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文檔簡介
實驗八
親和層析分離純化目標蛋白實驗目的掌握GST親和層析分離純化目標蛋白的原理和實驗方法(第一部分)掌握SDS檢測目標蛋白原理和方法(第二部分)第一部分
GST親和層析分離純化目標蛋白親和層析原理
生物大分子與配體特異非共價可逆結(jié)合酶-底物酶-底物類似物(酶的競爭性抑制劑)抗體-抗原激素-受體外源凝集素-多糖、糖蛋白、細胞表面受體核酸-互補核苷酸序列(Oligo-dT)親和層析原理GST親合層析谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶(GST,26kd)谷胱甘肽(GSH)作為配體,共價結(jié)合在葡聚糖上,(Sepharose4B)葡聚糖上的GSH與GST結(jié)合用還原型GSH洗脫GSTGSH-Sepharose4BGSH-Sepharose4BGSH-Sepharose4B實驗步驟一、細胞破碎3600mL誘導后的菌液,離心分裝到12只50mL離心管,-20℃保存。(每個班用2管)每管加30mLPBS緩沖液,混勻;超聲3S,暫停5S,持續(xù)15min;平衡,10000rpm/,5min,離心;取25uL上清,作為分離純化前的樣品;每組分取3-5mL上清液,上柱純化。二、裝GSH-Sepharose4B柱1.清洗和裝好層析柱,封閉出口;2.加入2mLPBS;3.取1-2mlGSH-Sepharose4B,加入柱子中;4.打開柱子出口,使PBS緩慢流出。注意:始終保持柱內(nèi)的液面高于GSH-Sepharose4B
三、純化目的蛋白1.用5mlPBS緩沖液洗柱床,重復3遍。2.將混合蛋白質(zhì)溶液2-3mL加到柱子中。3.用5mlPBS緩沖液洗柱子,重復3遍。4.加入1.5ml洗脫液。5.用1.5mL離心管收集洗脫液,每管收集0.3ml(約6滴),共收集5管。6.PBS緩沖液洗柱子3遍,關(guān)閉出口。7.將第3、4管和第5管用于目的蛋白的檢測。四、SDS樣品制備
0號樣:過柱前的蛋白溶液40uL,加10uL5X
上樣緩沖液。
3號樣:洗脫的蛋白溶液(3號管)40uL,加10uL5X上樣緩沖液。
4號樣:洗脫的蛋白溶液(4號管)40uL,加10uL5X上樣緩沖液。5號樣:洗脫的蛋白溶液(5號管)40uL,加10uL5X上樣緩沖液。
混勻后在沸水中加熱3-5min。03450345M每個樣點30微升親和層析試劑PBS(pH7.4)NaCl(58.5)40g;KCl(74.5)1.0g;KH2PO4(136.09)1.2g;Na2HPO4·12H2O(358.14)18.1g;加水定容到5000mL。親和層析試劑50mMTris-HCl(pH8.0)Tris(121.14)6.055g,溶于900mL水,用HCl調(diào)pH到8.0,用水定容至1000mL。洗脫液還原型谷胱甘肽(307.32)0.15366g,溶于50ml50mMTris-HCl(pH8.0)中。第二部分
SDS檢測目標蛋白實驗目的掌握SDS檢測蛋白原理和方法掌握垂直板電泳的操作方法實驗步驟1、洗凈玻璃板,蒸餾水沖洗3遍,吹干并安裝電泳槽。2、制作12%分離膠。按下表中所列順序加試劑,輕輕搖勻,加入兩塊玻璃板間,高度約玻璃板高度的一半。3、用1mL蒸餾水封住分離膠液面,室溫聚合約30min,至分離膠與水之間出現(xiàn)一條清亮的分界線,倒掉水層,用濾紙條吸干殘余的水。4、倒出水并用濾紙吸干,配好5%濃縮膠,輕輕搖勻,加入濃縮膠,迅速插入樣梳,靜置約30分鐘。
※水封的目的是為了使分離膠上沿平直,并排除氣泡。
※凝膠聚合好的標志是膠與水層之間形成清晰的界面。※樣梳需一次平穩(wěn)插入。梳口處不得有氣泡,梳底需水平。12%分離膠試劑名稱12%分離膠ddH2O2.5mL30%Acr-Bis(29:1)3.0mL1.5MTris-HCl(pH8.8)2.0mL10%SDS75uLTEMED(加速劑)10uL10%APS(催化劑,最后加)75uL總體積7.5mL分離膠的高度為整個凝膠高度的一半試劑名稱5%ddH2O3.4mL30%Acr-Bis
(29:1)0.86mL1MTris-HCl(pH6.8)0.62mL10%SDS50uLTEMED20uL10%AP(最后加)50uL總體積5mL5%濃縮膠5.將膠板放入電泳槽,加入1×Tris-Gly電泳緩沖液,拔掉梳子,液面應該完全沒過電極。6.點樣(Marker和待測蛋白樣,加入樣品緩沖液)每個點樣孔點30uL樣品,每板膠點15uLMarker。
加樣前,樣品在沸水中加熱3分鐘,以除掉亞穩(wěn)態(tài)聚合7.80V電泳約30min,等蛋白進入分離膠后,將電壓調(diào)節(jié)到120V,繼續(xù)電泳。溴酚藍接近膠底部時,關(guān)閉電源。電泳結(jié)束。實驗步驟8、撬開玻璃板,將凝膠做好標記,切除多余的膠,放在塑料盒內(nèi),加入染色液,染色30min左右。(染色液需回收,可反復使用)9、染色后的凝膠用蒸餾水煮沸脫色。(高火微波爐中煮5分鐘)10、觀察實驗步驟純化前純化后mark實驗試劑
低分子量標準蛋白
兔磷酸化酶B97400
牛血清白蛋白66200
兔肌動蛋白43000
牛碳酸酐酶31000
胰蛋白酶抑制劑20100
雞蛋清溶菌酶14400實驗結(jié)果分析繪制標準曲線:logMW=K-bm
蛋白質(zhì)區(qū)帶中心至分離膠上沿距離相對遷移率=
溴酚藍至分離膠上沿距離
以每個蛋白標準的分子量對數(shù)作縱坐標,相對遷移率作橫坐標,作標準曲線,然后在計算出待測蛋白的遷移率即可在標準曲線上查出其分子量。蛋白質(zhì)與SDS按1:1.4比例形成復合物,消除了各種蛋白質(zhì)分子之間原有的電荷差異。蛋白質(zhì)的遷移速度只取決于分子大小。在15-200KD之間,蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系:logMW=K-bm實驗原理不連續(xù)系統(tǒng):
緩沖液離子成分、pH、凝膠濃度及電位梯度的不連續(xù)性。
電荷效應、分子篩效應、濃縮效應。連續(xù)系統(tǒng):電泳體系中緩沖液pH值及凝膠濃度相同。電荷、分子篩效應。(三個不連續(xù)性)1、凝膠孔徑的不連續(xù)性(2種孔徑的凝膠)2、緩沖液離子成分及pH值的不連續(xù)性(2種緩沖體系,3種pH):濃縮膠,pH6.8,蛋白質(zhì)分子的遷移率比Cl-
低,比Gly高。3、電位梯度不連續(xù)性:快離子(Cl-
)后面形成高電位梯度區(qū),慢離子(Gly)前面形成低電位梯度區(qū),高電位梯度和低電位梯度之間的地方,形成一個穩(wěn)定而不斷向陽極移動的界面,蛋白質(zhì)分子在界面處濃縮成一個狹小的中間層。濃縮效應SDS試劑1.30%(W/V)凝膠:丙烯酰胺(Acr)29.0g,亞甲基雙丙烯酰胺(Bis)1.0g,加水到100mL。2.分離膠緩沖液(pH8.8,1.0mol/LTris-HCl):三羥甲基氨基甲烷(Tris)12.1g,加約80mL蒸餾水,用1.0mol/LHCl調(diào)節(jié)pH到8.8,用蒸餾水稀釋到100mL。3.濃縮膠緩沖液(1.0mol/LTris-HCl,pH6.8)
Tris12.1g,加約60mL蒸餾水,用1.0mol/LHCl調(diào)節(jié)pH到6.8,加蒸餾水到100mL。4.10.0%(W/V)SDS5.10.0%(W/V)過硫酸銨(現(xiàn)用現(xiàn)配)6.10X電極緩沖液(pH8.3):Tris30.3g,Gly144.2g,SDS10.0g,加水到1000mL。(用時稀釋10倍)7.蛋白質(zhì)標準溶液:低分子量蛋白質(zhì)標準,加200uL水溶解,加50uL上樣緩沖液。8.上樣緩沖
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