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ICSFORMTEXT點(diǎn)擊此處添加ICS號(hào)FORMTEXT點(diǎn)擊此處添加中國(guó)標(biāo)準(zhǔn)文獻(xiàn)分類號(hào)FORMTEXT?????DBFORMTEXT??DBFORMTEXTXX/FORMTEXTXXXXX—FORMTEXTXXXXFORMTEXT?????FORMTEXT新型鵝星狀病毒病診斷技術(shù)規(guī)程DiagnostictechniquesforNovelgooseastrovirusdiseaseFORMTEXT點(diǎn)擊此處添加與國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)一致性程度的標(biāo)識(shí)(送審討論稿)FORMTEXT2022.6.10FORMTEXT????-FORMTEXTXX-FORMTEXTXX發(fā)布FORMTEXTXXXX-FORMTEXTXX-FORMTEXTXX實(shí)施FORMTEXT????????發(fā)布DBXX/XXXXX—XXXX前??言本文件按照GB/T草。本文件由江西省農(nóng)業(yè)農(nóng)村廳提出并歸口。請(qǐng)注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機(jī)構(gòu)不承擔(dān)識(shí)別專利的責(zé)任。本文件起草單位:江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所。本文件主要起草人:李海琴、張帆帆、康昭風(fēng)、譚美芳、楊群、曾艷兵、韋啟鵬、黃江南、方紹培、譚佳、吳誠(chéng)誠(chéng)、季華員。新型鵝星狀病毒病診斷技術(shù)規(guī)程范圍本文件規(guī)定了新型鵝星狀病毒病的臨床診斷、實(shí)驗(yàn)室診斷和綜合判定技術(shù)要求。本文件適用于新型鵝星狀病毒病的診斷和流行病學(xué)調(diào)查。規(guī)范性引用文件下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求NY/T541獸醫(yī)診斷樣品采集、保存與運(yùn)輸技術(shù)規(guī)范術(shù)語(yǔ)和定義下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件新型鵝星狀病毒Novelgooseastrovirus,NGoAstV新型鵝星狀病毒屬于星狀病毒科(Astroviridae)禽星狀病毒屬(Avastrovirus),星狀病毒(Astroviruses,AstV)是一種呈球形的RNA病毒,直徑為25~35nm,病毒表面無(wú)囊膜,有5~6個(gè)突起,用透射電子顯微鏡觀察呈五角星狀或六角星狀。新型鵝星狀病毒病Novelgooseastrovirusdisease,NGoAstVD新型鵝星狀病毒病是由新型鵝星狀病毒引起的多品種鵝關(guān)節(jié)痛風(fēng)和內(nèi)臟痛風(fēng)為主要特征的致死性傳染病。臨床診斷流行病學(xué)主要感染雛鵝。病鵝、隱性帶毒鵝、帶毒種蛋是主要傳染源,自然感染的潛伏期是3d,經(jīng)蛋感染的雛鵝最早可在3日齡發(fā)病,以5~20日齡最為常見(jiàn),各品種的鵝均易感,死亡率30%~40%,最高可超過(guò)50%。臨床癥狀患鵝精神沉郁,食欲減退,飲水量增加,消瘦,四肢癱瘓,排白色稀便,隨后轉(zhuǎn)為黃綠色稀便,發(fā)病高峰期約在7~14日齡。病理變化剖檢病變剖檢病理變化主要表現(xiàn)為心臟、肝臟及肺臟表面有白色尿酸鹽沉積,腎臟呈花斑腎,輸尿管尿酸鹽沉積,關(guān)節(jié)腔尿酸鹽沉積嚴(yán)重,氣管也能見(jiàn)環(huán)狀白色尿酸鹽沉積,甚至腿肌出現(xiàn)大量尿酸鹽沉積。組織學(xué)病變患鵝腎小管上皮細(xì)胞脫落壞死,管腔內(nèi)充滿粉紅色的尿酸鹽沉積,腎間質(zhì)出血,腎小球腫脹;脾臟有大量紅細(xì)胞浸潤(rùn),肝細(xì)胞空泡變性。臨床診斷結(jié)果判定符合4.1流行病學(xué)特征,病鵝出現(xiàn)4.2臨床癥狀和4.3病理變化,可判定為新型鵝星狀病毒病疑似病例,應(yīng)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室確診。實(shí)驗(yàn)室診斷實(shí)驗(yàn)室生物安全要求按照GB19489執(zhí)行。病毒分離細(xì)胞分離儀器和設(shè)備
生物安全柜、可調(diào)微量移液器(2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、高壓蒸汽滅菌鍋、無(wú)菌離心管(1.5mL、15mL、50mL)、冰箱(4℃、-20℃、-80℃)、漩渦振蕩器、細(xì)胞培養(yǎng)箱、細(xì)胞培養(yǎng)瓶、細(xì)胞培養(yǎng)板。試劑磷酸鹽緩沖液(PBS)、DMEM/F12細(xì)胞培養(yǎng)液、胎牛血清(FBS)、胰酶、青霉素-鏈霉素溶液。分離病毒用細(xì)胞雞肝癌細(xì)胞系(LMH),LMH培養(yǎng)特性見(jiàn)參考文獻(xiàn)[1]。細(xì)胞的準(zhǔn)備在37℃水浴中提前預(yù)熱消化液(0.25%胰酶)和DMEM/F12細(xì)胞培養(yǎng)液(見(jiàn)附錄A),將生長(zhǎng)良好的LMH細(xì)胞用無(wú)菌PBS洗滌2次,棄去PBS,加入0.25%胰酶消化為單個(gè)細(xì)胞,加入少量細(xì)胞培養(yǎng)液,用吸管輕輕吹散細(xì)胞,再加入適量細(xì)胞培養(yǎng)液,用吸管輕輕吹打使細(xì)胞分散均勻后,按每孔1mL加入到細(xì)胞培養(yǎng)板;在37℃含5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24~36h,密度達(dá)到80%時(shí)用于細(xì)胞分離。病毒的分離培養(yǎng)將上述細(xì)胞培養(yǎng)液棄掉,用無(wú)菌PBS洗滌3次后,將處理好的樣品接種到單層細(xì)胞上,每孔0.2~0.4mL。放入細(xì)胞培養(yǎng)箱1h~2h,每隔15min輕輕搖動(dòng)一次,吸附后棄掉液體,用無(wú)菌PBS洗滌3次,加入細(xì)胞維持液(見(jiàn)附錄A),每孔1mL,于37℃含5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中連續(xù)培養(yǎng)5d,每天觀察細(xì)胞狀態(tài)。待細(xì)胞液變黃,將細(xì)胞培養(yǎng)瓶反復(fù)凍融3次,細(xì)胞液經(jīng)5000rpm離心10min后取上清用于檢測(cè)或置于-80℃保存。鵝胚分離儀器設(shè)備與耗材可調(diào)微量移液器(2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、高壓蒸汽滅菌鍋、無(wú)菌注射器(1mL、5mL)、無(wú)菌剪刀、無(wú)菌鑷子、無(wú)菌離心管(1.5mL、15mL、50mL)、無(wú)RNA酶的帶濾芯槍頭、75%酒精、碘伏、冰箱(4℃、-20℃、-80℃)、孵化箱、種鵝蛋(新型鵝星狀病毒抗體陰性)。種蛋準(zhǔn)備將種鵝蛋置于孵化器中37℃下孵育10~11d,用于病毒分離。樣品準(zhǔn)備見(jiàn)附錄B。鵝胚接種將待檢樣品以0.2mL/胚的劑量經(jīng)絨毛尿囊膜途徑接種10~11日齡鵝胚,37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每天照蛋2次,連續(xù)觀察6d,并記錄死胚情況。尿囊液收集棄掉接種后24h內(nèi)死亡的鵝胚,若接種2~6d內(nèi)鵝胚出現(xiàn)死亡,則收集死亡鵝胚的尿囊液;若接種6d內(nèi)鵝胚不出現(xiàn)死亡,則收集6d活胚的尿囊液。病毒的鑒定RT-PCR技術(shù)儀器設(shè)備與耗材PCR基因擴(kuò)增儀、核酸電泳儀、核酸電泳槽、凝膠成像分析系統(tǒng)、臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)、可調(diào)微量移液器(0.1-2.5μL、2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、無(wú)RNA酶的1.5mL離心管、無(wú)RNA酶的PCR管、無(wú)RNA酶的帶濾芯槍頭。試劑商品化RNA提取試劑盒、無(wú)RNA酶去離子水、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(包括Buffer緩沖液、M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶抑制劑)、2×PCRMix、dNTPs(2.5nmol/Leach)、DNAMarker、電泳級(jí)瓊脂糖、Tis-乙酸電泳緩沖液TAE(50×TAE,1×TAE)、1%瓊脂糖、陽(yáng)性對(duì)照(新型鵝星狀病毒)、陰性對(duì)照(陰性尿囊液或正常細(xì)胞)。引物隨機(jī)反轉(zhuǎn)錄引物Random9反轉(zhuǎn)錄引物。RT-PCR引物針對(duì)鵝星狀病毒的RT-PCR檢測(cè)引物,參照附錄C。試驗(yàn)步驟病毒RNA的提取按照RNA提取試劑操作說(shuō)明書(shū),提取待檢組織樣品總RNA。提取的RNA立即用于反轉(zhuǎn)錄,否則置于-80℃冰箱凍存。病毒cDNA的合成采用50μL體系,于無(wú)菌無(wú)酶EP管中依次加入RNA模板5μL、Buffer緩沖液10μL,隨機(jī)引物2μL、dNTPs(2.5mMeach)4μL、M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶(200U/μL)1μL,RNA酶抑制劑(40U/μL)2μL,補(bǔ)充無(wú)菌水至總體積共50μL,置于PCR儀中進(jìn)行cDNA合成,以25℃5min、50℃45min、85℃2min、4℃5min的程序進(jìn)行一個(gè)循環(huán),cDNA合成后進(jìn)行PCR擴(kuò)增或于-20℃保存?zhèn)溆谩CR反應(yīng)體系及反應(yīng)條件配置PCR反應(yīng)液,在樣品制備區(qū)加樣。采用25μL反應(yīng)體系,組成如下:2×PCRMix12.5μL上游引物(10μmol/L)1.0μL下游引物(10μmol/L)1.0μL模板cDNA2.0μL無(wú)RNA酶去離子水8.5μL總體積25.0μL瞬時(shí)離心,置PCR擴(kuò)增儀內(nèi)進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?5℃預(yù)變性3min;然后進(jìn)入擴(kuò)增循環(huán):95℃30s,55℃30s,72℃45s,35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸8min,4℃結(jié)束反應(yīng)。PCR產(chǎn)物檢測(cè)將制備好的1.0%瓊脂糖凝膠放入電泳槽(帶加樣孔的一端在陰極),倒入電泳液(1×TAE)浸過(guò)膠面。DNAMarker、陰性對(duì)照產(chǎn)物、PCR產(chǎn)物和陽(yáng)性對(duì)照產(chǎn)物各取7μL加入膠孔內(nèi),在110V電壓下電泳20~40min;在凝膠成像分析系統(tǒng)下觀察、拍照,并記錄結(jié)果。RT-PCR結(jié)果判定試驗(yàn)成立的條件陰性對(duì)照樣品無(wú)條帶,陽(yáng)性對(duì)照樣品出現(xiàn)489bp大小的條帶,試驗(yàn)條件成立。必要時(shí),對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行序列測(cè)定。試驗(yàn)結(jié)果的判定在試驗(yàn)成立的前提下,待檢樣品出現(xiàn)489bp大小的條帶,判定待檢樣品為新型鵝星狀病毒PCR陽(yáng)性。否則為陰性,必要時(shí),對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行序列測(cè)定。熒光RT-PCR技術(shù)儀器設(shè)備與耗材臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)、實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀、渦旋振蕩器、可調(diào)微量移液器(0.1-2.5μL、2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、無(wú)RNA酶的1.5mL離心管、無(wú)RNA酶的熒光定量PCR管、無(wú)RNA酶的帶濾芯槍頭。試劑商品化RNA提取試劑盒、無(wú)RNA酶去離子水、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(包括Buffer緩沖液、M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶抑制劑)、實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒、dNTPs(2.5nmol/Leach)、陽(yáng)性對(duì)照(新型鵝星狀病毒)、陰性對(duì)照(陰性尿囊液或正常細(xì)胞)。引物特異反轉(zhuǎn)錄引物Random9反轉(zhuǎn)錄引物。熒光定量RT-PCR引物和探針針對(duì)鵝星狀病毒的熒光PCR引物和探針,參照附錄C。試驗(yàn)步驟病毒RNA的提取同5.2.1.4.1。病毒cDNA的合成同5.2.1.4.2。熒光定量PCR反應(yīng)體系和反應(yīng)條件將試劑盒中預(yù)混液、引物和探針取出,置于冰上直至融化,將下列試劑依次加入到無(wú)RNA酶的熒光定量PCR管中。采用20μL反應(yīng)體系,組成如下:2×熒光定量PCR預(yù)混液10.0μL上游引物(10μmol/L)0.4μL下游引物(10μmol/L)0.4μL探針(10μmol/L)0.4μLcDNA1.0μL無(wú)RNA酶去離子水7.8μL總體積20.0μL將上述成分分別加入熒光定量PCR管中,輕輕混合均勻,瞬時(shí)離心,打開(kāi)熒光定量PCR儀和聯(lián)機(jī)計(jì)算機(jī),將上述熒光定量PCR管置于熒光定量PCR儀內(nèi),設(shè)置反應(yīng)程序?yàn)?4℃30s,94℃5s,60℃30s,45個(gè)循環(huán);4℃終止反應(yīng)。熒光定量PCR結(jié)果判定試驗(yàn)成立的條件閾值設(shè)定原則根據(jù)儀器噪聲情況進(jìn)行調(diào)整,以閾值線剛好超過(guò)正常陰性樣品擴(kuò)增的最高點(diǎn)為準(zhǔn)。陰性對(duì)照的檢測(cè)結(jié)果應(yīng)無(wú)特異性擴(kuò)增,陽(yáng)性對(duì)照Ct值應(yīng)<28,則試驗(yàn)結(jié)果成立。試驗(yàn)結(jié)果的判定Ct值≤30,而且出現(xiàn)明顯的擴(kuò)增線,表明樣品中存在新型鵝星狀病毒,判為陽(yáng)性。無(wú)Ct值,并且無(wú)擴(kuò)增曲線,或者Ct值>35。表明樣品中無(wú)新型鵝星狀病毒,判為陰性。30<Ct值<35的樣品,判為可疑,必須重做。重做結(jié)果Ct值<30者判為陽(yáng)性,否則判為陰性。RT-LAMP方法儀器設(shè)備與耗材高速冷凍離心機(jī)、水浴鍋、紫外分析儀、可調(diào)微量移液器(0.1-2.5μL、2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、無(wú)RNA酶的1.5mL離心管、無(wú)RNA酶的PCR管、無(wú)RNA酶的帶濾芯槍頭。試劑商品化RNA提取試劑盒、無(wú)RNA酶去離子水、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(包括Buffer緩沖液、M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、RNA酶抑制劑)、商品化LAMP擴(kuò)增試劑盒、TE可視染料、陽(yáng)性對(duì)照(新型鵝星狀病毒)、陰性對(duì)照(陰性尿囊液或正常細(xì)胞)。試驗(yàn)步驟病毒RNA的提取同5.2.1.4.1。病毒cDNA的合成同5.2.1.4.2。引物見(jiàn)附錄C。LAMP反應(yīng)體系和反應(yīng)條件2×buffer12.5μL酶混合物(EM)1.0μL內(nèi)引物-NGoAstV-FIP1.0μL內(nèi)引物-NGoAstV-BIP1.0μL外引物-NGoAstV-F30.5μL外引物-NGoAstV-B30.5μL環(huán)引物-NGoAstV-LB1.0μL環(huán)引物-NGoAstV-LF1.0μLcDNA2.0μL無(wú)RNA酶去離子水4.5μL總體積25.0μL將上述成分分別加入無(wú)菌的PCR管中,輕輕混合均勻、離心后置于PCR擴(kuò)增儀內(nèi)進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)程序64℃反應(yīng)60min,然后85℃反應(yīng)2min進(jìn)行酶滅活處理。LAMP結(jié)果判定試驗(yàn)成立條件反應(yīng)結(jié)束后,取TE染料加入產(chǎn)物中,混勻后在紫外線下觀察。在陽(yáng)性對(duì)照出現(xiàn)黃綠色熒光,同時(shí)陰性對(duì)照不出現(xiàn)黃綠色熒光的情況下,試驗(yàn)成立。結(jié)果判定在紫外線下被檢樣品出現(xiàn)黃綠色熒光,判為陽(yáng)性;在紫外線下被檢樣品未出現(xiàn)黃綠色熒光,判為陰性。綜合判定符合臨床診斷規(guī)定的疑似病例經(jīng)5.2.1、5.2.2、5.2.3中的任一方法檢測(cè),結(jié)果為陽(yáng)性者,可判定為新型鵝星狀病毒病。_________________________________
(資料性附錄)
LMH細(xì)胞培養(yǎng)液配制細(xì)胞培養(yǎng)液在DMEM/F12培養(yǎng)液中加入10%FBS、1%青霉素-鏈霉素溶液(1萬(wàn)U/mL),用于LMH細(xì)胞培養(yǎng)。細(xì)胞維持液在DMEM/F12培養(yǎng)液中加入2%FBS、1%青霉素-鏈霉素溶液(1萬(wàn)U/mL),用于病毒感染后的LMH細(xì)胞維持。
(資料性附錄)
樣品的采集、處理、運(yùn)輸及保存儀器設(shè)備與耗材臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)、高壓蒸汽滅菌鍋、高壓滅菌的剪刀、高壓滅菌的鑷子、旋渦振蕩器、可調(diào)微量移液器(2-20μL、20-200μL、100-1000μL)、無(wú)菌注射器(1mL、5mL)、無(wú)RNA酶的1.5mL離心管、無(wú)RNA酶的帶濾芯槍頭、0.22μm微孔濾器、冰箱(4℃、-20℃、-80℃)、一次性口罩、一次性手套和一次性帽子。樣品采集可采標(biāo)NY/T541。采集和樣品前處理過(guò)程中應(yīng)戴一次性手套、口罩、帽子,采集過(guò)程中樣品不得交叉污染。⑴組織樣品:采集死亡鵝或發(fā)病鵝的心、肝、肺、腎、脾等組織,采集病料時(shí),用無(wú)菌的剪刀剪取組織樣品,將樣品裝入一次性無(wú)菌50mL離心管或一次性潔凈塑料自封袋,密封、編號(hào),待檢。⑵細(xì)胞培養(yǎng)上清液:直接將細(xì)胞培養(yǎng)上清液加入到滅菌的1.5mL離心管中,加蓋、編號(hào),待檢。⑶鵝胚尿囊液:直接將鵝胚尿囊液加入到滅菌的1.5mL離心管中,加蓋、編號(hào),待檢。⑷肛拭子樣品:取泄殖腔棉拭子時(shí),將棉拭子深入泄殖腔轉(zhuǎn)3圈并沾取少量糞便;將棉拭子頭一并放入盛有1mLPBS的無(wú)菌離心管中,蓋上管蓋并編號(hào),10000rpm離心5min后取上清備用。樣品處理組織樣品在生物安全柜內(nèi)用滅菌剪刀剪碎后按照1:5加入無(wú)菌PBS(pH7.4、0.01
mol·L?1)進(jìn)行研磨,反復(fù)凍融3次后,在4℃下10000
rpm
離心15
min,上清液經(jīng)0.22
μm濾器過(guò)濾后-80
℃冰箱保存。細(xì)胞上清液和鵝胚尿囊液將細(xì)胞培養(yǎng)液和鵝胚尿囊液在4℃下10000
rpm
離心15
min,將上清液轉(zhuǎn)入滅菌的1.5mL離心管中,依據(jù)原樣品地編號(hào)。
(資料性附錄)
新型鵝星狀病毒RT-PCR引物、熒光RT-PCR的引物和探針、RT-LAMP引物新型鵝星狀病毒RT-PCR檢測(cè)引物見(jiàn)表E.1。表E.1鵝星狀病毒RT-PCR檢測(cè)用引物和探針引物名稱引物序列(5ˊ→3ˊ,上下兩行分別為上下游引物序列)產(chǎn)物大小,bp基因用途NGoAstV-FATTCTTGGCTCGGTTGTC
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