1、如何利用如何利用Internet化學化工資源化學化工資源李曉霞李曉霞中國科學院過程工程研究所（原化工冶金所）如何利用網絡化學化工資源？如何利用網絡化學化工資源？ (How to find Internet chemical information?)n對象：信息資源對象：信息資源n學科：化學相關學科：化學相關n平臺：平臺：Internet獲取的方法、獲取的方法、工具工具40個學時個學時內容提要內容提要n為什么？為什么？n網絡平臺化學信息檢索步驟網絡平臺化學信息檢索步驟l檢索策略檢索策略、文獻管理工具、文獻管理工具EndNoten主要檢索工具主要檢索工具l主流工具及其主流工具及其工作原理工作原理

2、、功能特點功能特點n全文獲取及其發展全文獲取及其發展趨勢趨勢l主流期刊全文數據庫、全文傳遞主流期刊全文數據庫、全文傳遞lRepository、Open accessl其他全文：專利、學位論文、科技報告其他全文：專利、學位論文、科技報告n小結小結為什么為什么？n信息獲取貫穿科研工作的各個環節信息獲取貫穿科研工作的各個環節n信息缺失的代價信息缺失的代價n信息時代信息時代 信息獲取方式的改變信息獲取方式的改變nInternet 信息檢索的機遇與挑戰信息檢索的機遇與挑戰為什么？為什么？n獲取信息獲取信息: R&D不可或缺不可或缺、貫穿整個過程貫穿整個過程n選題選題 及方案制定及方案制定 方向如

3、何、可行否？方向如何、可行否？ n做實驗做實驗 (計算計算) 如何做？如何做？n數據處理數據處理 如何處理？如何處理？n總結規律總結規律 結果如何？結果如何？信息獲取和利用信息獲取和利用為什么為什么?n信息獲取信息獲取/ /分析分析是終身需要的基本技能是終身需要的基本技能 n職業素養的培養職業素養的培養n整體水平的差距整體水平的差距 有有n可利用資源的差距可利用資源的差距 有有n交流渠道的差距交流渠道的差距 有有n美國美國 經常性講座經常性講座n獲取信息的習慣與意識的差距獲取信息的習慣與意識的差距 ？n日本日本, , 澳大利亞澳大利亞為什么？為什么？ - 信息缺失的代價信息缺失的代價n重復性研

4、究重復性研究 低水平低水平n1960s, 美國，調研計算機用于信息檢索美國，調研計算機用于信息檢索, Lockheed Missiles and Space Companyn“ A common statement around Lockheed at the time was that it is usually easier, cheaper, and faster to redo scientific research than to determine whether it has been done previously”n災難后果災難后果Roger Summit, Reflecti

5、ons on Beginning of Dialog (1972-2002) The Birth of Online Information Access, June, 2002n信息災難信息災難 2001 2001年年n2001年夏一位參加年夏一位參加John Hopkins大學醫療哮喘大學醫療哮喘研究項目的志愿者因吸入研究項目的志愿者因吸入hexamethonium死亡死亡.n文獻數據庫文獻數據庫Pubmed: 1966 -nWebnHexamethonium副作用報道副作用報道 - 1950sn可檢索文獻數據庫可檢索文獻數據庫ToxlineSusan Feldman, The high

6、cost of not finding information, KMWorld, Vol 13 (3), Mar. 2004六甲銨六甲銨降血壓降血壓為什么？為什么？ - 信息缺失的代價信息缺失的代價 /robert/internet/timeline/為什么？為什么？ - Internet的影響的影響 (1969 - ) /robert/internet/timeline/為什么？為什么？ - Web的影響的影響 (1990 目前可用工具的基礎目前可用工具的基礎)Chemistry on the Internet:

7、The Library on Your ComputerChemical Engineering為什么？為什么？- 網絡對專業信息獲取的影響網絡對專業信息獲取的影響 n Gary Wiggins, 1998 文章文章n 我國我國1994正式接入互聯網正式接入互聯網n 我們開始建立我們開始建立ChIN, 1997為什么？為什么？- 網絡對科研方式的影響網絡對科研方式的影響 n JACS, 2003 社論社論n 出版專著出版專著Internet化學化工資源化學化工資源, 2000n 我開課我開課: 2001 -2003(所里所里), 2004 (研究生院研究生院)“電子化、互聯網已經改變了電子化、

8、互聯網已經改變了科學研究的方式科學研究的方式、研、研究究成果傳播方式成果傳播方式、學生、學生學習的方式學習的方式”Editorial, J. AM. CHEM. SOC. 2003, 125, p1-8化學化工文獻檢索方式化學化工文獻檢索方式的改變的改變檢索工具檢索工具CA, EI原始文獻 (紙介質)期刊文章、專利、專著、期刊文章、專利、專著、報告、會議文集等報告、會議文集等其他其他原始文獻 (紙介質 + 電子化電子化)期刊文章、專利、專著、期刊文章、專利、專著、報告、會議文集等報告、會議文集等其他各類其他各類WebWeb信息信息檢索工具檢索工具CA, EI門戶門戶搜索引擎搜索引擎數據庫引擎數

9、據庫引擎圖書館圖書館圖書館圖書館Internet(實驗室實驗室)為什么：機遇與為什么：機遇與挑戰挑戰n(網絡網絡)信息資源的特點信息資源的特點 nScattered nNo one knows what exists or where it isnNo single unified access pointn信息檢索的要求信息檢索的要求nThoroughly (信息完整性信息完整性 Internet, Yes, but)nCritically (信息的仔細評估信息的仔細評估 ?)nTimely (信息的及時性信息的及時性 Internet )n如何獲取如何獲取 非常重要非常重要2010: 網絡

10、化行為模式網絡化行為模式 碎片化的時代？碎片化的時代？注意力轉移快？注意力轉移快？如何利用如何利用Internet化學化工資源化學化工資源？n目標目標n掌握掌握信息源基本知識信息源基本知識 What information is accessible?n信息檢索方法與策略信息檢索方法與策略 How to retrieve it?n更多信息或求助來源更多信息或求助來源 Ask for more infon運用運用Internet已有工具已有工具n傳統文獻源傳統文獻源+網絡檢索網絡檢索 (完整性要求完整性要求)n獲取信息意識獲取信息意識n觀念觀念 - 理性的態度理性的態度 (facts)網絡化學信

11、息檢索的基本步驟網絡化學信息檢索的基本步驟n明確信息需求明確信息需求 找什么？找什么？l問題問題 模型化模型化(主題主題/關鍵詞、關鍵詞、同行同行)n整理檢索起點整理檢索起點 已知什么？已知什么？l直接、簡介直接、簡介n選擇檢索工具選擇檢索工具 信息源知識信息源知識n設計設計檢索策略檢索策略 如何檢索？如何檢索？l結合結合(問題描述問題描述 + 工具功能工具功能)n評價檢索結果評價檢索結果 (個性化個性化 復雜復雜)l結果滿意嗎？結果滿意嗎？l新的線索新的線索循環循環 滿意！滿意！檢索檢索 - - 沒有標準答案沒有標準答案檢索結果檢索結果 自我評價自我評價信息檢索的基本步驟信息檢索的基本步驟n

12、明確信息需求明確信息需求/整理檢索起點整理檢索起點 舉例舉例n音樂之聲音樂之聲插曲插曲 - - 雪絨花的歌詞雪絨花的歌詞 ( (英語英語) )n工具：工具：GoogleGoogle， 可能的策略？可能的策略？( (不討論不討論baiduMP3)baiduMP3)n已知：音樂之聲已知：音樂之聲n模型化：雪絨花模型化：雪絨花 + + 歌詞歌詞 + +英語英語 找不到找不到! !n挖掘線索挖掘線索：歌詞：歌詞 “small and white”“small and white”或者歌名或者歌名/ /歌詞原文歌詞原文“EdelweissEdelweiss”n注意注意：EdelweissEdelweis

13、s僅為一種植物，應該加限制條件，僅為一種植物，應該加限制條件，如如EdelweissEdelweiss + + musicmusic ( (電影名稱原文的一部分電影名稱原文的一部分) )n注意注意：早期例子，由于：早期例子，由于GoogleGoogle索引覆蓋面擴大，結索引覆蓋面擴大，結果不同了，思路供參考果不同了，思路供參考為什么？為什么？為什么？為什么？Google是全文檢索是全文檢索Google是通用搜索是通用搜索增加限制條件可鎖定目標增加限制條件可鎖定目標信息檢索的基本步驟信息檢索的基本步驟n明確信息需求明確信息需求/整理檢索起點整理檢索起點 舉例舉例n一個站點雜志及創辦人一個站點雜志

14、及創辦人 間接線索間接線索n線索線索: : 訪談雜志，曾訪談訪談雜志，曾訪談“Wendy Warr”nGoogle “wendy warr“Google “wendy warr“得到訪談文章得到訪談文章n從文章鏈接從文章鏈接 ReportsReactive Reports”n利用利用Google/ChINGoogle/ChIN檢索檢索“”“”或或 直接利用域名到雜志站點得知期刊創辦人直接利用域名到雜志站點得知期刊創辦人為為”David Bradley”David Bradley”為什么？為什么？Google是是全文檢索全文檢索信息檢索的基本步驟信息檢索的基本步驟n明確信息需求明確信息需求/整理

15、檢索起點整理檢索起點 舉例舉例n院士張春霆研究組的網頁院士張春霆研究組的網頁n線索：天津大學、線索：天津大學、生物信息學、張春霆生物信息學、張春霆n線索：線索：Zcurve方法方法nGoogle “張春霆”、“生物信息學” “天津大學” NonGoogle “Zcurve” 學生網頁學生網頁Link to 張張groupn注意注意：早期例子，由于：早期例子，由于GoogleGoogle索引覆蓋面擴大，結果索引覆蓋面擴大，結果不同了，思路供參考不同了，思路供參考信息檢索的基本步驟信息檢索的基本步驟n科研項目信息檢索的起點科研項目信息檢索的起點 建議建議 n課題組原有的積累課題組原有的積累 ( (

16、工作工作+ +文獻文獻) )nReviewReview文章文章n近期的文章近期的文章n經典文章經典文章 引用引用l相關術語相關術語 檢索關鍵詞檢索關鍵詞l同行及課題組同行及課題組l學術會議、論壇學術會議、論壇檢索步驟：選擇檢索工具檢索步驟：選擇檢索工具 - 信息源知識的重信息源知識的重要性要性 n一公司合成出某化學品、欲知其分析方法及物一公司合成出某化學品、欲知其分析方法及物性性 (2010)(2010)n網絡：找到一部分，無法得出嚴謹的結論網絡：找到一部分，無法得出嚴謹的結論l所里可用的信息源受限制所里可用的信息源受限制n線索：清華線索：清華有有SciFinder (美國化學文摘美國化學文摘

17、CA)lSciFinder上不去上不去 - busyl意外發現另一個工具可用意外發現另一個工具可用 CrossFire (Beilstein有有機合成手冊、機合成手冊、Gmelin手冊手冊)n結果：結果：CrossFire給出了系統的結果給出了系統的結果n信息源知識的重要性信息源知識的重要性 需要積累需要積累n了解科學院、研究所訂閱情況了解科學院、研究所訂閱情況l方法：檢索方法：檢索CSDLCSDL、“查看具體研究所查看具體研究所”n了解各種可能的來源了解各種可能的來源 圖書館圖書館/ ChINl免費資源免費資源l館際互借館際互借 文獻傳遞文獻傳遞l互相幫忙互相幫忙 論壇、其他求助論壇、其他求

18、助檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例n從從NSFC檢索與檢索與Internet有關的資助項目有關的資助項目l檢索輸入：檢索輸入：“Internet”檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例n從從NSFC檢索與檢索與Internet有關的資助項目有關的資助項目l檢索輸入：檢索輸入：“Internet” (猜測檢索字段：項目名稱猜測檢索字段：項目名稱)檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例n從從NSFC檢索與檢索與Internet有關的資助項目有關的資助項目l檢索輸入：檢索輸入：“互聯網互聯網”檢索步驟檢索

19、步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例n從從NSFC檢索與檢索與Internet有關的資助項目有關的資助項目n術語規范化術語規范化 影響檢索準確性的基本問題影響檢索準確性的基本問題lSynonymy (一義多詞、多形態一義多詞、多形態)lPolysemy (一詞多義一詞多義)文獻數據庫文獻數據庫 信息加工水平的標志信息加工水平的標志l 是否有可控詞庫是否有可控詞庫( (主題詞表主題詞表) )？l 是否有敘詞表？是否有敘詞表？李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例李曉霞 中國科學院過程工程研究所 20

20、07.10檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例觀察檢索結果標題觀察檢索結果標題 “分析分析”相關術語：相關術語：l “ “測定測定”l “顯色反應顯色反應”l 李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10檢索步驟檢索步驟 設計檢索策略的重要性設計檢索策略的重要性 舉例舉例檢索步驟檢索步驟 檢索策略優化檢索策略優化l合適的檢索工具合適的檢索工具l利用檢索工具的主題詞表、索引利用檢索工具的主題詞表、索引n例如例如EI browse indexesl關鍵詞關鍵詞(術語術語)的優化的優化l檢索字段調整、優化檢索字段調整、優化n擴大檢索范圍：擴大檢索范圍： 標題標題(

21、TI) 主題詞主題詞 (subject/keywords/CV)李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9化學化工文獻檢索流程化學化工文獻檢索流程 (3步步)原始文獻 (紙介質 + 電子化電子化)期刊文章、專利、專著、期刊文章、專利、專著、報告、會議文集等報告、會議文集等其他各類其他各類WebWeb信息信息(Web)檢索工具檢索工具摘要庫摘要庫 ( (CA, EI)門戶門戶搜索引擎搜索引擎數據庫引擎數據庫引擎Internet檢索結果保存檢索結果保存復印、打印復印、打印文獻管理工具文獻管理工具文獻管理工具文獻管理工具李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9文獻管理工具文獻管理工具 nE

22、ndNote (中科院統一訂閱中科院統一訂閱)nReference ManagernProCitenThomson ResearchSoftn1000種文獻格式種文獻格式Niles SoftwareResearch Information Systems (RIS)李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9文獻管理工具文獻管理工具 建立自己的文獻數據庫建立自己的文獻數據庫 n導入導入 參考文獻信息參考文獻信息n手工手工n檢索結果文件檢索結果文件 - 自動導入自動導入n在線在線檢索檢索 - 直接自動導入直接自動導入n導出導出 論文參考文獻插入與格式自動生成論文參考文獻插入與格式自動生成nEn

23、dNote - WORD (論文寫作論文寫作)投國際期刊、論文修改投國際期刊、論文修改 EndNote內置其文獻格式內置其文獻格式李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2013.4EndNote 建立自己的文獻數據庫建立自己的文獻數據庫 信息檢索結果評價信息檢索結果評價 估計估計n相關文檔相關文檔 (Rel) 應該得到的應該得到的n檢索結果檢索結果 (Retr) 所得到的所得到的n查全率查全率 (Recall) n查準率查準率 (Precision)RetrRel李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9主要主要檢索工具檢索工具 - 類型類型 (Index)n文獻數據庫文獻數據庫(Web)n摘

24、要庫摘要庫n學科資源導航學科資源導航(信息源知識信息源知識)lChIN: http:/ n資源搜索引擎資源搜索引擎l通用：通用：Google, 百度百度l科技搜索：科技搜索：SciRus, Google Scholarl化學專業：化學專業：Pubchem, （我（我們）們）期刊文章、專利、專著、期刊文章、專利、專著、學位論文、報告等學位論文、報告等WebWeb信息信息系統系統部分部分李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9主要檢索工具：主要檢索工具：文獻摘要庫文獻摘要庫 平臺平臺n在線系統在線系統STN、Dialog、Questel Orbitn聯機系統聯機系統(online servi

25、ce, 1972 - )n磁帶磁帶 (1967 ) 光盤光盤 (正在消亡正在消亡)nInternet：基于：基于Web的摘要數據庫的摘要數據庫 ( 1995 -)文獻摘要數據庫文獻摘要數據庫 bibliographic database李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9n文摘數據庫文摘數據庫 (各有特色、互有重疊各有特色、互有重疊)nCA (Chemical Abstracts, SciFinder) 化學化學nEI (Engineering Village 2) 化學化工化學化工 15%nCurrent Contents - ISI Web of Knowledgeu多學科、全文

26、鏈接多學科、全文鏈接 *nCSA (劍橋科學文摘劍橋科學文摘) 材料材料nBIOSISnPubMed 醫學醫學(免費免費)n重慶維普重慶維普中文科技期刊中文科技期刊全文數據庫全文數據庫, CNKI, NSTL (面向全國面向全國)n其他其他主要檢索工具：主要檢索工具：文獻摘要庫文獻摘要庫 李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.9n文摘數據庫文摘數據庫n會議錄會議錄ISTP - ISI Web of Knowledge nPQDT.B學位論文學位論文數據庫數據庫nDewent世界世界專利專利索引索引 - ISI Web of Knowledgen免費免費專利專利檢索檢索 (USPTO、世界

27、各國世界各國專利專利espcenet等等)n美國科技報告檢索美國科技報告檢索 (NTIS等等)n其他其他主要檢索工具：主要檢索工具：文獻摘要庫文獻摘要庫 趨勢：文獻摘要數據庫趨勢：文獻摘要數據庫 對應的全文鏈接對應的全文鏈接 并不意味著并不意味著：摘要庫與全文庫是同一個庫：摘要庫與全文庫是同一個庫文獻摘要數據庫文獻摘要數據庫 工作原理及檢索功能工作原理及檢索功能n文獻數據庫檢索文獻數據庫檢索n文獻著錄信息文獻著錄信息 - 數據庫數據庫 (類似圖書館卡片類似圖書館卡片)n經過人加工、格式規范經過人加工、格式規范n可檢索字段可檢索字段 Title, Author, Keywords n原理：檢索式

28、原理：檢索式 = (匹配匹配) 被檢索字段值被檢索字段值 檢索結果檢索結果n組合檢索組合檢索 布爾代數布爾代數n檢索結果子集檢索結果子集 邏輯運算邏輯運算n運算符：運算符：AND, OR, NOTnAND (intersection) 交集交集nOR (union) 并集并集nNOT (complement) 補集補集推薦：推薦：高級檢索高級檢索索引索引 - - 關系數據庫關系數據庫檢索策略比較：檢索策略比較：l檢索檢索式式：“EI”? OK, 結果較多結果較多l檢索檢索式式：“Village”? better!l檢索檢索式式：“工程索引工程索引” ? No!文獻摘要數據庫檢索文獻摘要數據庫檢

29、索n組合檢索組合檢索 布爾代數布爾代數 舉例舉例n檢索結果子集檢索結果子集 邏輯運算邏輯運算n運算符：運算符：AND, OR, NOTn例如：例如：我們組的化合物搜索引擎我們組的化合物搜索引擎的組合檢索功的組合檢索功能能 ()n逐步增加檢索條件逐步增加檢索條件 - 供應商供應商(中文名稱中文名稱 )n檢索：蘇州生物制藥方面的公司檢索：蘇州生物制藥方面的公司高級檢索高級檢索細化細化文獻摘要數據庫檢索文獻摘要數據庫檢索n組合檢索組合檢索 布爾代數布爾代數 舉例舉例n檢索結果子集檢索結果子集 邏輯運算邏輯運算n運算符：運算符：AND, OR, NOTn例如：我們組的化合物搜索引擎的組合檢索功例如：我

30、們組的化合物搜索引擎的組合檢索功能能 ()n逐步增加檢索條件逐步增加檢索條件 - 產品產品(中文名稱中文名稱 +分子式分子式)文獻摘要數據庫檢索文獻摘要數據庫檢索n組合檢索組合檢索 布爾代數布爾代數 為什么能夠檢索？為什么能夠檢索？n經過人的組織、加工經過人的組織、加工n數據庫管理數據庫管理文獻摘要數據庫檢索文獻摘要數據庫檢索n組合檢索組合檢索 主流數據庫基本功能主流數據庫基本功能信息檢索基本問題信息檢索基本問題n有效交流有效交流 - 相同的語言相同的語言n檢索檢索 (匹配匹配) 一致表達一致表達nPolysemy (一詞多義一詞多義)n同一個詞有不同的含義同一個詞有不同的含義, e.g. “

31、擴散擴散”n社會學里：社會學里：“內部傳達，不要擴散內部傳達，不要擴散” - 傳播、流傳傳播、流傳n健康領域：癌癥：健康領域：癌癥：“擴散擴散”- 轉移轉移n化學：分子化學：分子/離子在一相分散的過程，從濃度高向低離子在一相分散的過程，從濃度高向低nSynonymy (一義多詞一義多詞)n同一個概念用不同的同一個概念用不同的 詞表達詞表達 (習慣習慣)文獻數據庫加工、格式規范文獻數據庫加工、格式規范n文章索引標準化文章索引標準化 - standardized terminologyn受控詞表受控詞表 文獻數據庫文獻數據庫規范化術語索引規范化術語索引 (防漏檢防漏檢)nControlled Vo

32、cabularies / Controlled Termsn如：主題詞表如：主題詞表(subject headings) n敘詞表敘詞表 (Thesauri) 以自己熟悉的詞為起點以自己熟悉的詞為起點n詞之間的關系詞之間的關系n縮小、擴大概念范圍縮小、擴大概念范圍n相關詞匯相關詞匯文獻摘要數據庫加工文獻摘要數據庫加工 - 受控詞表受控詞表n受控詞表受控詞表nControlled Vocabularies / Controlled Terms文獻摘要數據庫加工文獻摘要數據庫加工 - Stemmingn術語規范化術語規范化l不同詞性不同詞性/形式形式 詞根詞根(stem)l檢索工具：檢索工具：打開

33、或關閉打開或關閉stemming李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2012nISI Current Contents Connect檢索檢索n檢索結果分析檢索結果分析n例：例：Data mining + 化學領域化學領域n如果如果TI/TS=(data mining), 按領域分析按領域分析 (結果頁右結果頁右側上方圖標側上方圖標)nCC CLASSIC SEARCHnTI=(data mining)nDIS=(chem*)n結果分析結果分析 (國家國家, 2010無此字段選項，無此字段選項，2011有有)文獻摘要數據庫文獻摘要數據庫 分析功能分析功能 (策略優化依據策略優化依據)ISICur

34、rent Contents Connect 檢索結果分析檢索結果分析時間限制：時間限制：2009 ISICurrent Contents Connect 檢索結果分析檢索結果分析引文報告引文報告(2013)檢索步驟檢索步驟 檢索策略優化檢索策略優化l合適的檢索工具合適的檢索工具l推薦檢索模式：推薦檢索模式：高級檢索高級檢索 (更好地描述檢索策略更好地描述檢索策略)l利用檢索工具的主題詞表、索引利用檢索工具的主題詞表、索引n例如例如EI browse indexesl關鍵詞關鍵詞(術語術語)的優化的優化l檢索字段調整、優化檢索字段調整、優化n擴大檢索范圍：擴大檢索范圍： 標題標題(TI) 主題詞

35、主題詞 (subject/keywords/CV)l容易重名的字段容易重名的字段(縮寫加重這一問題，例：縮寫加重這一問題，例：Web of Knowledge)n作者名作者名n作者單位名作者單位名李曉霞,中國科學院過程工程所 2013n通用資源搜索引擎通用資源搜索引擎nGoogle、百度百度(中文雜項中文雜項)n科學搜索引擎科學搜索引擎nScirus, Google Scholar, Google Booksn百科全書百科全書(科技科技)：wikin化學化工專業搜索引擎化學化工專業搜索引擎n文本搜索：文本搜索：Cn化合物數據搜索：化合物數據搜索： nPubChem, eMolecule (Ch

36、moogle), ChemSpidernChemDB Portal (我們：我們：)主要檢索工具：主要檢索工具：搜索引擎搜索引擎 n可檢索詞可檢索詞 文檔中的所有詞文檔中的所有詞 (every word)n文檔文檔未經過人工加工未經過人工加工 (文獻數據庫文獻數據庫 人加工人加工)n計算機計算機 文本規范性處理文本規范性處理建索引建索引n停用詞過濾停用詞過濾 (a, the, we, chemistry?)n詞干歸一化詞干歸一化(stemming)n檢索結果的打分、排序檢索結果的打分、排序n例如：詞頻統計例如：詞頻統計n檢索結果檢索結果 太多太多n高級檢索高級檢索 檢索策略檢索策略Google

37、是通用搜索是通用搜索增加限制條件可鎖定目標增加限制條件可鎖定目標例：例：Edelweiss + music主要檢索工具：搜索引擎主要檢索工具：搜索引擎 檢索檢索 全文檢索全文檢索李曉霞,中國科學院過程工程所 2013nChIN 國內權威、國際承認國內權威、國際承認 (since 1997)l化學信息源知識化學信息源知識 幫助選擇不同類型工具幫助選擇不同類型工具l本身也是一個精選資源檢索工具本身也是一個精選資源檢索工具主要檢索工具：主要檢索工具：導航導航 系統系統(門戶門戶)61日本同行建立了日本同行建立了ChIN的日文版的日文版(2008 -)化學化學信息檢索工作原理及功能信息檢索工作原理及功

38、能n工具類型：工具類型：化學數據庫化學數據庫 化學結構檢索化學結構檢索n化學結構化學結構 (1D, 2D, 3D) n1D SMILES, InChI (New): 檢索途徑檢索途徑n2D MOL, RDF, : 檢索途徑檢索途徑n3D MOL, PDB, CIF (幾何優化幾何優化)n應用：應用：3D構象搜索、優化構象搜索、優化 - 藥物設計、分子模擬藥物設計、分子模擬n目前國際化學數據庫發展趨勢：目前國際化學數據庫發展趨勢：2D結構的檢索結構的檢索n全結構全結構(exact match) 唯一唯一n子結構子結構 (substructure)n相似性檢索相似性檢索 基于基于fingerpri

39、nt n舉例：我們的化合物搜索引擎舉例：我們的化合物搜索引擎n舉例：舉例：Web of Knowledge的化學模塊的化學模塊1D 2D結構結構可互相轉化可互相轉化化學結構化學結構的組合檢索的組合檢索數值型數據庫NIST：Chemistry WebBook李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.1070Internet化學化工數據庫化學化工數據庫n舉例：舉例：n從從NIST Chemistry WebBook檢索苯的數據檢索苯的數據n數據全數據全 (物化性質、譜圖、基元反應等物化性質、譜圖、基元反應等)李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10全文獲取及趨勢全文獲取及趨勢n一次文獻類

40、型及其所占比例一次文獻類型及其所占比例李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10Internet化學化工電子期刊進展化學化工電子期刊進展n電子期刊全文電子期刊全文 ( (文本文本 No Eqs., Graphs) )nJournal of Medicinal Chemistry, 1000篇文章篇文章, 試用試用, 1980n16種種ACS期刊全文通過期刊全文通過BRS在線在線, 1982nACS期刊全文上線期刊全文上線STN, 1983 1986nRSC, Elsevier, John Wiley , 1983 1986STN - 1995美國化學會美國化學會ACS: 19種種英國化學

41、會英國化學會RSC: 10種種 Elsevier: 4種種Wiley: 5種種Before Internet李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2012.10基于基于Web電子期刊全文電子期刊全文nScience AAAS, HighWiren1995 - nScienceDirect Elseviern1997 n1100 journals 1800 journalsnSTM (科學、技術、醫學科學、技術、醫學)nACS journals - - 美國化學會美國化學會n1997 免費試用免費試用n1998 收費服務收費服務nInterScience John Wiley (400)nSprin

42、gerLink (1600)1994我國加入我國加入InternetNetscape beta 版版李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10Internet化學化工電子期刊進展化學化工電子期刊進展n基于基于W Webeb的的期刊電子化期刊電子化nSciencen1995 - n整個刊物的電子化整個刊物的電子化 ( (backfiles) )n美國物理學會美國物理學會n美國化學會美國化學會 - 2002 (2000 - 2002 (2000秋季宣布秋季宣布) )n1879 - 1997n英國皇家化學會英國皇家化學會 - (2003 - (2003春季宣布春季宣布) )n1841 - 19

43、96 nElsevier - (200- (2004.74.7宣布宣布完成完成, 3, 3年年) )nJohn Wiley (2004.11, 完成完成11種期刊種期刊)83%科技期刊已上網科技期刊已上網Accounts of Chemical Research, 37(3), 2004李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2012.10CSDL訂閱的訂閱的電子期刊全文庫電子期刊全文庫nScienceDirect Elsevier (1800)nWiley-Balckwell online library (2011- )nWiley InterScience John Wiley (400)nB

44、lackwell SynergynSpringerLink Springer (1600)nACS journals - - 美國化學會美國化學會 (30) (30)nRSC journals 英英國皇家化學會國皇家化學會 (30) (30)nNature, SciencenCNKI 國內中文科技期刊國內中文科技期刊 (8000)n重慶維普重慶維普 中文科技期刊中文科技期刊 (7953)nMore?查看查看CSDLl 摘要檢索工具摘要檢索工具(EI, Web of Knowledge)檢索摘要的范圍囊括了這些全文庫檢索摘要的范圍囊括了這些全文庫+其他出版商的期刊其他出版商的期刊l 出版商的全文

45、庫出版商的全文庫 均有自己的檢索引擎均有自己的檢索引擎李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10Internet化學化工電子期刊化學化工電子期刊 附加數據附加數據n舉例：舉例：E. J. Corey發表發表2002年年在在JACS上的上的一篇論文附帶的數據一篇論文附帶的數據nRef: JACS, 124(27), 7904- 7905n步驟步驟n從從ChIN定位到定位到ACS期刊檢索頁期刊檢索頁n直接定位文章直接定位文章 / 通過檢索定位文章通過檢索定位文章n下載附帶數據下載附帶數據: 點擊、另存點擊、另存 (.cif) n下載下載Viewer: Rasmol (課件課件)n觀看數據觀看

46、數據李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10 詳細的實驗過程詳細的實驗過程 更完整的數據更完整的數據ACS期刊期刊: : 附帶數據附帶數據課件：課件：ACS-corey-supporting-info-2002.cifRasMol: raswin-272.exe李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2012.10nOpen Access (開放獲取開放獲取)“journals that use a funding model that does not charge readers or their institutions for access. - DOAJ.ORG網絡期刊網絡期刊的影

47、響的影響 出版商出版商李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed CentralnPublication is the last phase of Research processn作者交出版費作者交出版費 ( (科研經費的一部分科研經費的一部分) )n同行評審同行評審 標準標準n130130種期刊種期刊 (2005.11) (2005.11)nISI, Scopus, Google Scholarn免費全文免費全文網絡期刊網絡期刊的影響的影響 出版商出版商李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed Cen

48、tral李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed Central李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2013.nOpen Access 美國美國2013 (文章發表文章發表1年后免費年后免費)李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nOpen Access Chemistry Central李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nRepository PubMed CentralnNCBI, NLM, NIHn永久保藏永久保藏n213213種期刊種期刊 (2005.11) (2005.11)n版權仍屬于原出版者版權仍屬于原出版者nN

49、IHNIH資助項目：作者提交文章資助項目：作者提交文章n免費全文免費全文網絡期刊網絡期刊的影響的影響 信息服務者信息服務者李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nRepository PubMed Central李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10nRepository PubMed Central李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2012.10網絡期刊網絡期刊的影響的影響 讀者讀者n獲取一篇文章的全文獲取一篇文章的全文n過去過去n檢索工具檢索工具, ,圖書館書架圖書館書架( (字母序字母序) )、全文傳遞服務、全文傳遞服務n現在現在( (1995 -1995 -) )n

50、摘要摘要檢索工具檢索工具(Web of Knowledge)(Web of Knowledge) - - 期刊出版者網期刊出版者網站站 檢索檢索 全文全文 ( (無縫無縫) )n出版商出版商摘要檢索工具摘要檢索工具 全文全文 ( (無縫無縫) () (Scirus, SciVerse) )n圖書館圖書館摘要檢索工具摘要檢索工具( (圖書館收藏目錄圖書館收藏目錄) ) 全文全文 ( (NSTLNSTL、CSDLCSDL全文傳遞全文傳遞) )n搜索引擎搜索引擎 全文全文 ( (無縫無縫, , 作者網頁作者網頁) )n搜索引擎搜索引擎 全文全文 ( (無縫無縫, , 作者單位網頁作者單位網頁) )n

51、檢索工具檢索工具 全文全文 ( (無縫無縫, , Repository) )李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10期刊文章全文獲取期刊文章全文獲取n中國科學院訂閱的期刊全文中國科學院訂閱的期刊全文 CSDLn是否全院訂閱、是否所里訂閱是否全院訂閱、是否所里訂閱?n文章是否在訂閱庫的覆蓋范圍？文章是否在訂閱庫的覆蓋范圍？n是否已經電子化？是否已經電子化？n免費途徑免費途徑n全文傳遞全文傳遞 ( - 1995, 早期文獻早期文獻)n全國期刊聯合目錄全國期刊聯合目錄nN NSTLSTLn其他其他n向作者索要向作者索要李曉霞 中國科學院過程工程研究所 2007.10引用與研究者影響引用與研究者影響科學家訪談：科學家訪談：2008年之后在年之后在sciencewatch李曉霞 中國科學院過程工程研究所 20