第三代基因測序原理及應用_第1頁
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文檔簡介

第三代測序原理當前1頁,總共22頁。什么是DNA?DNA是英文Deoxyribonucleicacid的縮寫,中文含義為脫氧核糖核酸。

脫氧核糖核苷酸的類型:

腺嘌呤(A)=胸腺嘧啶(T)胞嘧啶(C)=鳥嘌呤(G)DNA分子的排列順序是可以檢測

的,從而可以解讀遺傳信息,即測序。DNA結構(視頻)當前2頁,總共22頁。什么是基因?

基因是具有遺傳效應的DNA分子片段,由許多脫氧核苷酸按照一定的

堿基順序構成的長鏈聚合物。

基因身高膚色智商胖瘦當前3頁,總共22頁。基因組:一個細胞內的全套染色體為一個基因組,或是一個細胞中的全部DNA為一個基因組什么是基因組?

基因組>染色體>基因當前4頁,總共22頁。測序技術發展史當前5頁,總共22頁。第一代測序原理-Sanger測序法雙脫氧鏈終止法(Sanger法):

1977年,英國人FredSanger發現,如果在DNA復制過程中摻入ddNTP,就會產生一系列末端終止的DNA鏈,并能通過電泳按長度分辨。不同末端終止DNA鏈的長度是由摻入到新合成鏈上隨機位置的ddNTP決定的。當前6頁,總共22頁。復制叉(Replicationfork)DNAligase:DNA連接酶;DNAgyrase:DNA旋轉酶;DnaBhelicase:解旋酶SSB:單鏈結合蛋白;當前7頁,總共22頁。DNA連接酶(DNAligase)功能:連接DNA鏈3‘-OH末端和另一DNA鏈的5’-P末端,使二者生成磷酸二酯鍵,從而把兩段相鄰的DNA鏈連成完整的鏈。DNA復制當前8頁,總共22頁。Sanger測序法當前9頁,總共22頁。第一代測序成果:人類基因組2001年2月份同時發表,從此有了人類基因組模板。當前10頁,總共22頁。ATCGAACTTCCATTGCACCAATATAGGTACGTAAATCGAACTTCCTTGCACCTATATAGGTGTACGTAA

參考序列:測序所得序列:堿基缺失堿基突變堿基重復特點:測序長度700-1000bp;通量小,一次96個樣本,每個樣本1條序列臨床應用:單基因病檢測,如血友病、白化病、地中海貧血等當前11頁,總共22頁。第二代測序原理-高通量測序NextSeq500–靈活通量廢液槽緩沖液化學試劑FlowCell當前12頁,總共22頁。CAGTCATCACCTAGCGTA5’GTGTCAGTCAGTCA3’5’測序基礎原理:邊合成邊測序(SBS)

如何理解邊合成邊測序?用不同顏色的熒光標記四種dNTP,在聚合酶作用下,按照堿基互補配對原則(A與T配對,C與G配對)進行鏈的延伸,每延伸一個堿基,堿基釋放熒光。通過光學系統捕獲熒光,從而獲得堿基信息。當前13頁,總共22頁。當前14頁,總共22頁。MiSeq建庫2HOURSCluster1HOURS測序4HOURS信息分析0.5

HOURS一體化進行:上樣后,測序儀自動化完成擴增和測序二代測序法當前15頁,總共22頁。當前16頁,總共22頁。當前17頁,總共22頁。第三代測序原理-單分子測序第三代測序方法與現在的測序技術相比之下的優點:1)更高的通量;2)更短的測序時間;3)更長的讀取長度;4)更高的精確性,可以檢測出極少的變異;5)需要很少的起始量;6)低成本。當前18頁,總共22頁。HelicoBioScience單分子測序技術當前19頁,總共22頁。PacificBioscienceSMRT技術當前20頁,總共22頁。OxfordNanoporeTechnologies的納米孔單分子測序技術當前21頁,總共22頁。第三代測序原理-單分子測序第三代測序方法與現在的測序技術相

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