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丙酮酸去氫酶復(fù)合物生物體體內(nèi)的物質(zhì)01組成反應(yīng)過程整體結(jié)構(gòu)調(diào)控目錄030204基本信息丙酮酸去氫酶復(fù)合物也稱為丙酮酸脫氫酶復(fù)合體(英語:Pyruvatedehydrogenasecomplex;PDHcomplex;PDC)是生物體內(nèi)催化丙酮酸轉(zhuǎn)變成乙酰輔酶A之反應(yīng)的三種酶及五種輔酶的組合。此復(fù)合物所參與的反應(yīng)名稱是丙酮酸脫羧作用(Pyruvatedecarboxylation),是連結(jié)糖解作用(最終產(chǎn)物為丙酮酸)與檸檬酸循環(huán)(起始反應(yīng)物為乙酰輔酶A)的一連串化學(xué)反應(yīng),所有反應(yīng)都是在丙酮酸去氫酶復(fù)合物的表面以內(nèi)進行。除此之外,此復(fù)合物也是生物體內(nèi)另外兩種酶復(fù)合物的原型,分別是參與檸檬酸循環(huán)的α-酮基戊二酸復(fù)合物(α-ketoglutaratedehydrogenasecomplex),以及參與一些氨基酸氧化路徑的支鏈α-酮酸去氫酶復(fù)合物(Branched-chainα-ketoaciddehydrogenasecomplex)。而且因為這些復(fù)合物都包含一些屬于維生素B群的化學(xué)物質(zhì),因此缺乏維生素B會造成眾多疾病,例如腳氣病。組成組成對真核生物來說,組成丙酮酸去氫酶復(fù)合物的三種酶及五種輔酶皆位在線粒體中;對原核生物來說,則是位在細胞質(zhì)里。這些酶除了組合在一起之外,還能夠重復(fù)地組成更大的蛋白質(zhì)群。組成丙酮酸去氫酶復(fù)合物的三種酶分別是:丙酮酸去氫酶、二氫硫辛酰基乙酰基轉(zhuǎn)基酶、二氫硫辛酰基去氫酶。五種輔酶則是:硫胺素焦磷酸、輔酶A、硫辛酸、黃素腺嘌呤雙核苷酸、煙堿胺腺呤雙核苷酸。硫胺素焦磷酸(TPP)位在在E1的活化位置上,其主要構(gòu)造是噻唑環(huán)(thiazolering),組成TPP的必要物質(zhì)是硫胺素(也就是維生素B1)。E2含有三種功能不同的區(qū)域,第一個區(qū)域稱為硫辛酰區(qū)(Lipoyldomain),位在E2蛋白質(zhì)的氨基端(N-terminal)上。硫辛酸形成的硫辛酰基(Lipoylgroup)與離胺酸形成的離胺酸殘基(residue)會組成硫辛酰基離胺酸,是E2的輔成基。這個區(qū)的數(shù)目在依照物種的不同而有變異。第二個區(qū)域是負責(zé)E2與E3、以及E2與E1之間連結(jié)的區(qū)域,稱為連接區(qū)(Bindingdomain)。第三個區(qū)域最靠近復(fù)合物內(nèi)部,稱為乙酰基轉(zhuǎn)移酶區(qū)(acyltransferasedomain),能使乙酰基轉(zhuǎn)移。不同區(qū)域之間會相隔20到30個不等的氨基酸。E3上則有黃素腺嘌呤雙核苷酸(FAD),而組成FAD的主要物質(zhì),是核黃素(維生素B2)。另外NAD中含有煙堿酸(維生素B3),CoA的組成物之一則是泛酸(Pantothenate;維生素B5)。整體結(jié)構(gòu)整體結(jié)構(gòu)哺乳類動物體內(nèi)的丙酮酸去氫酶復(fù)合物直徑大小,大約是50納米,約是核糖體的5倍大,可以在電子顯微鏡下直接觀察其外觀。分析電子顯微鏡照片與晶體衍射的結(jié)果,可以得出一個模型,模型顯示在復(fù)合體的外圍是E1,內(nèi)部則是E2與E3。E2的形狀為五角十二面體,直徑大約25納米。在牛科動物細胞里是以60個單位來組成一個核心;在大腸桿菌中則是以24個E2單位組成。另外大腸桿菌的丙酮酸去氫酶復(fù)合物重量大約是4600kdal。反應(yīng)過程反應(yīng)過程在復(fù)合物內(nèi)進行的脫羧作用主要可分為5個步驟,丙酮酸與乙酰輔酶A的中間物在復(fù)合物理的移動過程,大致依照E1、E2的順序,E3則沒有直接與中間物接觸。其中丙酮酸是在第一個步驟(E1中)加入反應(yīng),乙醘輔酶A是在第三個步驟(E2中)中生成。在第一個步驟中,丙酮酸上的一號碳(C-1)與相連的兩個氧原子,會形成二氧化碳然后釋出;C-2則會與E1中的TPP結(jié)合形成羥乙基TPP(HydroxyethylTPP),對丙酮酸來說是個氧化反應(yīng)。這個步驟是所有步驟中最慢的一個,因此決定了整個反應(yīng)的速率。接下來TPP會將羥乙基帶入第二個步驟,TPP本身則留在E1中繼續(xù)作用。羥乙基氧化之后變成乙酸基,并進入E2,與硫辛酰基上的其中一個硫原子結(jié)合,已經(jīng)氧化過的硫辛酰基離胺酸與乙酸基結(jié)合,成為酰基硫辛酰基離胺酸(Acyllipoyllysine)。第三個步驟在E2進行,酰基硫辛酰基離胺酸會與輔酶A進行反應(yīng),此反應(yīng)會使硫辛酰基離胺酸還原,并釋出乙酰輔酶A。硫辛酰基離胺酸則經(jīng)過下一步驟的氧化之后回到第二步驟作反應(yīng)。第四個步驟中,E3的輔成基FAD會使上一步驟中還原的硫辛酰基離胺酸再度氧化,以回到第二步驟;而FAD經(jīng)過反應(yīng)之后,會變成FADH2。調(diào)控調(diào)控丙酮酸去氫酶復(fù)合物會受到三種方式調(diào)控,第一種稱為產(chǎn)物抑制,也就是復(fù)合物所催化生成的產(chǎn)物乙酰輔酶A與NADH,能夠抑制復(fù)合物的作用能力。其中乙酰輔酶A抑制的對象是E2,NADH則是抑制E3。除此之外,這兩種抑制物氧化之后生成的輔酶A與NAD+,則能夠促進復(fù)合物的作用。第二種調(diào)控方式是由核苷酸來執(zhí)行,例如GTP有抑制作用,AMP則有促進作用。第三種稱為共價修飾作用,當(dāng)E1中的絲氨酸殘基被ATP磷酸酯化之后,復(fù)合物會失去
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