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文檔簡介
1、(生物科技行業(yè))分子生物學實驗指導20XX年XX月多年的企業(yè)咨詢豉問經(jīng)驗.經(jīng)過實戰(zhàn)驗證可以落地機行的卓越管理方案,值得您下載擁有分子生物學實驗指導動植物檢疫專業(yè)2012 , 2分子生物學實驗注意事項1 課前要提前預習實驗內(nèi)容,了解實驗設計的原理,理清實驗順序,制定實驗方案(沒有方案或方案不合理者不能進入實驗操作) 。2 由于實驗內(nèi)容多,時間短,多數(shù)實驗需要同時或穿插進行,壹定要做好統(tǒng)籌安排。3 實驗課中的所有單項實驗都屬于壹個整體流程。實驗時間安排上沒有上下午晚上等嚴格的作息安排,壹切服從實驗進度,必須在理論課上課期間完成。4 實驗的每壹步都要詳細地記錄操作內(nèi)容、時間、步驟、結(jié)果等,以備查詢!
2、5 對任何自己不熟悉的實驗儀器都不要隨意操作(尤其是微量移液器! ) 。在操作的過程中發(fā)現(xiàn)任何意外的現(xiàn)象都要及時向任課教師匯報。6 寫作實驗報告或?qū)嶒炚撐囊级ㄒ睦硗槨⑦壿嬊逦D表說明詳細,討論分析透徹。7 在實驗室內(nèi)不能大聲喧嘩。8 在實驗的過程中制造的任何垃圾都要丟到垃圾筐里(或先放在自己的桌面壹角) ,嚴禁隨地丟棄!特別注意對廢棄細菌的殺滅和有毒垃圾的定點投放。9 實驗結(jié)束后要把用過的器皿清洗后歸放整齊且清點數(shù)目,向教師匯報征得同意后方可離開實驗實。10 值日組的同學最后離開,等待清掃實驗室的衛(wèi)生,關閉門窗水電。11 實驗時損壞的任何物品都要及時申報。實驗壹質(zhì)粒DNA 的提取12 目
3、的學會最常用的小量制備質(zhì)粒 DNA 的堿裂解方法。13 原理根據(jù)共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒 DNA 和線性 DNA 在拓撲學上的差異來分離。在 pH12.0 12.5 這個狹窄的范圍內(nèi),線性DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而被變性。盡管在這項的條件下共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒 DNA 也會變性,但倆條互補鏈彼此互相盤繞,仍會緊密結(jié)合在壹起。當加入 pH4.8的乙酸鉀高鹽緩沖液使pH 恢復中性時,共價閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA 復性快,而線性的染色體DNA 復性緩慢,經(jīng)過離心和蛋白質(zhì)和大分子RNA 壹起沉淀下去。14 器材1.5ml 微超凈工作臺,接種環(huán),酒精燈,臺式離心機,旋渦混合器,微量移液取樣器, 量離心管,恒溫搖床,搖菌試管
4、,雙面微量離心管架,試管架,標簽紙,磁力攪拌機。15 試劑pMD18-T-F 載體菌, LB 培養(yǎng)基 1000ml (含 100ug/ml 氨芐青霉素) ,葡萄糖 /Tris/EDTA(GTE) 溶液(溶液I) , NaOH/SDS 溶液 (溶液 II) , KAc 溶液( pH4.8 ) (溶液 III) ,RNaseA , 95% 乙醇, 70% 乙醇, TEbuffer ( pH8.0 ) 。16 實驗準備氨芐青霉素儲存液(無菌水配制 5mg/ml ,分裝后 -20 C 保存) ,配制 LB 培養(yǎng)基(胰化蛋白胨 10g , 酵母提取物 5g , NaCl10g 加 200mLddwate
5、r 攪拌完全溶解, 用約 200 L5NNaOH 調(diào) pH 至 7.0 ,加 ddwater 至 1L , 121 C20min 滅菌) ;溶液 I (50mmol/L 葡萄糖, 25mmol/LTrisHClpH8.0 , 10mmol/LEDTApH8.0 ) ;溶液 II ( 0.2mol/LNaOH , 1%SDS ) ; 溶液 III( 60mL5mol/LKac , 加冰乙酸調(diào)pH4.8 , 補 ddwater 至 100ml ) , 70% 乙醇 (-20 C保存) , TEbuffer ( 10mmol/LTrisHClpH8.0 , 1mmol/LEDTApH8.0 ) ;
6、10mg/mLRNaseA( RNA 酶 A 溶于 10mmol/LTrisHClpH7.5 , 15mmol/LNaCl 中) ;搖菌試管洗凈且蓋上棉花塞、 1.5ml 離心管裝入鋁制飯盒、移液器吸頭裝入相應的吸頭盒, 壹起高壓滅菌 ( 121 C30min ) 。17 操作步驟( 1 )在超凈工作臺中取5mlLB ( Amp + ) ,加入滅菌的搖菌管中。( 2)從超低溫冰箱中取出保存pMD-18T-F 的菌種(操作完后迅速把菌種放回超低溫冰柜中,切不可將菌融化! ) ,在超凈工作臺上用燒紅的接種環(huán)刮壹下,再把接種環(huán)于無菌 LB 培 養(yǎng)液(含 100ug/ml 氨芐青霉素)中攪拌壹下, 3
7、7 C 搖床中搖 20h 。( 3) 取 1.5ml 的菌液于 1.5ml 離心管中, 15000rpm 離心 1min , 棄上清液 (盡量棄干凈) , 留沉淀備用。(4)在沉淀中加入 100 l溶液I,蓋上蓋后立即在渦旋混合器上混勻,室溫下靜置 5min。(等待的同時,取壹個塑料盒,裝上適量的冰塊備用。 )( 5)加入 200 l 溶液 II ,蓋上蓋后上下顛倒幾次混勻,插入冰中,放置5min 。(6)加入 150 l 溶液 III ,蓋上蓋后上下顛倒幾次混勻,插入冰中,放置5min 。( 7) 15000rpm 離心 5min ,小心吸取400 l 上清液于另壹個干凈的 1.5ml 離心
8、管中, (不要將白色沉淀物帶入! ) ,加入 800 l95% 乙醇,蓋上蓋后立即在渦旋混合器上混勻,室溫下 靜置 5min 。( 8) 15000rpm 離心 10min ,小心棄掉上清液,加入 500 l70% 乙醇,蓋上蓋后立即在渦旋混合器上混勻。 15000rpm 離心 10min ,小心棄掉上清液,盡量倒置棄干凈( 9) 再加入 500 l70% 乙醇, 蓋上蓋后立即在渦旋混合器上混勻。 15000rpm 離心 10min , 小心棄掉上清液,盡量倒置棄干凈(10)離心管倒置于37 C培養(yǎng)箱中(或室溫)空氣干燥。(管底的沉淀質(zhì)粒 DNA用肉眼幾乎見不見! ) 。( 11 ) pMD1
9、8-T-F 加入 30 l 無菌蒸餾水或TE 緩沖液,用記號筆標記后放入冰箱中備用。(12 )在剩余的菌液中倒入少許84 消毒液,待溶液變清亮后隨廢液和剩余的冰塊壹起倒入下水池。清理桌面,清洗儀器,撰寫實驗報告7 思考( 1 )影響本實驗結(jié)果的因素有哪些?實驗二、質(zhì)粒DNA 的酶切1 目的學會用限制性內(nèi)切酶切割質(zhì)粒 DNA 。2 原理II 型限制性內(nèi)切酶能識別雙鏈DNA 內(nèi)部的特殊序列且在識別位點處將雙鏈切斷,形成粘性末端或齊平末端,通過電用酶切后的 DNA 混合物能夠確認和分離酶切片段。3 器材旋渦混合器,微量移液取樣器,移液器吸頭, 1.5ml 微量離心管,雙面微量離心管架,水漂,恒溫水浴
10、。4 試劑pMD18-T-F 質(zhì)粒,EcoRI, BamHI ,內(nèi)切酶緩沖液(10 x), 10 x電泳加樣緩沖液5 實驗準備配制 TAE 電泳緩沖液( 50 儲存液) , 1000 溴化乙錠儲存液( 0.5mg/ml ) , 10 加樣緩沖液,1.5ml 離心管裝入鋁制飯盒(滅菌)、移液器吸頭裝入相應的吸頭盒(滅菌)6 操作步驟( 1 )混合下列溶液于壹個無菌的1.5ml 微量離心管中:pMD18-T-FDNA(或 pUCm-T-F)6 510 X酶切緩沖液(用 EcoRI的緩沖液)2 dLddwater30 科 LEcoRIIBamHII總體積40 L( 2 )先準備壹個冰盒且放入壹定量的
11、冰塊。從-20 冰柜中取出限制性內(nèi)切酶,立即插入冰塊中。( 3 )用壹只手的手指捏在盛放酶的微量離心管的上部(以免手指的給酶液加溫) ,另壹只手持微量移液器,小心翼翼地吸取1 wL限制性內(nèi)切酶。( 4 )在酶切樣品混合液中加入限制性內(nèi)切酶后(立即把內(nèi)切酶原液送回冰柜! ) ,輕輕震動微量離心管使管中的溶液混勻。再在離心機中 1000rpm 離心 10 秒。取出后插到水漂的孔中,在推薦的最適酶切溫度水浴中溫育1-3h (壹般是 37 ) 。( 5 )酶切后取少量酶切產(chǎn)物和合適的已知分子量的 DNA (如先前的 PCR 產(chǎn)物)對比電泳,以確認切下的片斷是否為自己想要的片斷。( 6 )酶切后的質(zhì)粒能
12、夠回收備用。( 7 )清理桌面垃圾,清洗實驗儀器。撰寫實驗報告。7 思考( 1 )酶切反應混合物的體積是否對酶切效果有影響?為什么?( 2 )如何估計DNA 用量和酶的用量?(3)在吸取內(nèi)切酶的時候如何操作才能別免浪費?實驗三、質(zhì)粒DNA的PCR擴增1 .目的學會PCR操作的基本技術。2 .原理是將待擴增的DNA模板加熱變性,和其倆側(cè)互補的寡聚核甘酸引物復性,然后經(jīng)過耐熱的DNA聚合酶延伸。再進入下壹輪變性一復性一延伸的循環(huán),n次循環(huán)后DNA可被擴增(1+X)叱言。其中25nt的引物退火溫度 Tm=2 (A+T ) +4 (G+C)。3 .器材旋渦混合器,微量移液取樣器,移液器吸頭,0.2ml
13、PCR微量管,雙面微量離心管架,PCR儀,臺式離心機,瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng),水漂,恒溫水浴。4 .試齊IJ3U/ 科 ITaqDNA聚合酶,PCR 緩沖?夜(10X, MgCl 2free ), 25mMMgCl 2, dNTP,引物, 模板質(zhì)粒 pMD18-T-F ,無菌ddwater 。5 .實驗準備dNTP混合液(每種25mM ), TAE電泳緩沖液,1000澳化乙錠儲存液(0.5mg/ml ), 10加樣緩沖液,1.5ml離心管裝入鋁制飯盒(滅菌)、移液器吸頭裝入相應的吸頭盒(滅菌)。合成的引物:Senseprimer5'-GGATCCGCGCAATCTGTTCCTTATGGC-
14、3'Antisenseprimer5'-GAATTCTTGTGCAGCTGCTTGTACGTTG-3'目的基因模板質(zhì)粒:已經(jīng)克隆在pMD18-T-F 載體上的781bpNDV-F 基因。待擴增的F片段長度:837bp 。6 .操作步驟(1)在0.2mlPCR微量離心管中配制 50科反應體系。ddwater32 科 110 xPCRbuffer (不含 MgCl 2) 5 口25mMMgCl 23 口2.5mmol/LdNTP4 科 l (每dNTP 終濃度 0.2mM )10mol/LPrimer12 12.5 十 25pmoles )10(imol/Lprimer22
15、 (12.5 25pmoles )模板質(zhì)粒 1(1 X10-3pmoles )3U/ /Taq 酶 1 / (3u)總體積50 /(2)根據(jù)廠商的操作手冊設置 PCR儀的循環(huán)程序: 94 C5min 94 C 1min 60 C 1min 72 C 1min50s goto 29times 72 C 10min(3) PCR結(jié)束后,取10科產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳。觀察膠上是否有預計的主要產(chǎn)物帶。 ( 4 )清理桌面,撰寫實驗報告。7 思考( 1 )復性溫度如何確定?( 2 )為什么要在最后延伸 10min ?( 3 )是否有非特異性擴增產(chǎn)物(或引物二聚體) ,如何才能消除?實驗四、 DNA 電
16、泳鑒定1 目的學會常用的 DNA 瓊脂糖凝膠電泳、 。2 原理DNA 雙螺旋分子骨架倆側(cè)帶有含負電荷的磷酸根,在電場中會向正極方向移動。不同長度的 DNA 由于受到凝膠介質(zhì)的阻力不同,表現(xiàn)為不同的遷移率而被分開。3 器材電泳儀,水平凝膠電泳槽和梳子及其制膠模塊, 250ml 三角瓶,微波爐,臺式離心機,旋渦混合器,凝膠成像系統(tǒng),分光光度計,微量移液取樣器, 1.5ml 離心管,雙面微量離心 管架,試管架等。4 試劑pMD18-T-F 載體, TAE 電泳緩沖液, 1000 溴化乙錠儲存液,電泳級瓊脂糖粉, 10 加樣緩沖液(或 6 加樣緩沖液) , DNA 分子量標準( DNAHindIII:
17、23130 , 9420 , 6560 , 4360 , 2320 , 2030 , 560 , 130bp ) 。5 實驗準備配制 TAE 電泳緩沖液( 50 儲存液, pH 約 8.5 : Tris 堿 242g , 57.1ml 冰乙酸,37.2gNa 2EDTA.2H 2O , ddwater 定容至 1L) , 1000 溴化乙錠儲存液( 0.5mg/ml : 50mg 溴化乙錠溶于100mLddwater , 4 C 避光儲存) , 10 加樣緩沖液( 20%Ficoll400 ,0.1mol/LNa 2EDTApH8.0 , 1.0%SDS , 0.25% 溴酚藍) ; 6 加樣
18、緩沖液( 0.25% 溴酚藍, 40%蔗糖水溶液) ; 1.5ml 離心管裝入鋁制飯盒(滅菌) 、移液器吸頭裝入相應的吸頭盒(滅菌) 。6 操作步驟( 1 )稱取 0.5g 瓊脂糖粉,放入三角瓶,加入 50mlTAE 電泳緩沖液(1 ) ,放入微波爐中燒開( 1min ) 。 50ml 正好倒倆塊小膠。( 2 )注意觀察燒瓶中的瓊脂糖粉末,待完全熔化后停止微波爐(切不可讓膠溶液溢出到微波爐中! ) 。( 3 )戴上線手套,從微波爐中取出三角瓶,置桌面上冷卻致不燙手(約 50-60 C ) 。( 4 )把梳子插到凝膠灌制模具的正確位置后緩緩倒入膠溶液。膠溶液倒至和模具的矮邊緣相平即可,不要把膠溶液溢到外面。在桌面上靜置10-20 分鐘待膠完全凝固。 (剩下的膠溶液封口后留待以后再熔化使用) 。( 5 )在水平電泳槽中加滿1 TAE 電泳緩沖液。根據(jù)電泳槽的長度把電泳儀的電壓調(diào)至170V(10V/cm) ,注意正負電極的位置連接正確。( 6 )待膠完全凝固后( 15-20 分鐘) ,小心拔出梳子。用手指捏住模具倆
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