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文檔簡介

1、核 磁 應 用 培 訓 筆 記一、一維H譜實驗操作流程1、 新建一個實驗,可以直接輸入 New命令,name:樣品名稱;PROCNO:處理 號;Solvent:不代表鎖場的溶劑,只影響最后打印譜圖參數中溶劑項的顯示;ExpenrimentDirs:標準實驗,不代表脈沖系歹0;User下,可以建立自己的標準實驗;H譜的標準實驗名稱是:proton2、getprosol:把相關的脈沖參數保存在 Acqupars表中:AcquparsPL13、 鎖場,可以直接點擊Lock圖表選擇溶劑后鎖場,或者輸入命令 LOCK空格 溶劑名稱直接鎖場;鎖場的目的?4、atma: topshim5、NS輸入數值6、r

2、ga7、za即zerogo的簡寫Notice:(1) 調諧:做同一樣品的不同譜圖時需要重新做一次調諧。(2) 當第一次勻場不好的時候,可以輸入命令topshim+空格+tunea進行二次勻 場,若多次勻場后仍然不能達到好的狀態(tài)則需要做三維勻場。(3) 同一溶劑的樣品,建議在同一時段做譜,有利丁勻場。(4) 勻場不好的原因有以下幾個方面:樣品中含有順磁性金屆離子高粘度樣品溶液高度太低。8、部分參數的設置(1) eda采樣參數設置:可以輸入命令 ased進入參數設置界面; PULPROG:脈沖系列名稱,zg30:30度角激發(fā),zg: 90度角激發(fā); AQ-mod:采樣模式 TD:采樣點數 NS:采

3、樣次數 DS:空掃:真正開始采樣前先采集的次數,做一維譜時可設為0,二維譜空掃的次數設置非常重要。 TD0,真正采樣次數,NS*TD0,如TD0設為10, NS為1024,則總采樣次數為 1024*10 SW譜寬,用默認的譜寬即可,其中 SW與AQ成反比 O1P, O1,中心頻率,其中前者是以ppm為單位,后者是以HZ為單位。最右邊:譜寬/2+O1P(2) 和脈沖系列有關的參數 DE值,采樣結束后等待衰減的時間。做雜核時需要更改。 D1:弛豫延遲,做定量H譜時需要更改 P1激發(fā)脈寬;PL1 (dB):激發(fā)功率;9、譜圖處理(1) Procpars:窗口函數 efp :指數函數,em ft、pk

4、三個命令的組合 gfp :高窗函數:gm ft、pk三個命令的組合 apk:根據當前的樣品來調PHC,PHC,1當譜峰有很多鼓包時使用效果不好。Notice : LB值越大信噪比越好,分辨率越差,LB值越小,分辨率越好。LB0是相對于efp函數而言的,當調節(jié)LB值為負,信噪比仍然不好時,可用gfp 函數,先更改GB值,再輸入GFMr令沖零也可以提高分辨率。(2) 定標(3) 直接輸入plot命令,進入打印界面。(4) 如何創(chuàng)建棋板?C:BrukerTopspinPlotLayouts,先另取名字創(chuàng)建模板,再將棋板文件夾下的默認棋板刪除,如H譜的默認棋板是:1D-Hxwp先刪除該棋板,再將自己

5、創(chuàng)建的棋板改為默認棋板的名字。二、如何做H譜的定量?與標準一維氫譜相比,需要做一下變換1、將脈沖系歹0 zg30改為zg,2、找內標,兩個峰挨的很近且基線分離,一般很難找到合適的內標物。3、調整O1P使得O1Pft兩個峰之間4、NS要足夠大,為了保證較好的信噪比,定量最起碼要做半個小時以上。5、 D1>5T1,D1要大于5倍的T1,首先要找最大的T1, D1的時間要足夠長。三、碳譜:碳譜的標準實驗為 C13CPD1、getprosol2、atma3、采樣參數的設置:譜寬sw一股設置為250,O1P, NS TD0,4、rga5、zg6、tr命令:保存數據,繼續(xù)采樣;如tr4,保存最近4次

6、的2倍。7、efp : apk8、ppf:對碳譜的全譜進行標峰。9、Mi+數字+PPF表小強度低于該數值的不標峰。10、go命令,樣品濃度太低的情況下,過夜采集仍然不能得到理想的譜圖,第 二天白天需做其他譜圖,可在第二天晚上將前一天晚上采集的譜圖拖動到當前窗 口,重新放入樣品鎖場調節(jié)后可以輸入 Gg令進行累加采集。11、和脈沖相關的參數CPDPRG2通常情況下用 Waltz16,做氫譜、碳譜的90度脈沖沒有問題,做 雜核時需要更改。Notice :看到碳譜有裂分,首先要考慮是否有同分異構體,再考慮更改 CPDPRG2選擇帶bi的參數。四、碳譜定量實驗(實驗時間相對很長,需要加弛豫試劑以減短實驗

7、時間。)1、標準實驗選擇 CBIG newok2、將 zgig30 改為 zgig3、DS:0加弛豫試劑后會影響鎖場和勻場。五、DEPT驗(45°、90°、135° )1、New>C13DEPT90OK2、getprosol3、修改參數:(1) 改動參數NS采樣次數是普通碳譜采樣次數的 1/4.Pulseprog查看與脈沖相關的參數,其中 NS是4的倍數。(3) DS=8, NS=4 SW譜寬,O1P.4、rga: zgNotice :(1) DEPT45只出現季碳;DEPT135只出現CH(2)HALT格數字(3) SR值,從校正后的普通碳譜的處理參數中

8、copySR值,復制到DEPTf圖中, 可將DEPT®圖中的化學位移與普通 C譜的化學位移對齊。六、如何將多種譜圖打印在同一張圖上?方法一:1、先將全譜圖調出并標好化學位移。2、選擇1D+1D+1DxwpX印模板3、在data中,點擊ADD選擇實驗數據現在的位置,將需要的數據拖入,點擊Apply ,確定。此方法的優(yōu)點是可以對每一張譜圖進行修改。、方法二:1、隨意拖入一張譜圖,輸入plot2、全選中,并刪除原有譜圖3、在 DATAS面選譜圖,APPLY>OK;4、在右側選擇多個譜圖疊加的圖標,三條重疊的折線;5、在空白處拖動鼠標,出現第一張譜圖6、右擊選擇Edit,選擇steak

9、ed ,輸入譜圖張數。Spectra : 0*5,0表示左右偏移量,5表示上下偏移量。此方法的缺點是不能單獨修改每一張譜圖。七、一些補充注意事項1、BBf,探頭。2、 新安裝儀器可以做的核有 H、C、P、F、N,可以直接選擇標準實驗,直接調用 標準棋板。P31CPg去偶,zgpg30; P31: zg。LOCQ后可以直接輸入一系列命令,點擊 ENTERS接完成。3、 做雜核前要先確認兩件事,情:(1)有無脈寬和功率(2)有無標準實驗;4、P的化學位移的標定:外標法。把標準品(查找網上文獻)放到P樣品中測定核磁,將標準品的化學位移定位為 0后看SR值,再將SR值復制粘貼到后續(xù)做的P譜圖上,再標定

10、化學位移。標準品:85嘴酸溶液。不鎖場、不勻場,直接調諧、prosol 不鎖場實驗:(1)打開BSM虢盤,將lock變成灰色。(2) sweep要變成灰色 (即將(1) (2)的 ON-OF睹K OFF掉)(3) atma; rga ; zg;八、對于沒有標準實驗、沒有脈寬和功率的雜核如何入手做?以 B11為例。1、首先查詢該雜核的旋磁比、天然豐度,對于天然豐度太低的要求濃度高些, 或者很難做出來。HelptNMRGuideNMREncyclopedi+NMRApplication tNMRpenddicTable點 擊要做的元素查看旋磁比和天然豐度。2、先借用C譜的標準實驗,新建一個實驗,當

11、旋磁比為正時標準實驗選擇C13CPD 當旋磁比為負時標準實驗選擇 C13IG點ok。3、更改參數查看Acqpar參數(都是C13的參數)Tgetprosol (讀取C的脈寬和功率)t輸 入edsp命令t把F1維中的C13改為B11,F2維不變t Default Sav>再次回到 Acqupars參數中t NS (掃描次數)、SW俏寬,盡量設寬些400), O1P(先賦予 0) +-200位置找峰,D1 (經驗值)2S,對0也適合,(事先查D1值,太大可加 弛豫試劑)t lock , topshim t輸入atmm(不能用atma,手動調諧,第一次做核 時必須用手動調諧。)t出現 Tuni

12、ng對話框,若點找不到會動的倒峰,則 點擊圖標,放大范圍,都調好后點FileSavepositionExit t輸入atma; rga ; zg,彈出rga對話框,點OK輸入密碼Bruker ,接著彈出zg警告t halt8 , efp ; apkT輸入sref彈出警告,close (將O1P放在最佳位置)t edmac(宏命 令)+空格+名稱(隨意命名)。校準背景信號,第一段(第一行,absf1 +空格+最大值;第二行,absf2+空格+ 次大值;第三行,absf);第二段(第一行,absf1+空格+最大值;第二行,absf2+ 空格+次大值;第三行,absf) ; Notice :下一段的

13、開始是上一段的結束,進入 鼓包區(qū)域后區(qū)間要變小,節(jié)點值不能正好落在峰的最高點,從最左端分多段編輯 到最右端。編輯好后保存。t輸入 BL命令4、如何創(chuàng)建標準實驗棋板?輸入wpaL在user下,不能存在par上面t點擊 writenew t輸入實驗名稱,OK tOK>close tnew不能getprosol (90咖水10咻疊代鈉標樣,可以用來建立 。的標準實驗,也可以用來建立 Na的標準實驗,需要做Pt的標準實驗室,可打 電話讓工程師過來設置,另外做其他雜核的定量需用到 C13IG脈沖系列,需要請 工程帥調90度脈沖的脈寬和功率,請工程師來做核。)九、部分二維實驗溫馨提示:二維譜實驗最重

14、要的就是控溫。(一)、實驗一1、New®立一個新實驗,標準實驗選擇 COSYGPMFSW梯度場進行相關路徑的 選擇。其中GP表小梯度;MF表小多量子粒波,SW!小方波,標準波形。多量子 粒波的好處:可以從對角峰上看到單峰的性質,簡化對角峰,易于解析。2、lock3、atma; topshim ; getprosol ,調諧的目的是為了接收線圈的頻率與中心頻率保持一致,提高靈敏度。DS空掃16次。Pulseprog :查看脈沖系列。TD,F2維 2000左右;F1維,大于256 (設高一點可以提高分辨率)。采采樣模式:QF與采樣相關的參數:TD NS DS SW O1P其中NS DS的

15、設置可以參考限定值。輸入命令ased,可以查看與脈沖系歹U相關的參數,基本不需要自行修改。4、rga; zg5、譜圖處理(1) 輸入命令xfb進行變換,其中xf表示加窗函數,b表示兩個維度。(2) 調進一維譜選中一維譜,右擊,選擇 displayAs2Dprojection 。選F1+F2(3) 點等高線調整圖標(一個沒有底邊的三角弧形,中間幾條平行線穿過)進 行等高線調整。Levelincrement : 1.2-1.3 即可;Numberoflevels (等高線數): 32; Fill tApplytOK或者可以輸入命令clev+32可得到等高線數目。(4) 校準(即定標)放大譜圖進行定

16、標。(5) 去除噪音,選中噪音,輸入命令 proj ,選擇UPdatarows/colsfromdisplaytokT再選擇最上面的calculatepositiveprojectiont輸入sub2 (對正峰和負峰都去除噪音)(二) 、實驗二1、New標準實驗選擇:MLEVPHSW,咐相位;MLEVg示自旋鎖定或自旋傳遞; SVa示方波,形狀脈沖SP;查看與脈沖系列相關的參數,其中NS=8*nDS=16*r TD(F2=204& F1>256)SW,O1PD6自旋鎖定時間,默認值為 0.08S ,即 混合時間(設短的話可能會無法調整相位)2、lock3、atma; topshi

17、m ; getprosol ;4、譜圖處理(1) 輸入命令xfb變換譜圖(2) 調等高線(3) 調相位,先調0級相位,再調1級相位。(4) 校準(三) 實驗三1、New> NOESYPHSW用于大分子2、NS 8*N; DS:16*N;D8混合時間,空間V 5 a ,峰的強度與距離的六次方 成正比。對于大分子,D8=0.10.3S;對于小分子:D8=0.60.8。Notice :分子量越大,弛豫時間越短,分子量越小,弛豫時間越長,溫度越高弛 豫時間越短。3、lock4、getprosol5、atma; topshim ; rga; zg(四)實驗四1、new,標準實驗選擇ROESYPHS

18、W,P通過相位循環(huán)可以減掉一些峰。2、具體實驗步驟與前面的實驗步驟大致相同,通過查看與脈沖系列相關的參數對參數進行設置。接著 LOCK,getprosol ; atma; topshim ; rga; zg3、Notice :輸入 Set 命令,選中 Enableautomaticcommandspooling 方框內口打 鉤。可以針對一個樣品的自動排列做多個實驗。(五)實驗五:J-Resolved同核實驗。1、new cosy45sw (先借用)2、Pulprog : jresqf (消除化學位移,保留耦合常數)3、NS:4*N; DS 16;4、F2維(化學位移);F1維(耦合常數)SW=

19、20 SWH=50HZO1P只針對F2設定值,F1不用設。5、getprosol6、lock7、atma; topshim ; rga; zg;(六)實驗六H-C相關的二維譜1、 New選擇標準實驗:HSQCETGPSISP,m采樣模式為回波反回波采樣;GP 梯度;SI靈敏度增強;SP形狀脈沖,讓激發(fā)更均勻。2、 輸入命令eda,進行采樣參數設置:NS=1*N,D手16,TD,SW譜寬(F2為H譜譜 寬,F1為C譜譜寬);輸入命令ased可進行與脈沖系列有關的參數設置, CNST2單位為H乙C和H 直接耦合常數的平均值。GPZ2 C:20.1%, N15, 8.1%,若有些雜核沒有顯 示,則改

20、核后可以輸入命令gradratio 查看3、lock4、getprosol ; atma; topshim5、rga; zg(七)實驗七1、New>HMBCGPNDND表示在采樣時間內不進行去耦。2、(1)采樣參數設置 NS=2 DS=16,O1P=?,SW=?(2)與脈沖系列相關的參數設置,CNST13遠程耦合常數,系統(tǒng)默認一般為8H乙 可以適當地減小,當看不到交義峰時,可能該值設大了,也可能是因為二面 角的原因。,通過耦合常數可以計算二面角的大小。3、lock4、atma; topshim ; rga; zgNotice : HMB圖中可能存在HSQC勺殘余峰。(八)實驗八,在HMB

21、(T維譜中去除HSQC勺殘余峰。1、nesHMBCGPND,Ttit電 J-FilterHMBC2、更改脈沖系列及參數將 Pulprog tHMBCGPL2ndqf(1) 輸入命令 eda,更改采樣參數,NS=2*N,DS=16 QF TD(分 F1, F2), O1P(2) 輸入命令ased,更改與脈沖系列相關的參數, CNST6:120HZ;CNST7180HZ, 在該區(qū)問內HSQ成余峰去除。CNST13白分比根據右側提示填寫。3、getprosol4、lock5、atma; topshim ; rga; zg十、完整的二維譜圖處理過程1、輸入xfb ,譜圖變換;2、調入一維譜,選擇F1+

22、F2 t ok3、clev32 ,修改等高線。4、校正相位(NOESYROESYTOCSY HSQCI要校正相位,其他的不需要)點 相位校正圖標,選幾個點,ADD先校正紅線所在的位置。5、定標:先定好一維譜,讀出化學位移,再點擊定標圖標,找出中心位置進行 定標。6、去除噪音,(T1噪音的去處),左邊沒有信號的投影。Proj tedit tupdate tok第一個正峰第二個負峰,輸入 sub2。7、可以通過選擇性預測提高 F1的分辨率,edpTprocpars tfouner tME_mod 選擇LPfr (LP表示線性預測,fr表示向前的)NCOEFHH相關選100, HC 相關選32) o

23、此處理的缺點是可能廣生鬼峰。H一、核磁的維護(一) 硬件維護1、機柜里面的濾網一般一年活洗一次2、建議每周重啟電腦一次3、打開機柜需要帶放靜電手環(huán)4、 每次嚴格開關機,關機開機后要做一次CE5、90度脈沖校準正常情況下半年做一次,對新儀器可能需要三個月做一次。6、field的校準,正常情況下半年一次,對于新儀器三個月做一次。(二) 磁體及軟件維護1、1H90度脈沖的校準,標樣:0.1%EBinCDCL(1) new,建立實驗,選擇 PROTON準實驗,title : 1H90cal(2) lock(3) getprosol ; atma; topshim(4) 更改參數 輸入命令eda更改采樣

24、參數,將zg30Tzg; NS=1 DS=0;O1P=2.6PPM(設定在乙基的四重峰中央)。 輸入命令ased更改與脈沖系列相關的參數,D1=20S,RG=16;P1=10.63己錄下來(脈沖作用時間) 改為2; PLW制PL1保持不變。Notice :先把原來的P1值,再將P1賦予一個比較小的時間,eg, 1us先試做一 個譜看看。(5) rga; zg(6) efp ; apk,處理譜圖,并找到四重峰,使當前窗口只出現四重峰。(7) 輸入命令dpl ,定義打印區(qū)問。(8) 回到處理參數procpars,將PH_mo曲的模式改為PK(9) 輸入命令POPT脈沖的功率為脈寬的優(yōu)化模式。勾選第

25、三個選項即performautomaticbaseline(PARAMETER 寫上 P1, OPTMUM選 zero ,STARTVAL 開始值:比原有值的三倍大一些即大于 3*10.60 ; ENDVA結束值:比原來的 四倍大一些,即大于4*10.60+4 ; INC步長一般定為2, 36、38等等),填好 以上各參數后,點擊Staroptimlze tSav>ok開始做實驗t若出現負值的 峰,說明已經越過180度得電,點擊skipcurrentoptim 停止實驗。結果存在TITLE里面,不用記錄。在 Acquars中的P1 (us)得到值/4, 得到的值其實是零點的值,即360度

26、得值,除4即可得到90度的值。(10) 更改prosol表,輸入命令edprosol ,將左右通道的pulse值改過來t Save tselectallrelevanttok輸入密碼t oktyestokyestok,關閉窗口。2、 C13的90度脈沖,標樣:ASTM (參考講義P48)(1) nesPROCNO(理號一定為1) tC13CPD準實驗名稱)(2) getprosol tlock 溶劑名稱t atma; topshim(3) 修改參數,輸入命令eda修改采樣參數:將zgpg30改為zgpg; NS=1;DS=0 O1P=67O2P=3.f®輸入命令ased修改與脈沖系列

27、相關的參數:RG=3減64;D1 (S) =20; P1先記錄下原始數值如8.8,先賦予小點的值如2us(4) 輸入zg命令直接采樣(5) efp ; apk讓窗口只出C的信號,輸入dpl ,以下步驟與H的90度脈沖一致, 可參考H的90度脈沖。Notice :測完后要到prosol表中進行更新。3、如何計算當前樣品的90度脈沖值?(1) new設定好參數之后做pulsecal(2) 輸入命令pulsecal , enter后可以計算當前樣品的90度脈寬,測完后點擊 close。第一次做pulsecal命令時會彈出對話框“該命令正在編譯”直接 close掉就可以了。4、3D勻場,標樣:90洌&

28、lt;+10咖水。(1) new,建立一個一維 H譜實驗(2) lockH20+D2O(3) atma; topshimgui (可以去除Y方向的勻場梯度)(4) 選 3A After : ZX-Y-XZ-YZ-Z (不做 Before) t Star t 結束后點 close。(5) 選一個常做的樣品,做一個一維 H譜,lock tgetprosol ; atma; topshim(6) 輸入 ws卜在filename中輸入文件夾名稱t write tcloseNotice :怎樣判斷勻場好不好?看 DMS。甲醇、丙酮的多重峰看 TMS勺衛(wèi) 星峰看溶劑本身的峰信號,越窄越好。5> lo

29、ckfield 的校準 方法一:鎖場鎖笊信號,標樣用10%勺EBinCDC3(1) 進樣(2) lockCDCla(3) 進入 BSM融盤Tlock'level tfield t讀取 field 值并記錄下來(6704.3) t點ON-OFF兌鎖t輸入命令lopo , enter進行鎖場參數的優(yōu)化t選溶劑,點 ok t輸入6704.3 (鎖場后的值)。Notice :紅線和綠線的交義點在鎖場的最中問, 蝴蝶線完全對稱,通過更改phase 值可以使其變得對稱,從交義點出來的第一個峰都是向上的。(4) 點擊stanby ,命令行中輸入edlock ,點折線圖標進行保存。方法二:什么溶劑都鎖

30、不上的情況下使用該方法(1) 放H20+D2O的標樣進去(2) 將 sweep 的 ON-OFF掉(3) 修改采樣參數,建立一個 H譜 zg30, NS=1, DS=0 O1P=4.7, SW=3040ppm(4) atma; rga ; zg ;(5) efp ; apk(6) 找到水峰,看水峰與4.7偏離了多少H乙在procpars中將PH_mo敬為pk;(7) 輸入命令gs,點實時變化譜圖,打開 BSM虢盤,進入locklevel里面, 調節(jié)filed 值,使水峰到達4.7的位置,到達4.7后點Standby,輸入命 令edlock ,點折線圖標,保存。(8) 將GS界面stop掉(9)

31、 用CDC3樣品做校準。十二、一維選擇性激發(fā)實驗1、實驗一:針對分的比較開的峰(1) 新建一個實驗,做一個一維譜。(2) 點擊積分符號,在自己想要的信號上,對其進行積分。(3) “Saveasveg”右擊保存圖標,保存。(4) 輸入 buttonnmr,選擇 select -(5) 點擊setGrROESY>OQ輸入實驗名稱后點OQOK不能再更改參數,直 接采樣;cancel只是建立實驗,還可以修改參數。本例中選cancel。(6) 修改 NS=8%NDS=4*N(7) rga; zg(8) efT相位校正,一般會出現三種信號:相關信號、吸收型信號、色散信號。2、實驗二:針對重疊比較嚴重

32、的多重峰。CSSF:chemicalshift 化學位移,selectivefilter 。(1) 進樣,采集一個一維譜(2) 找到重疊峰,拷貝其中的一個化學位移:所關心的峰的中間位置。(3) 新建一個實驗,修改 O1P為前一步驟的化學位移值。(4) 更改脈沖系歹U ( pulprog ),選擇 selcssfzs.2 tok(5) 查看參數,修改NS=2*N,DS=16 TD0=816部分參數根據右側提示修改。CNST2=4此值取決于峰的重疊程度)(6) rga; zg3、實驗三(1) 在實驗二的基礎上,輸入命令i , I命令表示做同樣的實驗。(2) 更改脈沖系歹U,將selcssfzs.2

33、 tselecssfdizs.2(2表示第二個版本,為 了選擇峰;帶zs表示能量子激發(fā);di自旋鎖定,cosy峰為了找相關譜)(3) 更改參數D9(混合時間)、NS DS TD0等參數。(4) rga; zgNotice : cosy、tocsy、noesy、roesy 對角峰、交義峰都有; hsqc、hmbc沒有對 角峰,只有交義峰。十三、溶劑峰的壓制1、只壓制一個峰(1) 做一個一維譜,找到要壓制的峰,復制化學位移。(2) nes標準實驗名稱為: WATERSUP,應的脈沖系列為 NOESYGPPR1dk(3) 設置實驗參數,D1:低功率、長時間的功率,關鍵設置參數 D1和PL9。對 于N

34、S DS無嚴格要求;PL9=60dB(該值越大,實際功率越大);D1=2s(時 間越長,頻率覆蓋范圍越窄);O1P的值直接粘貼步驟一復制的化學位移值, 譜寬要足夠大。(4) getprosol ;2、壓制兩個峰(1) edcT標準實驗名稱:LC1D1夕OK(2) O1P慶制峰1的中間位置的化學位移值(譜圖的中間)O2P壓制峰2的中間位置的化學位移值。(3) getprosol(4) NS=8*N,DS=4,PL9=60(5) rga; zg 3、如何壓制多個峰?(1) nesLC1DCWPS準實驗名稱)(2) 修改參數NS DS SW(3) getprosol(4) 輸入命令L30(即壓制峰的

35、個數,如N)(5) 輸入命令xaua (自動采集一個一維譜),壓制 N個最強的峰4、水峰的壓制(與壓制一個峰的步驟是一樣的)(1) nesWATERSUBJOESGPPR1d(2) O1P的確定,NS DS D1、PL9(3) getprosol(4) lock(5) atma; topshim ;(6) RGA> RG 記錄 RG®(7) rga ; zgTfp tall tapk(8) 更改O1值(9) rga ; zg (多次循環(huán),直到水峰的壓制達到好的狀態(tài))5、實驗五(1) edc (ne時 t NOESYPR1D準實驗名稱)(2) D8=0.1S;NS DS(B據提示

36、確定);O1(O1P=4.7)、D11=30ms=0.03sD1=2S;PL9=5060Db宜給太大的值)(3) getprosol(4) lock(5) atma; topshim ; rga; zg拓展實驗:輸入I命令tnoesygppr 1d口梯度場實驗),更改梯度參數。Notice :加梯度場對鎖場相位要求比較高。十四、Topspin軟件介紹1、通過命令re、rep、rel、repl+空格+數字打開文件2、rel :打開最后一個實驗名稱下的實驗號。Repl:實驗號下面的某一處理號。3、命令expl :按照2.1或者3.0版本的統(tǒng)一存放數據。4、命令.all5、E命令,選擇要看的區(qū)域6、

37、批處理:processing tsenalprocessing t Find 找到實驗名稱t next t LB0.3; efp ; apk; ppf (標峰)(輸入一系歹 U 命令符)t excute t close。Notice : LB增寬因子指數窗函數。7、批處理積分(intser批處理積分命令)(1)先對第一張譜圖進行積分并保存(2)輸入命令intser(3)選擇第幾個實驗t next(4) options (calibrate : 選定某一個位置;Normalizesumofintegrals 歸一 化法)T第幾個峰T定義幾個T Ok,歸一化值加和多少,可以自己增。8、增加一個處理

38、號(wrp命令)Corldram預測化學位移9、去卷積(去卷積的峰保留在999的處理號上面)Analysis t Deconvolution toktoptions (用什么函數)(uselorentzianshape ) 選擇區(qū)域(閾值)ok10、進入topspin用戶名和密碼的設置Set 命令t options admmistration locktopspinuserinterface11、 電子簽名: Electromicsignaturecreation,輸入命令 esign12、audit跟蹤文檔,可以看到所有的操作13、更改layout的三種途徑輸入命令layoutcontrl+

39、P處理參數中的Automation layout14、棋板保存的路徑,C:BrukerTopspin3.0plotlayouts15、stack1d多個譜圖疊加16、parplot參數修改17、輸入命令almanao打印化學位移18、利用NMRGuid由學:NMRGuide輸入關鍵詞t搜索19、Helptmanuals 1D2Dstep-by-stepbasic 多利用資源自學。十五、T1、T2的測定1、1H的T1的測定(做二維時也需要控溫)(1)做一個一維H譜(目的是看看勻場好不好有沒有合適的譜寬和O1PNesgetprosol tlock tatma; topshim ; NS=1;DS=

40、0 rga ; zgTefp ; apk(2) 輸入命令lexpno:完全拷貝當前實驗的所有參數,只是實驗號加1,目的 是為了譜寬和O1PtK不變。(3) 進入采樣參數欄,將zg30改為tlir (實際是假二維)t點 727) 圖標(目的是將其改為二維),彈出對話框,點OK>到脈沖參數里面看米樣參數:NS=8*N(此參數設置是實驗的關鍵),DS=4, FnMODE undefined tTD( fl : 變換等待時間,一般給10即可;f265536) , SW(F2:氫譜的譜寬,不變;F1 不用管)t點擊左側LIST,找到VDLIST,自己定義一個 VDLIST,edit (填十個點,

41、這是個點必須包含在弛豫時間內,前面的點密集些,后面的點系數些,如 0.01,0.02,0.05 , 0.1,0.4,0.8,1,3,5,10)其中最大值的確定是關鍵, 要保證做出來的曲線變化要么是向上的一個平臺,要么是向下的一個平臺。設置好后保存t回到與脈沖相關的參數上,D1(S)=10, D1值必須要大丁或者等丁 VDLIST中設 置的最大值,設置好 VDLIST后trga ; zg(4) 數據處理更改處理參數(procpars ) SIF1的一定是偶數,如16,其中SI(F1) > TD(F1);SI(F2) >TD(F2); t輸入命令xf2 (表示只對f2做傅里葉變換)t點

42、擊 相位調節(jié)圖標,將十字線辰在最下方,點鼠標右鍵選ADD(只需選一個點)t點R_圖標:出現氫譜,只需調節(jié)好氫譜的相位t保存,退出t返回處理參數propars 中,將F2維中的PH_mo故為PL點Analysis中的“T1/T2”圖標,進入右側 界面t點第一個圖標“折線FID”,彈出對話框,選spectrum ,彈出下一個對話 框,slice , number=1, ok點第二個圖標 peaksranges :彈出對話框,選 manualintegration ,彈出另一對話框,點ok,進入積分模式,選擇峰并進行積 分t積分后點擊“帶A的保存”圖標,選第三個選項 Exportregionstor

43、elaxationmoduleandrett點第三個圖標:relaxtion , widows fitingfuntionuxnmrt1 listfilename : vdlist 點數是前面設置的點數 10, 檢查以上三項無誤后輸入ok,點擊“» ”圖標,全部點擬合曲線t查看擬合 曲線T輸入plot命令T點擊T1/T2,拉動左鍵。2、1H的T2的測定(自選回波)(1) 做一個一維H譜(目的是看看勻場好不好有沒有合適的譜寬和O1PNesgetprosol lock atma; topshim ; NS=1;DS=0 rga ; zgTefp ; apk(2) 輸入命令Iexpno:完

44、全拷貝有參數,只是實驗號加1,目的 是為了譜寬和O1PtK不變。(12J J(3) 修改脈沖程序,改為cpmg將一維模式改為二維模式。(4) 在與脈沖相關的參數里面查看 NS DS Fnmode0勺定義(5) 修改 NS=8*N,DS=16,TD(F2=65536 F1=10), Fnmode:Nodefined, S"變。(6) 在LIST中,編輯VIDLIST (表示的是循環(huán)次數)表,如:2,10,20,50,100,200,300,500,750, ?(最后一個值的確定根據 Do來計算,是關鍵),單個循環(huán)時間=2Do+P18A保存。(7) 回到采樣參數中,查看和脈沖系列相關的參

45、數,Do稍微大丁 50*P2 (注意單位換算),D1值的設定,表示弛豫的恢復時間,與 T1有關,D1>5T1 本例中D1=10§測T2實驗中的關鍵參數有:D2慰NS D酸TDS1 隹VVLIST 的設定,最后一個循環(huán)次數由 Do決定。(8) rga; zg(9) 譜圖處理(與T1的處理過程類似,唯一區(qū)別是擬合出來的是循環(huán)的次數)更改處理參數(procpars ) SIF1的一定是偶數,如16,其中SI(F1) > TD(F1);SI(F2) >TD(F2); t輸入命令xf2 (表示只對f2做傅里葉變換)t點擊 相位調節(jié)圖標,將十字線放在最下方,點鼠標右鍵選ADD(

46、只需選一個點)t點R_圖標:出現氫譜,只需調節(jié)好氫譜的相位t保存,退出t返回處理參數propars 中,將F2維中的PH_mo故為PL點Analysis中的“T1/T2”圖標,進入右側 界面t點第一個圖標“折線FID”,彈出對話框,選spectrum,彈出下一個對話 框,slice , number=1, ok點第二個圖標 peaksranges :彈出對話框,選 manualintegration ,彈出另一對話框,點ok,進入積分模式,選擇峰并進行積 分t積分后點擊“帶A的保存”圖標,選第三個選項 Exportregionstorelaxationmoduleandrett點第三個圖標:r

47、elaxtion , widowsfitingfuntionuxnmrt1 listfilename : vclist 點數是前面設置的點數 10, 檢查以上三項無誤后輸入ok,點擊“» ”圖標,全部點擬合曲線t查看擬合 曲線T輸入plot命令T點擊T1/T2,拉動左鍵。Notice :此時得到的T2不是真正意義上的T2,而是循環(huán)次數,因此T2的 實際值計算公式為:如本例中得到的值為68.365,則T2的實際值=68.37*(2D+P180 =68.37* (2D+P2) =68.37* (2*0.00105+20.80*10 -6S) =151ms 注 意單位換算,P180即為P2

48、。C的T1的測定:脈沖系歹U選擇tlirpg 。十六、如何設置命令的自動排歹0 ?(1) 輸入 set 命令t Adiministration ,勾上 Enableautomaticcommandsppoling t ok(2) set t morepreferences tstatusbarprefrencest change 勾選需要顯示的欄目t Apply t okT最下方空白處右擊并將 Acquisitionbaron/off 關掉狀態(tài)欄,關掉后再打開。十七、如何建立宏命令的圖標?(1) 輸入edmac命令,edmc編輯宏命令 apk.All AbSF©ppf點 file(2

49、) 在菜單欄(目標欄)點右鍵,選擇Add/modifyabuttonwithtextlabel(Add/modifyabuttonwithananicon(3) Abs:自動積分;AbSn基線調整。,edmac瘁格+宏命令名稱t輸入efp 工具欄保存t關閉Adduserdefinedbutton t 出現對話框文本)(圖標)十八、H-P相關譜(1) new Acetone,標準實驗名稱:hmbcgpnd(nd表示在采樣過程中對 C13不 去偶)(2) 更改參數:輸入命令 EDSP將13C改為311 Default tSavClose。(3) getprosol(4) 更改采樣參數 sw (f1

50、 ) =400;ns=2*n, DS=1§ NUC1 f1 改為 31P; O1P,O2P=-50;更改與脈沖系列相關的參數: CNST13 8.0000(BC,關鍵參數)凡是帶梯度的 實驗,異核相關相關要設好核的梯度場,輸入 gradratio (改核后再修改)t彈 出對話框,顯示三個數值,依次填入梯度場中的參數設置中。(5) lock : acetone(6) atma; topshim ; rga; zg(7) 輸入xfb處理,dev32(8) 當右側譜寬出現幾萬的值的時候,輸入 sref ,回車,close , close。(9) 定標Notice : Nucleus1中的nucl的OFFfc為所要做的雜核。十九、變溫實驗(1) 50C以下,用塑料轉子即可,若大于 50 C時,要用陶瓷轉子,做高溫變溫 實驗時,氣流量要設置的大一些,并用惰性氣體保護線圈。氣流量要大陶瓷 轉子用惰性氣體保護線圈。(若氣流量太小,會導致樣品管底部溫度與上部溫 度不一致,導致梯度氣流量大,等待時間也短。)放樣品T先鎖場,鎖好

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