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2023-07-301微生物細(xì)胞新陳代謝的獨(dú)立性是靠其廣泛的適應(yīng)性和對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的節(jié)約使用即經(jīng)濟(jì)性來(lái)支撐的。歸根到底是依靠微生物細(xì)胞嚴(yán)密的代謝調(diào)節(jié)(包括能量代謝和物質(zhì)代謝)機(jī)構(gòu)來(lái)支撐的。關(guān)于代謝的自動(dòng)調(diào)節(jié)問(wèn)題上一節(jié)已作了簡(jiǎn)單的分析,本節(jié)將從細(xì)胞經(jīng)濟(jì)的角度來(lái)探討代謝產(chǎn)物過(guò)量合成的可能性。第1第頁(yè)一頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3024.2.1
微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系微生物細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)——微生物代謝的三個(gè)子系統(tǒng)微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系的運(yùn)行第2第頁(yè)二頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3034.2.1
微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系第3第頁(yè)三頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-304微生物細(xì)胞是遠(yuǎn)離平衡狀態(tài)的不平衡的開(kāi)放體系,它能對(duì)系統(tǒng)的三個(gè)要素(①能量、②物質(zhì)、③信息),自主地進(jìn)行定向的、全面的協(xié)調(diào)。我們把微生物細(xì)胞作為按特殊經(jīng)濟(jì)規(guī)律運(yùn)行的經(jīng)濟(jì)實(shí)體來(lái)看待,并且把這種按特殊的經(jīng)濟(jì)規(guī)律運(yùn)行的新陳代謝體系叫做細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系。第4第頁(yè)四頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-305微生物細(xì)胞的獨(dú)立存在和自主生存,依賴(lài)于微生物細(xì)胞廣泛的適應(yīng)性(先保證活下來(lái))和對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的節(jié)約使用,即經(jīng)濟(jì)性(爭(zhēng)取在所處環(huán)境條件下更具競(jìng)爭(zhēng)力)。適應(yīng)性和經(jīng)濟(jì)性都建立在微生物細(xì)胞代謝的變動(dòng)性上。第5第頁(yè)五頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-306但是,
微生物代謝的變動(dòng)是有限度的,它受到前述的細(xì)胞代謝調(diào)節(jié)機(jī)制的嚴(yán)格規(guī)范和嚴(yán)密控制,以保證代謝的持續(xù)。這些代謝調(diào)節(jié)的規(guī)律就是細(xì)胞生命活動(dòng)的
“
經(jīng)濟(jì)法則 ”,即細(xì)胞經(jīng)濟(jì)管理原則,
細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系按細(xì)胞經(jīng)濟(jì)規(guī)律運(yùn)行。細(xì)胞的遺傳物質(zhì)(
遺傳信息的載體)是細(xì)胞與環(huán)境對(duì)話的指揮中心。第6第頁(yè)六頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-307適應(yīng)性保障體系經(jīng)濟(jì)性持續(xù)代謝第7第頁(yè)七頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-308對(duì)于微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)而言,細(xì)胞實(shí)物結(jié)構(gòu)(微生物學(xué)的內(nèi)容)和細(xì)胞經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)(即將討論)構(gòu)成了細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)基礎(chǔ)。生產(chǎn)力生產(chǎn)關(guān)系第8第頁(yè)八頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-309細(xì)胞經(jīng)濟(jì)基礎(chǔ),
最終取決于細(xì)胞的遺傳物質(zhì)和環(huán)境的對(duì)話(
細(xì)胞的
“
藍(lán)圖
”和細(xì)胞生命活動(dòng)的指揮中心的現(xiàn)場(chǎng)指揮)。第9第頁(yè)九頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-30104
.
2
.
2
微生物細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)
——微生物代謝的三個(gè)子系統(tǒng)第10第十頁(yè)頁(yè),/共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3011對(duì)于化能異養(yǎng)型微生物而言,其碳架物質(zhì)的代謝是最基本的代謝,因?yàn)樘技芪镔|(zhì)代謝不但為其自身合
成提供碳架,而且為自身合成提供
了可直接使用的代謝能和還原力。
因此,我們首先以碳架代謝為主線,研究與微生物細(xì)胞生長(zhǎng)直接相關(guān)的初級(jí)代謝活動(dòng)。第1第1十頁(yè)一頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3012為了分析問(wèn)題的方便,把與微生物細(xì)胞生長(zhǎng)直接相關(guān)的代謝系統(tǒng)劃分為三個(gè)子系統(tǒng),來(lái)研究微生物細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)。第1第2十頁(yè)二頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-30134.2.2.1
碳架代謝的三個(gè)子系統(tǒng)4.2.2.2
三個(gè)子系統(tǒng)的相互關(guān)系第1第3十頁(yè)三頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3014微生物碳架物質(zhì)的初級(jí)代謝大致可分成三個(gè)子系統(tǒng),一個(gè)分解代謝子系統(tǒng)(子系統(tǒng)Ⅰ)和兩個(gè)合成代謝子系統(tǒng)(子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ)。第1第4十頁(yè)四頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3015ⅠⅡⅢ碳架ATP分子模塊微生物碳架代謝系統(tǒng)的三個(gè)子系統(tǒng)第1第5十頁(yè)五頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3016上圖中Ⅰ:碳源的分解代謝子系統(tǒng)
Ⅱ:分子模塊的合成代謝子系統(tǒng)Ⅲ:生物大分子的合成代謝子系統(tǒng)ATP代表代謝能;
分子模塊代表氨基酸、核苷酸等參與生物大分子組成的單元化合物;
碳架代表
PYR、 R-
5
-
P、α-
KG等前體代謝物。虛箭頭和實(shí)箭頭分別代表代謝系統(tǒng)內(nèi)部的松散的和緊密的聯(lián)第1第6十頁(yè)六系頁(yè)/,共共96頁(yè)9。。5頁(yè)2023-07-3017子系統(tǒng)Ⅰ是微生物細(xì)胞用以合成前體代謝物和提供代謝能的碳源分解代謝系統(tǒng)。這個(gè)系統(tǒng)最容易直接受外界環(huán)境條件在生理許可范圍內(nèi)的影響。例如,
p
H條件引起黑曲霉的發(fā)酵轉(zhuǎn)換,p
H3
時(shí)累積檸檬酸,
pH6
時(shí)累積葡萄糖酸,p
H
10
時(shí)累積草酸。第1第7十頁(yè)七頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3018這個(gè)系統(tǒng)之所以易受外界環(huán)境影響,可能是因?yàn)樘荚吹姆纸獯x有多條途徑可供選擇;此外,可能是因?yàn)榉纸獯x的酶主要分布在細(xì)胞內(nèi)可溶部分和膜上,易受外界條件影響。第1第8十頁(yè)八頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3019用來(lái)合成分子模塊(buildingblock)的合成代謝子系統(tǒng)。分子模塊一般是指用以合成生物大分子的標(biāo)準(zhǔn)單元,譬如用于多糖合成的
G-1-P,
用于蛋白質(zhì)合成的各種氨基酸,用于RNA
和
DNA
合成的各種核苷酸和脫氧核苷酸,
以及用于類(lèi)異戊二烯化合物合成的異戊烯基焦磷酸等。第1第9十頁(yè)九頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3020這個(gè)系統(tǒng)的調(diào)節(jié)機(jī)制主要是負(fù)反饋調(diào)節(jié)(包括反饋抑制和反饋?zhàn)瓒簦€有由遺傳因素決定的、可能出現(xiàn)酶的缺失(主要表型是營(yíng)養(yǎng)缺陷型)突變株。這些結(jié)構(gòu)單位的生物合成途徑大多已弄清楚,總的印象是此系統(tǒng)的調(diào)節(jié)機(jī)制較為單純。第2第0二頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3021分類(lèi)學(xué)上屬不同種的微生物的子系統(tǒng)Ⅰ的代謝調(diào)節(jié)機(jī)制比較接近,而子系統(tǒng)Ⅱ的代謝調(diào)節(jié)機(jī)制則頗為不同。第第2二1十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3022生物大分子合成代謝子系統(tǒng)是指細(xì)胞用以生成蛋白質(zhì)、DNA、RNA
、各種多糖
(
同多糖、雜多糖、肽多糖、脂多糖、莢膜多糖等)
及類(lèi)脂(
含類(lèi)異戊二烯化合物)等細(xì)胞結(jié)構(gòu)物質(zhì)的生物大分子合成代謝子系統(tǒng)。第第2二2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3023只有當(dāng)以上三個(gè)代謝子系統(tǒng)作為一個(gè)整體來(lái)運(yùn)行,微生物細(xì)胞才能維持生命循環(huán)。只有當(dāng)生命循環(huán)得到維持,我們才有可能通過(guò)微生物細(xì)胞的生命活動(dòng),生產(chǎn)微生物產(chǎn)品。第第2二3十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3024微生物活細(xì)胞是遠(yuǎn)離平衡狀態(tài)的不平衡的開(kāi)放體系,微生物細(xì)胞與它所處的環(huán)境不斷地進(jìn)行物質(zhì)、能量和信息的交換。微生物細(xì)胞作
為細(xì)胞機(jī)器用于工業(yè)生產(chǎn)時(shí),除了
要從培養(yǎng)基吸收營(yíng)養(yǎng)外,還要排出
工業(yè)生產(chǎn)的目的產(chǎn)物。第2第二4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3025分泌能量代謝的副產(chǎn)物(乙醇、乳酸等)ⅠⅡⅢ分泌生物大分子的前體(氨基酸、核酸等)分泌生物大分子(酶、微生物多糖等)碳架ATP分子模塊營(yíng)養(yǎng)第第2二5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3026如圖所示三子系統(tǒng)有如下關(guān)系:子系統(tǒng)Ⅰ生成
ATP,
子系統(tǒng)
Ⅱ和子系統(tǒng)Ⅲ使用ATP。但是子系統(tǒng)Ⅰ中ATP如何合成并不嚴(yán)重影響子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)
Ⅲ
對(duì)ATP
的使用。
因此可以認(rèn)為子系統(tǒng)Ⅰ與整個(gè)合成系統(tǒng)
(子系統(tǒng)Ⅱ
加上子系統(tǒng)
Ⅲ
)
之間的聯(lián)系是較為松散的(圖中的虛線箭頭)。第2第二6十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3027子系統(tǒng)Ⅰ
生成的前體代謝物的質(zhì)和量強(qiáng)烈地影響子系統(tǒng)Ⅱ的運(yùn)行
(
見(jiàn)離心途徑匯總圖
),
因此子系統(tǒng)Ⅰ與子系統(tǒng)
Ⅱ之間的聯(lián)系是緊密的(
實(shí)線箭頭)
。而子系統(tǒng)
Ⅰ
與子系統(tǒng)
Ⅲ
之間幾乎僅僅通過(guò)
ATP相聯(lián)系,
因此
這兩個(gè)系統(tǒng)之間的聯(lián)系是松散的(
虛線箭頭
)
。分子模塊
(
如氨基酸
)
在細(xì)胞內(nèi)通常可以游離狀態(tài)存在,
由此推測(cè),
子系統(tǒng)Ⅱ與子系統(tǒng)
Ⅲ
也只是保持松散的關(guān)系(
虛線箭頭)
。第2第二7十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3028綜上所述,第第2二8十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3029相對(duì)獨(dú)立運(yùn)行的另一個(gè)重要原因是細(xì)胞的分泌機(jī)制。子系統(tǒng)Ⅰ相對(duì)獨(dú)立運(yùn)轉(zhuǎn)的過(guò)程中,細(xì)胞可能分泌乙醇等能量代謝的副產(chǎn)物;“子系統(tǒng)Ⅰ+
子系統(tǒng)Ⅱ
”
相對(duì)獨(dú)立運(yùn)轉(zhuǎn)的過(guò)程中,
細(xì)胞可能分泌氨基酸等分子模塊;
三個(gè)子系統(tǒng)協(xié)調(diào)運(yùn)轉(zhuǎn),
微生物細(xì)胞生長(zhǎng)迅速。還有可能分泌酶、多糖、多肽等生物大分子。細(xì)胞分泌代謝產(chǎn)物的同時(shí)生長(zhǎng)速度放慢。第2第9二十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-30304.2.3
微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)學(xué)(
m
ic
ro
b
ia
l
c
e
ll
e
c
o
n
o
m
ic
s
)第3第0三頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3031經(jīng)濟(jì)學(xué)是研究各種經(jīng)濟(jì)關(guān)系和經(jīng)濟(jì)活動(dòng)的規(guī)律的科學(xué),是研究人類(lèi)社會(huì)在各個(gè)發(fā)展階段的活動(dòng)和各種相應(yīng)的經(jīng)濟(jì)關(guān)系,以及經(jīng)濟(jì)活動(dòng)規(guī)律的科學(xué)。經(jīng)濟(jì)活動(dòng)是人們?cè)谝欢ǖ慕?jīng)濟(jì)關(guān)系中(其中占主導(dǎo)地位的是生產(chǎn)關(guān)系
)
,
進(jìn)行生產(chǎn)、交換、分配、消費(fèi)以及與之有密切關(guān)系的活動(dòng)。第第3三1十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3032在經(jīng)濟(jì)活動(dòng)中,存在以較少的耗費(fèi)獲得較大經(jīng)濟(jì)效益的經(jīng)濟(jì)效果問(wèn)題。在微生物細(xì)胞的代謝活動(dòng)中
同樣也存在著以較少的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),獲得較大的生長(zhǎng)效益的經(jīng)濟(jì)效果問(wèn)題;在這個(gè)意義上,代謝活動(dòng)也是一種經(jīng)濟(jì)活動(dòng)。第3第三2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3033經(jīng)濟(jì)效果要用價(jià)值的尺度來(lái)衡量。談到價(jià)值,就涉及到價(jià)值取向問(wèn)題。用不同的價(jià)值取向?qū)ν粋€(gè)事物的效果進(jìn)行評(píng)價(jià),結(jié)果不會(huì)一樣。第3第3三十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3034微生物細(xì)胞本身的價(jià)值取向是加強(qiáng)生存競(jìng)爭(zhēng)能力,而工業(yè)發(fā)酵中微生物細(xì)胞機(jī)器的價(jià)值取向是提高目的產(chǎn)物的生產(chǎn)能力。因此在工業(yè)發(fā)酵的過(guò)程中,需要遵循微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行規(guī)律,對(duì)微生物的代謝活動(dòng)進(jìn)行協(xié)調(diào)。第3第三4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3035有關(guān)價(jià)值取向問(wèn)題:*微生物細(xì)胞——競(jìng)爭(zhēng)能力(細(xì)胞生長(zhǎng)速度和繁殖速度)。*細(xì)胞機(jī)器——生產(chǎn)能力(細(xì)胞在發(fā)酵液中累積特定代謝產(chǎn)物的能力)
。第3第三5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3036典型的工業(yè)發(fā)酵來(lái)說(shuō),目的產(chǎn)物的累積往往是以犧牲微生物的競(jìng)爭(zhēng)能力來(lái)實(shí)現(xiàn)的保證微生物細(xì)胞的生存利益的基礎(chǔ)上,精心協(xié)調(diào)微生物細(xì)胞的生長(zhǎng)和目的產(chǎn)物的累積這兩者的關(guān)系。第第3三6十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3037微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)學(xué)試圖研究①細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系的運(yùn)行規(guī)律②微生物細(xì)胞各個(gè)生命活動(dòng)階段的代謝活動(dòng)③代謝流在代謝網(wǎng)絡(luò)上的流量分布和流動(dòng)規(guī)律④微生物細(xì)胞的體現(xiàn)在不同價(jià)值取向上的生產(chǎn)力⑤微生物細(xì)胞的生產(chǎn)力與細(xì)胞的生產(chǎn)關(guān)系之間的關(guān)系第3第三7十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3038經(jīng)濟(jì)杠桿通用代謝物保障體系第3第三8十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3039在物競(jìng)天擇的基礎(chǔ)上建立的微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系已經(jīng)經(jīng)受長(zhǎng)期的實(shí)踐的檢驗(yàn),已成為微生物細(xì)胞生命活動(dòng)的保障體系,為①適應(yīng)性、②經(jīng)濟(jì)性和③代謝的持續(xù)性提供保障。第第3三9十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3040自然環(huán)境或人為的培養(yǎng)條件均能根據(jù)不同的價(jià)值取向,對(duì)細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)運(yùn)行進(jìn)行導(dǎo)向。但在細(xì)胞遺傳物質(zhì)沒(méi)有變動(dòng)的情況下,這種導(dǎo)向只能在有限的范圍內(nèi)進(jìn)行。第4第0四頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3041在遺傳物質(zhì)發(fā)生變動(dòng)的情況下,大自然的導(dǎo)向,是指自發(fā)突變加上自然選擇,導(dǎo)致微生物物種的進(jìn)化;人為的導(dǎo)向,就是遺傳改造和定向篩選,導(dǎo)致優(yōu)良的生產(chǎn)菌種的獲得,實(shí)現(xiàn)另一種意義上的進(jìn)化。然而,不論是大自然的導(dǎo)向還是人為的導(dǎo)向,都不能改變微生物細(xì)胞的生存保障規(guī)律。第4第四1十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3042⑴⑶
細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)第第4四2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3043微生物細(xì)胞的生存保障規(guī)律可以概括成:整體協(xié)調(diào),維持生計(jì)第第4四3十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3044微生物細(xì)胞必須按這個(gè)生存保障規(guī)律進(jìn)行經(jīng)濟(jì)運(yùn)行,在這個(gè)前提下,細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行還可以接受細(xì)胞經(jīng)濟(jì)杠桿的人為的調(diào)控。根據(jù)是否接受細(xì)胞經(jīng)濟(jì)杠桿的人為的調(diào)控可以把微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)分為:⑴原始型細(xì)胞經(jīng)濟(jì),⑵導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)。第4第4四十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3045⑴原始型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)原始型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系是這樣一種細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系,這種細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系還沒(méi)有接受人為的經(jīng)濟(jì)導(dǎo)向。野生型微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系往往是屬于這個(gè)類(lèi)型的。原始型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)是細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系的這樣一種運(yùn)行狀態(tài),這種運(yùn)行狀態(tài)有利于細(xì)胞生長(zhǎng)、繁殖和在競(jìng)爭(zhēng)中獲勝。第第4四5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3046微生物在生存競(jìng)爭(zhēng)中進(jìn)化的方向是發(fā)展其自身的適應(yīng)能力,提高生存競(jìng)爭(zhēng)能力;也就是優(yōu)化細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行狀態(tài)。經(jīng)生存競(jìng)爭(zhēng)而幸存下來(lái)的野生型微生物在其所棲身的環(huán)境中是富有競(jìng)爭(zhēng)能力的。第4第6四十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3047⑵導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)如果要求微生物過(guò)量合成
某種代謝中間產(chǎn)物,則須對(duì)微生物的代謝流進(jìn)行導(dǎo)向。根據(jù)已獲得的代謝分析的信息,應(yīng)用正確的策略,進(jìn)行設(shè)計(jì),然后按計(jì)劃對(duì)出發(fā)株進(jìn)行遺傳改造和隨后的培養(yǎng)條件優(yōu)化,將代謝流導(dǎo)向理想的載流路徑。第第4四7十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3048在這種情況下,細(xì)胞因接受了人為的代謝導(dǎo)向,細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系處于接受導(dǎo)向的運(yùn)行狀態(tài),因此有導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)之稱(chēng)。盡管以產(chǎn)品為導(dǎo)向的導(dǎo)向型細(xì)胞經(jīng)濟(jì)不同于原始型細(xì)胞經(jīng)濟(jì),然而,微生物細(xì)胞總是按整體協(xié)調(diào),維持生計(jì)的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)管理原則實(shí)現(xiàn)能量和還原力的新的平衡,從而保證生命活動(dòng)以另一種格局持續(xù)進(jìn)行下去。第4第四8十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3049經(jīng)濟(jì)活動(dòng)通過(guò)貨幣投入,獲得收益。在微生物細(xì)胞的代謝活動(dòng)中,存在著以較少的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),獲得較大的生長(zhǎng)效益問(wèn)題。在這個(gè)意義上,微生物的代謝活動(dòng)也是一種經(jīng)濟(jì)活動(dòng),微生物細(xì)胞消耗能量(實(shí)際上是以ATP的形式提供代謝能),實(shí)現(xiàn)生長(zhǎng)。因此研究微生物的代謝,即微生物細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)運(yùn)行,必須研究生長(zhǎng)能學(xué)。第4第9四十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3050⑶細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)為了使微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行狀態(tài)和競(jìng)爭(zhēng)能力得到量化。曾經(jīng)以基質(zhì)的得率系數(shù)
Yx
s
為基準(zhǔn),把細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)定義為細(xì)胞增長(zhǎng)速率與基質(zhì)消耗速率之比。第5第0五頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3051但是,在進(jìn)行分批培養(yǎng)時(shí),培養(yǎng)基的組成成分是在不斷變化的,細(xì)胞增長(zhǎng)速率與不同基質(zhì)的消耗速率都在變化之中,因此這樣的“細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系
數(shù)”難以進(jìn)行同一個(gè)水平上的比較。培養(yǎng)基的組成差異是一個(gè)質(zhì)的差異,如果我們將這個(gè)質(zhì)的差異換算成量的差異,或許問(wèn)題就容易解決了。第5第1五十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3052這樣,我們?cè)噲D將培養(yǎng)基的質(zhì)的差異轉(zhuǎn)換成ATP的量的差異,以ATP
得率系數(shù)Yx
A
T
P
為基準(zhǔn),
修改細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)。特引進(jìn)代謝經(jīng)濟(jì)系數(shù)(
economic
coefficient
ofmetabolism)的概念,用來(lái)描寫(xiě)細(xì)胞經(jīng)濟(jì)體系的經(jīng)濟(jì)運(yùn)行的狀況,以及代謝能對(duì)于細(xì)胞生長(zhǎng)的經(jīng)濟(jì)效果。第5第2五十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3053代謝經(jīng)濟(jì)系數(shù),簡(jiǎn)稱(chēng)經(jīng)濟(jì)系數(shù),被定義為細(xì)胞增長(zhǎng)的速率與ATP的消耗速率之比:這個(gè)經(jīng)濟(jì)系數(shù)不但使微生物的細(xì)胞經(jīng)濟(jì)運(yùn)行狀態(tài)和競(jìng)爭(zhēng)能力得到了量化,而且可以推算細(xì)胞的代謝成本。第第5五3十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3054綜上所述,ATP得率系數(shù)Y
x
A
T
P
,即合成單位細(xì)胞量所消耗ATP的量[mmol
ATP(
g細(xì)胞干重)
-
1
],
比細(xì)胞量對(duì)基質(zhì)的得率系數(shù)
Yx
s
,
即合成單位量的細(xì)胞所消耗的基質(zhì)的量,
更能體現(xiàn)細(xì)胞生長(zhǎng)的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)的基本特性。
所以在分析細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)時(shí),
以
ATP得率系數(shù)Y
x
A
T
P
為基準(zhǔn)比以基質(zhì)的得率系數(shù)Yxs
為基準(zhǔn)更能反映經(jīng)濟(jì)活動(dòng)的本質(zhì)。第第5五4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3055細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)的高低取決于分解代謝體系(子系統(tǒng)Ⅰ
)與兩個(gè)生物合成系統(tǒng)
(子系統(tǒng)Ⅱ和子系統(tǒng)
Ⅲ)的協(xié)調(diào)運(yùn)轉(zhuǎn)的狀況。經(jīng)濟(jì)系數(shù)高低反映各代謝體系之間的聯(lián)系程度、相關(guān)程度和協(xié)調(diào)程度的高低。第第5五5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3056各代謝子系統(tǒng)之間的聯(lián)系越緊密,各代謝子系統(tǒng)運(yùn)轉(zhuǎn)的獨(dú)立性就越小,代謝產(chǎn)物的累積就越困難。在這種情況下,微生物本身能最大
限度地生長(zhǎng)和繁殖,細(xì)胞生產(chǎn)自身
的能力最強(qiáng)。細(xì)胞經(jīng)濟(jì)處于富于競(jìng)
爭(zhēng)能力的運(yùn)行狀態(tài),細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)
最高。第5第五6十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3057經(jīng)濟(jì)杠桿第第5五7十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3058根據(jù)工業(yè)發(fā)酵的現(xiàn)狀,把依靠化能異養(yǎng)型微生物合成某最終被分泌到胞外的初級(jí)代謝產(chǎn)物(目的產(chǎn)物)的過(guò)程,作為工業(yè)發(fā)酵的典型過(guò)程來(lái)研究。如果要在發(fā)酵液中獲得大量的目的產(chǎn)物,先決條件是必須有一定量的細(xì)胞存在,而且細(xì)胞的生命活動(dòng)必須得到維持。第第5五8十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3059在發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)上,分批發(fā)酵的前期是菌種微生物增殖(細(xì)胞機(jī)器的在線制造)階段。應(yīng)該從培養(yǎng)條件上保證菌種微生物的正常增殖,以便為隨后目的產(chǎn)物生成(細(xì)胞機(jī)器的在線運(yùn)行)提供足夠的細(xì)胞機(jī)器。然后,細(xì)胞機(jī)器轉(zhuǎn)入目的產(chǎn)物的生產(chǎn)(在線運(yùn)行)階段。第5第9五十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3060目的產(chǎn)物在發(fā)酵液中的累積,是微生物細(xì)胞按整體協(xié)調(diào)維持生計(jì)的生存保障規(guī)律,自動(dòng)調(diào)低細(xì)胞生長(zhǎng)速度,維持生命活動(dòng)的情況下實(shí)現(xiàn)的。在這個(gè)階段,培養(yǎng)條件的轉(zhuǎn)換能調(diào)動(dòng)菌種微生物高產(chǎn)目的產(chǎn)物的遺傳潛力,從而促成目的產(chǎn)物生產(chǎn)的代謝導(dǎo)向,使微生物細(xì)胞在胞外累積目的產(chǎn)物,獲得發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益。第6第0六頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3061這時(shí),因?yàn)槟康漠a(chǎn)物(原來(lái)用于生長(zhǎng)的代謝中間產(chǎn)物)的抽出,造成細(xì)胞生長(zhǎng)速率的下降和競(jìng)爭(zhēng)能
力的削弱。細(xì)胞生成速度相對(duì)較低,細(xì)胞經(jīng)濟(jì)系數(shù)相對(duì)較低;目的產(chǎn)物
的生成速度相對(duì)較高,目的產(chǎn)物生
成系數(shù)相對(duì)較高。第第6六1十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3062微生物群體的生命活動(dòng)(也就是細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)),不論是在天然的環(huán)境下還是在人為的培養(yǎng)條件下進(jìn)行,都受到經(jīng)濟(jì)杠桿的調(diào)控。在微生物學(xué)中,細(xì)菌的(群體)生長(zhǎng)曲線反映的單細(xì)胞微生物生長(zhǎng)體系中細(xì)胞濃度隨時(shí)間的變化規(guī)律(先后經(jīng)過(guò)延遲期、對(duì)數(shù)期、平衡期和衰亡期),就是細(xì)胞的經(jīng)濟(jì)活動(dòng)受到調(diào)控的結(jié)果;細(xì)菌細(xì)胞自身的生命活動(dòng)影響其自身的環(huán)境條件,其自身的環(huán)境條件反過(guò)來(lái)又影響(調(diào)控)細(xì)胞自身的生命活動(dòng)。第第6六2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3063在工業(yè)發(fā)酵生產(chǎn)中,人們可以利用經(jīng)濟(jì)杠桿對(duì)微生物的生長(zhǎng)、繁殖等新陳代謝過(guò)程進(jìn)行調(diào)控。化能異養(yǎng)型微生物細(xì)胞經(jīng)濟(jì)的經(jīng)濟(jì)杠桿主要有下面幾種:第第6六3十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3064如
pH、
溫度、溶解氧及培養(yǎng)基的營(yíng)養(yǎng)成分。外界環(huán)境首先向子系統(tǒng)Ⅰ(
碳源分解代謝)施加影響,
比如使糖的降解代謝途徑上的代謝流發(fā)生變化,
甚至發(fā)生途徑的轉(zhuǎn)換和代謝流的漂移。第6第六4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3065要實(shí)現(xiàn)代謝產(chǎn)物在發(fā)酵液中的大量累積,還有一個(gè)先決條件是微生物細(xì)胞對(duì)這些代謝產(chǎn)物的分泌能力。如果這些代謝產(chǎn)物因代謝方面的原因只在細(xì)胞內(nèi)累積而不分泌,就會(huì)影響細(xì)胞的內(nèi)部環(huán)境,直至影響到微生物細(xì)胞的生存。第第6六5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3066在這種情況下,旺盛的分泌能力對(duì)微生物細(xì)胞來(lái)說(shuō)是一種解毒機(jī)制;對(duì)工業(yè)生產(chǎn)來(lái)說(shuō),細(xì)胞分泌能力有助
于代謝產(chǎn)物的大量生成和在發(fā)酵液中
的大量累積。代謝產(chǎn)物的分泌對(duì)以各
代謝子系統(tǒng)的松散聯(lián)系為基礎(chǔ)的有關(guān)
子系統(tǒng)的獨(dú)立運(yùn)轉(zhuǎn),也起著十分重要
的作用。第6第6六十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3067如子系統(tǒng)Ⅱ和Ⅲ(生物合成)所涉及的合成代謝途徑的酶和(或)調(diào)節(jié)機(jī)制的遺傳根據(jù)的改變。子系
統(tǒng)Ⅱ和Ⅲ的運(yùn)行,除了受到外界條
件的間接影響外,更多地取決于人
對(duì)菌種的選育和改造。第6第7六十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3068在工業(yè)發(fā)酵過(guò)程中,通過(guò)經(jīng)濟(jì)杠桿原理調(diào)節(jié)細(xì)胞機(jī)器的在線制造階段和在線運(yùn)行階段的相對(duì)長(zhǎng)度和運(yùn)行狀態(tài),根據(jù)生產(chǎn)需要和微生物菌種的性能適度地調(diào)節(jié)培養(yǎng)過(guò)程中代謝成本的分布(細(xì)胞機(jī)器成本在總成本中的比例)。第6第8六十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3069第6第六9十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3070可以在細(xì)胞全局范圍內(nèi)通用的代謝物通用代謝物(currencymetabolites)是指,主要是能量貨幣
ATP和以代謝物形式出現(xiàn)的還原力NADH
和NADPH。它們的作用主要在于調(diào)節(jié)代謝流的流量和方向,使途徑成為代謝網(wǎng)絡(luò)整體的一部分。第7第0七頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3071生物合成反應(yīng)一般都依賴(lài)于ATP的供應(yīng),若ATP供應(yīng)不足,則生物合成受阻,甚至連形成代謝能的降解途徑都不能激活。ATP及其相關(guān)分子
ADP、AMP(
三者組成腺苷酸庫(kù))不但調(diào)節(jié)中心(碳代謝)途徑的供能反應(yīng),還直接參與代謝反應(yīng)。這些中心分解代謝過(guò)程 ( 糖酵解和 TCA
循環(huán))為生物合成提供啟動(dòng)物質(zhì)。然而,
就其重要性來(lái)說(shuō),其調(diào)節(jié)作用遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于其參與作用。第7第七1十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3072第7第七2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3073這些途徑不僅提供前體代謝物,同
時(shí)也提供代謝能和輔助因子,以滿(mǎn)足基本的合成代謝的需要。因此,此類(lèi)途徑被稱(chēng)為無(wú)定向代謝途徑以表示它們?cè)诜纸獯x和合成代謝中的雙重作用。這些途徑的調(diào)節(jié)應(yīng)當(dāng)反映出其雙重功能,即確保碳架物質(zhì)(
carbon
skeletons)
正確地、協(xié)調(diào)地流進(jìn)生物合成途徑和產(chǎn)能途徑(收獲代謝能的途徑)。嚴(yán)格地說(shuō),生物合成途徑與降解途徑的主要區(qū)別在于,用來(lái)控制流量的調(diào)節(jié)信號(hào)的性質(zhì)的不同。第7第3七十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3074如果糖酵解或TCA循環(huán)僅僅接受能荷調(diào)節(jié),那么在能量供應(yīng)充足的條件下,通過(guò)這些途徑的流量將會(huì)硬性地減少。然而,伴隨著ATP再生的減少,這種反饋機(jī)制也會(huì)限制用于生長(zhǎng)的中間物的利用率,從而削弱生長(zhǎng)。這樣的響應(yīng)仍不能令人滿(mǎn)意,因?yàn)榕囵B(yǎng)基營(yíng)養(yǎng)供應(yīng)豐富時(shí),生長(zhǎng)也會(huì)受到限制。第第7七4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3075為了滿(mǎn)意地調(diào)節(jié)一個(gè)同時(shí)支持兩種功能(產(chǎn)能和生長(zhǎng))的過(guò)程,已經(jīng)導(dǎo)出了一種微妙的機(jī)制。這個(gè)機(jī)制需要兩類(lèi)信號(hào)的輸入,一類(lèi)是生物合成中間物水平的信號(hào),另一類(lèi)是代謝能水平的信號(hào)。第第7七5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3076第一類(lèi)信號(hào)是特定途徑(通常是嚴(yán)格的合成過(guò)程)的終產(chǎn)物。大量實(shí)例說(shuō)明大多數(shù)生物合成途徑的調(diào)節(jié)都包括簡(jiǎn)單反饋機(jī)制,
其中終產(chǎn)物抑制其自身合成的分支途徑的第一步,
例如蘇氨酸抑制高絲氨
酸脫氫酶,
異亮氨酸抑制蘇氨酸脫氨酶,組氨酸抑制磷酸核糖-
ATP
焦磷酸化酶
(
5
-
磷酸核糖焦磷酸激酶),
色氨酸抑制鄰氨基苯甲酸合成酶等。第第7七6十頁(yè)六頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3077第二個(gè)信號(hào)是嚴(yán)格的分解代謝途徑所特有的,而且是能量代謝的最終的(或中間的)產(chǎn)物,也就是Pi、AMP、ADP、ATP、NADH、NADPH,
例如
產(chǎn)氣腸桿菌的蘇氨酸脫氨酶(
降解酶
)受
AMP的激活,銅綠假單胞菌的組氨酸酶(降解酶)受Pi
的抑制,并且此抑制可被AMP和GDP解除。第第7七7十頁(yè)七頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3078無(wú)定向代謝途徑采用兩種流
量控制方式,即終產(chǎn)物的抑制和作為細(xì)胞能量狀態(tài)指示劑的代謝物的活性控制。當(dāng)兩個(gè)信號(hào)中任一個(gè)信號(hào)低時(shí),糖酵解將繼續(xù)進(jìn)行;當(dāng)兩者均處于正常范圍時(shí),糖酵解途徑尚能起作用,而通過(guò)該途徑的流量減小。第7第8七十頁(yè)八頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3079當(dāng)然在一個(gè)正在代謝葡萄糖的細(xì)胞中,糖酵解途徑?jīng)Q不會(huì)完全關(guān)閉,因?yàn)榧?xì)胞生命活動(dòng)需要ATP的持續(xù)供應(yīng)。就不同前體相互之間的平衡和生物合成對(duì)于不同前體的需要而論,12種前體代謝物的形成速率的平衡涉及一個(gè)高度復(fù)雜的調(diào)控機(jī)制。要進(jìn)行這樣的協(xié)調(diào),
除了涉及碳架物質(zhì),
還有供能反應(yīng)必須提供的代謝能(
ATP等)
和還原力(
NADH
和
NADPH
)。因此,毫不奇怪,這些化合物本身就是代謝網(wǎng)絡(luò)中許多不同位點(diǎn)的變構(gòu)效應(yīng)物。第第7七9十頁(yè)九頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3080關(guān)于能荷調(diào)節(jié),本章4.1.2.3已有描述,并已推導(dǎo)出推算能荷的公式:上式給出了對(duì)流量的協(xié)調(diào)控制的能荷的推算公式,式中帶下標(biāo)的c
分別表示下標(biāo)對(duì)應(yīng)的腺苷酸的濃度。從此式可知,能荷可以在0(全部AMP)和1(全部ATP)之間變化。第8第0八頁(yè)十頁(yè)/,共共96頁(yè)9。5頁(yè)2023-07-3081一般說(shuō)來(lái),高能荷抑制補(bǔ)充代謝能的酶系(例如生物合成酶系),同時(shí)激活消耗ATP的酶系;反之低能荷則抑制消耗代謝能的酶系,同時(shí)激活生成ATP的酶系。第8第1八十頁(yè)一頁(yè)/,共共969頁(yè)。5頁(yè)2023-07-3082在氧化-
還原反應(yīng)中也有類(lèi)似的情況。氧化
-
還原反應(yīng)受到還原荷(
reduction
charge
)
的類(lèi)似的調(diào)節(jié)。吡啶核苷酸作為氫負(fù)離子或還原力的載體:NAD
主要在供能途徑的氧化還原反應(yīng)中起作用,
NADP
通常用于生物合成反應(yīng)。在供能反應(yīng)中,
NAD
+
(
氧化型的NAD )是反應(yīng)物,而合成反應(yīng)利用NADPH
(
還原型的
NADP
)。因此毫不奇怪,
在生理?xiàng)l件下大部分
NAD
在胞內(nèi)是以
NAD
+
的形式存在,
而NADP是以NADPH的形式存在。第第8八2十頁(yè)二頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3083可用分解代謝還原荷(
catabolic
reduced
charge
)和合成代謝還原荷(anabolicreduced
charge
)
來(lái)描述細(xì)胞的氧化還原狀態(tài)。分解代謝還原荷,縮寫(xiě)為
CRC,
其值約為
0.03
~0.07;
合成代謝還原荷,
縮寫(xiě)為ARC,其值約為
CRC
的10
倍。第第8八3十頁(yè)三頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3084還原荷可用下面公式計(jì)算:式中帶下標(biāo)的c
分別表示下標(biāo)對(duì)應(yīng)的吡啶核苷酸的濃度。第第8八4十頁(yè)四頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3085CRC
和ARC
分別在協(xié)調(diào)供能反應(yīng)與生物合成反應(yīng)的過(guò)程中,
起著重要作用,盡管對(duì)它們的作用的細(xì)節(jié)尚不如對(duì)能荷的作用那樣清楚。大部分細(xì)胞中有 4 個(gè)供能反應(yīng)能生成
NADPH,
兩個(gè)反應(yīng)在磷
酸戊糖途徑,
它們分別是
6
-
磷酸葡萄糖脫氫酶(
G
6
PDH )
和
6
-
磷酸葡萄糖酸脫氫酶(
G
6
PDH
);
另外兩個(gè)反應(yīng)在TCA環(huán),它們分別是異檸檬酸脫氫酶(
ID)和蘋(píng)果酸酶(
ME
)。生成的
NADPH參與生物合成。第第8八5十頁(yè)五頁(yè)/,共共969頁(yè)5。頁(yè)2023-07-3086CRC
和ARC
的調(diào)節(jié)被認(rèn)為是通過(guò)轉(zhuǎn)氫酶而發(fā)生的,該酶催化如下可逆反應(yīng):NADP
+
+
NADH
←→
NADPH
+
NAD
+這是一個(gè)束縛在膜上的酶,
它由質(zhì)
子運(yùn)動(dòng)勢(shì)(
proton-
motive
for
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