關于western和酶切的問題_第1頁
關于western和酶切的問題_第2頁
關于western和酶切的問題_第3頁
關于western和酶切的問題_第4頁
全文預覽已結束

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、4. Western Blot 定量分析(1)腎臟組織總蛋白的提取1)用4的0.01M PBS 稀釋10細胞裂解液。取300l/EP管,標記,置冰上。2)從-80冰箱中取出約50mg冰凍組織,置于液氮中速凍。研磨后移入EP管;3)每個EP管中加入300L細胞蛋白裂解液,反復吹打混勻,振蕩器振蕩15s,冰上靜置反應20min;4)低溫快速離心收集管壁殘液;5)用UP200S超聲粉碎儀在冰上進行超聲粉碎,500Wx30s,以剪切DNA,降低粘稠度;6)低溫(4)離心12000轉15min,留取上清; 7)取2L上清,測定蛋白濃度,其余分裝后儲于-80備用。(2) 基側膜蛋白提取:取足量腎皮質于冰蔗

2、糖(250mmol/l蔗糖,5mmol/l tris-hepes,pH 7.4, 0.1mg/ml PMSF)緩沖液,離心1200gx15min;留上層物,離心22000gx15min;將松散的上層懸于蔗糖緩沖液,吹打均勻,并加入Percoll,離心39250gx30min,保留最暗的一層,用KCL緩沖液(85mmol/l KCl, 83mmol/l 蔗糖,2mmol/l trishepes,pH7.4)清洗3次,最后將膜蛋白提取物重懸于250mmol/l甘露醇緩沖液(250mmol/l 甘露醇,10mmol/l tris-hepes, pH 7.4, 0.1mg/ml PMSF)。基側膜成分

3、以Na-K-ATPase活性鑒定,該酶在基側膜活性比在勻漿中活性可高10倍【50】。 (2)蛋白濃度的測定1)標準曲線的繪制:將牛血清白蛋白(BSA)標準品用無菌生理鹽水稀釋成0l/ml、12.5l/ml、25l/ml、50l/ml、100l/ml、200l/ml共六管蛋白標準品。在核酸蛋白測定儀上設定相應的參數,以無菌生理鹽水為空白管調零,在儀器上測定上述各管蛋白標準液的A值,然后繪制成標準曲線。2)樣品蛋白濃度的檢測:取2l蛋白樣品溶液加入無菌生理鹽水98l中,在儀器上測定A值,根據標準取曲線及稀釋倍數即可得出樣品總蛋白濃度。(3)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳1)按Bio-Rad 說明書裝好

4、電泳用的玻璃裝置2)灌注分離膠和積層膠:分離膠 水 1.9ml30%丙烯酰胺 1.7ml 1.5M Tris HCL 1.3ml 10%SDS 0.05ml 10%過硫酸氨 0.005ml TEMED 0.005ml (灌膠前加)按上述成分和比例混勻,先加分離膠至玻璃緣下2cm 左右(預留梳子1cm 和積層膠1cm 左右),去離子水覆蓋。1020min 待分離膠聚合后,可見凝膠和水層之間明顯的界面。積層膠水 1.4ml30%丙烯酰胺 0.33ml1.0M Tris-HCL 0.25ml10%SDS 0.05ml 0.02ml10%過硫酸氨 0.002mlTEMED 0.005ml (灌膠前加)

5、灌積層膠:待分離膠聚合后倒掉去離子水,加按上述成分和比例混勻的積層膠。插入梳子,避免氣泡混入。放置至凝膠完全聚合。3)樣品準備:2上樣緩沖液和蛋白溶液按體積1:1 混勻,100加熱10min,瞬時離心。4)電泳:待濃縮膠完全聚合后,小心拔出梳子,去離子水沖洗梳孔,吸去多余水分。將玻璃板固定于垂直電泳槽中,充滿1電泳緩沖液。按照預定的上樣順序,每樣本20l,上樣完畢在剩余的加樣孔中加入等體積1SDS上樣緩沖液。積層膠電壓90V,待蛋白在積層膠和分離膠交界線壓薄后,換成電壓140V 至溴酚藍達分離膠底部,結束電泳。5)轉膜:將與分離膠大小一致的NC 膜100甲醇中浸泡1min,與分離膠、濾紙墊和海

6、綿墊一起放入預冷的1轉膜緩沖液中15min。按操作說明安裝轉膜系統:從負極到正極依次為海綿墊、濾紙墊、分離膠、NC 膜、濾紙墊和海綿墊。充滿預冷的1轉膜緩沖液,在負極側放入冰盒,以維持轉膜系統溫度不致太高。恒壓100V,轉90min。6)抗原抗體反應:電轉結束后,取出NC 膜,標記正反面后在TBS 中漂洗。7)麗春紅溶液染膜2min,去離子水漂洗,可以看到紅染的分子量大小不一的蛋白。TBST 洗去麗春紅。8)5脫脂奶粉室溫下阻斷60min,TBST 洗,10min3 次。9)孵育一抗:分別加入1:800 一抗稀釋液 稀釋的兔抗大鼠OAT1多克隆抗體,1:400一抗稀釋液稀釋的兔抗大鼠OAT3多

7、克窿抗體和1:1000 TBST 稀釋的-actin。4振蕩過夜后,TBST 洗,10min3次。10)孵育二抗:加入1:1000 5脫脂奶粉稀釋的HRP 標記的抗兔二抗,室溫下孵育60min 后,TBST 洗,10min3 次。11)顯影檢測:按Phototope-HRP Western Blot Detection System(CST,USA)操作規范,去離子水稀釋20X LumiGLO 和20 xPeroxide 成1x工作液。把NC 膜浸入ECL 發光液1min,濾紙吸除過多水份,保鮮膜包裹后放入暗盒。暗室中把KODAK膠片放入暗盒,曝光1min。然后放入自動洗片機中沖洗和烤干。12

8、)圖像分析:在凝膠成像和化學發光圖像分析系統上掃描和進行灰度分析。5.Na,K-ATPase活性:按照南京建成生物研究所Na-K-ATPase活性試劑盒說明書測定基側膜Na,K-ATPase活性小弟是新人,最近要用Xho和Hind酶切pGL2載體的MCS,由于兩種酶的Buffer不一樣所以只好分開兩次酶切。設第一次酶切的體系為20l,那反應后怎樣才能回收這20l中的載體以用作第二次酶切的底物呢?謝謝!我是直接用1/10醋酸鈉(PH5.2),2倍體積的無水乙醇直接沉淀過夜或者35個小時,然后離心,晾干,水溶后再用第二個酶進行切割。一般建議同時進行雙酶切(在兩種酶有通用buffer的情況下)第二,

9、采用酒精沉淀的方法。(1)在你第一次酶切后的產物中直接加入2.5-3倍體積的95%的乙醇,同時還要加入十分之一體積的3M的醋酸鈉(PH=5.2),混勻 放入-20度凍幾個小時或者過夜都沒有關系(2)13000RPM離心,傾倒出上清(但建議你最好用槍頭慢慢吸取上清,以免DNA有損失),應該可以看到顆粒狀的貼壁沉淀物(3)再加入一定量的70% 乙醇,輕輕洗滌沉淀后,離心去上清(同上面)(4)超靜臺里吹干(不能太干,10分鐘左右就好),水溶,加入第二種酶切體系對于第二次酶切產物,建議用回收試劑盒回收純化,這樣的話,DNA的損失是不大的第三,可以對第一次的酶切采取去另酸化處理,然后再進行二次酶切,這樣

10、也可以酶切充分的以上三種方法,你可以根據具體條件進行選擇沒必要,第一次酶切完后高溫使酶失活(具體溫度要看酶的失活溫度),然后再加入第二個酶及buffer,兩種酶的使用先后應該視所用的buffer而定,先用鹽離子濃度低的酶切再用鹽離子濃度高的酶切酶切,如果要使用兩種BUFFER不一樣的酶進行酶切,則應該先用鹽濃度低的再用鹽濃度高的去切。系統配好好,放37溫箱4個小時,4小時后取出,加入第二個酶系統,記得扣除先前加的那些液體的量,具體操作見我的那個本子。北大徐國恒教授做westernBLOT 的心得“樣品制備盡量用標準的protocol,因為步驟越多,則越容易出錯。蛋白樣品制備步驟過于繁瑣,是很多

11、新手失敗的原因。忠告,不要用所謂的蛋白制備方法,把所有的蛋白裂解在loading buffer里就可以了。抗體濃度高,可能是做不出來的主要原因。商品化的抗體很少做不出來。要是濃度太高了,背景可能漆黑一片。建議一抗1:1000-1:2000,二抗1:40001:10000.關于轉膜液中加入SDS,最好不要這樣做。標準的做法是轉膜前洗膠,把SDS洗掉。因為加SDS可能增加某些大分子150kd蛋白的溶解度,但是小分子則可能就此穿膜而過。轉膜前的泡膠最好小于十分鐘,因為過小的蛋白可能被洗去,要小心。電轉的問題,電泳的時候最好用恒壓80-100 2h(不要小于兩個小時。),但是轉膜的時候最好用恒流,200-400mA,保證充足的電流和時間。雖然低溫有利于保存抗原性,但是稍高一點也沒太大損失。(不正規操作,慎)、轉膜最好用硝酸纖維素膜。關于多余條帶。含天冬氨酸脯氨酸的蛋白,如IL-10,容易在偏酸性的條件下加熱降解,樣品bufferPH中性即可避免,應盡量避免過分煮沸2-5分鐘即可。熱變性是非常重要的,甚至重要過sds變性。在轉膜液中需不需要加甲醇,甲醇可防止大于20%的凝膠在水中膨脹變形,但小于

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論