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文檔簡介

1、DN 碾取中各種實驗試劑作用原理1、STE 是 Tris-Hcl、EDTANacl 的混合液。其總體作用是為 DN 砒供保護環境,在此環境下 DNA 可以呈穩定態,最少限度地受到破壞。Tris.HCl 提供緩沖體系,DNAS 這一體系中呈穩定態。EDTA 是 DNAB 的抑制劑,可以防止細胞破碎后 DNAB 降解 DNANaCl,有利于 DNA 的溶解。2、SDS 的作用:利用高濃度的陰離子去垢劑 SDS(十二烷基磺酸鈉,Sodiumdodecylsulfate)使 DNA 與蛋白質分離,在高溫(5565C)條件下裂解細胞,使染色體離析,蛋白變性,釋放出核酸,然后采用提高鹽濃度及降低溫度的方法

2、使蛋白質及多糖雜質沉淀,離心后除去沉淀,3、苯酚的作用:使蛋白質變性,同時抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚處理勻漿液時,由于蛋白與 DNA 聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相。使用酚的優點:1.有效變性蛋白質;2.抑制了 DNase 的降解作用。缺點:1.能溶解 10-15%的水,從而溶解一部分 poly(A)RNA2.不能完全抑制 RNase 的活性。Tris 酚的顏色,一般為黃色。如果變成粉紅色,說明被氧化,不能再用。4、氯仿的作用克服酚的缺點;加速有機相與液相分層。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的跡量酚。(酚易溶于氯仿中

3、)5、異戊醇:減少蛋白質變性操作過程中產生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少氣泡產生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含 DNA 的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩定。6、用乙醇沉淀 DNAM,為什么加入單價的陽離子?用乙醇沉淀 DNAM,通常要在溶液中加入單價的陽離子, 如 NaCl或 NaAc,Na+中和 DNA子上的負電荷,減少 DNA 分子之間的同性電荷相斥力,而易于聚集沉淀。7.為什么在保存或抽提 DNA程中,一般采用 TE 緩沖液?在基因操作實驗中,選擇緩沖液的主要原則是考慮 DNA 的穩定性及緩沖液成分不產生干擾作用。磷酸鹽緩沖系統(pKa=7.2)和硼酸

4、系統(pKa=9.24)等雖然也都符合細胞內環境的生理范圍(pH),可作 DNA 勺保存液,但在轉化實驗時,磷酸根離子的種類及數量將與 Ca2+產生 Ca3(PO4)2 沉淀,在 DN 版應時,不同的酶對輔助因子的種類及數量要求不同,有的要求高離子濃度,有的則要求低鹽濃度,采用 Tris-HCl(pKa=8.0)的緩沖系統,由于緩沖液是 TrisH+/Tris,不存在金屬離子的干擾作用,故在提取或保存 DNA 時,大都采用 Tris-HCl系統,而 TE 緩沖液中的 EDT 心能穩定。8、STE 是 Tris-Hcl、EDTANacl 的混合液。其總體作用是為 DNAj供保護環境,在此環境下

5、DNA 可以呈穩定態,最少限度地受到破壞。Tris.HCl 提供緩沖體系,DNAS 這一體系中呈穩定態。EDTA 是 DNAB 的抑制劑,可以防止細胞破碎后 DNAB 降解 DNANaCl,有利于 DNA 的溶解。9、SDS 的作用:利用高濃度的陰離子去垢劑 SDS(十二烷基磺酸鈉,Sodiumdodecylsulfate)使 DNA 與蛋白質分離,在高溫(5565C)條件下裂解細胞,使染色體離析,蛋白變性,釋放出核酸,然后采用提高鹽濃度及降低溫度的方法使蛋白質及多糖雜質沉淀,離心后除去沉淀,10、苯酚的作用:使蛋白質變性,同時抑制了 DNase 的降解作用。用苯酚處理勻漿液時,由于蛋白與 D

6、NA 聯結鍵已斷,蛋白分子表面又含有很多極性基團與苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而 DNA 溶于水相。使用酚的優點:1.有效變性蛋白質;2.抑制了 DNase 的降解作用。缺點:1.能溶解 10-15%的水,從而溶解一部分 poly(A)RNA2.不能完全抑制 RNase 的活性。Tris 酚的顏色,一般為黃色。如果變成粉紅色,說明被氧化,不能再用。11、氯仿的作用克服酚的缺點;加速有機相與液相分層。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的跡量酚。(酚易溶于氯仿中)5、異戊醇:減少蛋白質變性操作過程中產生的氣泡。異戊醇可以降低表面張力,從而減少氣泡產生。另外,異戊醇有助于分相,使離心后的上層含 DN

7、A 的水相、中間的變性蛋白相及下層有機溶劑相維持穩定。12、用乙醇沉淀 DNA 寸,為什么加入單價的陽離子?用乙醇沉淀 DNAM,通常要在溶液中加入單價的陽離子,如 NaCl 或 NaAc,Na+中和 DNA子上的負電荷,減少 DNA 分子之間的同性電荷相斥力,而易于聚集沉淀。Tris中文品名:三羥甲基氨基甲烷;氨基丁三醇;緩血酸胺NH2八。HHO,Tris 結構式英文品名:Tris;Tris(Hydroxymethyl)aminomethane英文別名:2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediolTHAM;Trisbase;Trometamol通用 CA

8、S:77-86-1產品純度:100%(USP 藥典級)/99.9%(實驗室技術級)產品級別:USP 藥典級,符合 USP/EP/cGMP 寸藥物賦形劑的要求分子式:NH2c(CH2OH)3分子量:121.14使用用途:生物制藥,體外診斷,個人護理及化妝品原料等保存溫度:常溫密封避光保存TRIS 是一種最常用的生物緩沖液,常配成 PH 值為 6.8,7.4,8.0,8.8。其 PH 值隨溫度變化很大。一般來說,溫度每升高一度,PH 值下降 0.03。1MTRIS-HCl6.8 和 1.5MTRIS-HCl8.8 是 SDS-PAGEt 常用的試劑。而由 TRIS 配成的 TAE,TBE 等是 D

9、NA 電泳最常用的試劑,TE(PH8.0)主要用于溶解 DNATE 為 Tris 力口 EDTA稱。緩沖特性:Tris 為弱堿,在室溫(25C)下,它的晅為 8.1;根據緩沖理論,Tris 緩沖液的有效緩沖范圍在pH7.0 到 9.2 之間。Tris 堿的水溶液 pH 在 10.5 左右,一般加入鹽酸以調節 pH 值至所需值,即可獲得該 pH 值的緩沖液。但同時應注意溫度對于 Tris 的 pKa 的影響。衍生緩沖液:由于 Tris 緩沖液為弱堿性溶液,DNA 在這樣的溶液中會被去質子化,從而提高其溶解性。人們常常在 Tris 鹽酸緩沖液中加入 EDTA 制成“TE 緩沖液:TE 緩沖液被用于 DNA 勺穩定和儲存。如果將調節 pH 值的酸溶液換成乙酸,則獲得“TAE 緩沖液”(Tris/Acetate/EDTA),而換成硼酸則獲得“TBE緩沖液”(Tris/Borate/EDTA)。這兩種緩沖液通常用于核酸電泳實驗中。制備:Tris 可以由兩步反應生成:先由硝基甲烷生成中間體三羥甲基硝基甲烷(HOCH2)3CNO2,然后再由該中間體還原得到 Tris。用途:Tris 緩沖液不僅被廣泛用作核酸和蛋白質白溶劑,還有許多重要

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