點在核酸合成反應時作為每個多核苷酸鏈進

DNARNA,DNA,,

行延伸的出發(fā)點而起作用的多核苷酸鏈

。

33

.

聚合酶鏈式反應polymerasechainreactionPCR

;

一種體外酶促合成特異片段的方法由高溫變性低溫退火及適溫延伸等幾步反應組成一個

DNA,、

周期循環(huán)進行使目的得以迅速擴增具有特異性強靈敏度高操作簡便省時等特點

,,DNA,、、。

34

.

DNA序列DNAsequence

多核苷酸鏈中的核苷酸的排列順序可能的字母只有和分別代表組成的四種核

。A、C、GT,DNA

苷酸腺嘌呤胞嘧啶鳥嘌呤胸腺嘧啶無間隔地排列在一起例如序列

———、、、,,AAAGTCTGAC。

35

.

DNA測序DNAsequencingtechnology

對分子的核苷酸排列順序的測定也就是測定組成分子的的排列順序

DNA,DNAA、T、G、C。

36

.

系統(tǒng)發(fā)育關系phylogeny

生物有機體隨著時間變

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