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文檔簡(jiǎn)介
1、常用功能和應(yīng)用主要內(nèi)容主要內(nèi)容一:一:ChemDraw 二:二:ChemDraw 三:三:ChemDrawCambridgeSoft開(kāi)發(fā)的綜合性科學(xué)應(yīng)用軟件包,開(kāi)發(fā)的綜合性科學(xué)應(yīng)用軟件包,是為廣大從事化學(xué)、生物研究領(lǐng)域的科研人是為廣大從事化學(xué)、生物研究領(lǐng)域的科研人員個(gè)人使用而設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品。員個(gè)人使用而設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品。一、一、 ChemDraw 簡(jiǎn)介簡(jiǎn)介ChemDraw 作為化學(xué)和生物工作者必須的有用的繪制軟件,作為化學(xué)和生物工作者必須的有用的繪制軟件,它的使用已成為一門(mén)最基本的技能。它的使用已成為一門(mén)最基本的技能。ChemDraw可編輯與化學(xué)和生物有關(guān)的絕大多數(shù)圖形。可編輯與化學(xué)和生物有關(guān)的
2、絕大多數(shù)圖形。如:建立和編輯各類(lèi)分子式、方程式、結(jié)構(gòu)式、立體圖形、對(duì)稱(chēng)圖形、如:建立和編輯各類(lèi)分子式、方程式、結(jié)構(gòu)式、立體圖形、對(duì)稱(chēng)圖形、軌道等,并能對(duì)圖形進(jìn)行翻轉(zhuǎn)、旋轉(zhuǎn)、縮放、存儲(chǔ)、復(fù)制、粘貼等多種操作。軌道等,并能對(duì)圖形進(jìn)行翻轉(zhuǎn)、旋轉(zhuǎn)、縮放、存儲(chǔ)、復(fù)制、粘貼等多種操作。 OOHOHOHOHCH2OHOOHOOH2-propanone2mol4-Hydroxy-4-methyl-pentan-2-one1molCambridgeSoft開(kāi)發(fā)的綜合性科學(xué)應(yīng)用軟件包,開(kāi)發(fā)的綜合性科學(xué)應(yīng)用軟件包,是為廣大從事化學(xué)、生物研究領(lǐng)域的科研人是為廣大從事化學(xué)、生物研究領(lǐng)域的科研人員個(gè)人使用而設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品
3、。員個(gè)人使用而設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品。圖形工具板圖形工具板編輯區(qū)編輯區(qū)滾動(dòng)欄滾動(dòng)欄菜單欄菜單欄工具欄工具欄ChemDraw 界面界面鍵工具鍵工具模板工具模板工具箭頭工具箭頭工具軌道工具軌道工具畫(huà)圖工具畫(huà)圖工具基元工具基元工具符號(hào)工具符號(hào)工具弧形工具弧形工具原子反應(yīng)工具原子反應(yīng)工具二、二、ChemDraw 常見(jiàn)功能常見(jiàn)功能 化學(xué)結(jié)構(gòu)的繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)的繪制 文本說(shuō)明和文字標(biāo)記文本說(shuō)明和文字標(biāo)記 繪制軌道和符號(hào)繪制軌道和符號(hào) 繪制箭頭,弧及其他圖形繪制箭頭,弧及其他圖形 選擇應(yīng)用選擇應(yīng)用1. 化學(xué)結(jié)構(gòu)的繪制化學(xué)結(jié)構(gòu)的繪制p 固定鍵的長(zhǎng)度,角度固定鍵的長(zhǎng)度,角度 軟件對(duì)鍵的長(zhǎng)度有一定的限制,在Object下拉菜
4、單中,點(diǎn)擊Fixed lengths,則畫(huà)出的鍵長(zhǎng)度固定。同樣的方法Fixed angles用于固定鍵的角度,默認(rèn)值15度為一個(gè)單位。如果需要臨時(shí)改變鍵的長(zhǎng)度或者角度,按下Alt鍵,同時(shí)按動(dòng)鍵到所需長(zhǎng)度和角度即可。p 楔鍵工具楔鍵工具點(diǎn)擊楔鍵工具,從楔鍵窄面點(diǎn)按動(dòng)到寬面另一點(diǎn)。繪制完成后,將鼠標(biāo)放在鍵上,單擊即可改變鍵的方向 。p 碳?xì)溟L(zhǎng)鏈的繪制碳?xì)溟L(zhǎng)鏈的繪制 使用無(wú)環(huán)鏈 工具,選擇后單擊,在彈出的對(duì)話框中輸入鍵的個(gè)數(shù)即可。按住鼠標(biāo),上下移動(dòng)可以改變長(zhǎng)鏈的方向。p 雙鍵雙鍵 選擇實(shí)鍵工具,點(diǎn)擊繪制單鍵,在單鍵基礎(chǔ)上再按動(dòng)一次即可得到雙鍵。通過(guò)在雙鍵中間(出現(xiàn)光標(biāo)塊)的點(diǎn)擊可以改變雙鍵的位置,在
5、上,在下或中間。 p雙抉擇鍵雙抉擇鍵 在雙鍵基礎(chǔ)上,選擇波浪鍵,在雙鍵上點(diǎn)擊即可。p 鍵的前后交叉鍵的前后交叉 雙擊;使用object菜單中的bring to front 和 send to back實(shí)現(xiàn) 注意:以上按動(dòng)和點(diǎn)擊的區(qū)別,按動(dòng)是按住鼠標(biāo),拉出一根鍵注意:以上按動(dòng)和點(diǎn)擊的區(qū)別,按動(dòng)是按住鼠標(biāo),拉出一根鍵后松開(kāi),點(diǎn)擊是單擊的意思。后松開(kāi),點(diǎn)擊是單擊的意思。2. 文本說(shuō)明和文字標(biāo)記文本說(shuō)明和文字標(biāo)記2.1 建立文本的方法:建立文本的方法:u利用文本工具 ,在所希望出單擊即可。需要重新編輯的話,在原文本處單擊。在工具欄Text下拉菜單中,可以改變字體,字形,以及字號(hào)u在字形子菜單中包括三種
6、常見(jiàn)字的操作:Superscript(上標(biāo))、Subscript(下標(biāo))、Formula(字形,數(shù)字自動(dòng)縮小)。比如輸入C6H6時(shí),自動(dòng)形成C6H6。u文本文件默認(rèn)的是左對(duì)齊,在Text下拉菜單中有Flush Left(左對(duì)齊), Centered(中間對(duì)齊), Flush Right, Justified(兩端對(duì)齊)Stacked Above(上標(biāo)記調(diào)整)。 u希臘字母的輸入:在Text菜單中的Font子菜單選擇Symbol,字母與希臘字母對(duì)應(yīng)關(guān)系-a, -b, -p, -w等等,基本根據(jù)形聲進(jìn)行對(duì)應(yīng)。3. 繪制軌道和符號(hào)繪制軌道和符號(hào) p軌道工具軌道工具 點(diǎn)擊會(huì)出現(xiàn)一系列子目錄,使用方便,
7、可以繪制各種軌道 p化學(xué)符號(hào)化學(xué)符號(hào) 點(diǎn)擊即可進(jìn)入。 和 分別表示沿Z軸向平面外伸和進(jìn)入的H原子。陽(yáng)離子陰離子符號(hào),在對(duì)應(yīng)原子附近定位,當(dāng)出現(xiàn)反色的小方塊時(shí),點(diǎn)擊即可,符號(hào)會(huì)自動(dòng)集成到原字上。表示帶電的基團(tuán)。 4. 繪制箭頭,弧及其他圖形繪制箭頭,弧及其他圖形 p箭頭工具箭頭工具 根據(jù)需要選擇,按住鼠標(biāo)左鍵可進(jìn)行箭頭的拉伸,縮短和轉(zhuǎn)向。p基元工具基元工具 內(nèi)含一些球形工具,用于繪制3D分子結(jié)構(gòu),線工具,用于繪制直線虛線等,可以畫(huà)立體圖形,如正八面體等。還有一些方框工具,可以把所繪結(jié)構(gòu)放到方框中,更為正規(guī)。 p 括號(hào)工具括號(hào)工具 內(nèi)含大小中括號(hào)和兩個(gè)短鍵工具 , 。特別用于繪制有配位結(jié)構(gòu)的化學(xué)方
8、程式。p 弧形工具弧形工具 可以繪制固定角度的弧,同樣用shift可以進(jìn)行旋轉(zhuǎn)和大小的調(diào)整。 5. 選擇應(yīng)用選擇應(yīng)用 p 選擇應(yīng)用及旋轉(zhuǎn)、縮放選擇應(yīng)用及旋轉(zhuǎn)、縮放 套索和 蓬罩選擇框,一個(gè)是任意形狀選中,一個(gè)是規(guī)則矩形選中,選中物體后,同時(shí)具有縮放和旋轉(zhuǎn)物體功能。 選中物體后,光標(biāo)指向在所出現(xiàn)矩形框右上角的一個(gè)黑色的直角弧,出現(xiàn)一個(gè)具有雙箭頭的弧線,按住鼠標(biāo)左鍵即可旋轉(zhuǎn)所繪圖形。鼠標(biāo)移向右下角時(shí)出現(xiàn)一個(gè)雙箭頭拉伸符,按住既可縮放圖形。而在雙擊雙箭頭符號(hào)時(shí)會(huì)出現(xiàn)一個(gè)對(duì)話框,可以設(shè)置拉伸的百分比和旋轉(zhuǎn)的具體角度。 p 移動(dòng)結(jié)構(gòu)移動(dòng)結(jié)構(gòu) 選擇結(jié)構(gòu)后,光標(biāo)移至結(jié)構(gòu)處變?yōu)槭中危藭r(shí)按住鼠標(biāo)左鍵即可拖動(dòng)結(jié)
9、構(gòu)按住shift鍵在進(jìn)行以上操作可以進(jìn)行限制在水平位置的移動(dòng) 通過(guò)鍵盤(pán)上的四個(gè)方向鍵可以在方向鍵所指方向上進(jìn)行小幅度移動(dòng),同時(shí)按住Alt鍵進(jìn)行剛才的操作進(jìn)行該方向上較大幅度移動(dòng) 。p 復(fù)制結(jié)構(gòu)復(fù)制結(jié)構(gòu)選中結(jié)構(gòu),按住選中結(jié)構(gòu),按住Ctrl鍵同時(shí)按動(dòng)鼠標(biāo)左鍵拖動(dòng)即可得到一個(gè)同樣的結(jié)構(gòu)鍵同時(shí)按動(dòng)鼠標(biāo)左鍵拖動(dòng)即可得到一個(gè)同樣的結(jié)構(gòu)Ctrl+shift+按動(dòng)可以在水平方向進(jìn)行復(fù)制。按動(dòng)可以在水平方向進(jìn)行復(fù)制。 p拉曲被選結(jié)構(gòu)拉曲被選結(jié)構(gòu) 選中結(jié)構(gòu),按住選中結(jié)構(gòu),按住shift,并把鼠標(biāo)指向右下角改變尺寸的箭頭處,即可,并把鼠標(biāo)指向右下角改變尺寸的箭頭處,即可以進(jìn)行上下或者左右的拉伸。以進(jìn)行上下或者左右的
10、拉伸。p繪制鏡面對(duì)稱(chēng)的結(jié)構(gòu)繪制鏡面對(duì)稱(chēng)的結(jié)構(gòu) 選中結(jié)構(gòu),在選中結(jié)構(gòu),在object下拉菜單中選擇下拉菜單中選擇flip horizontally或者或者flip vertically分分別可以將結(jié)構(gòu)進(jìn)行水平的鏡面對(duì)稱(chēng)或者垂直方向的對(duì)稱(chēng)結(jié)構(gòu)。別可以將結(jié)構(gòu)進(jìn)行水平的鏡面對(duì)稱(chēng)或者垂直方向的對(duì)稱(chēng)結(jié)構(gòu)。 繪制技巧:每次繪制鍵的時(shí)候,最后一個(gè)被繪制的原子將繪制技巧:每次繪制鍵的時(shí)候,最后一個(gè)被繪制的原子將是快捷鍵。是快捷鍵。 三、ChemDraw 應(yīng)用應(yīng)用 無(wú)機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入無(wú)機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入 有機(jī)結(jié)構(gòu)式輸入有機(jī)結(jié)構(gòu)式輸入 三維結(jié)構(gòu)的輸入三維結(jié)構(gòu)的輸入 其他應(yīng)用其他應(yīng)用1、無(wú)機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入無(wú)機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入o2
11、500 C30MPa223224422NaOHHClH ONaClN3H2NHCaSOCaSOH O(l)H O(g) OOHOOH2-propanone2mol4-Hydroxy-4-methyl-pentan-2-one1mol2、有機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入、有機(jī)結(jié)構(gòu)式的輸入例1選擇選擇點(diǎn)位點(diǎn)位拖動(dòng)拖動(dòng)定位定位單擊單擊單擊單擊定位定位單擊生成雙鍵單擊生成雙鍵雙擊生成文本框雙擊生成文本框輸入字母輸入字母 反應(yīng)物繪制反應(yīng)物繪制定位定位單擊生成一單鍵單擊生成一單鍵再定位再定位連續(xù)單擊生成三單鍵連續(xù)單擊生成三單鍵定位定位雙擊后輸入雙擊后輸入OH按按Ctrl鍵鍵拖動(dòng)復(fù)制拖動(dòng)復(fù)制 產(chǎn)物繪制產(chǎn)物繪制選擇反應(yīng)箭頭選
12、擇反應(yīng)箭頭在兩個(gè)分子中單擊在兩個(gè)分子中單擊生成一反應(yīng)箭頭生成一反應(yīng)箭頭 箭頭繪制箭頭繪制箭頭上方建立文本框箭頭上方建立文本框輸入反應(yīng)條件輸入反應(yīng)條件選擇電荷選擇電荷定位定位添加負(fù)電荷添加負(fù)電荷 反應(yīng)條件繪制反應(yīng)條件繪制選擇居中選擇居中分子下方建立文本框分子下方建立文本框依次輸入文本信息依次輸入文本信息 分子下方文本框繪制分子下方文本框繪制選擇陰影框選擇陰影框?qū)⒎磻?yīng)方程式全部罩上將反應(yīng)方程式全部罩上 陰影框設(shè)置陰影框設(shè)置例例2、繪制中間體結(jié)構(gòu)、繪制中間體結(jié)構(gòu)OOH選擇環(huán)己烷以建立六員環(huán)模型選擇橡皮,擦去六員環(huán)一部選擇單鍵定位連續(xù)單擊生成新的單鍵單擊單鍵中央,生成雙鍵在原子上定位建立標(biāo)記選擇筆工具
13、在曲線菜單中選擇箭頭位于末端定位拖動(dòng)鼠標(biāo)左鍵定位單擊生成曲線箭按Esc鍵退出繪制模式單擊箭頭用小手形光標(biāo)移動(dòng)造另一虛線小手形光標(biāo)選中虛線柄拖動(dòng)改變虛線箭形狀按Esc鍵例3 復(fù)雜環(huán)結(jié)構(gòu)CHO選擇環(huán)己烷;并添加第一個(gè)環(huán)添加第二個(gè)環(huán)選擇鍵工具;單擊生成新的單雙鍵28選擇鍵工具;連續(xù)單擊生成三鍵對(duì)稱(chēng)結(jié)構(gòu)按Ctrl鍵拖動(dòng)復(fù)制例例4 Newman結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)29選擇鍵工具;按住Alt鍵,連接兩個(gè)結(jié)構(gòu)選擇軌道工具定位中心原子;按住Alt鍵,按下鼠標(biāo)鍵,向外按動(dòng)建立軌道部分選擇上面分結(jié)構(gòu)單擊旋轉(zhuǎn)從Object菜單選擇Bring to Front命令后面結(jié)構(gòu)移至前面按Esc鍵添加陰影框選擇環(huán)己烷旋轉(zhuǎn)環(huán)己烷在原子上定
14、位建立標(biāo)記旋轉(zhuǎn)指示箭頭例5. 透視圖形OOHOHOHOHCH2OH添加垂直鍵按Alt鍵,任意鍵長(zhǎng)選擇套索工具,陰影右下腳按Shift鍵向上按動(dòng),垂直壓縮50在原子上定位建立標(biāo)記選擇黑體楔鍵單擊下部?jī)蓚?cè)鍵的中央選擇黑體鍵單擊底鍵的中央37例:多中心結(jié)構(gòu)Fe多中心鍵多中心鍵中心原子多中心節(jié)點(diǎn)多中心節(jié)點(diǎn)二茂鐵3、三維圖的輸入三維圖的輸入3839警示標(biāo)志的去除與添加警示標(biāo)志顯示(去除)警示40分別添加多中心節(jié)點(diǎn)41選擇實(shí)鍵工具,在上下兩個(gè)中心節(jié)點(diǎn)畫(huà)出上下兩根單鍵在其中一根單鍵上標(biāo)記Fe另一根鍵與Fe沒(méi)有連接選擇鍵的末端,拉動(dòng)與Fe連接調(diào)整對(duì)齊43鍵的前后次序錯(cuò)誤鍵的前后次序正確4 其他應(yīng)用其他應(yīng)用4.1 化學(xué)儀器化學(xué)儀器4.2 生物儀器生物儀器4.3 結(jié)構(gòu)
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