·· 基于文獻挖掘的乳腺癌免疫調控基因數(shù)據(jù)庫的構建研究摘要本課題從PubMed文獻檢索系統(tǒng)網站中搜尋有關乳腺癌免疫基因的文獻，把搜尋到文獻中乳腺癌相關的基因信息進行采集、挖掘。例如，IL-12基因是一種對乳腺癌有免疫作用的基因，把有關IL-12基因的文獻中的信息數(shù)據(jù)，免疫基因的名稱，免疫調控類型，文獻網址等信息數(shù)據(jù)收集，整理。然后用WPS中的Excel軟件把收集好的基因信息數(shù)據(jù)，整理成表格的樣子。表格中有乳腺癌有關的免疫基因名稱，免疫調控類型，免疫基因文獻網站等信息。之后，根據(jù)WPS中Excel中表格的信息數(shù)據(jù)，用MySQL數(shù)據(jù)庫把Excel表格中數(shù)據(jù)導入數(shù)據(jù)庫命名為gene表。最后，設計動態(tài)網頁來顯示數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)信息。在動態(tài)網頁的設計上有一些功能，分別是首頁、檢索、統(tǒng)計、上傳、下載。首先，首頁功能是把數(shù)據(jù)庫中乳腺癌信息和網頁設計介紹出來供用戶查閱。第二，檢索功能是通過網頁中的檢索框中輸入想要查詢的乳腺癌免疫基因的關鍵字，就可以查看基因相關的文獻信息，并通過點擊相關的文獻網址鏈接查看文獻。第三，統(tǒng)計功能是統(tǒng)計基因類型數(shù)量，并顯示給用戶查看。最后，上傳和下載功能是可以把收集的乳腺癌基因的相關文獻文件進行上傳，然后檢索后查看的乳腺癌基因信息中，可以根據(jù)數(shù)據(jù)庫中乳腺癌免疫基因文獻所對應的網址，把乳腺癌基因文獻下載出來，進行保存。綜上所述，本課題對乳腺癌免疫調控基因數(shù)據(jù)進行文獻挖掘，構建相關數(shù)據(jù)庫。這對乳腺癌研究有重要意義。關鍵詞：乳腺癌；免疫基因；數(shù)據(jù)庫目錄TOC\o"1-3"\h\u25347摘要 II76341引言 1278241.1乳腺癌治療的研究進展 1130611.2免疫療法在乳腺癌中的作用及意義 2326141.3乳腺癌中的免疫基因的識別 3213981.4乳腺癌相關數(shù)據(jù)庫研究與進展 494071.5乳腺癌的免疫調控基因相關數(shù)據(jù)庫作用及意義 569242數(shù)據(jù)和方法 6168912.1數(shù)據(jù)來源 666782.2數(shù)據(jù)收集與整理 6111982.3數(shù)據(jù)庫構建的工具 7263212.4數(shù)據(jù)庫網頁平臺開發(fā)工具 7275553數(shù)據(jù)庫網頁平臺的構建及展示 9267433.1數(shù)據(jù)庫網頁平臺結構設計 919973.1.1數(shù)據(jù)庫網頁平臺結構 93273.1.2數(shù)據(jù)庫網頁平臺數(shù)據(jù)庫結構設計 99173.2數(shù)據(jù)庫網頁平臺整體流程介紹 1043233.2.1數(shù)據(jù)收集 10192023.2.2底層Excel表格 11231673.2.2數(shù)據(jù)庫構建 1117143.3數(shù)據(jù)庫網頁平臺功能介紹 12300903.3.1home（首頁） 1211153.3.2search（檢索） 12258003.3.3statistical（統(tǒng)計） 13203.3.4download（下載） 1338153.4數(shù)據(jù)庫網頁平臺功能展示 1315607討論 1827930結論 194073參考文獻 201引言1.1乳腺癌治療的研究進展乳腺癌是女性中常見的惡性腫瘤之一，其發(fā)病率逐年上升。根據(jù)今年1月份世界衛(wèi)生組織國際癌癥研究機構（IARC）發(fā)布了2020年全球最新癌癥數(shù)據(jù)。據(jù)統(tǒng)計，乳腺癌新增人數(shù)達226萬，肺癌為220萬，乳腺癌正式取代肺癌，成為全球第一大癌癥[1]。近年來，隨著對乳腺癌研究的不斷深入，乳腺癌的治療方法不斷更新，乳腺癌治療取得了很大的成就。對于乳腺癌的治療，手術治療一直是乳腺癌治療的主要手段。在早期乳腺癌的治療方法是保守手術治療（主要是乳房腫瘤切除術），然后在進行乳房照射[2]。因此，早期容易對乳腺癌女性患者的乳房造成損傷。之后，阿拉巴馬對乳腺癌根治術和改良根治術進行實驗，實驗研究得出兩種手術患者的生存率沒有明顯的差別，但是改良根治術的手術范圍較小，在形體效果和上肢功能方面，乳腺癌改良根治術均優(yōu)于根治術，這為保留乳房的手術提供了理論依據(jù)[3]。國內研究顯示，保乳手術治療與傳統(tǒng)的改良根治術比較，具有手術操作時間短、術中出血量少、住院治療時間短、術后并發(fā)癥發(fā)生概率低，并且美容效果良好，術后患者心理負擔小等優(yōu)點[4]。保乳手術后的放射治療可減少局部復發(fā)，并將癌癥特異性存活率提高到與乳房切除術相當?shù)拇婊盥蔥5]。隨著乳腺癌輔助治療的不斷發(fā)展，保乳手術的適應證有所擴大，對一些原先具有保乳手術禁忌的乳腺癌患者也正在嘗試此手術。對于乳腺癌治療的研究，還有放射治療、內分泌治療等。放療是乳腺癌治療的重要組成部分，能夠明顯提高保乳手術治療者的局部腫瘤有效的控制率，并為提高患者遠期生存率提供有力保障[6]。國內研究顯示，術中放射治療在乳腺癌保留乳房手術中的應用得到滿意的療效，具有較高的臨床安全性，并且同時美容效果良好[7]。內分泌治療是利用SERM、芳香化酶抑制劑和促性腺激素釋放激素激動劑，可防止雌激素的產生或阻斷雌激素，從而防止刺激對雌激素敏感的腫瘤。據(jù)相關研究表明，對于絕經后激素敏感的早期乳腺癌患者，術后早期應用阿那曲唑（第三代芳香化酶抑制劑）的療效和耐受性明顯優(yōu)于他莫昔芬（抗雌激素類藥物），聯(lián)用曲妥珠單抗（轉移乳腺癌藥物）可明顯提高無瘤生存率和總生存數(shù)[8]。最后，乳腺癌其他的治療有目前國內外研究關注的乳腺癌靶向治療。乳腺癌靶向治療是指治療藥物進入體內后，可特異性地選擇致癌位點相結合并發(fā)生作用，從而無法誘導細胞進入無限增殖的狀態(tài)，從而起到治療作用[9]。隨著分子靶向治療的發(fā)展，乳腺癌將來有可能不以手術治療為主要治療手段。1.2免疫療法在乳腺癌中的作用及意義免疫療法是利用藥物刺激人體自身免疫系統(tǒng)提高識別和破壞癌細胞的能力。免疫療法是一種有吸引力且有前途的方法，可以利用免疫系統(tǒng)識別和破壞腫瘤的能力，從而預防復發(fā)和轉移性病變。免疫系統(tǒng)在乳腺癌的發(fā)生、進展和控制中發(fā)揮著積極作用[10]。免疫系統(tǒng)的一個重要功能是能夠保持自身免受正常細胞的攻擊。乳腺癌免疫療法主要是加強機體對癌的特異性抗原的反應，以達到控制癌的發(fā)生和發(fā)展，甚至于達到消滅的目的。免疫療法有免疫檢查點抑制劑，化療和放療聯(lián)合免疫療法等方法。癌癥免疫治療研究中最有希望和最有吸引力的方法是阻斷抑制免疫檢查點[11]。檢驗點抑制劑方法，免疫系統(tǒng)通過檢查點（免疫細胞上的蛋白質）來激發(fā)免疫反應的產生。乳腺癌細胞能使用這些檢查點來逃避免疫系統(tǒng)的攻擊。之后，檢驗點的抑制劑藥物有有助于重建免疫系統(tǒng)對乳腺癌細胞的免疫應答[12]。PD-L1抑制劑是一種阻斷免疫細胞上的蛋白質的藥物，它通過阻斷這種蛋白質有助于增加對乳腺癌細胞的免疫反應的作用[13]。通過增加免疫反應，從而擴大免疫的癌癥治療中受益的患者群體，對乳腺癌的免疫治療有重要意義。對于目前免疫療法，通過化療與免疫療法相結合能對三陰乳腺癌患者有非常好的治療效果。首先，化學療法可用于細胞減滅術并實現(xiàn)微小殘留疾病狀態(tài)，從而改變疾病負擔的平衡，有利于T細胞反應[14]。其次，化療可以促進腫瘤抗原呈遞和腫瘤特異性T細胞的啟動。最后，化療可以直接或通過改變宿主免疫抑制來刺激免疫效應物。現(xiàn)在的許多試驗研究中，在PD-1抑制劑中加入化療，通過減輕TME中的免疫抑制信號來增加免疫力[15]。這會是乳腺癌未來治療的發(fā)展趨勢，也能作為治療乳腺癌最好的方法。除了化療，放療也可以與免疫療法相結合增強腫瘤免疫力。它通過釋放腫瘤抗原，并促進它們被樹突細胞加工和交叉呈遞，從而促進T細胞啟動。此外，放療上調趨化因子和血管粘附分子以支持T細胞向腫瘤的運輸，并通過上調癌細胞本身的MHC分子、應激誘導配體和死亡受體的表達來進一步增強腫瘤免疫原性[16]。最后，局部放療可以與免疫療法協(xié)同作用，并通過增加TAA的釋放、增加APC、改善DC功能以及增強T細胞啟動來增強局部和遠處抗腫瘤作用[17]。現(xiàn)在乳腺癌免疫療法治療的試驗研究越來越多，相信對乳腺癌的治療會越來越好。1.3乳腺癌中的免疫基因的識別乳腺癌具有高度的異質性，所以具有很多種亞型。現(xiàn)在乳腺癌主要分為四種類型，LuminalA型（ER）、LuminalB型、HER2陽性（HER2）和三陰性。對其進行識別，鑒定的研究也有很多，現(xiàn)在常用于研究的就是三陰性乳腺癌（TNBC），因為研究表明，三陰性乳腺癌具有很強的異質性，TNBC比其他乳腺癌(BC)亞型更具免疫原性[18]。分析腫瘤異質性的重要工具就是基因組分析。在20世紀70年代。核型分析就被用于檢查基因組異常，由于來自乳腺癌的基因樣本是來自于異質細胞的不同DNA的混合物，因此很難確定細胞的基因組異質性程度。所以基因組分析和基因異常檢查方法的開發(fā)在那些得到很大的進展[19]。其中的技術進步有二代基因測序（NGS）和基因表達譜等。這些技術都能捕獲到乳腺癌細胞的基因組多樣性二代基因測序(NGS）是一種新型測序技術，通過癌癥基因組的詳細特征和有關乳腺癌的表觀基因組信息，獲取了癌癥基因組序列，從而發(fā)現(xiàn)與乳腺癌相關的基因和個體腫瘤的異質性[20]。還有有效的全基因組擴增（WGA），因此NGS可用于檢測單個腫瘤細胞的基因組改變[21]。最后通過對乳腺癌基因組序列上的分析，在對三陰性乳腺癌患者治療具有一定的指導意義，促進了乳腺癌治療的發(fā)展。基因表達譜是檢測乳腺癌患者基因異質性的重要方法。其中的基因微陣列和21基因表達是臨床檢測患者RNA表達異質性中常用的技術[22]。基因微陣列是附在固體表面上已知序列的基因探針的集合。該技術可以測量大量的基因表達水平，并識別不用癌癥患者之間的差異表達基因，實現(xiàn)基因信息的快速檢測。近幾年來，微陣列常常被用于篩選與乳腺癌相關的非編碼RNA，并識別新的腫瘤亞型標志物[23]。21基因表達測定是基于逆轉錄酶聚合酶鏈反應，能夠定性檢測基因表達。乳腺癌的21基因表達，其中包括16個與癌癥相關基因和5個內參基因，主要包括增值相關基因（Ki-67）,激素受體表達（ER,PR），通路激活和細胞侵襲相關基因[24]。通過這21個前瞻性選擇基因，來檢測ER陽性乳腺癌患者遠期復發(fā)的風險。在國外研究證明，使用21基因表達檢測可避免不必要的化療，大大的節(jié)省治療費用[25]。基因表達譜研究深化了對于乳腺癌異質性的認識，對ER陽性患者預后表現(xiàn)出良好的預測能力。總之，基因表達譜研究很有發(fā)展前景，對檢測乳腺癌有重要的作用。在國內外研究中，通過免疫基因組分析將TNBC分為三個不同的亞型：免疫高、免疫中和免疫低。根據(jù)29個免疫特征的免疫基因組學分析對TNBC進行了分類識別。通過分析了29個免疫相關基因集，它們代表了不同的免疫細胞類型、功能和途徑。我們使用單樣本基因集富集分析(ssGSEA)評分來量化癌癥樣本中免疫細胞、功能或通路的活性或富集水平。根據(jù)這個評分的分數(shù)高低來區(qū)分識別三陰性乳腺癌亞型。識別與免疫特征相關的TNBC亞型可能有助于優(yōu)化選擇對免疫療法有反應的TNBC患者[26]。1.4乳腺癌相關數(shù)據(jù)庫研究與進展因為乳腺癌具有高度的異質性，有很多亞型分類，所以為了統(tǒng)計乳腺癌的基因表達特征等數(shù)據(jù)，國際上有一些數(shù)據(jù)庫是來儲存分析這些數(shù)據(jù)的。癌癥基因組圖譜（TCGA）數(shù)據(jù)庫由美國美國國家癌癥和腫瘤研究所（NCI）和國家人類基因組研究所（NHGRI）于2006年聯(lián)合啟動，該數(shù)據(jù)庫主要對樣本進行外顯子組和基因組測序分析，所提供的數(shù)據(jù)包括：基因組拷貝數(shù)變化、表觀遺傳、基因表達譜、miRNA等。因此可以從TCGA數(shù)據(jù)庫下載了BC相關SNP的數(shù)據(jù)，并使用了生物信息學分析方法，包括突變數(shù)據(jù)、蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）網絡和相關性分析，挖掘與BC診斷和預后相關的突變基因[27]。國際癌癥基因組聯(lián)盟（ICGC）數(shù)據(jù)庫是為了協(xié)調研究項目而設立的，為了解決多種癌癥中存在的基因組變化。它可以獲取包括膽道癌、膀胱癌、乳腺癌等多達50種腫瘤及其亞型的基因組、轉錄組和表觀遺傳的全部信息[28]。這些數(shù)據(jù)可促進癌癥的機理和治療研究。這個數(shù)據(jù)庫和TCGA的關系，就是ICGC數(shù)據(jù)庫包括了TCGA的數(shù)據(jù)。另外呢，ICGC也納入了其他別的地區(qū)所做的隊列的測序數(shù)據(jù)[29]。所以如果使用ICGC進行檢索的話，我們可以得到更多的數(shù)據(jù)。最后，除了以上數(shù)據(jù)庫以外，對于乳腺癌數(shù)據(jù)挖掘還有METABRIC數(shù)據(jù)庫。METABRIC(乳腺癌國際聯(lián)盟的分子分類學)是一項加拿大與英國合作項目,旨在根據(jù)有助于確定最佳治療過程的分子特征將乳腺腫瘤分類為更多的亞類[30]。METABRIC是一項大型的分子分析研究，包括基因表達、拷貝數(shù)、基因突變和臨床數(shù)據(jù)[31]。根據(jù)METABRIC數(shù)據(jù)庫對乳腺癌的分類，這對乳腺癌的治療研究有著重要的幫助。1.5乳腺癌的免疫調控基因相關數(shù)據(jù)庫作用及意義對于乳腺癌的相關數(shù)據(jù)庫，有了TCGA、GEO、ICGC、CPTAC、METABRIC數(shù)據(jù)庫等，這些數(shù)據(jù)庫存儲著除了乳腺癌以外，還有其他膽道癌、膀胱癌、血癌等腫瘤的基因型，轉錄組和遺傳信息。這些數(shù)據(jù)庫的作用是除了存儲，記錄的作用，最重要是有助于對腫瘤的研究，為許多的腫瘤預防、治療臨床研究有了促進作用。雖然有了很多數(shù)據(jù)庫都記錄著腫瘤等信息，但是對于腫瘤數(shù)據(jù)相關基因的文獻數(shù)據(jù)庫不多。面對乳腺癌特異性很強的癌癥，乳腺癌的基因、亞型等的數(shù)據(jù)很多的情況，對于預防、免疫、治療等臨床研究也會特別多。在研究乳腺癌中會需要很多的文獻資料查詢，但是因為乳腺癌的特異性很強，所以需要查詢的文獻資料也會特別多，要查詢的相關的基因信息也會很復雜。基于以上的原因，我為此設計一個乳腺癌基因的文獻數(shù)據(jù)庫網頁平臺。這數(shù)據(jù)庫會根據(jù)整理乳腺癌的基因類型等信息，并把對應的相關文獻存儲，展示出來并提供查看。對乳腺癌的研究人員提供了便捷，有助于乳腺癌的研究。

2數(shù)據(jù)和方法2.1數(shù)據(jù)來源乳腺癌基因等數(shù)據(jù)主要源自于PubMed文獻檢索系統(tǒng)網站。PubMed是一個提供生物醫(yī)學方面的論文搜尋以及摘要，并且免費搜尋的數(shù)據(jù)庫。它的數(shù)據(jù)庫來源為MEDLINE。MEDLINE收錄了1966年以來的包含醫(yī)學、護理、獸醫(yī)、健康保健系統(tǒng)及前臨床科學的文獻1600萬余條書目數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)來源于70多個國家和地區(qū)的4800多種生物醫(yī)學期刊，近年數(shù)據(jù)涉及30多個語種，回溯至1966年的數(shù)據(jù)涉及40多個語種，90%左右為英文文獻，70%~80%的文獻有著者撰寫的英文摘要。PubMed界面提供與綜合分子生物學數(shù)據(jù)庫的鏈接，其內容包括：DNA與蛋白質序列，基因圖數(shù)據(jù)，3D蛋白構象，人類孟德爾遺傳在線，也包含著與提供期刊全文的出版商網址的鏈接等。PubMed是目前世界上內容最廣泛的免費檢索文獻網站。這其中的文獻期刊，源自于國內外各大生物醫(yī)學出版商，具有很強的專業(yè)性。它的特點是提供免費的文獻，提供與原文出版的網址鏈接，提供的檢索詞進行自動匹配，且操作簡便，快捷。因此乳腺癌等基因數(shù)據(jù)從其中獲取，查找在合適不過。2.2數(shù)據(jù)收集與整理通過PubMed文獻檢索系統(tǒng)網站，查詢乳腺癌基因相關的文獻，獲取挖掘乳腺癌基因，基因類型，相關文獻信息。然后，手工提取收集到的基因信息數(shù)據(jù)，進行記錄整理。記錄的方式是采用Excel表格的形式進行記錄存儲。Excel表格中構建了兩個表，分別是gene表，literature表。gene表用于儲存基因的信息，表格設置了基因ID(geneid)，基因名稱（genename），基因類型（immunegenetype），RNA類型（typeofRNA）列名。基因ID是記錄每個收集到的基因的序號，為每個基因記錄序號是為了后續(xù)檢索功能設計而設置的，基因名稱負責記錄收集到的乳腺癌基因名稱，基因類型負責記錄收到的基因類型，RNA類型是因為有些RNA是對乳腺癌的免疫，預防，治療有作用，比如lncRNA。對研究乳腺癌是有幫助的，所以也記錄在基因名稱中，因此設置RNA類型字段來記錄其RNA的類型。literature表用于儲存文獻的信息，表格設置文獻標題（Literaturetitle），作者（author），期刊（journal），發(fā)布日期（Publicationdate），文獻網址（Literatureurl），基因ID（geneid）列名。文獻標題，作者，出版商，發(fā)表日期是儲存收集到基因相關文獻的信息。而文獻網址就是儲存查閱文獻對應的網址，通過點擊網址鏈接跳轉到相應的文獻網頁，可進行查閱。最后，基因ID是為了在后續(xù)查詢功能設計上，找到相應文獻對應的基因，因此通過基因ID把兩個表進行關聯(lián)。2.3數(shù)據(jù)庫構建的工具本次構建數(shù)據(jù)庫網頁平臺所使用的數(shù)據(jù)庫是MySQL。MySQL是一種關系型數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。MySQL是現(xiàn)在最流行的數(shù)據(jù)庫管理應用軟件之一，它是一個開源的關系型數(shù)據(jù)庫。MySQL是由瑞典MySQLAB公司開發(fā)，目前屬于Oracle公司。MySQL具有開源，速度快，成本低的特點。特別是開源的這方面，開源軟件可以讓任何人獲取到該數(shù)據(jù)庫的源代碼，讓任何人都可以修改學習。非常適合一般中小型網站的開發(fā)，很受中小企業(yè)的青睞。因此運用于本網頁的開發(fā)。2.4數(shù)據(jù)庫網頁平臺開發(fā)工具本數(shù)據(jù)庫網頁平臺的開發(fā)的工具是IntelliJIDEA。IntelliJIDEA是java編程語言開發(fā)的工具，由JetBrains公司研發(fā)。IDEA是被公認為是最好的java開發(fā)工具之一，比較突出在智能代碼助手、重構、代碼審查、創(chuàng)新的GUI設計等方面的功能上。IntelliJIDEA的特點如下：智能代碼，在IntelliJIDEA中toString()、equals()、get/set等方法，只用輸入函數(shù)或者方法等首字符就會自動出現(xiàn)對應的函數(shù)進行選取，生成代碼，加快代碼的編寫速度。重構是IDEA最早支持的，是IDEA的主要的特點之一。重構，也叫代碼重構。代碼重構是指在對軟件系統(tǒng)外部行為接口不改變的前提下，改善內部結構，進行重新編寫代碼的動作。重構是需要借助工具實現(xiàn)完成的，重構工具能夠在修改代碼的同時修改所有引用該代碼的地方，這不影響原來的輸出結果。這可以提高程序的運行效率，方便去除已知bug。代碼審查，對代碼進行自動分析，出現(xiàn)不符合規(guī)范的，存在風險的代碼，進行加亮標記顯示。IntelliJ

IDEA可以進行創(chuàng)新的GUI設計，可以對窗口，圖標，表單，用戶界面進行自己想要的設計。IntelliJ

IDEA工具雖然有很多優(yōu)點，但還是有些不足的地方。IDEA所需要的內存過多，資源占用，消耗比較大。盡管IntelliJ

IDEA有些不足，但是對于它得到的稱贊，美譽相比算不上什么，它有很多的實際功能已經走在時代前列，因此本數(shù)據(jù)庫網頁平臺選擇IntelliJ

IDEA工具開發(fā)再合適不過。

3數(shù)據(jù)庫網頁平臺的構建及展示3.1數(shù)據(jù)庫網頁平臺結構設計3.1.1數(shù)據(jù)庫網頁平臺結構數(shù)據(jù)庫網頁平臺主要有home,search,download結構組成。結構圖如下（圖3-1）圖3-1結構圖3.1.2數(shù)據(jù)庫網頁平臺數(shù)據(jù)庫結構設計數(shù)據(jù)庫網頁平臺數(shù)據(jù)表格包括：基因信息表（gene_data）、文獻信息表（literature_data）、下載信息表（download_data)。這其中基因信息表（gene_data）的屬性包括基因名稱、基因類型、RNA類型。文獻信息表中（literature_data）包含了基因ID、文獻標題、作者、期刊、發(fā)表年份。下載信息表（download_data）包括文件名，創(chuàng)建時間，下載鏈接。物理結構設計:基因信息表，文獻信息表（如表3-1，表3-2，表3-3）表3-1基因信息表列名數(shù)據(jù)類型允許Null值geneidInt(20)genenamevarchar(200)允許immunegenetypevarchar(200)允許typeofRNAvarchar(200)允許表3-2文獻信息表列名數(shù)據(jù)類型允許Null值Literaturetitlenvarchar(200)authornvarchar(200)允許journalnvarchar(200)允許Publicationdatenvarchar(200)允許Literatureurlnvarchar(200)允許GeneidInt(20)允許表3-3下載信息表列名數(shù)據(jù)類型允許Null值namenvarchar(200)timedatetime允許urlnvarchar(200)允許3.2數(shù)據(jù)庫網頁平臺整體流程介紹3.2.1數(shù)據(jù)收集數(shù)據(jù)庫收集通過Pubmed文獻收集網址收集（圖3-2）圖3-23.2.2底層Excel表格通過Pubmed網站收集到的數(shù)據(jù)收集整理建成底層Excel表格，并命名為基因信息表（如圖3-3），文獻信息表（如圖3-4）圖3-3圖3-43.2.2數(shù)據(jù)庫構建把底層Excel表格數(shù)據(jù)導入MySQL構建數(shù)據(jù)庫，基因數(shù)據(jù)庫gene_data(如圖3-5)，文獻信息表literature_data（如圖3-6），download_data(如圖3-7)圖3-5圖3-6具體系統(tǒng)的設計流程如下（圖3-8）圖3-73.3數(shù)據(jù)庫網頁平臺功能介紹構建數(shù)據(jù)庫網頁主要有以下功能，home(首頁)、search(檢索)、download(下載)。3.3.1home（首頁）數(shù)據(jù)庫網頁的第一個界面home，也就是首頁。首頁是會展示乳腺癌的介紹，數(shù)據(jù)庫網頁的介紹，直觀的讓用戶了解乳腺癌與本網頁。3.3.2search（檢索）Search（檢索）功能界面是數(shù)據(jù)庫主要的功能界面，這個界面提供乳腺癌免疫基因信息查詢，用戶可以快速獲取到乳腺癌基因信息。在界面中設置兩個檢索框，提供兩種查詢方式來檢索數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)內容。基因名稱查詢：通過輸入基因名稱進行關鍵詞查詢，點擊跳轉到相應的界面，可以獲取相應基因的各種文獻信息。文獻信息包括文獻的標題，作者,期刊，發(fā)表年份，表格中的每行內容中除了文獻信息外，還有一個鏈接的圖標。點擊圖標，就可以跳轉到相應的文獻界面進行查閱。。基因類型查詢：通過輸入基因的類型進行關鍵詞檢索，檢索出的內容功能與基因名稱檢索框一樣，提供了兩個搜索框是為了讓用戶快速，準確，直接的查詢。此頁面附帶導出數(shù)據(jù)功能，用戶可以把顯示乳腺癌基因相關文獻信息數(shù)據(jù)導出到excel表格進行存儲，方便用戶進行數(shù)據(jù)整理、查閱、分享。3.3.3statistical（統(tǒng)計）statistical(統(tǒng)計）統(tǒng)計收集的乳腺癌相關基因的基因類型數(shù)量，通過統(tǒng)計圖的形式顯示在界面，同時以表格的形式顯示乳腺癌基因類型數(shù)量的統(tǒng)計情況。3.3.4download（下載）download(下載）分為上傳和下載。上傳界面設置上傳文件按鈕，可以上傳本地文件，自動生成文件名、創(chuàng)建時間等文件信息。下載界面是展示乳腺癌基因相關文件信息。通過點擊文件記錄操作欄中下載按鈕，可以把相應的文件進行下載保存。方便用戶進行數(shù)據(jù)查閱及分享，并且下載界面設置了搜索框，用戶可以通過輸入想要查看的文件名進行查詢。3.4數(shù)據(jù)庫網頁平臺功能展示home（首頁）展示乳腺癌最新統(tǒng)計數(shù)據(jù)，乳腺癌的相關信息介紹和本網頁的內容介紹。（圖3-8）圖3-8Search(檢索)是通過輸入基因名稱或者基因類型可以查詢到對應基因的文獻數(shù)據(jù)（見圖3-9，圖3-10），然后可以點擊右邊文獻相應的鏈接，可以跳轉到相應的文獻的頁面，提供用戶進行查閱（見圖3-11）。圖3-9圖3-10圖3-11在search界面中的右邊附帶導出數(shù)據(jù)功能，可以在查詢中想要當前頁面把文獻的信息提取出來導成excel表格的形式進行保存（見圖3-12），導出的表格內容（見圖3-13）。圖3-12圖3-13statistical(統(tǒng)計）乳腺癌基因類型統(tǒng)計情況（圖3-14，圖3-15）。圖3-14圖3-15Download（下載）點擊上傳文件，選擇上傳文件（圖3-16）。下載文件信息顯示（圖3-17），點擊下載跳轉到相應的文件頁面，點擊右邊下載或者保存方式（見圖3-18）。圖3-16圖3-17圖3-18

討論乳腺癌是全球女性癌癥死亡最高的疾病。為了能更加詳細了解，研究乳腺癌，因此根據(jù)文獻挖掘的乳腺癌免疫基因信息構建數(shù)據(jù)庫網頁平臺。能夠讓乳腺癌相關研究者在查詢乳腺癌免疫基因時能夠快速找到相關基因內容，查詢相關文獻時能夠準確的找到。本項目可以為乳腺癌研究上提供幫助，具有重要意義。在本次構建數(shù)據(jù)庫網頁平臺過程中，遇到了一些困難。例如，在構建數(shù)據(jù)庫gene_data表時，把整理，處理完成的excel表格導入數(shù)據(jù)時，發(fā)生異常報錯，無法導入數(shù)據(jù)。把excel表格的文件類型從xlsx改為xls，也還是無法導入數(shù)據(jù)，會出現(xiàn)提示報錯。最終經過多次調試，發(fā)現(xiàn)excel表格的版本與導入數(shù)據(jù)要求的版本不一致，因此把excel表格版本改為MicrosoftExcel97-2003，即可導入數(shù)據(jù)。雖然本項目數(shù)據(jù)庫網頁平臺還有很多的不足，在功能上也不是很完善，但是我相信這小小的，微不足道的幫助能為乳腺癌治療的研究盡一份力。結論乳腺癌是復雜的疾病，目前乳腺癌的發(fā)病的原因尚未確定，因此國內外對于乳腺癌的研究一直是熱潮。本項目數(shù)據(jù)庫網頁平臺創(chuàng)立的目的就是為了幫助乳腺癌的研究，能夠在查找乳腺癌基因信息、文獻等信息時能方便，快捷。在對數(shù)據(jù)庫網頁平臺建立的過程中，從前期數(shù)據(jù)的收集，整理，到中期構建數(shù)據(jù)庫，編程設計數(shù)據(jù)庫網頁平臺結構框架，最后設計網頁平臺，網頁功能實現(xiàn)。這過程中我已經拼盡了全部心血。就是為了自己的這個項目能夠化作一陣風，幫助，推動研究者們在探究乳腺癌治療的道路上向前進一小步，這對未來乳腺癌研究具有重要意義和重要價值。

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