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STYLEREF標(biāo)題摘要第2章臨床PCR檢驗(yàn)2.1標(biāo)本的類型在臨床PCR中,血清(血漿)、血液、外周血單核細(xì)胞、痰、棉片、膿液等體液(胸腔積液、腹水、腦脊液、尿液等)、乳液、運(yùn)輸和保存對(duì)檢測(cè)結(jié)果有影響。因此,為了驗(yàn)證試驗(yàn)結(jié)果的正確性,必須制定收集、運(yùn)輸和保存臨床樣品的標(biāo)準(zhǔn)程序。2.2標(biāo)本的采集2.2.1標(biāo)本采集時(shí)間采集過(guò)早或過(guò)晚都可能會(huì)給出假陽(yáng)性結(jié)果,所以一定要把握好最佳時(shí)間。2.2.2標(biāo)本采集部位消毒在開(kāi)始取樣之前,應(yīng)清潔取樣點(diǎn),以去除受污染的微生物或其他雜質(zhì)。但是,這必須是適當(dāng)?shù)模^(guò)度凈化可能會(huì)去除或破壞目標(biāo)微生物。2.2.3采樣量樣本的類型和數(shù)量應(yīng)根據(jù)已經(jīng)識(shí)別出的引起疾病的微生物來(lái)確定,一般要根據(jù)引起充足數(shù)量疾病的微生物樣本來(lái)確定,用于提取核酸和測(cè)量此后的增長(zhǎng)。在病原體含量低的樣品中,樣品的尺寸是測(cè)量的關(guān)鍵。例如,PCR用于血液檢查,血液中的特異性抗原或抗體一般含有較少的病原體,因此需要更多的樣本。2.2.4樣品采集器衛(wèi)生棉條和其他收集的材料必須是一次性的,運(yùn)輸容器還必須是密封的一次性消毒器。材料中使用的抗凝劑和相關(guān)試劑不應(yīng)妨礙基因的擴(kuò)大和測(cè)試。2.2.5采樣過(guò)程中的防污染最好使用一次性材料,而不是直接治療;采集時(shí)應(yīng)特別注意防止污染,混入作業(yè)人員皮膚細(xì)胞、痰盂等;如果使用玻璃器皿,則必須在0.1%高壓水下處理,以使核糖核酸酶能夠存活和降解,這可以抑制聚合酶鏈反應(yīng)。2.3標(biāo)本的運(yùn)送一旦收集了所有的PCR樣品,就應(yīng)暫時(shí)儲(chǔ)存在2-8℃之下,然后再送往實(shí)驗(yàn)室。應(yīng)盡快將其送到實(shí)驗(yàn)室。在無(wú)菌條件下收集的DNA靶標(biāo)樣品應(yīng)在室溫下交付實(shí)驗(yàn)室8小時(shí);如果核酸是RNA,它可以在室溫下運(yùn)輸10分鐘。如果需要很長(zhǎng)的時(shí)間,它應(yīng)該在冰上運(yùn)輸。2.4標(biāo)本驗(yàn)收、拒收采集的樣本必須從原容器中采集,不能與生化、免疫學(xué)等其他樣本混用,因?yàn)樗鼈冎g感染的可能性很高。應(yīng)拒收溶血或高脂血癥等血樣。對(duì)于沙眼衣原體的擴(kuò)張,應(yīng)在顯微鏡下觀察表皮,因?yàn)椴≡w是在上皮細(xì)胞中形成的,如果下一層上皮沒(méi)有或很少,如果在顯微鏡下觀察到的白細(xì)胞很少,說(shuō)明沒(méi)有收集到合格標(biāo)本。2.5標(biāo)本的預(yù)處理和保存血清(漿)標(biāo)本
如果血清樣品用于DNA提取和檢測(cè),請(qǐng)遵循血清樣本的一般處理程序。如果EDTA更適合RNA捕獲檢測(cè),則嚴(yán)禁使用海洛因。因?yàn)樗种屏薖CR的增加,在核酸提取過(guò)程中很難完全清除,防止凝固后1h內(nèi)分離血清,4h內(nèi)分離血漿,放入1.5ml無(wú)菌離心管保存。外周血單個(gè)核細(xì)胞
外周血單個(gè)核細(xì)胞可以在抗凝劑中產(chǎn)生。主要有兩種方法:一種是用淋巴細(xì)胞分離液分離產(chǎn)生外周血單個(gè)核細(xì)胞,另一種是用紅細(xì)胞溶解液分解全血中的紅細(xì)胞,用生理鹽水反復(fù)洗滌可獲得單核細(xì)胞。痰
痰屬于分泌物,臨床上經(jīng)常使用DNA檢測(cè)結(jié)核,痰中含有大量粘稠雜質(zhì),DNA提取需要初步處理在室溫下用NaOH或變性劑液化約三十分鐘,如果液體樣品不能立即用于DNA提取,可以保存在-70℃下。棉拭子
在檢測(cè)性病病原體的PCR程序中,臨床樣本通常是棉絮,可將棉絮棒置于室溫下適量的生理鹽水溶液中,完全搖勻洗凈,然后在室溫下放置5至10分鐘。立即離心殘余物,隨后的沉淀可用于提取DNA。如果不立即使用膠囊提取核酸,則應(yīng)將其儲(chǔ)存于-70℃下。膿液
膿液如用于分枝桿菌測(cè)定的標(biāo)本,黏液可采用痰標(biāo)本的處理方法來(lái)處理,先液化,再離心取沉淀提取DNA;水樣的膿液則直接離心沉淀用生理鹽水洗2-3次后,即可用于DNA提取。第3章案例分析3.1案例一男性,44歲,腹脹、厭食、乏力間作5年余,加重10余天。飲酒史15年,每天飲白酒約200毫升。患者緣于5年余前無(wú)明確誘因出現(xiàn)上腹部脹滿不適,食欲不振,周身乏力。到當(dāng)?shù)匦l(wèi)生院就診,化驗(yàn)乙肝五項(xiàng)提示“乙肝表面抗原陽(yáng)性,乙肝e抗原陽(yáng)性,乙肝核心抗體陽(yáng)性”,診斷為“慢性乙型病毒性肝炎”,間斷服用“護(hù)肝片”等藥物治療,病情遷延不愈。近10余天來(lái),患者飲酒后出現(xiàn)上腹部脹滿不適癥狀加重,無(wú)腹痛腹瀉,無(wú)惡心嘔吐。食欲不振,周身乏力。在家口服“護(hù)肝片、奧美拉唑腸溶膠囊”等藥物治療,癥狀無(wú)減輕,為系統(tǒng)診治。(一)體查:T36.5℃,P86次/分,R:15次/分,BP130/80/mmhg。神清語(yǔ)利,周身皮膚粘膜無(wú)黃染,未見(jiàn)蜘蛛痣及肝臟,未見(jiàn)皮下出血點(diǎn)。口唇無(wú)發(fā)紺,咽部無(wú)充血發(fā)紅,扁桃體無(wú)腫大。頸軟無(wú)抵抗,甲狀腺未觸及腫大。胸廓對(duì)稱,語(yǔ)顫無(wú)增強(qiáng)或減弱,叩診呈清音,雙肺呼吸音清,未聞及干濕啰音。心律86次/分,律齊,各瓣膜聽(tīng)診區(qū)未聞及病理性雜音。腹平軟,右上腹輕壓痛,無(wú)反跳痛,肝脾臟未觸及,肝區(qū)叩擊痛,移動(dòng)性濁音陰性,腸鳴音正常存在。雙腎區(qū)無(wú)叩擊痛,雙下肢無(wú)浮腫,四肢肌力、肌張力正常,病理征陰性。(二)輔助檢查乙肝表面抗原:500ng/ml。乙肝病毒指數(shù):9.3+7。肝功能:ALT(谷丙):138.6,AST(谷草):193U/L,GGT(谷氨酰基轉(zhuǎn)移酶):867U/L,前白蛋白:41.3mg/dl。尿素氮:2.3mmol/L,肌酐:36.2umol/L,尿酸:440.3umol/L,總膽固醇(TBIL):6.9mmol/L,高密度脂蛋白:2.91mmol/L,載脂蛋白A:2.60g/L。LDH(乳酸脫氫酶):248U/L,HBDH(α-羥丁酸脫氫酶):188U/L。上腹部超聲:肝臟實(shí)質(zhì)回聲增粗。(三)初步診斷1.慢性乙型病毒性肝炎2.高尿酸血癥3.高脂血癥(四)診斷依據(jù)1.患者上腹部脹滿不適,無(wú)腹痛腹瀉惡心嘔吐的癥狀。食欲不振,周身乏力。2.查體:Bp:130/80mmHg。周身皮膚粘膜無(wú)黃染,未見(jiàn)蜘蛛痣和皮下出血點(diǎn)。心肺未見(jiàn)異常。腹平軟,右上腹輕壓有痛感,無(wú)反跳痛,肝脾臟未觸及,肝區(qū)叩擊痛,移動(dòng)性濁音陰性,腸鳴音正常存在。3.輔助檢查資料:化驗(yàn)乙肝表面抗原:500ng/ml。乙肝病毒指數(shù):9.3+.7。肝功能:ALT:138.6,AST:193U/L,GGT:867U/L,前白蛋白:41.3mg/dl。尿素氮:2.3mmol/L,肌酐:36.2umol/L,尿酸:440.3umol/L,總膽固醇:6.9mmol/L,高密度脂蛋白:2.91mmol/L,載脂蛋白A:2.60g/L。LDH:248U/L,HBDH:188U/L。上腹部超聲:肝臟實(shí)質(zhì)回聲增粗。(五)鑒別診斷1.肝硬化:患者多有慢性肝炎病史,或者長(zhǎng)期飲酒、脂肪肝、自身免疫性肝炎,酒精肝等病史,主要表現(xiàn)為右上腹不適癥狀,周身乏力,可以出現(xiàn)皮膚粘膜黃疸,腹水、上消化道出血等癥狀,上腹部超聲檢查可以鑒別。2.慢性胃炎:患者一般表現(xiàn)為上腹部不適,惡心嘔吐,可以出現(xiàn)上腹部燒灼感,泛酸,食欲不振等癥狀。胃鏡檢查可以鑒別。(六)診治經(jīng)過(guò)入院后完善各項(xiàng)輔助檢查。給予感染性疾病護(hù)理常規(guī),II級(jí)護(hù)理,低鹽低脂飲食。予護(hù)肝片口服、硫普羅寧、肝水解肽靜點(diǎn)以保肝降酶,恩替卡韋分散片口服以抗病毒,辛伐他丁片口服以調(diào)脂,維生素C、維生素B6靜點(diǎn)以加強(qiáng)營(yíng)養(yǎng)支持。(七)臨床診斷1.慢性乙型病毒性肝炎2.高尿酸血癥3.高脂血癥(八)分析總結(jié)慢性乙型病毒性肝炎是由于HBV感染引起的,如果治療不及時(shí),可以會(huì)發(fā)展為肝硬化,甚至肝癌。慢性乙型病毒性肝炎患者需要定期復(fù)查肝功能和乙肝病毒指數(shù)。如果肝功能在正常范圍內(nèi),可暫時(shí)不用抗病毒藥物治療。如果乙肝病毒指數(shù)明顯升高,谷丙轉(zhuǎn)氨酶數(shù)值在正常數(shù)值的2倍以上,無(wú)禁忌癥,需要常規(guī)使用抗病毒藥物治療。目前比較常用的抗病毒藥物包括a-2b干擾素、聚乙二醇干擾素、拉米夫定片、恩替卡韋分散片等藥物,可以根據(jù)患者病情選擇,一定要按照療程用藥,避免隨意停藥,導(dǎo)致病情反彈。要注意定期復(fù)查肝功能、乙肝五項(xiàng)、乙肝病毒指數(shù)等項(xiàng)目。要注意飲食控制,不要吃辛辣食物,避免飲酒,防止損傷肝細(xì)胞。3.2案例二病人男,42歲,發(fā)熱、食欲減退時(shí)達(dá)10天。10天前不明原因出現(xiàn)發(fā)熱,體溫在38℃左右,伴有頭痛,全身乏力、食欲減退等癥,自認(rèn)為是“感冒”,口服“康秦克”等藥物,5天后體溫下降至正常,食欲好轉(zhuǎn),但家人發(fā)現(xiàn)患者皮膚發(fā)黃因此來(lái)醫(yī)院就診。(一)體檢:T36.5℃,p70次/分,R20次/分,BP110/70mHg鞏膜及皮膚黃染,未見(jiàn)肝掌且無(wú)出血點(diǎn),淺表淋巴結(jié)無(wú)腫大,頸軟,心肺正常。腹軟,右肋下2.3cm質(zhì)軟有壓痛感,表面光滑,脾未及。(二)實(shí)驗(yàn)室檢查:血常規(guī),血紅蛋白126g/L,白細(xì)胞5.0×10L,中性粒細(xì)胞0.66,淋巴細(xì)胞0.34,大便、尿常規(guī)正常。(三)肝功檢查:ALT450U/L,血清抗HAV-1gM(+)。(四)初步診斷:1.甲型肝炎病毒2.黃疸(五)診斷分析依據(jù)HAV主要在肝細(xì)胞胞漿內(nèi)復(fù)制,通過(guò)膽汁從糞便中排出,HAV只有一個(gè)血清型和一個(gè)抗原抗體系統(tǒng),肝炎又分為急性和慢性,急性黃疸型肝炎又分為。黃疸前期,黃疸期,恢復(fù)期三個(gè)階段,總病程2~4個(gè)月,黃疸前期甲型肝炎于物型肝炎發(fā)病較急,常伴全身癥狀發(fā)熱,全身乏力,消化道癥狀,食欲不振,厭油,惡心,嘔吐,腹痛,腹瀉,尿色逐漸加深。黃疸期自覺(jué)癥狀好轉(zhuǎn),發(fā)熱消退,但尿色繼續(xù)加深,出現(xiàn)黃疸約于二周內(nèi)達(dá)高峰。(六)輔助檢查肝功能檢查1.血清酶的檢測(cè)丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)是反映肝細(xì)胞功能的最常用指標(biāo);天門冬氨酸氨基酶(AST)存在于線粒體中,意義與ALT相同;堿性磷酸酶(ALP)在肝外梗阻性黃疸、淤膽型肝炎患兒童中可明顯升高;γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶在肝炎活動(dòng)期時(shí)可升高,在肝癌或膽管阻塞、藥物性肝炎者中可顯著升高。2.膽紅素黃疸型肝炎及部分肝硬化患者血清直接和間接膽紅素測(cè)定均升高,但前者幅度高于血清膽紅素是判定肝損傷程度的重要指標(biāo)之一。急性肝炎早期尿中尿膽原增加,黃疸期尿膽原和紅素均增加,梗阻性黃疸時(shí)尿膽紅素強(qiáng)陽(yáng)性而尿膽原可陰性。3.血清蛋白慢性肝炎和肝硬化時(shí)常有血清清蛋白減少和球蛋白增加。形成A/G值下降,甚置。4.凝血酶原活動(dòng)度凝血酶原活動(dòng)度高低與肝損害程度成反比,凝血酶原活動(dòng)度<40%時(shí)提示肝損傷嚴(yán)重。(七)超聲檢查動(dòng)態(tài)的觀察肝脾的形態(tài)大小血管分布情況,觀察膽囊大小,形態(tài),膽囊壁的厚薄,探測(cè)有腹腔積液,有無(wú)肝硬化,顯示肝門部及后腹部淋巴結(jié)是否腫大。(八)肝穿刺活體組織檢查肝穿刺活體組織檢查能準(zhǔn)確判斷。慢性肝炎患者所處的病變階段及預(yù)后,同時(shí)可進(jìn)行原位雜交和原位聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)確定病原及病毒復(fù)制狀態(tài)。臨床診斷為急性黃疸型甲型病毒型肝炎(九)治療原則:病毒性肝炎目前還缺乏可靠的特效治療方法,治療原則以適當(dāng)休息合理營(yíng)養(yǎng)為主,輔以適當(dāng)?shù)乃幬镏委煟苊怙嬀坪褪褂脫p害肝臟的藥物。3.3案例三患者男,68歲,14年前診斷為MPN-PV(骨髓增殖),曾使用羥基脲、別嘌醇及皮下注射干擾素進(jìn)行治療。現(xiàn)外周血常規(guī)檢查:白細(xì)胞計(jì)數(shù):10.5*109/L升高、血紅蛋白測(cè)定:64g/L下降、血小板計(jì)數(shù):75*109/L,白細(xì)胞分類,可見(jiàn)幼粒及幼紅細(xì)胞;巨脾,甲乙線:10cm,甲丙線:11cm丁戊線1cm;分子生物學(xué)檢查:jak2/v617f定量82.63%;BCR/ABLP190、BCR/ABLP210定量均為0;JAK2-Exon13、MPL-Exon10、CALR-Exon9均陰性;骨髓活檢:骨髓增生極度活躍,粒系,紅系,巨系細(xì)胞增生伴巨核細(xì)胞形態(tài)異常及纖維組織增生(MF-2);骨髓細(xì)胞涂片:增生重度減低,成紅細(xì)胞易見(jiàn)淚滴形紅細(xì)胞。見(jiàn)圖5.1圖5.1易見(jiàn)淚滴形紅細(xì)胞
骨髓涂片
瑞氏染色x1000圖5.2淚滴形紅細(xì)胞易見(jiàn)
偶見(jiàn)原始細(xì)胞
骨髓涂片
瑞氏染色x1000圖5.3PV后MF診斷標(biāo)準(zhǔn)(WHO,2017)乙型肝炎病毒是引起病毒性肝炎的主要病原體之一。根據(jù)有關(guān)資料統(tǒng)計(jì),全球約有3.5億乙肝病毒攜帶者,我國(guó)約50%~70%的人群感染過(guò)乙肝病毒,其中乙肝病毒攜帶者已超過(guò)1.3億,肝癌發(fā)病率也在增加。肝癌偏愛(ài)的人身上往往有8個(gè)特點(diǎn),分別是:1.得過(guò)乙肝2.有肝硬化3.家族中有肝癌患者4.過(guò)了40歲更要注意5.嗜酒如命6.喜歡吃霉變食品7.長(zhǎng)期患有膽結(jié)石8.長(zhǎng)期服用某些特定傳統(tǒng)藥物經(jīng)過(guò)四個(gè)案例分析數(shù)據(jù)得出下圖; 圖5.4圖5.5圖5.5圖5.6 結(jié)論也就是說(shuō),分子生物學(xué)技術(shù)廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、標(biāo)準(zhǔn)化、質(zhì)量管理等領(lǐng)域。由衛(wèi)生部開(kāi)發(fā),對(duì)分子生物學(xué)的發(fā)展起到了重要作用。交叉污染的醫(yī)療檢查在一定程度上得到了解決。分子生物學(xué)的應(yīng)用主要與完全自動(dòng)化的醫(yī)療系統(tǒng)的發(fā)展有關(guān)。可有效處理聚氯乙烯污染問(wèn)題的檢查。此外,分子生物學(xué)技術(shù)。例如,由于自擴(kuò)增系統(tǒng)等技術(shù)的發(fā)展,得到了人們的認(rèn)可。分子生物技術(shù)的廣泛應(yīng)用和醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)化大大減少了醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)過(guò)程中交叉污染的相關(guān)問(wèn)題,使得醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)難度大,可以提高整體效率。分子生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)的臨床應(yīng)用,主要指應(yīng)用分子生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)對(duì)人類疾病進(jìn)行診斷和研究的過(guò)程。包括病原微生物的診斷、人類基因組相關(guān)疾病的診斷惡性腫瘤個(gè)體化治療靶點(diǎn)的選擇以及在移植配型和個(gè)體識(shí)別方面的應(yīng)用。分子生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)通過(guò)檢測(cè)病原微生物的特征性基因位點(diǎn)以及患者自身基因結(jié)構(gòu)的變化或表達(dá)異常的存在,獲得疾病的診斷依據(jù),完成疾病的分子診斷。隨著分子生物學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)的飛速發(fā)展,分子診斷、基因診斷正日漸成為臨床上快速、準(zhǔn)確的進(jìn)行疾病診斷的重要途徑和手段。參考文獻(xiàn)[1]王海英.分子生物學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中的應(yīng)用進(jìn)展[J].當(dāng)代醫(yī)學(xué),2011,17(06):16.[2]李鵬.現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)在醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中的應(yīng)用[J].臨床和實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2007,(03):161.[3]楊振華.為21世紀(jì)中國(guó)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)事業(yè)崛起而奮斗——寫于本刊更名之際[J].中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2000,(01):4.[4]姚均,何忠平,張福杰,等.核酸序列擴(kuò)增早期診斷人類免疫缺陷病毒感染[J].中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2002,(06):42.[5]胡頌恩.分子生物學(xué)與檢驗(yàn)技術(shù)[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,2018.[6]武衛(wèi)杰,冷遠(yuǎn)逵,沈夢(mèng)飛等.基于功能納米材料的液相生物芯片檢測(cè)技術(shù)[J].化學(xué)進(jìn)展,2019,31(2/3):283-299.[7]徐疏梅.新一代DNA測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用與研究進(jìn)展[J].徐州工程學(xué)院學(xué)報(bào),2018,33(4):60
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