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文檔簡介
第十二章核酸的生物合成一、DNA的生物合成二、RNA的生物合成中心法則一、DNA的生物合成(一)DNA的半保留復制(二)DNA復制的起始點和方向(三)原核細胞DNA的復制(四)真核細胞DNA的復制(五)反轉錄作用(RNA指導的DNA合成)(六)DNA的損傷與修復復制(replication)是指遺傳物質的傳代,以母鏈DNA為模板合成子鏈DNA的過程。復制親代DNA子代DNA(一)DNA的半保留復制DNA生物合成時,母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板,按堿基配對規律,合成與模板互補的子鏈。子代細胞的DNA,一股單鏈從親代完整接受過來,另一股單鏈則完全重新合成,兩個子細胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致,這種復制方式為半保留復制。保證遺傳信息傳遞的忠實性;遺傳和變異的統一(二)DNA復制的起始點和方向DNA復制是從DNA上一個固定點開始的;DNA復制起始點稱為原點;它的復制從原點開始可雙向同時進行,也可以單向進行;DNA復制是邊解鏈邊復制,復制中的DNA在復制點呈叉狀,這個分叉點稱為復制叉。5’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’5’5’3’復制子3’真核生物DNA多復制子復制半不連續復制順著解鏈方向生成的子鏈,復制是連續進行的,這股鏈稱為領頭鏈。復制方向與解鏈方向相反,不能順著解鏈方向連續延長,這股不連續復制的鏈稱為隨從鏈。復制中的不連續片段稱為岡崎片段。3535解鏈方向3′5′3′3′5′領頭鏈(leadingstrand)隨從鏈(laggingstrand)岡崎片段(okazakifragment)
領頭鏈連續復制而隨從鏈不連續復制
——復制的半不連續性DNA復制的特點固定的起始點邊解鏈邊復制單向或雙向沿53
方向復制半保留復制半不連續參與DNA復制的物質模板:解開成單鏈的DNA母鏈底物:dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)引物:提供3-OH末端使dNTP可以依次聚合聚合酶:依賴DNA的DNA聚合酶,簡寫為DNA-pol其他的酶和蛋白質因子(三)原核細胞DNA的復制復制的起始延長終止5'3'5'dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH3'3'DNA-poldNMP引物:短鏈RNA分子領頭鏈的合成領頭鏈:順著解鏈方向生成的子鏈,復制是連續進行的,這股鏈稱為領頭鏈。隨從鏈的合成隨從鏈:復制方向與解鏈方向相反,為不連續復制,這股不連續復制的鏈稱為隨從鏈。復制中位于隨從鏈上的不連續片段稱為岡崎片段(okazakifragment)。(四)真核生物的DNA生物合成
?多復制子復制子(replicon):相鄰兩個復制起點之間的距離。復制子是獨立完成復制的功能單位。復制有時序性,即復制子以分組方式激活而不是同步起動。
復制的起始3553領頭鏈3535親代DNA隨從鏈引物核小體復制的延長DNA-polδDNA-polα353355335+5333555′復制的終止染色體DNA呈線狀,復制在末端停止。1、親代DNA為模板嚴格遵守堿基配對規律2、復制延長時聚合酶對堿基的選擇功能3、復制出錯時DNA-pol的即時校讀功能4、錯配修復機制DNA復制具有保真性(五)反轉錄作用(RNA指導的DNA合成)
指遺傳信息從RNA流向DNA,是RNA指導下的DNA合成過程,即以RNA為模板,四種dNTP為原料,合成與RNA互補的DNA單鏈。RNADNA
逆轉錄酶逆轉錄酶(reversetranscriptase)
催化逆轉錄過程的酶稱逆轉錄酶,RNA病毒中都含有此酶。具有三種酶活性:
RNA指導的DNA聚合酶
RNA酶
DNA指導的DNA聚合酶逆轉錄過程RNA模板逆轉錄酶(RNA指導的DNA聚合酶)DNA-RNA雜化雙鏈逆轉錄酶(RNA酶)單鏈DNA逆轉錄酶(DNA指導的DNA聚合酶)雙鏈DNA(六)DNA的損傷與修復DNADamage(Mutation)andRepair遺傳物質的結構改變而引起的遺傳信息改變,均可稱為突變。在復制過程中發生的DNA突變稱為DNA損傷(DNAdamage)。從分子水平來看,突變就是DNA分子上堿基的改變。
引發突變的因素物理因素如紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射UV胸腺嘧啶二體化學因素DNA損傷的修復修復(repairing)
是對已發生分子改變的補償措施,使其回復為原有的天然狀態。光修復(lightrepairing)切除修復(excisionrepairing)重組修復(recombinationrepairing)SOS修復
修復的主要類型二、RNA的生物合成轉錄(transcription)
生物體以DNA為模板合成RNA的過程
DNA
RNA轉錄(一)參與轉錄的物質原料:
NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)
模板:
DNA酶:
RNA聚合酶(RNA-pol)其他蛋白質因子
結構基因(structuralgene):能轉錄生成RNA的DNA區段。
模板鏈(templatestrand):
DNA雙鏈中按堿基配對規律能指引轉錄生成RNA的一股鏈。
編碼鏈(codingstrand):
DNA雙鏈中與模板鏈相對應的另一條鏈1、模板不對稱轉錄:在DNA分子雙鏈上,一股鏈用作模板指導轉錄,另一股鏈不轉錄;模板鏈并非總是在同一條鏈上。
2、原料4種核糖核苷三磷酸:
ATP、GTP、CTP、UTP
作為RNA聚合酶的底物3、RNA聚合酶全稱:依賴DNA的RNA聚合酶
(DNA-dependentRNApolymerase)簡稱:RNA-pol它以DNA為模板,4種NTP為原料,按A=U、CG堿基配對規則,催化合成5′→3′方向的RNA鏈。原核生物的RNA聚合酶真核生物的RNA聚合酶4、終止因子(ρ)其作用是協助RNA聚合酶辨認終止點并終止轉錄(二)轉錄的過程
轉錄是以DNA為模板合成RNA的過程包括起始、延長和終止三個階段1、起始階段
轉錄起始需解決兩個問題:RNA聚合酶必須準確地結合在轉錄模板的起始區域。DNA雙鏈解開,使其中的一條鏈作為轉錄的模板。2、延長階段RNA–pol聚合酶核心酶沿著DNA模板鏈3′→5′方向,催化合成5′→3′方向的RNA鏈。(NMP)n+NTP(NMP)n+1+PPi(三)終止階段RNA聚合酶在DNA模板鏈上停止滑動,轉錄產物RNA鏈停止延長并從轉錄復合物上脫落下來分類依賴ρ因子的轉錄終止依賴莖環結構的轉錄終止轉錄全過程(三)轉錄后加工真核生物轉錄產物RNA都要經過一系列改變才能成為有生物活性的RNA分子。1、mRNA的轉錄后加工mRNA的前體分子被稱為核內不均一RNA(hnRNA)
hnRNA需進行5′端(形成帽子結構m7GpppGp—)和3′端(加多聚腺苷酸尾巴polyA)的修飾,再進行剪接加工,才能成為成熟mRNA。mRNA的剪接外顯子(exon):能編碼多肽鏈中氨基酸的序列的被稱為外顯子。內含子(intron):不被翻譯的插入序列被稱為內含子。
mRNA的剪接:除去hnRNA中的內含子,將外顯子連接。2、tRNA的轉錄后加工3、rRNA的轉錄后加工第十三章蛋白質的生物合成一、遺傳密碼二、核糖體三、轉移RNA的功能四、蛋白質生物合成的分子機制五、真核生物與原核生物蛋白質合成的差異mRNA分子中的遺傳信息轉變為蛋白質的氨基酸排列順序的過程稱為翻譯(translation)蛋白質的生物合成體系
原料:20種氨基酸模板:mRNA
場所:核蛋白體氨基酸的“搬運工具”:tRNA
酶與蛋白質因子:啟動、延長、終止因子能量:ATP、GTP
無機離子
起始密碼(initiationcoden):5′端第一個AUG表示起動信號,并代表甲酰甲硫氨酸(細菌)或甲硫氨酸(高等動物)
密碼子(codon):mRNA從5′端→3′端,每3個核苷酸組成一組,代表相應的氨基酸或翻譯起始、終止信號。
終止密碼(terminationcoden)
:UAA、UAG或UGA(不編碼氨基酸)
一、遺傳密碼遺傳密碼表UCUCUCUCAGAGAGAG第三個字母密碼子的特點1、不重疊性2、簡并性3、通用性4、連續性二、核糖體核糖體(核蛋白體)是多肽鏈合成的裝置核糖體可游離存在,真核中,也可同內質網結合,形成粗糙的內質網。原核中,與mRNA形成串狀——多核糖體。原核生物真核生物核糖體小亞基大亞基核糖體小亞基大亞基S值70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質rpS21種rpL36種rpS33種rpL49種
不同細胞核糖體的組成蛋白質rRNA原核生物翻譯過程中核糖體結構與功能A位:氨基酰位(結合AA-tRNA)P位:肽酰位(結合肽酰-tRNA和起始Met-tRNA)E位:排出位(轉肽酶、GTP酶)三、轉移RNA的功能一種tRNA可攜帶一種氨基酸;而一種氨基酸可由數種tRNA攜帶。
搬運工具—tRNA與氨基酸結合與氨酰-tRNA合成酶結合識別密碼子與核糖體結合四、蛋白質生物合成的分子機制蛋白質合成的過程大致分為五個階段:氨基酸的激活;肽鏈合成的起動;肽鏈的延長;肽鏈合成的終止和釋放;肽鏈的折疊和加工處理。(一)氨基酸的激活(1)氨酰-tRNA合成酶:高度特異識別氨基酸、tRNA;校對活性(2)能量:1個ATP(2個高能鍵)氨基酸+tRNA氨酰-tRNAATPAMP+PPi氨酰-tRNA合成酶(二)在核糖體上合成多肽1、起始復合物的生成(1)起始因子
3種IF(原核):IF1、IF2、IF3
多種eIF(真核):eIF2是合成調控的關鍵物質(2)能量:GTP(真核體系還需ATP)(3)起始AA-tRNAfMet-tRNAfmet
(原核)
Met-tRNAmet
(真核)(4)起始復合物組成:大、小亞基、mRNA、起始因子、起始AA-tRNA小亞基先與起始AA-tRNA結合(真核)起始復合物形成過程核蛋白體的拆離、mRNA就位、起始tRNA結合、大亞基結合小亞基先與mRNA結合(原核)2、肽鏈延長
(1)延長因子EF-T:真核為EF-T1與T2,原核為EF-Tu、Ts與EF-G
(2)能量:GTP
方向:N端→C端(肽鏈);5′端→3′端(mRNA)
(3)過程
進位:EF-Tu、Ts或T1、GTP;進入A位轉肽:轉肽酶;P位酰基與A位氨基反應
轉位、脫落、移位:EF-G(轉位酶)或T2、GTP
;由A位移至P位,A位留空肽鏈的延長12122323進位肽鍵形成移位進位(Tu\Ts)GTPGTPN-端235′3′C-端肽鍵形成15′3′(EF-G)
(1)釋放因子RF:原核:3種真核:1種(2)能量:GTP(3)轉肽酶活性轉變:轉肽酶→酯酶(水解酶)3、終止參與翻譯的蛋白質因子
階段原核真核功能
IF1
IF2
eIF2參與起始復合物的形成
IF3
eIF3、eIF4C
起始CBPI與mRNA帽子結合
eIF4ABF參與尋找第一個AUG
eIF5協助eIF2、eIF3、eIF4C的釋放
eIF6協助60S亞基從無活性的核糖體上解離
EF-Tu
eEF1
協助氨酰-tRNA進入核糖體延長EF-Ts
eEF1
幫助EF-Tu、eEF1周轉
EF-G
eEF2移位因子終止RF-1eRF釋放完整的肽鏈
RF-2因子前加“e”表示真核生物(eukaryotic)(三)翻譯后加工1、去除N-甲酰基(原核)或N-蛋氨酸(真核)2、二硫鍵形成:生成胱氨酸5、水解修剪
3、氨基酸側鏈修飾:羥化(生成羥脯氨酸、羥賴氨酸)、乙酰化、磷酸化、甲基化與羥甲基化、加糖、加脂,等
6、亞基聚合
4、輔基結合
多肽鏈折疊為天然三維結構肽鏈一級結構的修飾空間結構的修飾IF-3IF-11.核蛋白體大小亞基分離AUG5'3'IF-3IF-12.mRNA在小亞基定位結合IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)結合到小亞基AUG5'3'IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4.核蛋白體大亞基結合,起始復合物形成AUG5'3'IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi核蛋白體大小亞基分離;起始氨基酰-tRNA結合;mRNA在核蛋白體小亞基準確就位;核蛋白體大亞基結合。met40S60SMetMet40S60SmRNAeIF-2B、eIF-3、
eIF-6①elF-3②GDP+Pi各種elF釋放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③MetMet-tRNAiMet-elF-2
-GTP真核生物翻譯起始復合物形成過程又稱注冊(registration)1、進位指根據mRNA下一組遺傳密碼指導,使相應氨基酰-tRNA進入核蛋白體A位。
延長因子EF-T催化進位(原核生物)
TuTsGTPGDPAUG5'3'TuTsGTP2、轉肽由轉肽酶催化的肽鍵形成過程3、移位延長因子EF-G有移位酶(translocase)活性,可結合并水解1分子GTP,促進核蛋白體向mRNA的3'側移動。進位移位轉肽原核肽鏈合成終止過程UAG5'3'RFCOO-多核蛋白體1個mRNA和多個核蛋白體的聚合物,體現了蛋白質合成的高速、高效性。每個核糖體都獨立完成一條多肽鏈的合成,所以這種多核糖體可以在一條mRNA鏈上同時合成多條相同的多肽鏈,大大提高了翻譯的效率。(四)蛋白質合成所需的能量
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