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文檔簡(jiǎn)介
1、WB注意事項(xiàng)及常見(jiàn)問(wèn)題注意事項(xiàng)一、 樣本收集1. 組織樣本原則上要求客戶或我們的技術(shù)員把組織分切剪碎至研磨管(根據(jù)實(shí)驗(yàn)的需要告知他們?nèi)《嗌俳M織),并加入適量裂解液和研磨珠,然后放置于-80保存。具體詳情參照“組織樣本收集注意事項(xiàng).doc”;2. 細(xì)胞樣品原則上要求客戶或我們的技術(shù)員不要用胰酶把細(xì)胞消化下來(lái),特別是分選對(duì)象是膜蛋白時(shí),具體詳情參照“細(xì)胞樣品收集注意事項(xiàng).doc”;二、 總蛋白提取1. 組織樣品具體詳情參照“組織樣本收集注意事項(xiàng).doc”;記得加入蛋白酶抑制劑,如果分選對(duì)象是磷酸化蛋白時(shí),記得加入磷酸化酶抑制劑;2. 細(xì)胞樣品具體詳情參照“細(xì)胞樣品收集注意事項(xiàng).doc”;記得加入蛋
2、白酶抑制劑,如果分選對(duì)象是磷酸化蛋白時(shí),記得加入磷酸化酶抑制劑;三、 蛋白樣本保存裂解細(xì)胞或組織提取總蛋白時(shí),細(xì)胞碎片沉淀一般-20保存以防萬(wàn)一,提取好的蛋白樣品分裝2份,一份加入上樣緩沖液變性后-20保存,一份直接-20保存;四、 蛋白變性提取好的總蛋白取一部分(不是全部)加入上樣緩沖液進(jìn)行加熱變性(100,5min),變性好的蛋白應(yīng)該-20保存,凍融后不再需要加熱變性;五、 SDS-PAGE1. 濃縮膠的膠濃度一般為5%,用于壓沉樣品;2. 分離膠的膠濃度取決于分析對(duì)象的分子量大小,詳情見(jiàn)Western Blotting 全攻略.pdf第4頁(yè);3. 分離膠和濃縮膠的高度比為8:3;4. 電
3、泳結(jié)束后,應(yīng)及時(shí)用清洗干凈玻璃板,清洗時(shí)應(yīng)使用海綿擦布,切勿使用刷子,以免刮花玻璃板;5. 電泳結(jié)束后,應(yīng)及時(shí)沖洗電泳槽,以免鹽離子沉積,導(dǎo)致電泳絲腐蝕;6. 清洗電泳芯時(shí),一定要注意別弄段電泳絲;六、 轉(zhuǎn)膜1. 注意海綿墊,濾紙(轉(zhuǎn)膜專用濾紙),轉(zhuǎn)印膜,膠的疊放位置,以保證正確的轉(zhuǎn)印方向;2. 注意海綿墊,濾紙(轉(zhuǎn)膜專用濾紙),轉(zhuǎn)印膜,膠的相對(duì)大小,以免造成短路;3. 轉(zhuǎn)印結(jié)束后,應(yīng)及時(shí)取出轉(zhuǎn)印膜,并立即用TBST漂洗1-2遍,并立即加入封閉液,這樣可以避免膜上的雜質(zhì)殘留或膜變干導(dǎo)致背景高的問(wèn)題;4. 轉(zhuǎn)印結(jié)束后,應(yīng)及時(shí)沖洗轉(zhuǎn)印槽和轉(zhuǎn)印芯,以免鹽離子沉積,導(dǎo)致電泳絲腐蝕;5. 轉(zhuǎn)印結(jié)束后,應(yīng)
4、及時(shí)用水泡洗海綿墊和濾紙,以免鹽離子沉積,導(dǎo)致轉(zhuǎn)膜時(shí)短路,并放在籃子上晾干,如果海綿墊和濾紙不及時(shí)晾干,容易導(dǎo)致海綿墊和濾紙內(nèi)部的結(jié)構(gòu)破壞;七、 封閉1. 進(jìn)行封閉時(shí),應(yīng)加入足量的封閉液(以完全覆蓋膜為底限),并保證整個(gè)封閉過(guò)程中,膜與封閉液充分接觸,避免長(zhǎng)時(shí)間離開(kāi)封閉液,特別進(jìn)行4靜止封閉過(guò)夜時(shí),一定要加入足量的封閉液和保證平坦放置;上述注意事項(xiàng)主要為了避免膜變干,導(dǎo)致背景升高;八、 一抗雜交1. 一抗的稀釋比例:第一次使用時(shí)參考具體抗體說(shuō)明書(shū)建議的稀釋比例,并根據(jù)實(shí)際的實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行調(diào)整;2. 雜交條件:如果是室溫孵育,至少保證孵育1-2小時(shí),并放置脫色搖床上進(jìn)行搖晃,如果是4孵育,應(yīng)孵育過(guò)
5、夜,可靜止亦可放置脫色搖床上進(jìn)行搖晃;3. 應(yīng)使用專用的一抗稀釋液進(jìn)行稀釋,使用后進(jìn)行回收并4保存,如果回收的稀釋抗體用沉淀或長(zhǎng)菌,應(yīng)丟棄;九、 一抗雜交后洗膜1. 一般使用標(biāo)準(zhǔn)的TBST緩沖液,如果判斷因?yàn)槭且豢沟脑驅(qū)е碌谋尘斑^(guò)高,可以把NaCl的濃度提高到500 nM (標(biāo)準(zhǔn)的為150nM);2. 一般洗滌3次,每次10min,如果判斷因?yàn)槭且豢沟脑驅(qū)е碌谋尘斑^(guò)高,可以把洗滌次數(shù)提高到4-6次;十、 二抗雜交1.二抗的稀釋比例:第一次使用時(shí)參考具體抗體說(shuō)明書(shū)建議的稀釋比例,并根據(jù)實(shí)際的實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行調(diào)整;2.雜交條件:一般室溫孵育,孵育1小時(shí)即可(時(shí)間延長(zhǎng)會(huì)產(chǎn)生非特異雜交,從而導(dǎo)致背景過(guò)
6、高),并放置脫色搖床上進(jìn)行搖晃(一定要避免膜變干,否則背景其高);3.應(yīng)使用封閉液進(jìn)行稀釋,使用后進(jìn)行不回收;十一、 二抗雜交后洗膜1.一般使用標(biāo)準(zhǔn)的TBST緩沖液,如果判斷因?yàn)槭且豢沟脑驅(qū)е碌谋尘斑^(guò)高,可以把NaCl的濃度提高到500 nM (標(biāo)準(zhǔn)的為150nM);2.一般洗滌3次,每次10min,如果判斷因?yàn)槭且豢沟脑驅(qū)е碌谋尘斑^(guò)高,可以把洗滌次數(shù)提高到4-6次;十二、 拍照1. 注意選擇曝光時(shí)間,同時(shí)兼顧工作效率,因選擇連續(xù)拍照模式,這樣總有一個(gè)何時(shí)曝光時(shí)間;十三、 報(bào)告單整理1. 原始圖片;2. 對(duì)比度和亮度調(diào)整的圖片;3. 圖片說(shuō)明:上樣順序;4. 灰度值:原始值,數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化(同
7、一個(gè)樣品的目標(biāo)蛋白的灰度值除以內(nèi)參蛋白的灰度值),相對(duì)表達(dá)量(實(shí)驗(yàn)樣品的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化比值除以參照樣品(問(wèn)客戶)的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化比值),參照樣品的相對(duì)表達(dá)量一定為1;5. 實(shí)驗(yàn)方法:準(zhǔn)確的一抗,二抗,稀釋比例;常見(jiàn)問(wèn)題一、 沒(méi)信號(hào)1. 膜一片空白,沒(méi)有任何條帶,陽(yáng)性對(duì)照樣品也無(wú)條帶:實(shí)驗(yàn)失???抗體失效?;重新進(jìn)行實(shí)驗(yàn),重新稀釋抗體;2. 膜一片空白,沒(méi)有任何條帶,陽(yáng)性對(duì)照樣品有條帶:實(shí)驗(yàn)樣品降解?實(shí)驗(yàn)樣品無(wú)該蛋白的表達(dá)?轉(zhuǎn)膜效率過(guò)低?;重新進(jìn)行實(shí)驗(yàn),復(fù)核查找上述原因,以尋找對(duì)策;二、 背景過(guò)高1. 目的條帶以外的區(qū)域有信號(hào),如果是片狀,甚至整塊膜,一般是封閉不好,膜變干,一抗非特異雜交或二抗的非特異雜交導(dǎo)致;如果是條紋狀,一般是由于膜上有壓痕導(dǎo)致,如果是點(diǎn)狀,一般是膜上有雜質(zhì),或泡膜時(shí)膜沒(méi)有充分浸泡;三、 雜帶1. 目的帶以外的信號(hào)條帶為雜帶,一般由于一抗的特異性不好所導(dǎo)致,如果目的帶比雜帶信號(hào)強(qiáng),可通過(guò)減低一抗的稀釋比例,并縮短雜交時(shí)間解決;如果目的帶比雜帶信號(hào)弱,在不減低一抗的稀釋比例的前提下,縮短雜交時(shí)間;并提高TBST緩沖液的NaCl的濃度提高到500 nM;2. 雜帶如果與目的帶的位置相距較遠(yuǎn),可以不優(yōu)化實(shí)驗(yàn),直接裁剪即可,雜帶如果與目的帶的位置相距較進(jìn),應(yīng)調(diào)整膠濃度,并延長(zhǎng)電泳時(shí)間,已經(jīng)采取上述解決方法;四、 目的帶弱1. 一抗效價(jià)低:提
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